目的:通过生物信息学方法筛选出参与肝细胞癌（HCC）进展的核心基因（Hub gene），探讨细胞周期蛋白B2（CCNB2）在HCC发生发展及预后中的潜在作用。方法:从GEO数据库中筛选并下载四个HCC相关数据集，用GEO2R分析数据并鉴定差异表达基因（DEGs）。利用DAVID数据库对DEGs进行GO分析，Cytoscape的ClueGO插件完成KEGG信号通路富集分析，并将DEGs导入STRING数据库建立蛋白相互作用（PPI）网络图，用Cytoscape对PPI网络进行可视化，构建关键模块（cluster）和筛选核心基因。分别使用UCSC数据库和UALCAN数据库完成核心基因在TCGA肝癌中的差异表达分析和生存分析。使用Firebrowse，Oncomine和UALCAN数据库分析核心基因在包括HCC在内的多个肿瘤中的表达。用实时荧光定量PCR（RT-qPCR）检测候选基因在HCC组织和肝癌细胞系中的表达水平。结果:从四个数据集中共鉴定了73个DEGs，包括15个上调基因和58个下调基因。KEGG信号通路富集分析显示DEGs主要富集于肿瘤相关通路。基于DEGs的PPI网络图,筛选了一个关键模块和10个核心基因。CCNB2与NCAPG在多个数据库的肝癌组织中均高表达。CCNB2与NCAPG呈正相关，被认为是与预后相关的关键基因（ P < 0.01）。RT-qPCR结果表明CCNB2在人肝癌组织和细胞系中高表达（ P < 0.01）。 结论:成功筛选出HCC相关的DEGs和核心基因，其中CCNB2在HCC中高表达且与患者生存预后相关，有望成为HCC诊疗和预后的生物标志物。

目的:研究CDK6和FOXM1在外周T细胞淋巴瘤（peripheral T-cell lymphoma，PTCL）组织中的表达情况，探讨其与患者临床病理特征及预后的关系。方法:利用Oncomine 4.5数据库分析PTCL组织中CDK6和FOXM1的表达水平；收集山西省肿瘤医院病理科2006年1月至2018年12月诊断的166例PTCL患者病历资料及存档石蜡标本，应用免疫组织化学（IHC）EnVision法检测166例PTCL组织中CDK6和FOXM1的蛋白表达水平，并以30例淋巴结反应性增生组织作为对照。结果:男性104例，女性62例，年龄3~85岁，平均年龄53岁。Oncomine 4.5数据库中的数据显示，PTCL组织中CDK6和FOXM1 mRNA的表达明显高于正常组织（ P<0.05）。PTCL组织中CDK6和FOXM1蛋白阳性表达率分别为27.7%（46/166）与80.7%（134/166），主要见于肿瘤细胞的细胞核，呈弥漫强阳性表达；在30例淋巴结反应性增生组织中CDK6和FOXM1蛋白阳性表达率分别为0（0/30)和30.0%（9/30），主要表达于淋巴滤泡生发中心，T区细胞不表达。PTCL组织中CDK6、FOXM1及两者蛋白共表达均与患者的Ann Arbor分期、国际预后指数（IPI）评分呈正相关（ P<0.05），与患者总生存期呈负相关（ P<0.05）。CDK6蛋白表达与FOXM1蛋白表达呈正相关（ P<0.05）。 结论:CDK6、FOXM1可能是诊断及治疗PTCL的新靶点。CDK6的过表达可能导致转录因子FOXM1功能增强，且CDK6及FOXM1的过表达作为不利因素促进了PTCL的发生发展。

目的:分析三阴性乳腺癌(TNBC)与非三阴性乳腺癌(non-TNBC)的基因表达谱，寻找可能参与TNBC发生发展的差异表达基因(DEGs)。方法:从GEO数据库下载4个mRNA芯片数据集进行分析，获得基因表达谱。通过STRING和Cytoscape构建了DEGs的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络，并筛选出核心基因。京东基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)用于功能富集分析。使用UCSC、Oncomine和Kaplan-Meier在线网站来分析核心基因的表达和生存水平。结果:在TNBC和non-TNBC中共识别出287个DEGs和10个核心基因。Kaplan-Meier生存曲线显示，TNBC患者表皮生长因子受体(EGFR)高表达或ESR1、胰岛素样生长因子(IGF)-1低表达与更差预后相关。Non-TNBC患者的预后特征与TNBC患者差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:ESR1、EGFR和IGF-1可能导致TNBC的不良预后与复发。

