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整合全基因组关联研究和大脑表达数量性状位点探究精神分裂症重要风险基因
编辑人员丨6天前
目的:探究精神分裂症表达异常的致病风险基因。方法:选取56 418例精神分裂症患者与78 818名健康对照者的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据和大脑表达数量性状位点(expression quantitative trait loci,eQTLs),采用基于汇总数据的孟德尔随机化(summary data-based mendelian randomization analysis,SMR)整合分析精神分裂症的重要风险致病基因,并采用精神分裂症患者尸脑背外侧前额叶皮质第3层和第5层锥体神经元、人诱导多能干细胞(human induced pluripotent stem cell,hiPSC)和全血表达数据集进行差异表达分析,以验证风险基因表达失调情况。结果:基于SMR共发现16个精神分裂症风险基因( PSMR<5×10 -6),分别为C4A、HLA-C、EMB、SLC9B1、PCDHA7、BTN3A2、KRT8P46、PCDHA8、SFMBT1、PCCB、WBP1L、BTN3A3、MUSTN1、PPM1M、TYW5和SF3B1。差异表达分析结果进一步验证显示,SF3B1在大脑背外侧前额叶皮质第3层和第5层锥体神经元( Padjust=5.22×10 -3)和hiPSC( Padjust=1.41×10 -4)中表达水平均显著下调。WBP1L在hiPSC( Padjust=1.28×10 -8)和全血( Padjust=1.17×10 -4)中表达水平均显著上调。TYW5( Padjust=3.06×10 -6)在hiPSC中表达水平显著上调,PCCB( Padjust=1.34×10 -4)、BTN3A2( Padjust=1.48×10 -3)、PPM1M( Padjust=5.13×10 -6)和PCDHA8( Padjust=4.31×10 -2)在hiPSC中表达水平显著下调。BTN3A3( Padjust=2.18×10 -2)在全血中表达水平显著下调。 结论:精神分裂症风险基因SF3B1、TYW5、PCCB、BTN3A2、PPM1M、PCDHA8、WBP1L和BTN3A3异常表达可增加发病风险。
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编辑人员丨6天前
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miR-218靶向SFMBT1影响肺癌细胞凋亡的研究
编辑人员丨2023/8/6
目的:探讨miR-218对肺癌细胞凋亡的影响.方法:qRT-PCR检测肺癌细胞A549、SPC-A1、H322和支气管黏膜上皮细胞16HBE中miR-218表达水平.以A549细胞为研究对象,预测miR-218的靶基因可能为含有4个mbt的Scm相关蛋白(SFMBT1),双荧光素酶报告基因鉴定靶基因,细胞转染miR-218模拟物、模拟物阴序列、SFMBT1小干扰RNA、小干扰RNA阴序列,以不处理的细胞为对照,qRT-PCR和Western blot检测转染后细胞中miR-218和SFMBT1表达,流式细胞术检测细胞凋亡情况.结果:miR-218在肺癌细胞中表达水平明显低于支气管黏膜上皮细胞16HBE,并且A549细胞中miR-218水平最低.miR-218模拟物和野生型的SFMBT1共转染后细胞荧光素酶活降低.转染miR-218模拟物后细胞中miR-218水平升高,细胞凋亡率升高,细胞中SFMBT1 mRNA和蛋白水平降低.转染SFMBT1小干扰RNA后细胞中SFMBT1 mRNA和蛋白水平降低,细胞凋亡率升高.结论:miR-218可以负调控靶基因SFMBT1的表达促进肺癌细胞凋亡.
