目的 C12ORF56(chromosome 12 open reading frame 56)是一个位于人染色体12长臂14.2区、且目前功能未知的新基因,在多种正常组织及包括肺癌在内的多种肿瘤中均有表达,但是C12ORF56在肺癌中的表达特征及功能尚不明确.在本研究中我们对C12ORF56在肺癌组织及细胞系中的表达及亚细胞定位特征、细胞生理功进行了探讨.方法 在ONCOMINE数据库中比较了正常组织和肺癌组织的C12ORF56 mRNA 的转录水平;并使用 LinkedOmics、Metas-cape、String 和GSEA等工具对C12ORF56及其关联的分子调控网络在肺癌病理过程中的潜在细胞生物学功能进行了预测;通过EdU和CCK-8法评估了特异性siRNA靶向敲降C12ORF56 mRNA对肺癌细胞系NCI-H1073增殖的影响;应用RT-qPCR检测肺癌细胞周期各阶段中C12ORF56的转录水平;采用Jaspar在线工具预测,并通过双荧光素酶报告基因系统明确了影响肺癌细胞系中C12ORF56基因转录的启动子核心区域.结果 相对于正常组织,C12ORF56转录本在肺癌组织、特别是在鳞状细胞肺癌中表达明显上调;靶向敲降C12ORF56明显抑制了肺癌细胞NCI-H1703的增殖.结论 C12ORF56转录水平在肺癌组织、特别是鳞状细胞肺癌组织中明显上调;上调的C12ORF56通过促进肿瘤细胞的增殖参与肺癌的发生和发展进程.

目的:研究CDK6和FOXM1在外周T细胞淋巴瘤（peripheral T-cell lymphoma，PTCL）组织中的表达情况，探讨其与患者临床病理特征及预后的关系。方法:利用Oncomine 4.5数据库分析PTCL组织中CDK6和FOXM1的表达水平；收集山西省肿瘤医院病理科2006年1月至2018年12月诊断的166例PTCL患者病历资料及存档石蜡标本，应用免疫组织化学（IHC）EnVision法检测166例PTCL组织中CDK6和FOXM1的蛋白表达水平，并以30例淋巴结反应性增生组织作为对照。结果:男性104例，女性62例，年龄3~85岁，平均年龄53岁。Oncomine 4.5数据库中的数据显示，PTCL组织中CDK6和FOXM1 mRNA的表达明显高于正常组织（ P<0.05）。PTCL组织中CDK6和FOXM1蛋白阳性表达率分别为27.7%（46/166）与80.7%（134/166），主要见于肿瘤细胞的细胞核，呈弥漫强阳性表达；在30例淋巴结反应性增生组织中CDK6和FOXM1蛋白阳性表达率分别为0（0/30)和30.0%（9/30），主要表达于淋巴滤泡生发中心，T区细胞不表达。PTCL组织中CDK6、FOXM1及两者蛋白共表达均与患者的Ann Arbor分期、国际预后指数（IPI）评分呈正相关（ P<0.05），与患者总生存期呈负相关（ P<0.05）。CDK6蛋白表达与FOXM1蛋白表达呈正相关（ P<0.05）。 结论:CDK6、FOXM1可能是诊断及治疗PTCL的新靶点。CDK6的过表达可能导致转录因子FOXM1功能增强，且CDK6及FOXM1的过表达作为不利因素促进了PTCL的发生发展。

