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LINC01116在肝细胞癌中的表达及促癌效应的初步研究
编辑人员丨1周前
目的:研究长非编码RNA(long non-coding RNA, LncRNA)LINC01116在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达及其在HCC的发生和发展中的作用。方法:首先采用生物信息学方法分析LINC01116在HCC中表达水平及其与临床病理因素的关系及其在HCC进展中的预后意义,然后通过在肝癌细胞系(Huh-7)中转染LINC01116的siRNA进行干扰,实时荧光定量PCR(real time quantitative PCR,RT-qPCR)检测干扰后LINC01116的表达情况,细胞计数试剂盒-8(cell counting Kit-8,CCK-8)检测Huh-7细胞的增殖情况,流式细胞术检测Huh-7细胞凋亡情况,Transwell检测对Huh-7细胞迁移能力的影响,同时Western blot检测上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)进程相关蛋白表达情况。结果:LINC01116在HCC组织和细胞系中过表达,且与HCC患者预后不良相关。LINC01116下调后能抑制细胞增殖、迁移和侵袭,促进细胞凋亡。LINC01116下调促进了上皮标记物E-cadherin的表达增加,同时抑制间充质标记物N-cadherin和Vimentin的表达,促进了EMT进程。结论:LINC01116在HCC中可能起着促癌基因的作用,是HCC患者预后判断的潜在生物标志物。
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编辑人员丨1周前
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干扰LINC01116表达通过靶向微小RNA-9-5p影响肾癌细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭
编辑人员丨1周前
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA) LINC01116在肾细胞癌发生发展中的作用及可能机制。方法:实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测LINC01116和微小RNA(miR)-9-5p含量;双荧光素酶报告实验验证LINC01116和miR-9-5p的靶向关系;细胞计数试剂盒-8(CCK-8)法,克隆形成实验,流式细胞术检测细胞增殖,迁移,侵袭和凋亡;蛋白质印迹法(Western blot)检测表型相关蛋白。结果:肾细胞癌组织中LINC01116的表达高于癌旁组织(2.68±0.15比1.02±0.08, P<0.05),而miR-9-5p的表达明显低于癌旁组织(0.31±0.04比1.04±0.09, P<0.05);LINC01116靶向结合miR-9-5p,且负调控miR-9-5p的表达( P<0.05);与对照组或si-NC组比较,si-LINC01116组786-O细胞光吸光度( A)值(0.69±0.06、0.66±0.08比0.35±0.05),克隆形成数(117.37±14.71、115.54±12.42比51.71±3.46),迁移数[(158.11±11.92)个、(159.89±11.81)个比(56.56±5.59)个],侵袭数[(117.78±7.51)个、(118.33±7.70)个比35.56±3.43)个]及细胞中细胞核增殖抗原(Ki-67)(0.51±0.09、0.53±0.05比0.17±0.04)、基质金属蛋白酶(MMP)-2(0.73±0.09、0.75±0.04比0.27±0.05)和MMP-9(0.79±0.07、0.77±0.08比0.34±0.05)蛋白表达水平明显降低( P<0.05),凋亡率[(3.07±0.40)%、(3.14±0.46)%比(25.47±2.23)%]和活化的半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶-3(cleaved-Caspases-3)蛋白水平(0.28±0.04、0.27±0.05比0.62±0.08)明显升高( P<0.05)。与si-LINC01116+抗miR-NC组比较,si-LINC01116+抗miR-9-5p组786-O细胞 A值(0.33±0.07比0.57±0.07)、克隆形成数(50.14±3.09比101.97±11.87)、迁移数[(57.89±6.29)个比(126.89±8.02)个],侵袭数[(36.11±4.62)个比(96.89±5.73)个]及细胞中Ki-67(0.16±0.05比0.35±0.08)、MMP-2(0.29±0.02比0.63±0.04)和MMP-9(0.33±0.03比0.65±0.03)蛋白表达水平明显升高( P<0.05),凋亡率[(26.06±2.54)%比(6.07±0.71)%]和细胞中cleaved-Caspases-3蛋白(0.64±0.06比0.29±0.06)表达水平明显降低( P<0.05)。 结论:干扰LINC01116表达通过负调控miR-9-5p可以降低肾细胞癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并促进细胞凋亡。
