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MNX1基因突变在Currarino综合征中的研究现状与进展
编辑人员丨5天前
Currarino综合征是一种罕见的先天畸形,以骶骨、肛门直肠畸形与骶前肿物为典型表现,可伴多系统异常。根据患儿和成年患者的临床表型差异可分为完全型、轻型和微型。MNX1基因与Currarino综合征的发生密切相关。本文通过文献回顾,收集并分析145种MNX1致病变异携带者(297例)的临床表型及基因型信息,分析其临床特点及基因型-表型关联性。结果表明,Currarino综合征分型与突变位点的位置之间无明显关联,但累及MNX1基因的染色体变异携带者往往表型更重。突变位点的分布在MNX1基因的同源异形盒编码区内较为集中,这可能影响MNX1编码蛋白与特定下游靶基因的结合。罕见的MNX1纯合突变提示应关注Currarino综合征患儿的胰岛细胞功能。同一家系内携带相同MNX1突变的不同个体间表型差异大,提示存在其他调节因子。未来应在与MNX1存在显著相互作用蛋白的编码基因中继续寻找其他候选基因,重点关注参与胰腺、感觉器官发生、生殖结构发育等生物学过程的相关基因。
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编辑人员丨5天前
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MNX1在乳腺癌组织中的表达及功能研究
编辑人员丨5天前
目的:研究运动神经元和胰腺同源盒1( MNX1)在乳腺癌组织中的表达,通过构建 MNX1沉默的MDA-MB-231细胞株,检测 MNX1对乳腺癌细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭等生物学功能的作用。 方法:收集广西医科大学第一附属医院乳腺癌73例患者的73对乳腺癌组织和邻近正常组织进行回顾性研究,采用qRT-PCR检测 MNX1在组织和细胞中的相对表达,使用Western blotting检测组织中 MNX1的蛋白质水平。我们设计了 MNX1的 shRNA,构建了低表达的 MNX1病毒载体。病毒载体进一步用于感染三阴性乳腺癌细胞。设计沉默效果最好的 MNX1靶向沉默乳腺癌细胞株MDAMB-231作为沉默组( shMNX1),设计空载体慢病毒感染的阴性对照组(Control)以进行后续的细胞功能实验。采用CCK-8实验检测细胞增殖能力,Transwell实验检测细胞迁移和侵袭能力,用流式细胞仪检测细胞凋亡,每个实验至少有3次独立实验,正态分布的计量资料以均数±标准差( Mean± SD)表示,组间比较采用 t检验。 结果:qRT-PCR结果显示,在乳腺癌组织中 MNX1基因的表达水平高于癌旁组织( P<0.05)。Western blotting显示乳腺癌组织中 MNX1基因的蛋白表达水平明显高于邻近组织( P<0.01)。CCK-8实验结果显示,沉默组乳腺癌细胞在24、48和72 h的外径(450 nm)低于阴性对照组( P<0.05),可以认为沉默 MNX1基因可抑制乳腺癌细胞的增殖。Transwell结果显示,迁移实验中,沉默组和阴性对照组通过跨室的细胞数分别为217.00±33.23和490.00±45.56;侵袭实验中,沉默组和阴性对照组通过跨室的细胞数分别为91.00±12.79和419.00±49.37,可以认为沉默 MNX1基因可以抑制乳腺癌细胞株MDA-MB-231的迁移和侵袭能力。在流式细胞术检测细胞凋亡中,沉默组乳腺癌细胞凋亡率为(3.81±0.41)%,阴性对照组为(2.13±0.16)%。沉默组乳腺癌细胞凋亡率高于阴性对照组,说明沉默 MNX1基因促进乳腺癌细胞株MDA-MB-231的的凋亡。 结论:MNX1在乳腺癌组织中高表达,沉默 MNX1基因的表达抑制乳腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭,促进细胞凋亡。
