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UBQLN2基因罕见变异与肌萎缩侧索硬化发病的相关性
编辑人员丨4天前
目的:探讨UBQLN2基因罕见变异与肌萎缩侧索硬化(ALS)发病的相关性。方法:通过二代测序技术对2018年1月至2020年7月就诊于北京大学第三医院神经内科的ALS患者进行基因检测,筛选出UBQLN2基因可能的致病性罕见变异,分别与国际千人基因组计划(1000 Genome Project)2 504个样本及国内全外显子测序健康对照数据库1 812个样本比对分析,进行序列核关联性检验(SKAT)及优化的SKAT(SKAT-O),并分析其致病性罕见变异携带者的临床表型特点。结果:共纳入166例中国ALS患者,家族性病例33例,散发性病例133例,男女比例为1.68∶1,发病年龄(43.8±12.2)岁,球部起病占12.7%,肢体起病占85.5%,5例为ALS合并额颞叶痴呆(FTD)(3.0%)。共筛选出3个UBQLN2基因可能的致病性罕见变异,c.128A>G(p.Lys43Arg)、c.142G>T(p.Val48Leu)及c.1451T>G(p.Val484Gly),均为错义突变,既往未见致病性报道。以1000 Genome Project作为对照,SKAT P=2.49×10 -6,SKAT-O P=9.22×10 -7;以国内全外显子测序健康对照数据库作为对照,SKAT P=1.42×10 -3,SKAT-O P=1.10×10 -3;携带UBQLN2基因罕见变异患者球部起病比例较其他患者高(2/3比19/163, P=0.042)。 结论:UBQLN2基因罕见变异与ALS发病存在相关性,该基因突变可能与球部起病相关。
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编辑人员丨4天前
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泛素样蛋白质2在结直肠癌中的表达及其对癌细胞增殖作用
编辑人员丨1个月前
目的 探讨泛素样蛋白质2(UBQLN2)在结直肠癌中的表达及其对结直肠癌细胞增殖的影响.方法 选取2020年1月至2021年1月河北北方学院附属第一医院治疗的90例病人为研究对象,根据术中手术获取组织情况,分为正常组、癌旁组和肿瘤组.免疫组织化学法和免疫荧光评估UBQLN2在肿瘤组织、远端组织和正常组织中表达;分析UBQLN2与病人临床病理特征以及预后的相关性;蛋白质印迹法和实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测UBQLN2在结直肠癌细胞系HT29、SW620、SW480、LOVO、HCT116以及人正常肠上皮细胞HIEC细胞中的表达;分别过表达和干扰UBQLN2在结肠癌细胞中的表达,随后CCK-8检测干扰前后细胞增殖能力变化.结果 UBQLN2在结直肠癌癌旁组织中阳性面积(32.57±12.44)%显著高于肿瘤组织(12.68±9.79)%;UBQLN2 mRNA表达在转移阴性病人肿瘤组织中0.98±0.15显著高于转移阳性病人肿瘤组织0.33±0.08;UBQLN2的表达与结直肠癌病人预后呈正相关;UBQLN2在人正常肠上皮细胞中表达显著高于结直肠癌细胞,且在HCT116中表达最低;HCT116过表达UBQLN2培养36 h后,与pcDNA3.1-NC组细胞增殖能力0.78±0.23比较,pcDNA3.1-UBQLN-2组细胞0.52±0.18增殖能力显著降低;SW480细胞敲减UBQLN2培养36 h后,与si-NC细胞0.65±0.37增殖能力比较,si-UBQLN-2组细胞0.89±0.36增殖能力显著增加.结论 UBQLN2在结直肠癌肿瘤组织和细胞中明显低表达并与转移呈负相关,UBQLN2可抑制结直肠癌增殖并与病人预后呈正相关.
