目的:验证全基因组关联分析所发现的7个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms，SNPs)，包括rs13278062( TNFRSF10A)、rs3750846( ARMS2-HTRA1)、rs429358( APOE)、rs5817082( CEPT)、rs2043085( LIPC)、rs1626340( TGFBR1)以及rs8135665( SLC16A8)与四川汉族人群年龄相关性黄斑变性(age-related macular degeneration，AMD)的相关性。 方法:采用病例-对照研究，用飞行质谱对576例湿性AMD患者和572例健康对照进行SNPs分型并通过Sanger测序进行验证。在两组各SNP位点基因型分布均满足Hardy-Weinberg平衡的前提下，分析各位点的遗传模式，并比较其等位基因与基因型频率的分布。结果:TNFRSF10A rs13278062在杂合子模型( P＝0.000， OR＝1.529，95% CI＝1.196-1.954)和显性模型( P＝0.002， OR＝1.459，95% CI＝1.154-1.865)下在两组之间存在显著的差异。 结论:TNFRSF10A rs13278062在杂合或显性模式下与AMD相关，携带rs13278062GT和rs13278062TT+GT的个体更容易患AMD。

目的:系统评价人类肝脂肪酶( LIPC)基因rs10468017多态性与年龄相关性黄斑变性(AMD)易感性的关系。 方法:计算机检索英文数据库(PubMed、Embase、EBSCO、Web of Knowledge、Cochrane图书馆)及中文数据库(中国知网、万方数据、维普、中国生物医学文献数据库)自建库起至2019年12月31日关于 LIPC基因rs10468017多态性位点与AMD研究的文献。采用Stata 12.0软件计算等位基因模型(T和C)、杂合子模型(TC和CC)及纯合子模型(TT和CC)3种遗传模型下该多点性位点和AMD相关性的比值比( OR值)及95%置信区间( CI)，并进一步按AMD类型和种族进行亚组分析，分别计算 OR值及95% CI，进行Meta分析。 结果:本研究共纳入21篇文献，包括AMD患者25 649例和正常对照人群26 294例。Meta分析结果显示，rs10468017多态性的T等位基因与AMD发生风险显著相关(T vs. C： OR＝0.83，95% CI：0.80～0.87；TC vs. CC： OR＝0.82，95% CI：0.75～0.90；TT vs. CC： OR＝0.65，95% CI：0.56～0.76)。亚组分析结果显示，rs10468017多态性与早期AMD( OR＝0.87，95% CI：0.78～0.96)、晚期AMD( OR＝0.83，95% CI：0.77～0.88)、地图样萎缩( OR＝0.79，95% CI：0.72～0.87)及脉络膜新生血管( OR＝0.83，95% CI：0.78～0.89)均相关。进一步对种族进行分层分析显示，高加索人群中T等位基因与AMD相关(早期AMD： OR＝0.77，95% CI：0.67～0.89；晚期AMD： OR＝0.80，95% CI：0.75～0.87)，亚洲人群中T等位基因与AMD无显著相关性(早期AMD： OR＝0.98，95% CI：0.85～1.13；晚期AMD： OR＝0.93，95% CI：0.81～1.06)。 结论:rs10468017多态性的T等位基因与AMD显著相关，可降低AMD的发生风险，虽然这种相关性存在于AMD的各个表型中，但是存在一定的种族差异。

目的:对一个家族性高胆固醇血症样表型（FHLP）家系的易感基因突变位点进行鉴定，并分析蛋白三维结构。方法:该研究为病例系列研究。病例来源于北京安贞医院2019年4月4日门诊收治的一疑似家族性高胆固醇血症家系。通过全外显子测序，对先证者进行易感基因突变位点筛查，采用聚合酶链式反应对先证者亲属进行突变位点验证。通过Discovery Studio 4.0和PyMoL 2.0软件对突变前后蛋白的结构与功能进行分析和预测。结果:该家系患者表现为以总胆固醇（TC）升高为主要特征的血脂异常。易感基因筛查结果显示先证者及其父亲和弟弟在突变脂肪酶C（LIPC）基因的第8外显子存在一个杂合单核苷酸多态性位点LIPC：c.1330C>T，导致LIPC蛋白序列第444位的精氨酸（Arg）被半胱氨酸（Cys）替代（Arg444Cys）。该家系中携带该突变的成员表现为TC升高，而未携带该突变的先证者母亲血脂正常，提示LIPC：c.1330C>T可能是易感基因突变位点。蛋白质功能预测提示该突变主要影响其配体结合功能，对催化功能影响有限。结论:LIPC：c.1330C>T是新的FHLP易感基因突变位点。