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编辑人员丨1周前
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胃癌组织中上皮间质转化相关lncRNA LINC01116的表达及临床意义
编辑人员丨2024/3/30
目的 探讨胃癌组织中上皮间质转化相关lncRNA长基因间非蛋白质编码RNA 1116(LINC01116)的表达及临床意义.方法 使用实时荧光定量PCR检测 98 对胃癌组织和癌旁组织的LINC01116 水平,结合临床病理资料和随访数据分层分析LINC01116 表达与胃癌临床病理特征和预后的关系,多因素分析采用Cox比例风险模型.结果 98 例胃癌组织的LINC01116 水平为 3.241±0.102,高于癌旁组织的1.308±0.046,差异有统计学意义(t=17.243,P<0.001).LINC01116 表达与胃癌患者的性别、年龄、吸烟史、饮酒史、肿瘤大小和浸润深度无关(P>0.05),而与Lauren分型、TNM分期、分化程度和淋巴结转移有关(P<0.05);单因素分析发现LINC01116 表达与预后有关,其中LINC01116 低表达患者的中位总生存期为 58.0(95%CI:44.766~71.234)个月,优于高表达者的 29.0(95%CI:18.345~39.655)个月(P=0.002);多因素分析显示LINC01116 表达是胃癌的独立预后因素,LINC01116 高表达是胃癌预后不良的危险因素(HR=2.062,95%CI:1.134~3.750,P=0.018).结论 胃癌组织中LINC01116 高表达,且与胃癌进展和不良预后有关,有作为胃癌诊治靶点的潜能.
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编辑人员丨2024/3/30
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缺氧诱导血管内皮细胞中长链非编码RNA LINC01116的表达及其功能的初步研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨缺氧条件下人脐静脉内皮细胞(human umbilical vein endothelial cell,HUVEC)中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA) LINC01116的表达及其在炎症分子表达调控中的作用.方法 采用三气培养箱模拟缺氧环境(1%O2),常氧对照组细胞于普通培养箱(21%O2)中常规培养.采用实时荧光定量PCR检测LINC01116及各炎症分子的mRNA水平.Western blot检测缺氧诱导因子-1α(hypoxia-inducible factor 1 alpha,HIF-1α)蛋白水平,并用葡萄糖转运体-1 (glucosetransporter 1,GLUT-1)的转录表达水平反映HIF-1的转录活性.免疫荧光法检测核转录因子NF-κB(nuclear factor of kappa B,NF-κB)活性亚基p65在细胞中的分布,并计算p65入核的细胞比例.结果 qRT-PCR的结果显示,缺氧条件下,LINC01116在HUVEC中持续高表达,与常氧对照组相比,差异均具有统计学意义(P<0.01).经脯氨酸羟化酶抑制剂(DMOG)和去铁酰胺(DFX)处理后,常氧培养HUVEC中HIF-1α蛋白表达和GLUT-1的转录表达增加,LINC01116表达增高,与溶剂对照组相比,差异均具有统计学意义(P<0.01).经YC-1和小干扰RNA处理后,缺氧培养HUVEC中HIF-1α蛋白表达和GLUT-1的转录表达下降,LINC01116的表达显著下降,与各对照组相比,差异均具有统计学意义(P<0.01).缺氧24 h时,HUVEC中炎症分TNF-α、IL-1β、ICAM、E-SELECTIN的mRNA水平增加,干扰LINC011 16表达后,上述炎症分子的mRNA水平显著降低(P<0.01).免疫荧光的实验显示,缺氧24 h后,细胞核内p65的分布增加,而干扰LINC01116表达后,p65入核的细胞比例下降,与对照组相比,差异均具有统计学意义(P<0.05).结论 缺氧通过HIF-1途径诱导血管内皮细胞LINC011 16的表达增加;LINC01116可以通过调控p65入核,调节内皮细胞炎症分子的表达,参与介导缺氧血管内皮细胞炎症反应.