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编辑人员丨1个月前
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基于杜洛克猪全基因组重测序的InDel分析及重要经济性状基因定位
编辑人员丨1个月前
本研究利用选择信号分析方法在美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪中筛选与重要经济性状相关的候选基因.选取健康状态良好、饲养管理水平一致的成年美系杜洛克公猪33头、丹系杜洛克公猪11头,提取DNA并重测序,利用Fst&Pi的联合分析,保留候选区域,对注释基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,进一步筛选与重要经济性状相关的相关候选基因.美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪的全基因组重测序平均测序深度在13×以上,测序数据平均效率为99.82%,Q30平均值分别为91.91%、91.93%,G+C含量分别在42.90%-43.83%和42.48%~43.55%,均表明本次测序数据质量较高.以5%为筛选阈值,关联Fst&Pi提取相关候选区域,采用选择性消除方法检测到相应的选择信号区域,美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪之间的Fst值为0.268,θπ比值分别为0.495和-1.415,Pi值分别为4.206和3.506.在美系杜洛克猪的选择性消除分析中有557个受选择区域,注释到1 323个基因;丹系杜洛克猪的选择性消除分析中有207个受选择区域,注释到338个基因.GO分析和KEGG通路富集分析发现,在美系和丹系杜洛克群体中初步筛选到ERLIN2、TMCO2、PITX2、SORCS3和SUFU等5个与精子发生、脂肪形成、生殖功能等性状相关的候选基因.在美系杜洛克猪中筛选到ATP1B1、LAMA4、EP300、ELOVL3、ECHS1、THEME5、PIP5K1A、PPT1、UBQLN1、1L2、CNTFR、ITGA10、SEC24D、MAP3K5 和 HSP90B1 等 15 个与肉质、脂肪合成与代谢、精子发生、生长发育、骨发生和饲料效率等性状相关的候选基因.在丹系杜洛克猪中筛选到PDIA3、CBLIN2、CYCS和CDH7等4个候选基因,分别与产奶量、肉质性状、骨骼肌、饲料效率相关;BMI1、LHX8、ELL3、CATSPER2和CSMD1等5个与繁殖性状相关的候选基因.本研究发现美系杜洛克猪群体和丹系杜洛克猪群体间存在较大的遗传分化,为进一步研究杜洛克公猪的遗传特性提供了基因组数据支撑.
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编辑人员丨1个月前
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RNA干扰UBQLN基因表达对乳腺癌细胞增殖、凋亡、侵袭的影响及机制研究
编辑人员丨2023/8/6
目的:观察抑制泛素1(UBQLN1)基因表达对乳腺癌细胞增殖、凋亡、侵袭的影响.方法:Western blot检测UBQLN1在乳腺癌T47D、BT549、MDA-MB-231、MCF7细胞中相对于正常乳腺上皮细胞MCF-10A的蛋白表达;用LipofectamineTM2000将干扰UBQLN1表达的siRNA(UBQLN1-siRNA)转染MDA-MB-231细胞,同时转染阴性对照组(NC组),并设置空白对照组,收集转染48 h的细胞Western blot检测其UBQLN1的蛋白表达;CCK8法检测UBQLN1-siRNA转染24 h、48 h和72 h的细胞活力;流式细胞仪及Transwell小室分别检测UBQLN1-siRNA转染48 h的细胞凋亡率及侵袭能力;Western blot检测促凋亡蛋白p53和抑凋亡蛋白Survivin、侵袭相关蛋白基质金属蛋白酶2(MMP-2)和基质金属蛋白酶9(MMP-9)及STAT3和磷酸化的信号转导与转录因子3(p-STAT3)的蛋白表达.结果:与MCF-10A细胞比较,UBQLN1在T47D、BT549、MDA-MB-231、MCF7乳腺癌细胞中的表达均显著升高(P<0.01);与NC组比较,UBQLN1-siRNA组UBQLN1的蛋白表达显著降低,24 h、48 h和72 h的细胞活力均显著降低,细胞凋亡率显著升高,细胞侵袭能力显著降低,Survivin、MMP-2、MMP-9和p-STAT3的蛋白表达均显著降低,p53蛋白表达显著升高(P<0.01),三组间STAT3的蛋白表达差异无统计学意义(P>0.05).结论:抑制乳腺癌细胞中UBQLN1基因表达可降低乳腺癌细胞活力和侵袭能力,并诱导细胞凋亡和下调STAT3信号通路.
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编辑人员丨2023/8/6
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转突变型A53Tα-突触核蛋白基因的帕金森模型小鼠中脑的全基因组甲基化测序分析
编辑人员丨2023/8/6
[目的]研究帕金森氏病(PD)致病基因SNCA在A53T位置突变后对转基因小鼠中脑多巴胺,神经元DNA甲基化修饰的影响.[方法]分别取转突变的人源α-突触核蛋白(hα-syn)即hA53Tα-syn基因小鼠和对照组小鼠的中脑组织,采用重亚硫酸盐测序法(BS-seq)分别对12月龄的转基因小鼠和非转基因(nTg)小鼠进行全基因组甲基化分析,随后筛选出差异甲基化区域(DMR)用于GO富集分析.[结果]通过对比分析,我们总计发现481个DMR,其中高甲基化与低甲基化DMR分别有257和224个,包括与泛素降解途径相关的Ubqln2、HECTD4、Rnf157基因,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PINK1等基因.富集结果显示,差异甲基化基因总共映射到545个GO子条目,且主要富集于解剖结构发育、树突发育、神经系统发育、神经元投射等条目.[结论]帕金森致病基因SNCA在A53T位置的突变可诱导小鼠中脑多巴胺神经元DNA甲基化改变.