目的:观察渗出型老年性黄斑变性（wAMD）患者负荷抗血管内皮生长因子（VEGF）药物治疗反应与单核苷酸多态性（SNP）基因型的关系。方法:回顾性临床研究。2019年8月至2020年9月在天津医科大学眼科医院检查确诊的wAMD患者103例103只眼纳入研究。其中，男性59例（57.28%，59/103），女性44例（42.72%，44/103 ）；平均年龄（68.74±7.74）岁。采用标准对数视力表检测患眼BCVA，统计时换算为最小分辨角对数（logMAR）视力。采用光相干断层扫描（OCT）检测患眼黄斑中心凹视网膜厚度（CRT）。同时检测患者的高密度脂蛋白胆固醇（HDL-C）。所有患眼均行玻璃体腔注射抗VEGF药物治疗，每月1次，连续3个月。初次治疗前，采集患者外周静脉血，质谱法检测白细胞介素-8 （ IL-8）、补体C3基因（ C3）、补体因子H （ CFH）、肝脂肪酶（ LIPC）、胆固醇脂蛋白转移酶（ CETP）、三磷酸腺苷结合盒亚家族A成员1（ ABCA1）、脂蛋白脂肪酶（ LPL）、脂肪酸去饱和基因簇（ FADS1 ）的SNP。按照基因频率将基因型分为野生型和突变型。临床表型中各基因型分布的频率差异和基因型分布的Hardy-Weinberg平衡等定性数据比较行 χ2检验或Fisher确切检验。 结果:IL-8 rs4073突变型（TA+AA）患者中CRT有反应者较野生型（TT）少[比值比（ OR）=0.310，95%可信区间（ CI）0.106~ 0.910， P<0.05）。其中药物分层检验后，康柏西普治疗组中 IL-8 rs4073位点TT基因型患者CRT无反应者占比更少（ OR=0.179，95% CI =0.034~ 0.960， P=0.033）。 LIPC rs2043085突变型（CT+TT）患者中BCVA提高≥0.2 logMAR单位者较野生型（CC）可能性更高（ OR=3.031，95% CI 1.036~ 8.867， P<0.05）；HDL-C水平显著低于野生型（CC），差异有统计学意义（ t=2.448， P=0.016）。 IL-8 rs4073、 LIPC rs2043085突变型和野生型患者治疗前logMAR BCVA、CRT比较，差异无统计学意义（ IL-8 rs4073： Z=-0.198、-1.651， P=0.843、0.099； LIPC rs2043085 ： Z=-0.532、-0.152， P=0.595、0.879）。 C3 rs 225066、 CFH rs800292、 CETP rs708272、 ABCA1 rs1883025、 FADS1 rs174547、 LPL rs12678919与抗VEGF药物治疗反应无相关性。 结论:wAMD患者负荷抗VEGF药物治疗， IL-8 rs4073位点A基因型者可能对CRT反应性更差； LIPC rs2043085位点T基因型者可能对BCVA反应性相对更好。