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编辑人员丨2023/8/6
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脑胶质瘤组织中lncRNA-LINC01116的表达变化及其意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 观察脑胶质瘤组织中长链非编码RNA (lncRNA)-LINC01116的表达变化,并探讨其意义.方法 脑胶质瘤组织95例份,正常脑组织21例份,采用实时荧光定量PCR法检测IncRNA-LINC0 1116;分析lncRNA-LINC01116表达与脑胶质瘤临床病理特征及患者预后的关系.结果 脑胶质瘤、正常组织IncRNA-LINC01116的相对表达量分别为0.665±0.678、0.103 ±0.147,两者比较,P<0.05.lncRNA-LINC01116仅与脑胶质瘤患者临床病理分级有关(P<0.05),而与患者年龄、性别、是否发生脑积水、病理类型、肿瘤直径、术前KPS评分、侵犯脑叶数目无关(P均>0.05).按照lncRNA-LINC01116相对表达量的平均数0.665为界,将95例患者分为低表达者41例和高表达者54例,低表达者生存率为73.17% (30/41)、生存时间为(100.30-6.91)个月,高表达者生存率为31.48% (17/54)、生存时间为(43.90 ±5.92)个月,两者比较,P均<0.05;低表达者复发率为31.71%(13/41),高表达者复发率为74.07% (40/54),两者比较,P<0.05.结论 脑胶质瘤组织中lncRNA-LINC01116表达升高,其表达与临床病理分级及患者预后相关;lncRNA-LINC01116有望成为脑胶质瘤的病理诊断、预后的肿瘤标记物.
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编辑人员丨2023/8/6
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脑胶质瘤LINC01116的高表达及其促进瘤细胞的恶性增殖
编辑人员丨2023/8/5
研究脑胶质瘤LINC01116高表达的临床价值及其促进瘤细胞的恶性增殖.通过GEO及TCGA数据库分析筛选出差异基因,利用TCGA临床数据分析LINC01116表达水平与脑胶质瘤病人预后的关系.qRT-PCR检测LINC01116在脑胶质瘤和非瘤脑组织中的表达,分析与临床病理资料的相关性.qRT-PCR检测LINC01116在U251、Ln229、U87和SVG细胞系中的表达;构建LINC01116干扰序列和真核pcDNA3.1(-)为载体的过表达质粒.在U251细胞系中,下(和上)调、Ln229和U87细胞系中下调LINC01116表达,进行CCK8、克隆形成、EDU实验检测其对瘤细胞增殖能力的影响.通过给免疫缺陷裸鼠皮下注射U87细胞,观察下调LINC01116表达水平后对体内胶质瘤生长的影响.GEO及TCGA数据分析示:LINC01116在脑胶质瘤中显著高表达(P<0.01).生存分析提示,LINC01116表达越高越不利于病人的生存;qRT-PCR结果提示,LINC01116在脑胶质瘤中的表达显著高于非瘤脑组织,结果具有统计学意义(P<0.01);脑胶质瘤临床病理级别越高,组织类型恶性度较高,LINC01116表达越高,结果具有统计学意义(P<0.01).细胞水平qRT-PCR结果显示:LINC01116在U251、Ln229、U87细胞系中表达显著高于SVG细胞系,结果具有统计学意义(P<0.01);干扰U251、Ln229和U87细胞中LINC01116的表达后,进行CCK8、克隆形成、EDU实验显示:敲低LINC01116的表达抑制胶质瘤细胞的增殖能力,结果具有统计学意义(P<0.05);裸鼠成瘤结果显示:敲低LINC01116表达,裸鼠皮下瘤体生长减缓,重量及体积均较对照组下降,结果具有统计学意义(P<0.01);qRT-PCR检测瘤体LINC01116的表达显示:敲低组LINC01116表达明显下降,与对照组相比有统计学意义(P<0.01).U251系细胞中过表达LINC01116后进行CCK8、克隆形成、EDU实验显示:LINC01116过表达促进胶质瘤细胞的增殖,结果具有统计学意义(P<0.05).综上所述,LINC01116在脑胶质瘤中高表达,其临床病理级别与LINC01116表达量正相关;细胞水平及裸鼠成瘤提示,LINC01116促进脑胶质瘤细胞的恶性增殖,促进瘤细胞的发生发展.LINC01116可能为未来临床治疗脑胶质瘤的病理诊断和分子药物治疗提高新的候选位点.
