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PPP2R5D基因变异所致常染色体显性遗传性智力障碍35型1例并文献复习
编辑人员丨1周前
目的:通过分析常染色体显性遗传性智力障碍35型患儿的临床及遗传学特点以提高对该病的认识。方法:报道北京儿童医院2018年7月收治的1例常染色体显性遗传性智力障碍35型患者的临床资料、遗传学特点,并进行文献复习。结果:先证者男性,1岁3个月龄,表现为发育落后,低热,患儿面容特殊(额部突出、鼻梁塌平),张口呼吸,肌张力减低。头颅磁共振成像示侧脑室增宽、透明隔间腔及Vergae腔形成、中间帆腔囊肿。基因检测结果示PPP2R5D基因位点新生突变(NM_006245:c.1258G>A,p.E420K)。检索到既往共10篇国外文献报道31例常染色体显性遗传性智力障碍35型患者,包括本例共32例。32例中临床表现为智力发育迟缓(32例;100.0%)、运动发育迟缓(26例;81.3%)、巨头畸形(26例;81.3%)、癫痫(8例;25.0%),此外有特殊面容、震颤、眼科异常、骨骼发育异常、心脏畸形等表现。PPP2R5D基因突变均为新生错义突变,常染色体显性遗传。结论:常染色体显性遗传性智力障碍35型主要临床表现为发育迟缓/智力障碍、严重的语言发育落后、巨头畸形、肌张力减低、特殊面容。PPP2R5D基因新生错义突变为本病的遗传学病因。
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编辑人员丨1周前
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一例由 PPP2R5D基因变异引起的神经发育迟缓
编辑人员丨1周前
目的:使用全外显子组测序技术对一例发育迟缓的婴儿进行基因检测,查明该患儿致病原因。方法:应用全外显子组测序技术对其进行致病基因筛查,结合临床表型资料,锁定候选基因致病位点,利用Sanger测序技术对先证者及其家系成员完成致病变异验证。结果:发现先证者存在 PPP2R5D基因c.592G>A(p.E198K)杂合变异,该变异为已知致病变异,根据相关文献报道及患儿临床症状,诊断该患儿的致病原因为 PPP2R5D基因c.592G>A变异引起的。 结论:Jordan综合征是一种罕见的遗传疾病,应用全外显子组测序技术能够快速发现 PPP2R5D基因变异,有助于该疾病的临床诊断和辅助治疗及该家系的遗传咨询及产前诊断。
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编辑人员丨1周前
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新生儿期起病的常染色体显性智力障碍35型1例
编辑人员丨1周前
本文报道1例新生儿期起病的常染色体显性智力障碍35型(mental retardation autosomal dominant 35,MRD35)患儿的诊治过程。患儿男,生后1.5 h发病,表现为反复抽搐、肌张力低下、头围大、先天性肌性斜颈、喂养困难。动态脑电图示左中央区-颞区阵发性痫样波放电。全外显子组测序示患儿 PPP2R5D基因杂合变异c.139G>A(p.Glu47Lys),为新发变异,父母为野生型。随访至患儿1岁龄时,发育迟缓明显。MRD35临床缺乏特异性,需全外显子组测序明确诊断;且无特异性治疗,多为对症治疗,包括康复训练、语言训练、控制癫痫发作等。
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编辑人员丨1周前
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诱导性ppp2r1a基因敲除小鼠模型的表型和机制研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究诱导性ppp2r1a基因全身敲除对成年小鼠的主要生理功能影响并探讨相关机制.方法 将ppp2r1aflox/flox小鼠和CAGG-CreER小鼠杂交繁殖,获得20只CAGG-CreER ppp2r1aflox/flox小鼠,设立为纯合子组,并同时选取同窝野生型小鼠20只,采用单纯随机法,将纯合子、野生型小鼠分别分为4组,共8组,每组5只,腹腔注射他莫昔芬0、2、4、6 d,建立ppp2r1a基因诱导性敲除小鼠模型.