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编辑人员丨5天前
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基于全转录组测序分析核糖核酸氧化影响胰岛β细胞的分子机制
编辑人员丨5天前
目的:探索高糖诱导核糖核酸氧化增加对胰岛β细胞功能和活性的影响及分子机制。方法:体外培养大鼠胰岛β细胞瘤INS-1细胞,高糖干预后同位素稀释超高效液相串联质谱(ID LC MS/MS)评估核酸氧化。利用8-氧代鸟苷-5'-三磷酸酯(8-oxoGTP)体外模拟INS-1细胞RNA氧化增加,CCK-8评估细胞增殖,流式细胞术评估细胞凋亡,实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)评估胰岛素(INS)、胰-十二指肠同源盒1(PDX1)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(Casp3)和半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶6(Casp6)基因信使RNA(mRNA)表达,全转录组测序分析RNA氧化影响INS-1细胞的分子机制。结果:高糖致INS-1细胞RNA氧化增加。RNA氧化增加抑制INS-1细胞增殖,降低INS和PDX1基因mRNA水平,促进凋亡相关casp3和casp6基因mRNA合成。全转录组测序分析发现,RNA氧化增加导致INS-1细胞内mRNA、长链非编码RNA(lncRNA)、微RNA(miRNA)和环状RNA(circRNA)差异表达,显著下调Mafa、Pdx1、Pax6和Mnx1转录因子,上调rno-miR-124-3p,rno-miR-133a-3p,rno-miR-3120,rno-miR-212-3p,rno-miR-7a-2-3p,促使相关lncRNAs差异表达,从而抑制胰岛素合成和分泌及β细胞增殖。结论:RNA氧化增加下调β细胞关键转录因子mRNAs水平,促使相关非编码RNA(ncRNA)特别是lncRNAs差异表达,影响β细胞胰岛素合成和分泌,抑制细胞增殖,是2型糖尿病(T2DM)β细胞功能障碍和活性降低的重要原因。
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编辑人员丨5天前
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Currarino综合征诊治和预后的研究进展
编辑人员丨2023/11/18
Currarino 综合征(CS)是一种罕见的常染色体显性遗传病,主要致病基因是MNX1,以骶骨发育不全、骶前肿物和肛门直肠畸形三联征为特征性表现,多变的临床表现是该病临床诊断的一大难点.充分了解CS患者的临床特点和并发症,有利于其及时诊断和有效治疗,从而改善患者的预后.现基于近年来关于CS遗传背景的探索,针对该疾病的流行病学、临床和影像学表现、手术治疗方式及预后进展进行综述,以加深临床医生对CS的认识,为该病的诊治提供新思路.
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编辑人员丨2023/11/18
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Currarino综合征基因研究进展
编辑人员丨2023/8/6
Currarino综合征是一种罕见的常染色体显性遗传病.其较低的发病率及多变的表现型已成为临床诊断的一大难点.科学研究者们发现运动神经元与胰腺同源基因(motor neuron and pancreas homeobox 1,MNX1)与Currarino综合征的发病存在密切关系.文章回顾了1996—2017年间关于Currarino综合征患者MNX1基因突变位点的报道,并综述了近年来Currarino综合征基因表型关系及新基因的探索.现阶段Currarino综合征的研究仍处于起始阶段且MNX1尚不能完全解释该病的发病机制.