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编辑人员丨2023/8/6
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依托咪酯通过调控miR-3666/UBQLN1基因表达抑制乳腺癌细胞增殖和诱导凋亡的机制
编辑人员丨2023/8/5
本研究旨在探讨依托咪酯对乳腺癌细胞增殖、凋亡的影响及其机制,选取依托咪酯(0.2 μg/mL,0.4 μg/mL和0.8 μg/mL)处理乳腺癌细胞SK-BR-3,筛选最适浓度0.8 μg/mL.将依托咪酯+anti-miR-NC组(转染anti-miR-NC)、依托咪酯+anti-miR-3666组(转染anti-miR-3666)、miR-NC组(转染miR-NC)、miR-3666组(转染anti-miR-3666)、anti-miR-NC组(转染anti-miR-NC)和anti-miR-3666组(转染anti-miR-3666)用脂质体法转染至SK-BR-3细胞,部分组用0.8μg/nnL依托咪酯处理.细胞计数(CCK-8)法、流式细胞术、免疫印迹(Western blotting)、实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测细胞的抑制率、凋亡率、miR-3666、泛素1(UBQLN1)、细胞周期素D1 (CyclinD1)、细胞周期依赖性蛋白激酶抑制因子1A (p21)、B细胞淋巴瘤/白血病-2(Bcl-2)、Bcl-2相关的X基因(Bax)的表达;双荧光素酶报告基因检测实验检测细胞的荧光活性.依托咪酯(0.2 μg/mL,0.4 μg/mL和0.8 μg/mL)明显的增强对乳腺癌细胞的抑制率和凋亡率,并上调miR-3666,下调UBQLN1,均呈明显的浓度依赖性(p<0.05).miR-3666能够明显的抑制野生型UBQLN1细胞的荧光活性.过表达miR-3666具有与依托咪酯相似的增强乳腺癌细胞抑制率和凋亡率,下调CyclinD1、Bcl-2,上调p21、Bax的作用.抑制miR-3666明显的减弱依托咪酯对乳腺癌细胞的抑制和凋亡的作用.依托咪酯可抑制乳腺癌细胞增殖,促进凋亡,其机制与上调miR-3666进而靶向抑制UBQLN1有关,将可为依托咪酯用于乳腺癌的治疗提供更充分的理论依据.
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编辑人员丨2023/8/5
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UBQLN-1在直肠癌组织中的表达、临床意义及与预后的相关性分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨泛素-1(UBQLN-1)在直肠癌组织中的表达情况、临床意义及与预后的相关性.方法 选取2015年12月—2016年1月于河北北方学院附属第一医院普通外科住院行直肠癌手术患者90例,留取直肠癌灶组织及癌旁正常组织,应用逆转录聚合酶链反应法(Rt-PCR)检测UBQLN-1 mRNA在两组标本中的表达情况,应用免疫组化检测UBQLN-1蛋白在两组标本中的表达情况,分析其与肿瘤临床病理特征的关系.并对所纳入的患者进行生存期随访,应用Kaplan-Meier绘制生存曲线,应用多因素预后分析UBQLN-1蛋白的表达与直肠癌患者预后的关系.结果 直肠癌组织中UBQLN-1 mRNA的相对表达量明显高于癌旁正常组织,差异有高度统计学意义(P<0.01).直肠癌组织中UBQLN-1的阳性表达明显高于癌旁正常组织,差异有高度统计学意义(P<0.01).不同分化程度、T分期、淋巴结转移及肝转移状态患者直肠癌组织UBQLN-1阳性表达情况比较,差异有统计学意义(P<0.05).UBQLN-1阳性表达的直肠癌患者5年无病生存率明显低于阴性表达者,差异有统计学意义(P<0.05).T分期(HR=1.246)、淋巴结转移(HR=2.538)、肝转移(HR=2.256)及UBQLN-1表达(HR=5.820)是影响患者预后的独立危险因素(P<0.05).结论 直肠癌组织中UBQLN-1高表达与直肠癌的发生、发展、浸润和转移关系密切,同时是直肠癌患者预后的独立危险因素,因而可作为直肠癌早期诊断、预后评估的潜在分子生物学指标.