采用Western blot法检测主要脏器中PP2A Aα(由ppp2r1a基因编码)的敲除效率,并观察小鼠体重、脏器病理改变以及外周血细胞计数和血生化,采用Real-time PCR法检测肝脏糖脂代谢相关基因的表达改变.结果 他莫昔芬注射6 d后,小鼠心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和脑的PP2A Aα敲除效率分别约为35%、12%、15%、60%、69%和72%.他莫昔芬注射6 d后,纯合子小鼠体重[(17.42±1.76)g]低于野生型小鼠[(21.69±1.82)g](P<0.05).纯合子小鼠活动减少,腹部和肾周脂肪少,存活不超过7 d.第6天后,纯合子小鼠脾脏的脏器系数[(0.36±0.05)%]低于野生型小鼠[(0.59±0.10)%](P<0.05),组织病理HE染色显示脾脏萎缩明显,有核细胞明显减少.Tunel染色发现脾脏中淋巴细胞凋亡增多.纯合子小鼠血浆中谷丙转氨酶(ALT)和谷草转氨酶(AST)水平[(153.68±62.80)U/L和(193.2±44.28)U/L]均高于野生型小鼠[(41.02±12.91)U/L和(69.40±9.55)U/L](P值均<0.05),提示ppp2r1a敲除导致肝损伤.纯合子血糖水平[(4.20±1.99)mmol/L]低于野生型[(8.88±0.65)mmol/L](P<0.05),而总胆固醇、HDL-C和β-羟基丁酸(β-HB)水平[(3.12±0.39)、(1.53±0.38)和(2.49±0.89)mmol/L]均高于野生型小鼠[(1.69± 0.92)、(0.78±0.50)和(0.45±0.30)mmol/L](P值均<0.05),表明ppp2r1a敲除会扰乱葡萄糖和胆固醇代谢.此外,纯合子小鼠白细胞计数(WBC)和淋巴细胞计数[(1.88±0.89)×109/L和(0.92±0.37)×109/L]低于野生型小鼠[(3.91±0.80)×109/L和(2.74±0.52)×109/L](P值均<0.05).纯合子小鼠肝脏中糖异生基因葡萄糖-6-磷酸酶(G6P)和磷酸烯醇丙酮酸羧化酶的mRNA相对表达水平[(0.46±0.11)和(0.72±0.07)]均低于野生型小鼠[(1.02±0.07)和(1.02±0.06)](P值均<0.05).结论 全器官ppp2r1a基因对成年小鼠的存活是必不可少的,且ppp2r1a基因可能通过调控肝脏葡萄糖和胆固醇代谢发挥重要作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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染料木黄酮对PPP2R2C在小鼠睾丸表达定位的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 明确PPP2R2C蛋白在不同发育阶段的小鼠睾丸中的表达与定位,探讨染料木黄酮(GEN)对新生小鼠睾丸组织PPP2R2C、细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)和波形蛋白(Vimentin)表达的影响.方法 选用出生后1、6、10、15、20、30、60 d的雄性小鼠,采用免疫荧光技术观察PPP2R2C蛋白在各发育阶段小鼠睾丸中的细胞定位和表达;用2~3日龄雄性小鼠,取睾丸组织随机分为5组,即DMSO溶剂对照组和4个GEN剂量组(终浓度6.25、12.5、25、50μmol/L).旋转通气法体外培养72 h,HE染色观察睾丸组织病理改变,Real-time PCR测定蛋白PPP2R2C、CDK2和Vimentin mRNA表达.结果 免疫荧光结果发现PPP2R2C蛋白在小鼠睾丸间质细胞和其他细胞胞浆内表达;HE染色显示,各GEN剂量组均出现睾丸组织病理改变;Real-time PCR检测显示,6.25 μmol/L GEN组PPP2R2C mRNA表达高于对照组(P=0.021),各剂量组CDK2 mRNA表达呈下降趋势(P>0.05),GEN各剂量组Vimentin mRNA表达略有降低,但是差异无统计学意义(P>0.05).结论 本研究首次发现PPP2R2C蛋白在小鼠睾丸组织中表达,其可能参与了小鼠睾丸发育、细胞分裂和精子发生过程.GEN可能通过调节体外培养小鼠睾丸PPP2R2C、CDK2和Vimentin基因的表达,影响睾丸发育和精子发生过程.