目的:探讨Toll样受体8（TLR8）在弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）中的表达及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:利用Oncomine数据库中的数据分析TLR8 mRNA在DLBCL肿瘤组织与正常淋巴细胞中的差异化表达情况，并在NCBI-GEO数据库的两个独立子集GSE 25638、GSE 32018中进行验证。采用OSDLBCL在线生存分析工具分析TLR8 mRNA相对表达水平与DLBCL患者总生存（OS）及无进展生存（PFS）的相关性。采用GSEA软件进行基因本体生物过程（GO_BP）富集分析。通过TIMER在线工具网站分析TLR8 mRNA表达与肿瘤免疫细胞浸润程度及免疫检查点相关分子表达的关系。选择2020年6月至2021年6月盐城市第一人民医院53例接受淋巴结活组织检查的DLBCL患者，采用免疫组织化学法检测TLR8蛋白表达情况，并分析其与患者临床病理特征的关系。结果:Oncomine与GEO数据库中数据分析结果显示，DLBCL、活化B细胞型DLCBL患者肿瘤组织中的TLR8 mRNA相对表达水平均高于正常淋巴细胞（均 P<0.001）。OSDLBCL在线生存分析结果显示，TLR8 mRNA高表达的DLBCL患者OS（ P=0.020）与PFS（ P=0.004）均较TLR8 mRNA低表达患者差。TLR8水平与免疫反应、细胞因子代谢及DNA损伤监测的功能异常有关；TIMER在线分析结果显示，TLR8 mRNA表达水平与中性粒细胞浸润程度（ r=0.78， P<0.001）及免疫抑制分子的表达[HAVCR2（ r=0.85， P<0.001）、LAG3（ r=0.63， P<0.001）、CD274（ r=0.77， P<0.001）、TIGIT（ r=0.32， P=0.037）、C10ORF54（ r=0.34， P=0.029）]呈正相关。53例DLBCL患者中，TLR8蛋白低表达29例（54.7%）、高表达24例（45.3%）。不同血清乳酸脱氢酶、β 2-微球蛋白水平的DLBCL患者TLR8蛋白表达差异均有统计学意义（均 P<0.05）。 结论:DLBCL患者TLR8高表达，TLR8可能是DLBCL预后的标志物。

目的:探讨环指蛋白181(RNF181)及Yes相关蛋白YAP(YAP)在三阴性乳腺癌中表达及其意义。方法:采用人类蛋白质图谱图像分类(Human Protein Atlas)数据库及Oncomine数据库分析RNF181在乳腺癌中的表达；采用Kmplot数据库分析RNF181与预后的关系；采用免疫组织化学方法检测123例三阴性乳腺癌标本中RNF181和YAP的表达，分析RNF181表达与临床病理特征及预后的关系；采用Cox回归分析影响三阴性乳腺癌的预后因素。结果:通过数据库分析发现RNF181在乳腺癌组织中呈高表达，三阴性乳腺癌患者的RNF181、YAP表达与预后呈负相关；123例三阴性乳腺癌中RNF181的阳性表达率[82.11%(101/123)]明显高于相对应癌旁组织中的阳性表达[25.2%(31/123， χ2＝80.104， P<0.01]。RNF181在TNM Ⅲ、Ⅳ期中表达高于TNM Ⅰ、Ⅱ期( χ2＝4.386， P<0.05)；组织学Ⅲ级中RNF181的表达高于Ⅰ、Ⅱ级( χ2＝6.149， P<0.05)；RNF181在有淋巴结转移的组织中的表达高于无淋巴结转移( χ2＝5.617， P<0.05)；p53阳性的患者RNF181蛋白表达高于阴性的患者( χ2＝4.754， P<0.05)；RNF181的表达与细胞核增殖抗原Ki-67表达呈正相关( χ2＝4.236， P<0.05)；采用Kaplan-Meire法绘制生存曲线并行Log-rank检验发现RNF181表达与患者预后呈负相关( P<0.05)；单因素分析结果显示RNF181是影响预后的因素之一( P<0.05)；123例三阴性乳腺癌中RNF181表达与YAP表达呈正相关( R＝0.348， P<0.01)。 结论:RNF181在三阴性乳腺癌中表达增高，并与TNBC患者的TNM分期、腋窝淋巴结转移、p53表达、Ki-67表达等临床病理特征明显相关，是影响TNBC预后的因素之一。RNF181与YAP表达呈正相关，可能通过YAP发挥作用。