目的:通过生物信息学方法筛选出参与肝细胞癌（HCC）进展的核心基因（Hub gene），探讨细胞周期蛋白B2（CCNB2）在HCC发生发展及预后中的潜在作用。方法:从GEO数据库中筛选并下载四个HCC相关数据集，用GEO2R分析数据并鉴定差异表达基因（DEGs）。利用DAVID数据库对DEGs进行GO分析，Cytoscape的ClueGO插件完成KEGG信号通路富集分析，并将DEGs导入STRING数据库建立蛋白相互作用（PPI）网络图，用Cytoscape对PPI网络进行可视化，构建关键模块（cluster）和筛选核心基因。分别使用UCSC数据库和UALCAN数据库完成核心基因在TCGA肝癌中的差异表达分析和生存分析。使用Firebrowse，Oncomine和UALCAN数据库分析核心基因在包括HCC在内的多个肿瘤中的表达。用实时荧光定量PCR（RT-qPCR）检测候选基因在HCC组织和肝癌细胞系中的表达水平。结果:从四个数据集中共鉴定了73个DEGs，包括15个上调基因和58个下调基因。KEGG信号通路富集分析显示DEGs主要富集于肿瘤相关通路。基于DEGs的PPI网络图,筛选了一个关键模块和10个核心基因。CCNB2与NCAPG在多个数据库的肝癌组织中均高表达。CCNB2与NCAPG呈正相关，被认为是与预后相关的关键基因（ P < 0.01）。RT-qPCR结果表明CCNB2在人肝癌组织和细胞系中高表达（ P < 0.01）。 结论:成功筛选出HCC相关的DEGs和核心基因，其中CCNB2在HCC中高表达且与患者生存预后相关，有望成为HCC诊疗和预后的生物标志物。

目的:探讨Toll样受体8（TLR8）在弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）中的表达及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:利用Oncomine数据库中的数据分析TLR8 mRNA在DLBCL肿瘤组织与正常淋巴细胞中的差异化表达情况，并在NCBI-GEO数据库的两个独立子集GSE 25638、GSE 32018中进行验证。采用OSDLBCL在线生存分析工具分析TLR8 mRNA相对表达水平与DLBCL患者总生存（OS）及无进展生存（PFS）的相关性。采用GSEA软件进行基因本体生物过程（GO_BP）富集分析。通过TIMER在线工具网站分析TLR8 mRNA表达与肿瘤免疫细胞浸润程度及免疫检查点相关分子表达的关系。选择2020年6月至2021年6月盐城市第一人民医院53例接受淋巴结活组织检查的DLBCL患者，采用免疫组织化学法检测TLR8蛋白表达情况，并分析其与患者临床病理特征的关系。结果:Oncomine与GEO数据库中数据分析结果显示，DLBCL、活化B细胞型DLCBL患者肿瘤组织中的TLR8 mRNA相对表达水平均高于正常淋巴细胞（均 P<0.001）。OSDLBCL在线生存分析结果显示，TLR8 mRNA高表达的DLBCL患者OS（ P=0.020）与PFS（ P=0.004）均较TLR8 mRNA低表达患者差。TLR8水平与免疫反应、细胞因子代谢及DNA损伤监测的功能异常有关；TIMER在线分析结果显示，TLR8 mRNA表达水平与中性粒细胞浸润程度（ r=0.78， P<0.001）及免疫抑制分子的表达[HAVCR2（ r=0.85， P<0.001）、LAG3（ r=0.63， P<0.001）、CD274（ r=0.77， P<0.001）、TIGIT（ r=0.32， P=0.037）、C10ORF54（ r=0.34， P=0.029）]呈正相关。53例DLBCL患者中，TLR8蛋白低表达29例（54.7%）、高表达24例（45.3%）。不同血清乳酸脱氢酶、β 2-微球蛋白水平的DLBCL患者TLR8蛋白表达差异均有统计学意义（均 P<0.05）。 结论:DLBCL患者TLR8高表达，TLR8可能是DLBCL预后的标志物。