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编辑人员丨2023/8/6
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PPP2R5C小干扰RNA的安全性分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨PPP2R5C小干扰RNA的安全性.方法 利用原子力显微镜观察转染PPP2R5C小干扰RNA 72 h K562细胞株干扰组、空转组及阴性对照组间微观形态学变化;利用荧光实时定量PCR检测K562细胞株组、健康人骨髓单个核细胞组、转染PPP2R5C-siRNA的健康人骨髓单个核细胞组及空转的健康人骨髓单个核细胞组的PPP2R5C基因表达量;利用甲基纤维素半固体培养方法分析PPP2R5C小干扰RNA作用后, 对转染组(siRNA)及空转组(MOCK)的健康人骨髓单个核细胞体外分化及增殖能力的影响.结果转染PPP2R5C小干扰RNA 72 h K562细胞株各组间在细胞高度和半径上的差异无统计学意义(P> 0.05); 3例健康人骨髓单个核细胞中的PPP2R5C基因表达明显低于K562, 差异有统计学意义(P <0.05);转染前后骨髓单个核细胞中PPP2R5C基因表达量无明显变化.PPP2R5C-siRNA转染、种板后14 d, 健康人骨髓单个核细胞体外BFU-E、CFU-GM、CFU-Meg的形成与MOCK对照组比较差异无统计学意义(P=0.723、0.826、0.448).结论 PPP2R5C小干扰RNA对健康人骨髓单个核细胞的体外增殖和分化无显著影响, 初步说明其安全性.
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编辑人员丨2023/8/6
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七氟醚对C57小鼠海马基因表达的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的:通过微阵列分析来研究七氟醚对小鼠海马基因表达的影响.方法:出生后第7天(P7)C57BL/6雄性小鼠12只,随机分为2组(n=6),重复七氟醚组(RS组)和空气对照组(C组),每天暴露于七氟醚(浓度为2.5%)或空气2 h,连续5 d,小鼠处死后提取海马RNA进行基因表达谱分析.结果:与C组相比,RS组共有30个基因发生了显著变化(>1.5或<1.5倍),其中上调基因16个(P<0.05),下调基因14个(P<0.05).这些基因主要参与学习记忆、认知、细胞代谢、信号转导和通讯、结构和囊泡过程、生命物质结合和定位等过程.实验随机选择9个差异基因验证芯片结果,发现3个上调基因(Ppp1 r1 b、Id1和Txnip)和5个下调基因(Arc、c-Fos、Npas4、Grin2a和Kcnj2).结论:七氟醚可引起小鼠海马中一些关键基因的改变,这些改变可能与认知功能障碍或其他神经系统疾病有关.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于GEO数据库的不明原因复发性自然流产患者子宫内膜差异基因筛选及其生物信息学分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨不明原因复发性自然流产(URSA)患者子宫内膜差异基因筛选及其相关信号通路及生物学过程.方法 在基因表达总览(GEO)数据库中,以"recurrent spontaneous abortion""recurrent pregnancy loss""endometrium""homo sapiens"为关键词,检索URSA患者子宫内膜基因芯片数据集.利用R语言对U RS A患者子宫内膜基因芯片数据进行分析,筛选差异基因,并对不同芯片数据集间差异基因取交集,获得共同差异基因.利用David数据库对共同差异基因的基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路进行富集分析.利用STRING数据库对这些基因数据集的差异基因编码蛋白的蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络进行构建,并采用Cytoscape软件(v3.0)进行可视化.结果 ①本研究获得GSE26787和GSE65099共计2个URSA患者子宫内膜基因数据集,对这2个数据集差异基因取交集,最终获得23个共差异基因,其中上调基因为19个,分别为ADM2、SH3D21、FGFR4、SULT2B1、NRG2、SERPINA4、NLRP5、FAM124B、MCOLN3、SLC7A1、PPP1R1B、SQLE、SLC24A4、PLPPR5、EPHB3、SMIM24、ZNF589、SOX7、EDN3;下调基因为4个,分别为PRKCB、A NG、IRX5、A TG9B.②共同差异基因GO富集分析获得BP、CC和M F共计3个部分结果.共同差异基因在BP中,主要涉及细胞Ca2+稳态、血管生成及细胞内信号传导;在CC中,主要涉及膜的整体组分;在M F中,主要涉及受体结合.③K EGG通路富集分析结果显示,共同差异基因富集于ErbB信号通路(P=0.070,FDR=55.245).涉及该信号通路的共同差异基因为NRG2和PRKCB.结论 基于GEO数据库,采用生物信息学的方法筛选到参与URSA发生、发展的部分差异基因,并为进一步研究提供数据支撑.