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编辑人员丨2023/8/6
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乳腺癌相关长链非编码RNA的生物信息学分析
编辑人员丨2023/8/6
目的:应用生物信息学筛选乳腺癌基因芯片中差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)并探讨其在乳腺癌中的表达情况.方法:从美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)公共基因芯片数据平台(gene expression omnibus,GEO)下载乳腺癌lncRNA基因芯片数据集GSE33447,包含8对乳腺癌组织及其对应癌旁非肿瘤组织,采用R语言Limma函数包筛选乳腺癌差异表达的lncRNA,并用Benjamini&Hochberg错误发现率(false discovery rate,FDR)对原始P值进行多重矫正,采用NONCODE生物信息学网站对lncRNAs进行重新注释,采用starbase 2.0对差异表达的lncRNAs靶基因进行靶向预测,并进一步用DAVID数据库对靶基因进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和KEGG信号通路富集分析,最后分别选取3个高表达和3个低表达的lncRNA,采用qRT-PCR的方法验证其在乳腺癌组织中的表达.结果:与正常组织相比,乳腺癌中227个lncRNA存在明显差异表达(Fold change≥2.0,adj.P<0.05),其中135个lncRNA表达上调,92个lncRNA表达下调.采用NONCODE对227个差异表达的lncRNA重新注释后发现,47个lncRNA存在明显差异表达,其中17个lncRNA表达上调,30个lncRNA表达下调.通过GO和KEGG信号通路富集分析发现,差异表达的lncRNAs广泛地参与了基因的转录及转录后调控等生物学进程以及PI3K-Akt、Ras、TNF以及p53等信号通路.采用qRT-PCR的方法检测3个高表达(MNX1-AS1、MIAT、HOXA11-AS)和3个低表达(PGM5-AS1、LINC00908、AC226118.1)lncRNA的表达水平,发现乳腺癌组织中MNX1-AS1、MIAT和HOXA11-AS表达水平明显高于其癌旁非肿瘤对照组,而PGM5-AS1、LINC00908和AC226118.1在乳腺癌组织中的表达水平明显低于癌旁非肿瘤对照组(P值均<0.05),差异有统计学意义,其结果与基因芯片筛查结果一致.结论:使用生物信息学方法筛选乳腺癌相关的lncRNAs可能为乳腺癌新型肿瘤标志物的筛选提供新的策略.
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编辑人员丨2023/8/6
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Currarino综合征2例临床与遗传学分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨Currarino综合征患者的临床表现及运动神经元与胰腺同源框基因(motor neuron and pancreas homeobox 1 gene,MNX1基因)突变的特点.方法 利用染色体芯片技术对Currarino综合征患者进行全基因组水平微缺失/微重复检测,并复习文献比较相似基因型Currarino综合征患者的临床表型.结果 纳入2例Currarino综合征患者.例1,女,7d,因“反复呕吐”就诊,入院查体发现患者面容特殊,足月小样儿,视不追物,腹部胀气严重;患儿肛门狭窄,肠道造影提示中肠旋转不良;心脏彩超提示卵圆孔未闭或房间隔缺损;头颅超声提示颅内出血,骶尾椎磁共振成像(MRI)示脊髓栓系,骶尾椎发育畸形;染色体芯片技术检测发现7号染色体q36.1 q36.3区域缺失1个拷贝(7.89 Mb),14q32.33区域重复1个拷贝(2.20 Mb);患儿父母该区域未见异常.例2,女,1岁3个月,因“整体发育落后”就诊;患儿面容特殊,右眼上睑下垂,语言、运动均落后,肛门狭窄,MRI示隐性脊柱裂;染色体芯片技术检测发现7号染色体q35q36.3区域缺失1个拷贝(15.00 Mb).文献复习:MNX1基因所在的染色体区域缺失导致的Currarino综合征存在特殊面容、智力障碍及生长落后的特征,国内未见该类型的报道.结论 在国内首次报道了2例因染色体微缺失导致的Currarino综合征,丰富了临床医师对该病的认识.
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编辑人员丨2023/8/6
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乳腺导管原位癌浸润性进展相关基因的生物信息学研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 筛选介导乳腺导管原位癌(DCIS)浸润性进展的相关基因.方法 从美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共基因芯片(GEO)数据库下载含正常乳腺(NC)、DCIS和微小浸润乳腺癌(IBC)这3种类型样本的基因芯片;使用R软件包limma分析IBC与DCIS、DCIS与NC之间的差异表达基因;使用STEM软件对上述两组差异表达基因进行趋势分析,筛选出随着NC-DCIS-IBC的趋势表达水平逐渐变化的基因;对筛选出的差异表达的基因进行KEGG信号通路富集分析.结果 通过对差异基因的趋势分析,筛选出12个随着NC-DCIS-IBC的趋势表达显著下调的基因,以及10个显著上调的基因,其中运动神经元和胰腺同源盒1(MNX1)、基质金属蛋白酶1(MMP-1)可能为介导DCIS浸润性进展的相关基因.信号通路富集分析结果显示,磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)、黏附和细胞外基质/受体相互作用3个信号通路分子异常在DCIS发生及浸润性进展中均存在显著异常调控.结论 MNX1、MMP-1可能为介导DCIS浸润性进展的相关基因,PI3K/AKT信号通路可能参与介导MNX1/MMP-1促进DCIS浸润性进展.