目的 探讨马兜铃酸Ⅰ(AAⅠ)致小鼠急性肝损伤的分子机制.方法 雄性C57BL/6小鼠15只,随机分为正常组(n=6)和处理组(n=9).处理组小鼠以AAⅠ20 mg/kg剂量腹腔注射,连续5 d,第6天处死、取材.检测血清ALT、AST,HE染色观察肝组织学变化;两组各随机选择3例肝组织样本提取RNA进行高通量转录组测序.通过生物信息学分析和功能预测筛选出表达显著的差异基因;再采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对部分差异基因进行验证.计量资料两组间差异比较采用t检验.结果 与正常组比较,处理组ALT、AST水平明显升高(t值分别为4.331、4.947,P值均<0.01);处理组肝组织HE染色可见肝小叶结构紊乱,小叶内见点状坏死.通过筛选条件[logFC>2倍且P<0.05]获得差异基因共计1352个,其中上调基因703个,下调基因649个.对这些差异性表达的基因进行GO和KEGG富集分析(P<0.05),小分子分解代谢、中性粒细胞参与的免疫应答、分泌颗粒细胞质囊泡腔、细胞质囊泡腔、细胞外结构组织、细胞外基质组织等相关的GO分类呈显著富集;化学致癌、视黄醇代谢、花生四烯酸代谢、类固醇激素合成、癌症中的转录失调、蛋白质消化和吸收、炎症介质对TRP通道的调节、药物代谢、补体和凝血级联、谷胱甘肽代谢、PPAR信号通路等在KEGG通路中显著富集.聚类分析发现明显下调基因包括Srd5a1、Lipc、Aqp8、Hba-a1、Slco1a1、Pklr等,采用qRT-PCR得以证实(P值均<0.05).结论 AAⅠ有明显急性肝毒性,其毒性主要涉及化学致癌、视黄醇代谢、花生四烯酸代谢、类固醇激素合成、癌症中的转录失调等环节.

目的 探讨信号蛋白3A(Sema3A)对成肌细胞功能的影响及其转录调控机制.方法 以1.0、0.1、0.01μg/ml重组Sema3A蛋白作用成肌细胞,并设置对照组,采用动态活细胞成像及划痕实验检测细胞的增殖与迁移能力,RT-qPCR检测成肌分化因子的表达.对1.0μg/ml重组Sema3A蛋白干预的成肌细胞及对照组细胞进行转录组测序,筛选差异表达基因并进行GO富集分析,对部分差异表达基因通过RT-qPCR进行转录水平验证.结果 IncuCyte细胞成像计数显示,Sema3A可促进成肌细胞增殖,其中1.0μg/ml Sema3A组细胞计数较对照组升高17.36％(P<0.001).划痕实验结果显示,Sema3A可使成肌细胞迁移能力明显增强,其中1.0μg/ml Sema3A组细胞划痕愈合率较对照组升高69.66％(P<0.001).RT-qRCR检测结果显示,Sema3A可上调部分成肌分化基因的表达,其中1.0μg/ml Sema3A可使Myf5、MyoG基因表达分别升高37.47％±11.67％(P<0.01)、26.57％±11.31％(P<0.05).生物信息学分析显示,Sema3A可上调成肌细胞转录组中的肌细胞与肌纤维发育、细胞与解剖结构成熟及成骨发育等相关功能通路,下调脂蛋白代谢与乳糜微粒等相关功能通路;RT-qPCR验证了富集通路中的部分差异表达基因,其中Prox1、Myh11表达分别升高22.48％±14.42％(P<0.05)、21.42％±5.81％(P<0.01),LipC、ApoC2表达分别降低23.08％±15.38％(P<0.05)、55.97％±26.51％(P<0.05).结论 外源性Sema3A蛋白可上调成肌细胞分化相关基因Myf5、MyoG的表达,且可能通过对骨骼肌发育、成熟与脂蛋白代谢等相关基因进行转录调控而促进成肌细胞的增殖、迁移.

本研究旨在基于加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选肝纤维化发生及发展过程中的关键基因及潜在机制.从GEO数据库获得肝纤维化患者全基因组芯片数据(GSE84044),采用WGCNA发掘与肝纤维化发生发展相关的重要模块及关键基因,通过GO注释和KEGG富集揭示潜在的关键机制.对肝纤维化患者基因组芯片数据进行WGCNA分析,22876个基因被分为8个模块,其中有两个模块与肝纤维化相关性较大,GO注释和KEGG富集的结果表明,这两个模块主要与细胞外基质和胶原蛋白的产生有关.分析WGCNA关键基因在肝纤维化4个时期的表达差异,结果发现,LIPC、DCN、LUM、COL1A1等10个基因呈现出明显变化趋势.本研究采用WGCNA对肝纤维化患者的基因芯片进行分析,挖掘肝纤维化发生发展过程中的重要基因,为肝纤维化预防与治疗提供生物标志物和潜在靶点的新筛选方向.