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编辑人员丨2023/8/5
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不明原因的癫(癎)和智力障碍/发育迟缓患儿的临床及相关致病基因分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 分析不明原因的癫(癎)和智力障碍/发育迟缓(E-ID/DD)患儿的临床特征及基因型特点.方法 回顾性分析32例2017年1月至2020年12月徐州医科大学附属医院儿科通过高通量二代测序技术基因检测阳性的不明原因的E-ID/DD患儿临床资料.结果 32例患儿中,男21例(65.6%),女11例(34.4%);癫(癎)首次发病年龄2日龄至11岁;E-ID/DD严重程度以中、重度为主(68.8%);呈药物难治性癫(癎)(46.9%).28/32例为基因突变,4/32例为基因拷贝数(CNVs)变异,主要涉及动作电位形成、突触传递、转录调节、信号传导,等.本研究共检测出22个基因突变,包括10个离子通道相关基因(SCN1A、SCN2A、SCN8A、KCNQ2、KCNT1、CACNA1A、CLIC2、CLCN4、GRIN2A、ATP1A3),2个转录相关基因(ZMYND11、ATN1),3个突触相关基因(DLG3、DLG4、CNKSR2),2个细胞间相互作用基因(PCDH19、RELN),2个酶相关基因(PPP2R5D、CDK13),2个细胞功能相关基因(SHROOM4、CNNM2),1个蛋白激活相关基因(OPHN1).结论 E-ID/DD临床表型呈多样性,离子通道基因变异最为常见;转录调控、细胞代谢、酶调节及细胞间相互作用等因素也可能参与E-ID/DD的共同发病机制.本研究发现了多个未报道致病性基因突变位点及CNVs变异,丰富了E-ID/DD患儿的基因型及表型.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于加权基因共表达网络分析识别雄激素性脱发的枢纽基因
编辑人员丨2023/8/5
目的 使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探究雄激素性脱发(AGA)基因的协同共表达,寻找与雄激素性脱发有关的关键基因.方法 借助R语言分析基因表达数据库(GEO)中关于AGA的GSE90594数据集,得到与临床表现正负相关性最高的模块各一个,并提取模块中的基因,使用clusterprofiler包进行下游GO与KEGG富集分析,同时对模块内GS和MM的相关性进行分析,并使用Cytosacpe绘制共表达网络图,筛选枢纽基因.结果 根据基因表达的相关性,发现20个共表达模块,其中brown模块和turquoise模块与AGA显著相关,共表达网络发现13个基因(PDGFRA、PMP22、ZCCHC24、COL6AI、ISLR、PRRX1、PKP1、CALN1、PNMAL2、PPP5D1、GJB6、DSC2、GJA3)在网络中处于核心的地位.并用上述基因做了疾病模型,对疾病预测准确性很高.结论 PDGFRA、PMP22、ZCCHC24、COL6A1、ISLR、PRRX1 的表达与 AGA 呈正相关,PKP1、CALN1、PNMAL2、PPP5D1、GJB6、DSC2、GJA3的表达与 AGA 呈负相关.
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编辑人员丨2023/8/5