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编辑人员丨2023/8/6
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Currarino综合征基因MNX1新突变位点分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 寻找Currarino综合征患儿在已知基因MNX1上的新发突变位点,探索新发突变对原基因与基因产物的结构及功能可能产生的影响,并以其影响为根据阐述Currarino综合征可能的发病机制.方法 抽取2014~2016年入院治疗的5例Currarino综合征患儿及其核心家属(患儿父母)的外周血液作为样本,应用高通量测序的方法,对5个家族的成员进行外显子测序,通过结果 分析,筛选出存在M NX1基因突变的个体,后针对存在M NX1基因突变的个体进行Sanger测序验证,对所得数据结果进行分析,并与已报道的关于Currarino综合征患儿中M NX1突变位点进行对比,寻找新的突变位点.结果根据测序与验证试验结果,我们发现了2种发生在外显子上的突变c.863N>T,c.723N>A,其中c.863N>T属于已报道过的突变类型,c.723N>A并未报道过,为新发位点.通过对MNX1基因结构的分析,由于c.723N>A位于基因同源结构域上游,且为终止密码子突变,故该突变的发生对于M NX1基因的功能会产生严重的影响.结论 目前对于Currarino综合征的基因研究还不能充分解释该病的发病机制,故在已发表的文献中尚无其下行信号传导通路实验及动物模型试验的相关报道,现阶段对于Currarino综合征的研究仍处于基因探索阶段,该综合征的研究仍任重而道远.
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编辑人员丨2023/8/6
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宫颈癌组织的MNX1-AS1水平及临床意义
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨宫颈癌组织的MNX1反义RNA 1(MNX1-AS1)水平及临床意义.方法 采用实时定量PCR检测本院2017年9月至2019年6月手术切除的107例宫颈癌组织和98例正常宫颈组织的MNX1-AS1水平,采用受试者工作特征(ROC)曲线评估组织MNX1-AS1水平诊断宫颈癌的效能,进一步分析MNX1-AS1水平与宫颈癌临床病理特征的关系.GEPIA分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中宫颈癌组织MNX1-AS1水平与预后的关系.结果 宫颈癌组织的MNX1-AS1水平为2.847±1.076,高于正常宫颈组织的1.182±0.712(P<0.05);ROC曲线结果 显示组织MNX1-AS1水平诊断宫颈癌的曲线下面积为0.906(95%CI:0.867~0.945),当以1.634为截断点时对应的约登指数最大,灵敏度和特异度分别为85.98%和79.59%.MNX1-AS1水平与宫颈癌患者的年龄、月经状态、肿瘤直径、病理类型和分化程度无关(P>0.05),而与FIGO分期、浸润深度和淋巴结转移有关(P<0.05),其中FIGO分期Ⅲ~Ⅳ期、T3~T4期及淋巴结转移的MNX1-AS1水平分别为3.188±0.907、3.427±0.817和3.219±0.902,均高于Ⅰ~Ⅱ期、浸润深度T1~T2期及淋巴结未转移的2.590±1.127、2.426±1.050和2.171±1.046(P<0.05).GEPIA在线分析显示MNX1-AS1水平与宫颈癌的总生存期和无病生存期均有关,其中MNX1-AS1高水平的预后较差风险分别是低水平的2.2和1.9倍(P<0.05).结论 宫颈癌组织的MNX1-AS1呈高表达,与宫颈癌的病情进展和预后有关,可能促进了宫颈癌病情进展,有作为宫颈癌诊治的潜能.
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编辑人员丨2023/8/5