目的:分析lncRNA NPIPA9在前列腺癌组织中的相对表达量，通过过表达lncRNA NPIPA9检测miR-210-3p的相对表达量及对前列腺癌细胞生长和迁移的影响。方法:通过Oncomine数据库分析lncRNA NPIPA9在前列腺癌组织中的相对表达量。实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测lncRNA NPIPA9在前列腺癌细胞株DU-145、PC-3、C4-2B、22Rv1、LNCaP和正常前列腺上皮细胞RWPE-1中的相对表达量。体外培养前列腺癌PC-3细胞，分为两组：NPIPA9组和对照组，NPIPA9组转染100 nmol/L lncRNA NPIPA9载体，对照组转染100 nmol/L对照载体。CCK-8法检测PC-3细胞的增殖活力。Transwell实验检测PC-3细胞的迁移能力。生物信息学技术预测lncRNA NPIPA9的潜在靶点。双荧光素酶报告基因实验确定lncRNA NPIPA9和miR-210-3p的靶向结合关系。RT-qPCR检测lncRNA NPIPA9对前列腺癌细胞中miR-210-3p相对表达量的影响。Western blotting法检测lncRNA NPIPA9对前列腺癌细胞中核因子κB(NF-κB)通路蛋白表达量的影响。计量资料以均数±标准差( ± s)表示，两组间比较采用 t检验，多组间比较采用单因素方差分析。 结果:前列腺癌组织中lncRNA NPIPA9相对表达量低于癌旁组织，差异具有统计学意义( P<0.01)。前列腺癌细胞株中lncRNA NPIPA9相对表达量均低于RWPE-1细胞，差异具有统计学意义( P<0.01)；前列腺癌PC-3细胞中lncRNA NPIPA9相对表达量最低，差异具有统计学意义( P<0.01)。与对照组相比，lncRNA NPIPA9对前列腺癌PC-3细胞活力具有抑制作用，差异具有统计学意义( P<0.05)。对照组和NPIPA9组PC-3细胞迁移数目分别为(101.70 ± 8.63)、(45.97 ± 8.83)个，lncRNA NPIPA9对PC-3细胞迁移具有抑制作用，差异具有统计学意义( P<0.01)。lncRNA NPIPA9可以直接靶向结合miR-210-3p，差异具有统计学意义( P<0.01)。对照组和NPIPA9组PC-3细胞中miR-210-3p相对表达量分别为5.32±0.79和1.11±0.56，lncRNA NPIPA9可直接下调PC-3细胞中miR-210-3p表达，差异具有统计学意义( P<0.01)。与对照组相比，lncRNA NPIPA9能够降低PC-3细胞中NF-κB通路蛋白c-Myc、MMP-9、VEGF、p65、p50表达。 结论:lncRNA NPIPA9在前列腺癌组织中表达下调，其通过靶向并负调控miR-210-3p，降低前列腺癌PC-3细胞的增殖和迁移能力。