目的:探讨环指蛋白181(RNF181)及Yes相关蛋白YAP(YAP)在三阴性乳腺癌中表达及其意义。方法:采用人类蛋白质图谱图像分类(Human Protein Atlas)数据库及Oncomine数据库分析RNF181在乳腺癌中的表达；采用Kmplot数据库分析RNF181与预后的关系；采用免疫组织化学方法检测123例三阴性乳腺癌标本中RNF181和YAP的表达，分析RNF181表达与临床病理特征及预后的关系；采用Cox回归分析影响三阴性乳腺癌的预后因素。结果:通过数据库分析发现RNF181在乳腺癌组织中呈高表达，三阴性乳腺癌患者的RNF181、YAP表达与预后呈负相关；123例三阴性乳腺癌中RNF181的阳性表达率[82.11%(101/123)]明显高于相对应癌旁组织中的阳性表达[25.2%(31/123， χ2＝80.104， P<0.01]。RNF181在TNM Ⅲ、Ⅳ期中表达高于TNM Ⅰ、Ⅱ期( χ2＝4.386， P<0.05)；组织学Ⅲ级中RNF181的表达高于Ⅰ、Ⅱ级( χ2＝6.149， P<0.05)；RNF181在有淋巴结转移的组织中的表达高于无淋巴结转移( χ2＝5.617， P<0.05)；p53阳性的患者RNF181蛋白表达高于阴性的患者( χ2＝4.754， P<0.05)；RNF181的表达与细胞核增殖抗原Ki-67表达呈正相关( χ2＝4.236， P<0.05)；采用Kaplan-Meire法绘制生存曲线并行Log-rank检验发现RNF181表达与患者预后呈负相关( P<0.05)；单因素分析结果显示RNF181是影响预后的因素之一( P<0.05)；123例三阴性乳腺癌中RNF181表达与YAP表达呈正相关( R＝0.348， P<0.01)。 结论:RNF181在三阴性乳腺癌中表达增高，并与TNBC患者的TNM分期、腋窝淋巴结转移、p53表达、Ki-67表达等临床病理特征明显相关，是影响TNBC预后的因素之一。RNF181与YAP表达呈正相关，可能通过YAP发挥作用。

目的:分析三阴性乳腺癌(TNBC)与非三阴性乳腺癌(non-TNBC)的基因表达谱，寻找可能参与TNBC发生发展的差异表达基因(DEGs)。方法:从GEO数据库下载4个mRNA芯片数据集进行分析，获得基因表达谱。通过STRING和Cytoscape构建了DEGs的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络，并筛选出核心基因。京东基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)用于功能富集分析。使用UCSC、Oncomine和Kaplan-Meier在线网站来分析核心基因的表达和生存水平。结果:在TNBC和non-TNBC中共识别出287个DEGs和10个核心基因。Kaplan-Meier生存曲线显示，TNBC患者表皮生长因子受体(EGFR)高表达或ESR1、胰岛素样生长因子(IGF)-1低表达与更差预后相关。Non-TNBC患者的预后特征与TNBC患者差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:ESR1、EGFR和IGF-1可能导致TNBC的不良预后与复发。

Background::Aurora kinases (AURKs) family plays a vital role not only in cell division but also in tumorigenesis. However, there are still rare systematic analyses of the diverse expression patterns and prognostic value of the AURKs family in breast cancer (BC). Systematic bioinformatics analysis was conducted to explore the biological role, prognostic value, and immunologic function of AURKs family in BC. Methods::The expression, prognostic value, and clinical functions of AURKs family in BC were evaluated with several bioinformatics web portals: ONCOMINE Gene Expression Profiling Interactive Analysis, Kaplan-Meier plotter, cBioPortal, Metascape, GeneMANIA, and LinkedOmics; and the result was verified using human tissues. Results::The expression of AURKA and AURKB were upregulated in BC in subgroup analyses based on tumor stage (all P < 0.05). BC patients with high AURKA and AURKB expression had a worse overall survival, relapse-free survival, and distant metastasis-free survival (all P < 0.05). Verification experiment revealed that AURKA and AURKB were upregulated in BC ( P < 0.05). AURKA and AURKB were specifically associated with several tumor-associated kinases (polo-like kinase 1 and cyclin-dependent kinase 1), miRNAs (miR-507 and miR-381), and E2F transcription factor 1. Moreover, AURKA and AURKB were correlated with immune cell infiltration. Functional enrichment analysis revealed that AURKA and AURKB were involved in the cell cycle signaling pathway, platinum drug resistance signaling pathway, ErbB signaling pathway, Hippo signaling pathway, and nucleotide-binding and oligomerization domain-like receptor signaling pathway. Conclusions::Aurora kinases AURKA and AURKB could be employed as novel prognostic biomarkers or promising therapeutic targets for BC.