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编辑人员丨2023/8/5
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UBQLN-1和RUNX3在直肠癌组织中的表达和临床意义
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨UBQLN-1(泛素-1)和人Runt相关转录因子3(RUNX3)在直肠癌组织中的表达和临床意义.方法 选取2017年6月—2019年6月河北北方学院附属第一医院行手术切除的85例直肠癌组织和相应癌旁正常组织,应用逆转录聚合酶链反应法(RT-PCR)和免疫组化法检测UBQLN-1及RUNX3 mRNA与蛋白水平,分析其与肿瘤临床病理特征间的关系及二者表达的相关性.结果 直肠癌组织中UBQLN-1 mRNA表达水平高于癌旁正常组织,RUNX3 mRNA的表达水平低于癌旁正常组织,差异均有高度统计学(P<0.01).直肠癌组织中UBQLN-1阳性表达率高于癌旁正常组织,RUNX3阳性表达率低于癌旁正常组织,差异有高度统计学意义(P<0.01).直肠癌组织中UBQLN-1与RUNX3表达呈负相关(r=-0.225,P=0.038).结论 UBQLN-1和RUNX3在直肠癌组织中的异常表达与其发生发展、演进密切相关,且二者呈明显负相关,可作为直肠癌诊断、治疗和预后评估的潜在分子生物学指标.
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编辑人员丨2023/8/5
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UBQLN1诱导上皮-间质转化促进食管鳞癌细胞的迁移和侵袭
编辑人员丨2023/8/5
目的 分析泛醌蛋白1(UBQLN1)及上皮-间质转化(EMT)标志分子在食管鳞癌(ESCC)组织中的表达及其相关性,探讨UBQLN1对ESCC细胞迁移和侵袭的影响.方法 RT-qPCR和western blot检测ESCC癌组织及对应癌旁组织中UBQLN1的mRNA和蛋白表达;RT-qPCR检测ESCC癌组织及对应癌旁组织中EMT标志分子(E-cadherin、N-cadherin、Vimentin)的mRNA表达;构建UBQLN1 siRNA和过表达重组质粒,分别转染ESCC细胞系EC9706、HET-1A和TE-1;采用划痕试验和Transwell试验检测各细胞的迁移和侵袭能力;RT-qPCR和western blot检测各组EC9706细胞中EMT标志分子的mRNA和蛋白表达.结果 ESCC癌组织中UBQLN1的mRNA和蛋白表达均高于癌旁组织(均P<0.05);ESCC癌组织中E-cadherin mRNA的表达低于癌旁组织(P<0.05),而N-cadherin和Vimentin mRNA的表达均高于癌旁组织(均P<0.05);ESCC组织中UBQLN1与E-cad-herin的mRNA表达呈负相关(r=-0.5173,P<0.001),而与N-cadherin和Vimentin的mRNA表达呈正相关(r=0.7803、0.6856,P<0.001).下调UBQLN1表达增加EC9706、HET-1A和TE-1细胞中E-cadherin的表达,降低N-cadherin和Vimentin的表达,抑制其迁移和侵袭,而过表达UBQLN1下调E-cadherin的表达,上调N-cad-herin和Vimentin的表达,促进细胞迁移和侵袭.结论 UBQLN1能诱导EMT,促进ESCC细胞的迁移和侵袭.
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编辑人员丨2023/8/5
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肝癌患者外周血环状RNAs诊断价值分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨原发性肝癌(PLC)患者外周血中环状RNAs(circRNAs)作为PLC分子标志物的临床诊断价值.方法 利用circRNAs微阵列芯片技术检测4例PLC患者(PLC组)和4例健康对照者(对照组)外周血circRNAs的表达谱,并进行组间差异分析,基因本体/基因功能(GO/KEGG)分析差异表达的circRNAs明显富集的潜在功能和信号通路.结果 与对照组比较,PLC组中共有26种circRNAs具有差异表达,包括上调的14种circRNAs和下调的12种circRNAs,亲本基因为:NFATC3、UBQLN1、SKA3、OAT、DENND4A、MGEA5、N4BP2L2、MKLN1、RANBP9、PICALM、SPECC1、LRP5、FAM64A、RPS8、FLI1、PCNXL2、RPL13、LINC00340、KIF26B、WBSCR17、NUP214、GPI、GRB10.GO/KEGG分析发现,亲本基因多涉及转录因子活性、RNA转运RT及通过内质网蛋白质加工、泛素介导的蛋白质水解和参与cGM P-PKG信号通路等功能.结论 PLC患者外周血存在明显差异表达的circRNAs,其亲本基因可能参与PLC复杂的发病机制.
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编辑人员丨2023/8/5