目的:探究溶质载体家族41成员A3(SLC41A3)在胃癌(GC)组织的表达、临床预后价值以及其对肿瘤细胞侵袭和迁移能力的影响。方法:利用在线生物信息学数据库Oncomine、UALCAN和Kaplan-Meier Plotter探究SLC41A3 mRNA在GC组织中的表达及其与患者预后的关系；然后，分别利用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和免疫组织化学(IHC)检测96例临床GC组织中SLC41A3 mRNA和蛋白的表达水平，并进一步分析SLC41A3蛋白表达水平与患者临床病理学特征和预后的相关性；最后，检测SLC41A3 mRNA在GC细胞中的表达水平及其对肿瘤细胞侵袭和迁移能力的影响。计量资料采用 t检验，计数资料采用 χ2检验，生存分析采用Log-rank检验和Cox单因素和多因素回归分析。 结果:Oncomine数据库分析显示SLC41A3 mRNA在GC组织中的表达量显著高于正常胃组织(DErrico： t＝4.147， P<0.01；Cho： t＝2.420， P<0.05；Chen： t＝1.687， P<0.05)。UALCAN分析结果分析，SLC41A3 mRNA在GC中的表达与肿瘤分级、N分期和TNM分期相关(均 P<0.05)。Kaplan-Meier Plotter数据库显示，SLC41A3 mRNA高表达组的GC患者的总生存期(OS)明显短于低表达组[219175_s_at：风险比( HR)＝1.86(1.53~2.27)，Log-rank P<0.01；224931_at： HR＝1.67(1.33~2.10)，Log-rank P<0.01]。RT-qPCR和IHC结果证实，GC临床样本中SLC41A3 mRNA和蛋白的表达水平明显高于对应的癌旁组[RT-qPCR：3.768±0.196比1.397±0.089， t＝11.000， P<0.01；IHC：(7.150±0.137)分比(3.910±0.083)分， t＝20.210， P<0.01]，且SLC41A3蛋白在GC中的表达与组织学分级( χ2＝7.055， P<0.01)、T分期( χ2＝4.018， P<0.05)、N分期( χ2＝5.888， P<0.05)、TNM分期( χ2＝8.114， P<0.01)、脉管侵犯( χ2＝4.444， P<0.05)、神经侵犯( χ2＝6.160， P<0.05)明显相关。进一步，Kaplan-Meier分析结果表明，与SLC41A3蛋白低表达比较，高表达组GC患者5年生存率明显低于低表达组(31.7%比61.1%，Log-rank P<0.01)。Cox多因素回归分析结果表明，SLC41A3蛋白高表达是影响GC患者OS的独立危险因素[ HR＝1.984，95%可信区间( CI)：1.102~3.436， P<0.05]。体外细胞实验结果表明，SLC41A3在GC细胞中的表达明显高于正常胃上皮细胞，过表达SLC41A3显著增强胃癌细胞的侵袭和迁移能力。 结论:SLC41A3高表达与GC的恶性进展和患者的不良预后密切相关。

目的:探讨低密度脂蛋白受体相关蛋白（LDLR）表达对肝癌血管异常化的影响及其机制。方法:从Oncomine癌症基因芯片数据库提取87例肝癌组织的基因转录组信息，分析肝癌组织中LDLR的表达水平与癌胚抗原（CEA）和CD31表达水平的相关性。采用短发卡RNA靶基因慢病毒转染的方法，构建LDLR敲降的MHCC-97H和HLE肝癌细胞。通过转录组测序、实时荧光定量聚合酶链反应、蛋白免疫印迹法检测LDLR敲降后肝癌细胞的差异基因及其表达水平变化。通过富集分析明确LDLR参与的基因相关信号通路。通过对肝癌细胞条件培养基中CEA含量的检测评估LDLR对CEA的影响。采用血管生成实验检测LDLR对人脐静脉内皮细胞血管生成能力的影响，以及CEA在LDLR调控血管生成过程中的作用。收集2019年1月至2022年12月于天津医科大学肿瘤医院手术切除的肝癌组织标本176例，采用免疫组织化学染色检测176例肝癌组织中LDLR及146例肝癌组织中CEA和CD31的表达水平，分析肝癌组织中LDLR的表达水平与肝癌组织中CEA和CD31的表达水平、血清CEA和丙氨酸氨基转移酶（ALT）水平的相关性。结果:Oncomine数据库分析显示，发生门静脉转移的肝癌患者肝癌组织中LDLR和CEA的表达呈负相关（ r=-0.64， P=0.001），而CEA和CD31的表达呈正相关（ r=0.46， P=0.010）；转录组测序结果显示，LDLR敲降组与对照组MHCC-97H细胞的差异表达基因共有1 032个，其中517个基因表达上调，515个基因表达下调。CEA相关细胞黏附分子5（CEACAM5）在LDLR敲降组细胞中上调明显。基因本体论功能富集分析显示，差异基因最明显富集在血管生成的功能上。京都基因与基因组百科全书信号通路富集分析显示，涉及的相关通路主要包括细胞粘着斑、细胞外基质受体相互作用等。LDLR敲降组条件培养基中CEA含量为43.75±8.43，高于对照组（1.15±0.14， P＜0.001）。血管生成实验结果显示，在5 h，用LDLR敲降组MHCC-97H细胞的条件培养基培养HUVEC细胞形成的血管主结点数、主分段数和网格总面积分别为（295.3±26.4）个、（552.5±63.8）个和（2 239 781.0±138 211.9）平方像素，均高于对照组［分别为（113.3±23.5）个、（194.8±36.5）个和（660 621.0±280 328.3）平方像素，均 P＜0.01］；用LDLR敲降组HLE细胞的条件培养基培养HUVEC细胞形成的血管主结点数、主分段数和网格总面积分别为（245.3±42.4）个、（257.5±20.4）个和（2 535 754.5±249 094.2）平方像素，均高于对照组［分别为（113.3±23.5）个、（114.3±12.2）个和（1 565 456.5±219 259.7）平方像素，均 P＜0.01］；在对照组MHCC-97H细胞条件培养基中加入CEA培养HUVEC细胞形成的血管主结点数、主分段数和网格总面积分别为（178.9±12.0）个、（286.9±12.3）个和（1 966 990.0±126 249.5）平方像素，均高于对照组［分别为（119.7±22.1）个、（202.7±33.7）个和（1 421 191.0±189 837.8）平方像素，均 P＜0.01］。肝癌组织中LDLR的表达与CEA的表达无相关性，与肝癌组织中CD31的表达、血清CEA水平、血清ALT水平均呈负相关（ r=-0.167， P=0.044； r=-0.061， P=0.032； r=-0.147， P=0.05）。肝癌组织中CEA的表达与CD31的表达呈正相关（ r=0.192， P=0.020），血清CEA水平与血清ALT水平呈正相关（ r=0.164， P=0.029）。 结论:肝癌细胞敲降LDLR可通过释放CEA促进肝癌血管异常化。