目的:分析lncRNA NPIPA9在前列腺癌组织中的相对表达量，通过过表达lncRNA NPIPA9检测miR-210-3p的相对表达量及对前列腺癌细胞生长和迁移的影响。方法:通过Oncomine数据库分析lncRNA NPIPA9在前列腺癌组织中的相对表达量。实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测lncRNA NPIPA9在前列腺癌细胞株DU-145、PC-3、C4-2B、22Rv1、LNCaP和正常前列腺上皮细胞RWPE-1中的相对表达量。体外培养前列腺癌PC-3细胞，分为两组：NPIPA9组和对照组，NPIPA9组转染100 nmol/L lncRNA NPIPA9载体，对照组转染100 nmol/L对照载体。CCK-8法检测PC-3细胞的增殖活力。Transwell实验检测PC-3细胞的迁移能力。生物信息学技术预测lncRNA NPIPA9的潜在靶点。双荧光素酶报告基因实验确定lncRNA NPIPA9和miR-210-3p的靶向结合关系。RT-qPCR检测lncRNA NPIPA9对前列腺癌细胞中miR-210-3p相对表达量的影响。Western blotting法检测lncRNA NPIPA9对前列腺癌细胞中核因子κB(NF-κB)通路蛋白表达量的影响。计量资料以均数±标准差( ± s)表示，两组间比较采用 t检验，多组间比较采用单因素方差分析。 结果:前列腺癌组织中lncRNA NPIPA9相对表达量低于癌旁组织，差异具有统计学意义( P<0.01)。前列腺癌细胞株中lncRNA NPIPA9相对表达量均低于RWPE-1细胞，差异具有统计学意义( P<0.01)；前列腺癌PC-3细胞中lncRNA NPIPA9相对表达量最低，差异具有统计学意义( P<0.01)。与对照组相比，lncRNA NPIPA9对前列腺癌PC-3细胞活力具有抑制作用，差异具有统计学意义( P<0.05)。对照组和NPIPA9组PC-3细胞迁移数目分别为(101.70 ± 8.63)、(45.97 ± 8.83)个，lncRNA NPIPA9对PC-3细胞迁移具有抑制作用，差异具有统计学意义( P<0.01)。lncRNA NPIPA9可以直接靶向结合miR-210-3p，差异具有统计学意义( P<0.01)。对照组和NPIPA9组PC-3细胞中miR-210-3p相对表达量分别为5.32±0.79和1.11±0.56，lncRNA NPIPA9可直接下调PC-3细胞中miR-210-3p表达，差异具有统计学意义( P<0.01)。与对照组相比，lncRNA NPIPA9能够降低PC-3细胞中NF-κB通路蛋白c-Myc、MMP-9、VEGF、p65、p50表达。 结论:lncRNA NPIPA9在前列腺癌组织中表达下调，其通过靶向并负调控miR-210-3p，降低前列腺癌PC-3细胞的增殖和迁移能力。