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编辑人员丨2023/8/5
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木香烃内酯通过调控LncRNA LINC01116/miR-9-5p的表达来减轻过氧化氢诱导的大鼠脑微血管内皮细胞损伤
编辑人员丨2023/8/5
目的探讨木香烃内酯(Cos)对过氧化氢(H2O2)诱导的大鼠脑微血管内皮细胞的氧化应激、凋亡的影响及其对长链非编码RNA LINC01116(LncRNA LINC01116)/微小RNA-9-5p(miR-9-5p)的调控作用.方法原代分离培养大鼠脑微血管内皮细胞,并随机分成Con组、H2O2组、Cos-L组、Cos-M组、Cos-H组、Cos-H+pcDNA组、Cos-H+pcDNA-LINC01116组;采用化学比色法检测丙二醛(MDA)、还原型谷胱甘肽(GSH)的水平及超氧化物歧化酶(SOD)的活性;流式细胞术检测细胞凋亡率;实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测LINC01116、miR-9-5p的表达水平;双荧光素酶报告实验验证LINC01116与miR-9-5p的靶向关系;蛋白免疫印迹法(Western blot)检测B淋巴细胞瘤-2相关蛋白(Bax)、B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)的表达水平.结果H2O2处理后MDA的水平显著升高(P<0.05),GSH水平与SOD活性显著降低(P<0.05),细胞凋亡率显著升高(P<0.05),Bax蛋白水平显著升高(P<0.05),Bcl-2蛋白水平显著降低(P<0.05),LINC01116的表达水平显著升高(P<0.05),miR-9-5p的表达水平显著降低(P<0.05);Cos处理后MDA的水平显著降低(P<0.05),GSH水平与SOD活性显著升高(P<0.05),细胞凋亡率显著降低(P<0.05),Bax蛋白水平显著降低(P<0.05),Bcl-2蛋白水平显著升高(P<0.05),LINC01116的表达水平显著降低(P<0.05),miR-9-5p的表达水平显著升高(P<0.05),且Cos-L组、Cos-M组、Cos-H组上述指标的水平比较均有明显差异(P<0.05);双荧光素酶报告实验证实LINC01116可靶向结合miR-9-5p;LINC01116过表达可减弱木香烃内酯对H2O2诱导的大鼠脑微血管内皮细胞凋亡及氧化应激的作用.结论木香烃内酯可能通过抑制LINC01116的表达及促进miR-9-5p的表达来抑制H2 O2诱导的大鼠脑微血管内皮细胞的氧化应激及细胞凋亡,从而减轻细胞损伤.
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编辑人员丨2023/8/5
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LINC06靶向miR-9-5p调控结直肠癌细胞对奥沙利铂的耐药性
编辑人员丨2023/8/5
目的:研究LINC01116对结直肠癌细胞奥沙利铂耐药性的调控作用,并探讨其分子机制.方法:用2.5、5、10、20、40、80μmol/L浓度奥沙利铂处理亲本HCT-8细胞及HCT-8/L-OHP细胞.细胞计数试剂盒(CCK-8)检测细胞活力,计算半数抑制浓度(IC50).实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测HCT-8、HCT-8/L-OHP细胞中LINC01116和miR-9-5p的表达水平.将HCT-8/L-OHP细胞分为L-OHP+si-NC、L-OHP+si-LINC01116、L-OHP+miR-NC、L-OHP+miR-9-5p、L-OHP+si-LINC01116+anti-miR-NC和L-OHP+si-LINC01116+anti-miR-9-5p组,CCK-8法和流式细胞术分别检测细胞活力和凋亡.双荧光素酶报告基因实验和RT-qPCR确定LINC01116与miR-9-5p之间调控关系.结果:与亲本HCT-8细胞比较,HCT-8/L-OHP细胞显示出较强的奥沙利铂耐受性(P<0.05).与L-OHP+si-NC组比较,抑制LINC01116表达可显著提高奥沙利铂作用下HCT-8/L-OHP细胞凋亡率和增殖抑制率(P<0.05).与L-OHP+miR-NC组比较,miR-9-5p过表达可显著提高奥沙利铂作用下HCT-8/L-OHP细胞凋亡率和增殖抑制率(P<0.05).LINC01116靶向负性调控miR-9-5p表达.抑制miR-9-5p表达可逆转抑制LINC01116对奥沙利铂作用下HCT-8/L-OHP细胞增殖和凋亡的影响(P<0.05).结论:抑制LINC01116表达可降低HCT-8/L-OHP细胞对奥沙利的耐药性,其机制与靶向调控miR-9-5p表达有关.