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编辑人员丨2023/8/6
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circ-SFMBT2通过miR-224-5p/USP3轴对肝癌细胞增殖及迁移能力的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨环状RNA(circRNA)SFMBT2(circ-SFMBT2)通过miR-224-5p/USP3轴对肝癌细胞增殖及迁移能力的影响.方法 选取人肝癌细胞株HepG2、SMMC7721、Huh-7、Sk-Hep-1及人正常肝细胞株LO2,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)技术检测circ-SFMBT2在5个细胞株中的表达,筛选出高表达circ-SFMBT2的人肝癌细胞株HepG2和正常肝细胞株LO2进行后续实验,采用原位杂交实验检测circ-SFMBT2在HepG2和LO2中的亚细胞定位;选取人肝癌细胞系HepG2传代培养,利用Lipofectamine 2000为转染试剂进行转染,分为circ-SFMBT2转染对照组(circ-SFMBT2 NC,NC组)、circ-SFMBT2干扰组(si-circ-SFMBT2组)、miR-224-5 p过表达组(mimic组)、USP3过表达组(si-circ-SFMBT2+USP3组)、miR-224-5 p干扰组(si-circ-SFMBT2+in-hibitor组)、miR-224-5p和USP3双过表达组(mimic+USP3组),分别采用细胞增殖(CCK-8)、克隆斑点形成及Transwell实验检测6组HepG2细胞增殖和迁移能力,采用双荧光素报告实验检测circ-SFMBT2、miR-224-5 p和USP3在HepG2细胞中彼此之间的靶向关系.结果 qRT-PCR结果显示与正常肝细胞LO2比较,circ-SFMBT2在4株肝癌细胞中高表达,差异有统计学意义(P<0.05);原位杂交实验证实circ-SFMBT2存在于细胞质中;细胞增殖(CCK-8、克隆斑点实验)和迁移实验(Transwell实验)检测发现,si-circ-SFMBT2组细胞增殖和迁移能力较NC组降低(P<0.05),mimic组增殖和迁移能力较si-circ-SFMBT2+inhibitor组降低(P<0.05),mimic+USP3组细胞增殖和迁移能力较mimic组升高(P<0.05);双荧光素实验证实miR-224-5p和USP3是circ-SFMBT2的下游靶点.结论 circ-SFMBT2通过miR-224-5 p/USP3轴参与了对肝癌细胞增殖和迁移的调控.
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编辑人员丨2023/8/5
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Biological roles and potential clinical values of circular RNAs in gastrointestinal malignancies
编辑人员丨2023/8/5
Circular RNAs (circRNAs), a class of endogenous RNA molecules, are produced by alternative splicing of precursor RNA and are covalently linked at the 5′ and 3′ ends. Recent studies have revealed that dysregulated circRNAs are closely related to the occurrence and progression of gastrointestinal malignancies. Accumulating evidence indicates that circRNAs, including circPVT1, circLARP4, circ-SFMBT2, cir-ITCH, circRNA_100782, circ_100395, circ-DONSON, hsa_circ_0001368, circNRIP1, circFAT1(e2), circCCDC66, circSMARCA5, circ-ZNF652, and circ_0030235 play important roles in the proliferation, differentiation, invasion, and metastasis of cancer cells through a variety of mechanisms, such as acting as microRNA sponges, interacting with RNA-binding proteins, regulating gene transcription and alternative splicing, and being translated into proteins. With the characteristics of high abundance, high stability, extensive functions, and certain tissue-, time- and disease-specific expressions, circRNAs are expected to provide novel perspectives for the diagnoses and treatments of gastrointestinal malignancies.
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编辑人员丨2023/8/5
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miR-496通过SFMBT1抑制子宫颈癌HeLa细胞增殖、迁移和侵袭的相关研究
编辑人员丨2023/8/5
背景与目的:微小RNA(microRNA,miRNA)已被证实与子宫颈癌的发病相关.分析miR-496与SFMBT1的相互关系,阐明miR-496在子宫颈癌中的作用及其机制.方法:预测并验证miR-496的靶基因.实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)分析miR-496 mimics对SFMBT1表达的影响.使用免疫荧光和Western blot分析SFMBT1在子宫颈癌组织中的表达变化.细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)法和transwell实验分别检测miR-496和SFMBT1对HeLa细胞增殖、迁移和侵袭的影响.观察miR-496在BALB/c裸小鼠移植瘤模型中对肿瘤生长的影响.结果:相比癌旁正常组织,SFMBT1在子宫颈癌组织中的mRNA(1.69±0.23 vs 1.00±0.12)以及蛋白(1.73±0.28 vs 1.00±0.15)均呈高表达,miR-496能通过特异性结合SFMBT1的3'-UTR抑制SFMBT1的mRNA(0.81±0.07 vs 1.00±0.15)以及蛋白表达(0.26±0.02 vs 1.00±0.14);细胞实验中相比对照组,miR-496 mimics处理组能抑制HeLa细胞增殖(1.39±0.10 vs 2.01±0.09)、迁移(40.50±3.17 vs 28.42±1.21)和侵袭能力(15.03±1.67 vs 25.71±2.56),但相比miR-496 mimics处理组,miR-496+SFMBT1处理组迁移(33.21±2.66 vs 19.28±1.50)和侵袭能力增强(30.11±2.73 vs 15.03±1.67).子宫颈癌裸小鼠移植瘤模型发现,相比对照组miR-496组裸小鼠中移植瘤体积、重量均明显降低.miR-496组裸小鼠中病变程度、SFMBT1表达和Ki-67增殖指数均明显降低,差异有统计学意义(P<0.01).结论:miR-496通过靶向调控SFMBT1抑制子宫颈癌细胞的生物学行为和裸小鼠移植瘤的生长.
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编辑人员丨2023/8/5