目的:探讨Achaete Scute同源物2(ASCL2)基因在消化系统肿瘤中的表达及临床意义。方法:通过检索基因表达谱数据动态分析(GEPIA)数据库2017年1月至2021年1月筛选出胃癌与结直肠癌均显著变化的ASCL2基因。通过肿瘤免疫估计资源(TIMER)数据库分析ASCL2在各类肿瘤中相对于正常组织的表达水平。利用GEPIA数据库评估ASCL2对消化系统肿瘤临床预后的影响，并通过TIMER数据库研究了ASCL2与癌细胞免疫浸润的相关性。通过cBioportal网站对ASCL2共表达的错配修复基因进行相关性分析。结果:神经肽S受体1(NPSR1)、棕榈油酰蛋白羧酸酯酶(NOTUM)、RP11-400N13.2及ASCL2是胃癌、结肠癌与直肠癌共有的与正常组织比较表达差异最显著的4个基因。ASCL2在结肠腺癌、食管腺癌、直肠腺癌及胃腺癌等多数肿瘤中显著高于癌旁组织(0.61±0.03、0.56±0.02、0.67±0.04、0.59±0.03比0.14±0.01)，差异有统计学意义( P<0.05)。ASCL2高表达的食管腺癌患者预后差[总生存期：风险比( HR)＝1.6， P<0.05；无病生存期： HR＝1.6， P<0.05]。cBioportal数据库分析结果显示ASCL2基因表达与错配修复基因MLH1( rs＝0.17， P<0.05)和PMS2( rs＝0.30， P<0.05)的表达均呈正相关。ASCL2表达与结直肠腺癌肿瘤纯度呈正相关( r＝0.237， P<0.05)，与结肠腺癌中B细胞( r＝-0.159， P<0.05)、CD8 +T细胞( r＝-0.468， P<0.05)、巨噬细胞( r＝-0.115， P<0.05)、中性粒细胞( r＝-0.340， P<0.05)和树突状细胞( r＝-0.351， P<0.05)的浸润水平呈负相关，在直肠腺癌中与肿瘤纯度呈正相关( r＝0.260， P<0.05)，与CD8 +T细胞( r＝-0.431， P<0.05)、中性粒细胞( r＝-0.305， P<0.05)和树突状细胞( r＝-0.186， P<0.05)的浸润水平呈负相关。 结论:ASCL2在消化系统肿瘤组织中呈高表达状态且抑制消化系统肿瘤患者机体免疫，与其预后密切相关。

目的:基于Oncomine数据库的基因信息，探讨肝细胞生长因子（HGF）在多发性骨髓瘤（MM）中的表达及作用机制。方法:收集Oncomine数据库中关于HGF研究的信息，对MM中HGF的表达水平变化进行分析。应用Genecards数据库收集与HGF基因相关的蛋白，并通过STRING软件绘制HGF相关蛋白网络图，应用DAVID在线工具分析蛋白功能富集的生理过程。通过DRUGSURV数据库及其在线工具分析HGF表达水平与MM患者生存间的关系，探讨其临床意义。结果:Oncomine数据库中共检索到445项不同肿瘤中关于HGF的研究；其中23项研究显示肿瘤组织与正常组织间HGF表达水平差异有统计学意义（ P<0.05），包括肿瘤组织HGF表达增高10项，表达降低13项。Oncomine数据库中关于MM和正常组织HGF基因差异表达3项研究的4个数据集中，HGF在MM组织中的表达水平均高于正常组织（均 P<0.05）。通过Genecards数据库收集到SDC1、YWHAG、RAF1等25个与HGF相关的蛋白；蛋白功能富集分析显示，这些蛋白主要富集在过氧化氢介导的程序性细胞死亡的负调控、突触可塑性调节、死亡域受体对外源性凋亡信号通路的负调控等过程中，与PI3K-AKT及肿瘤相关通路有关。基于DRUGSURV数据库进行的生存分析显示，HGF高表达和低表达的MM患者总生存率差异无统计学意义（ P>0.05）。 结论:HGF基因可能通过PI3K-AKT通路调节MM细胞的凋亡，在MM的发生、发展中发挥作用。HGF可能是一个潜在的MM标志物，但其在预后判断中的价值需要进一步研究论证。