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编辑人员丨2023/8/5
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LINC01116靶向miR-203加剧氧糖剥夺/复氧诱导下人海马星形胶质细胞损伤
编辑人员丨2023/8/5
目的 明确长基因间非编码RNA 1116(LINC01116)在急性缺血性脑卒中(AIS)海马星形胶质细胞中的作用及分子机制.方法 利用实时荧光定量PCR检测131例AIS患者溶栓前后血清中LINC01116与miR-203表达.采用双荧光素酶报告基因与RNA结合蛋白免疫沉淀试验检测LINC01116对miR-203的调控作用.以人海马星形胶质细胞(hHA)建立氧糖剥夺/复氧(OGD/R)模型并给予LINC01116干扰与LINC01116联合miR-203干扰处理,采用CCK-8、TUNEL与蛋白质印迹、活性氧(ROS)试验、乳酸脱氢酶(LDH)试验及酶联免疫吸附试验分别检测细胞增殖、细胞凋亡、ROS生成、LDH活性及炎症因子的变化.结果 溶栓后血清中LINC01116与miR-203的表达分别高于与低于溶栓前,且LINC01116与miR-203表达呈负相关(P<0.05).LINC01116海绵吸附miR-203并抑制其表达(P<0.05).LINC01116干扰减轻OGD/R诱导下hHA细胞损伤,表现为细胞增殖能力提高,细胞凋亡率下降,激活型caspase-3与Bax蛋白表达降低而Bcl-2蛋白表达升高,ROS生成减少,LDH活性下降,TNF-α、IL-1β及IL-6浓度下调而IL-4、IL-10及IL-13浓度上调(P<0.05).miR-203干扰逆转LINC01116干扰对OGD/R诱导下hHA细胞损伤的保护作用(P<0.05).结论 LINC01116靶向miR-203促进OGD/R诱导下hHA细胞损伤,表明LINC01116/miR-203通路可能是AIS的潜在治疗靶点.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于坏死性凋亡相关长链非编码RNA构建肝细胞癌预后模型及药物治疗反应分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 使用坏死性凋亡相关长链非编码RNA(NRLs)构建肝细胞癌(HCC)预后模型并分析不同风险组间药物敏感性差异,为HCC病人预后预测和临床个体化治疗提供理论依据.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载HCC病人的RNA测序数据和临床信息.采用共表达网络分析鉴定NRLs.使用单变量Cox回归和LASSO-Cox回归构建预后模型,并在测试集和整个集合中进行验证.运用生存分析、受试者操作特征(ROC)曲线、临床病理分层相关性分析、多变量Cox回归、列线图和校准曲线来评估预后模型.随后,采用基因集富集分析(GSEA)不同风险群体间生物过程和功能的差异.使用单样本基因集富集分析(ssGSEA)来探讨不同风险群体与肿瘤免疫、浸润之间的关系,并采用Pearson相关分析HCC病人预后特征与免疫检查点表达的相关性.最后,使用药物敏感性分析20种化疗药物在不同风险群体中的IC50值.结果 构建了由4个NRLs(ZFPM2-AS1、MKLN1-AS、LINC01116、AP003390.1)组成的风险评分(NRLs risk-Score)预后特征,并根据风险评分中位值将病人划分为高风险组和低风险组.生存分析表明,NRLs低风险组的总生存期(OS)显著高于高风险组;与临床病理特征相比,NRLs risk-Score具有更高的诊断效率,受试者操作特征曲线下面积(AUC)为0.74;临床病理变量分层生存分析表明,高风险组病人OS显著低于低风险组;多变量Cox结果显示,分期(Stage)和NRLs risk-Score可作为HCC病人的独立预后因子,结合临床病理学特征和NRLs risk-Score的列线图显示出较好的预测性能.GSEA分析表明,癌症相关通路主要在高风险组中富集.ssGSEA结果显示,NRLs预测特征与HCC病人的免疫状态显著相关.免疫检查点分析结果显示,高风险组病人的免疫检查点表达较高,表明可能受益于检查点阻滞剂免疫疗法的高风险组HCC病人中免疫功能更为活跃.化疗药物敏感性分析结果显示,16种化疗药物的IC50值在高低风险组间存在差异.结论 4个NRLs的风险特征有助于评估HCC病人预后和分子特征,可用于进一步优化HCC的个性化治疗和管理策略.
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编辑人员丨2023/8/5