目的:运用网络药理学和分子对接技术分析七方胃痛颗粒干预胃癌的潜在作用机制。方法:运用TCMSP、TCMID和Swiss Target Prediction数据库筛选七方胃痛颗粒的药物化学成分及相关靶点，采用GeneCards、OMIM数据库筛选胃癌作用靶点，并获得药物-疾病共同靶点，上传至STRING数据库，构建蛋白相互作用关系（PPI）网络，得到关键靶点，在Oncomine肿瘤数据库中分析关键靶点与胃癌的相关性。通过Cytoscape软件构建药物-疾病调控网络，采用Cytoscape软件的CluoGO插件和R语言对关键靶点进行GO和KEGG富集分析。通过分子对接验证药物分子和靶分子结合的可能性。结果:获得七方胃痛颗粒的药物化学成分168个，胃癌作用靶点2 803个，药物-疾病共同靶点49个。药物-疾病调控网络中度值较高的化学成分为β-谷甾醇、芒柄花素、豆甾醇等。PPI网络中关键靶点为MAPK8、FOS、AR等，GO富集分析集中于凋亡信号通路中线粒体外膜通透性的正调控等，KEGG富集分析显著富集在细胞凋亡通路等。分子对接结果显示药物分子与靶分子结合性好、构象稳定。结论:七方胃痛颗粒可诱导与胃癌相关的基因、蛋白表达，影响激素水平、细胞凋亡等生物学过程，激活凋亡信号通路来发挥主效应。

目的:以基因表达数据集资料为研究对象，分析BCAN基因在肾透明细胞癌中的表达情况以及对患者预后的影响。方法:在Oncomine数据库中挖掘BCAN在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达情况。从TCGA数据库中获取ccRCC患者临床资料和目的基因的表达信息并进行统计分析。利用GEO数据库中GSE73731数据集的ccRCC样本进行基因富集分析。利用String数据库分析与BCAN相关的蛋白。结果:BCAN低表达组的ccRCC患者在病理分期及T分期方面低于高表达组( P<0.001； P＝0.001)；N分期及M分期差异无统计学意义( P>0.05)。BCAN低表达组患者的总生存期优于高表达组( P＝0.033)。BCAN基因高表达组的样本主要富集在KRAS信号通路。 结论:BCAN可以通过多种途径来促进肿瘤细胞的侵袭能力，有望成为ccRCC不良预后的重要生物标志物之一。