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尿黑酸尿症一家系基因诊断及分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨尿黑酸尿症的临床特征和基因突变特点.方法 收集先证者及其家系成员临床资料,尿气相色谱分析尿液,采用PCR方法对尿黑酸1,2-二氧化酶(HGD)基因所有外显子检测,确定基因突变位点,Polyphen软件预测其蛋白质功能,分析基因型与表型的关系.结果 患者临床表现仅尿液为红褐色,而无皮肤、关节及脏器改变,尿气相色谱提示尿黑酸尿症(AKU),HGD基因检测提示该家系先证者的HGD基因第2外显子c.34A> C(p.N12H)及第4外显子c.240A> T(p.Q80H)及第12外显子c.910A >G(p.K304E)错义突变,先证者表型正常的母亲及姐姐发现携带第2外显子c.34A> C(p.N12H)错义突变,先证者表型正常的父亲发现携带第12外显子c.910A>G(p.K304E)错义突变.蛋白质功能预测后提示2号外显子c.34A>C(p.N12H)致病性突变位点.结论 此家系中先证者为HGD基因复合杂合子突变致病,其第2外显子c.34A>C(p.N12H)来自于母亲,第12外显子c.910A> G(p.K304E)错义突变来自于父亲,其父母及姐姐均为表型正常的杂合子携带者.发现2个国际上尚未报道的新HGD基因突变(p.N12H与p.K304E),且发病年龄最早,仅有黑尿表现.
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编辑人员丨2023/8/6
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尿黑酸尿症合并周围神经病1例
编辑人员丨2023/8/5
尿黑酸尿症(alkaptonuria, AKU)又称为黑尿症或褐黄病,是一种罕见的酪氨酸代谢障碍性疾病,呈常染色体隐性遗传,由编码尿黑酸1, 2-二氧化酶的HGD基因(homogen?tisate 1,2 dioxygenase,HGD)突变所致.患者因先天缺乏尿黑酸氧化酶,导致体内苯丙氨酸和酪氨酸代谢产生的尿黑酸(homogentisic acid,HGA)无法降解,经尿液排出,或慢性进行性沉积于机体多处结缔组织,形成色素沉着.该病早期主要表现为尿色加深、黑尿,皮肤色素沉着,晚期因体内无法排除的尿黑酸侵蚀全身软骨和软组织引起继发性褐黄病性骨关节病[1].本文报告1例合并周围神经损伤的尿黑酸尿症病例,以增加对该病的认识,防止漏诊、误诊.
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编辑人员丨2023/8/5
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微卫星标记分析在人类基因组多样性研究中的应用
编辑人员丨2023/8/5
人类基因组多样性(HGD)研究中一项引人注目的技术是以微卫星DNA为标记的基因分型。微卫星DNA种类多、分布广、呈高度多态性,并容易用PCR方法检测,故得以广泛应用。本文主要对微卫生DNA的分子生物学特征,在HGD研究中的应用方法及其应用前景作一综述。
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编辑人员丨2023/8/5
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基于TCGA数据库的食管鳞癌代谢相关基因预后风险模型的建立
编辑人员丨2023/8/5
目的:探索影响食管鳞状细胞癌(ESCC)患者预后的代谢相关基因,构建ESCC患者的预后风险模型.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载食管癌的转录组数据和临床病例资料.从转录组数据中提取出代谢相关基因的数据,筛选ESCC组织和正常组织中差异表达的代谢基因.运用单因素COX分析、Lasso回归分析、多因素COX分析构建预后风险模型,并用受试者工作特征(ROC)曲线评估代谢相关基因预后模型的预测能力,并对高低风险组进行GSEA分析.结果:肿瘤组和对照组共存在280个差异表达的代谢相关基因,其中乙醛脱氢酶1A1(ALDH1A1)、黑酸1,2-二加氧酶(HGD)以及DNA引物酶多肽1(PRIM1)与ESCC的预后相关.Kaplan-Meier分析显示,相较于低风险组,高风险组的总体生存期降低(P<0.01).ROC曲线分析及多因素COX回归分析表明,该预后模型具有良好的预测效能[曲线下面积(AUC)=0.741],可以作为一个独立的预后因素(HR=11.66,P<0.001).结论:基于代谢相关基因构建的预后风险模型可以作为ESCC患者的预后因素,为寻找新的食管癌治疗靶点提供了方向.
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编辑人员丨2023/8/5
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膜性肾病中M2巨噬细胞相关基因的生物信息学分析
编辑人员丨2023/8/5
目的:通过生物信息学分析探讨膜性肾病(MN)中有关M2巨噬细胞的免疫分子机制。方法:从基因表达集(GEO)数据库下载微阵列数据集(GSE104948和GSE108109,其中GSE108109作为验证数据集),使用Timer数据库进行免疫浸润分析。以M2巨噬细胞作为表型进行加权基因共表达网络分析,筛选M2巨噬细胞相关核心基因。从差异表达基因和核心基因的交集确定潜在关键基因。利用数据集GSE108109验证潜在关键基因的表达水平,以接受者操作特征(ROC)曲线分析评估其诊断价值。结果:M2巨噬细胞在MN组和正常对照组之间显著不同。确定了6个M2巨噬细胞相关的关键基因:PPARGC1A、ESRRG、KCNJ16、HLF、HGD和SULT1C2。ROC曲线分析显示,以上6个基因的ROC曲线下面积值均大于0.85。结论:本研究发现了有关MN中M2巨噬细胞的6个基因,尚需进一步研究验证其在MN中的作用。
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编辑人员丨2023/8/5
