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一例Usher综合征Ⅱ型患儿 USH2A基因的致病变异分析
编辑人员丨1天前
目的:分析1例Usher综合征Ⅱ型患儿听力障碍相关基因的致病性变异,为其临床诊断提供分子遗传学依据。方法:采集患儿和父母外周血进行听力障碍者相关基因检测,100名无听力障碍作为正常对照。结果:患儿 USH2A基因存在第41内含子c.8224-1G>C和第28外显子c.5678C>G(p.Ser1893X)复合杂合变异,患儿的母亲为c.8224-1G>C杂合变异携带者,父亲为c.5678C>G杂合变异携带者。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南, USH2A基因c.8224-1G>C和c.5678C>G变异均判定为致病性变异(PVS1+PM2+PM3)。 结论:USH2A基因c.8224-1G>C和c.5678C>G复合杂合变异可能为该患儿的致病原因,新变异的检出扩展了 USH2A基因变异谱。
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编辑人员丨1天前
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USH2A基因外显子13相关遗传性视网膜变性基因治疗进展
编辑人员丨1天前
USH2A基因双等位基因致病变异可导致Usher综合征Ⅱ型和非综合征性视网膜色素变性,患者因光感受器细胞进行性丧失最终失明。USH2A基因很大,其cDNA有15,606 bp,无法使用腺相关病毒载体递送进行基因替代治疗。研究发现位于外显子13的致病变异在USH2A基因所有外显子的致病变异中占比最高,成为治疗的靶点。反义寡核苷酸、基因组编辑和RNA编辑方法对USH2A基因外显子13的干预研究,显示了潜在的治疗效果和应用前景。本文总结了USH2A基因外显子13相关的分子遗传机制、研究结果以及面临的挑战。
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编辑人员丨1天前
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Usher综合征伴合并型甲基丙二酸血症1例
编辑人员丨1天前
本文报告了1例同时患有Usher综合征及合并型甲基丙二酸血症的患儿。患儿为2月龄男性,为小于胎龄儿,新生儿期曾因“喂养困难”住院治疗,生后肌张力低、小头畸形伴听力损失。基因检测显示该患儿 MMACHC基因c.482G>A和c.567dup位点存在复合杂合变异,均为致病变异,分别来自患儿父母;同时患儿存在 USH2A基因c.2802T>G和c.14017T>C位点复合杂合变异,前者为疑似致病性,后者临床意义未明,变异来自患儿父母,临床诊断Usher综合征及甲基丙二酸血症合并同型半胱氨酸血症。随访至2岁余,患儿智能发育中度落后,体格发育与同龄儿相当。
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编辑人员丨1天前
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基于转录组测序分析唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素-15在胃癌细胞中的作用机制
编辑人员丨1天前
目的:筛选并分析唾液酸结合Ig样凝集素15(Siglec-15)在胃癌细胞中的候选靶基因及其下游信号通路并进行患者预后相关性分析。方法:构建干扰Siglec-15基因的最佳慢病毒转染至人胃腺癌AGS细胞株获得沉默组(AGS-shSiglec-15),以及空载体慢病毒转染获得的AGS细胞对照组(AGS-NC),各取三个样本进行转录组测序。根据测序数据筛选差异表达基因,通过GO分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析和GESA分析进行基因的功能注释和信号通路的鉴定。构建蛋白与蛋白相互作用网络图(PPI),进行可视化分析并获取关键互作蛋白,并对靶蛋白进行生存期分析。结果:共鉴定出符合筛选标准的255个差异表达蛋白编码基因,包括119个上调基因和136个下调基因。经GO、KEGG和GSEA分析表明,差异表达基因(DEGs)主要参与甲型流感、Toll样受体信号传导途径、钙信号传导途径、NOD样受体信号传导途径、病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体的相互作用等进程。同时筛选出10个Siglec-15相关基因的靶蛋白,其中钙黏蛋白23(CDH23)[ HR=1.31(1.05~1.63), P<0.05]、蛋白网络成分协调蛋白(USH1C)[ HR=1.25(1.05~1.48), P<0.05]、干扰素调节因子7(IRF7)[ HR=1.7(1.41~2.05), P<0.001]、MX2[ HR=1.63(1.33~2.00), P<0.01]、干扰素调节因子9(IRF9)[ HR=1.30(1.09~1.54), P<0.01]高表达的胃癌患者总生存率(OS)较差。而RSAD2(RSAD2)[ HR=0.78(0.61~1.00), P<0.05]、CC基序趋化因子配体5(CCL5)[ HR=0.66(0.55~0.78), P<0.01]、CXC趋化因子配体(CXCL8)[ HR=0.65(0.53~0.79), P<0.01]、XIAP相关因子1(XAF1)[ HR=0.77(0.65~0.92), P<0.01]、干扰素调节因子6(IRF6)[ HR=0.51(0.41~0.63), P<0.01]高表达的患者具有较好的OS。 结论:沉默Siglec-15基因在胃癌细胞中有明显差异表达基因并参与多种生物学进程和信号通路调节,可能作为胃癌的潜在新免疫检查点标志物及治疗靶点。
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编辑人员丨1天前
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136个耳聋家庭Usher综合征1型相关基因变异情况分析
编辑人员丨1天前
目的:探讨Usher综合征1型(Usher syndrome type 1,USH1)相关基因在136例中国河南籍耳聋家庭中的变异情况。方法:总结2016年11月至2019年12月在郑州大学第一附属医院遗传与产前诊断中心应用二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术进行耳聋基因检测的136个耳聋家庭的临床资料和测序数据,统计分析USH1相关基因( MYO7A、 USH1C、 CDH23、 PCDH15、 USH1G、 CIB2)的变异情况。 结果:共有5个耳聋家庭检测到USH1相关基因的9个致病或可能致病变异,占所有耳聋家庭的3.7%(5/136),其中4个耳聋家庭致病基因为 MYO7A,1个耳聋家庭致病基因为 CDH23,9个变异中的7个变异为首次报道,包括 MYO7A基因的c.313delG、c.5257dupA、c.5435A>T、c.5636G>C、c.5722T>G变异,以及 CDH23基因的c.155_166del、c.4802delA变异。其中家庭2和家庭3的患者视力目前无异常,但根据基因诊断及行走延迟考虑为USH1的可能性大。 结论:在本组河南籍耳聋患者中, MYO7A为USH1相关基因中最常见的致病基因。应用NGS技术可以在视觉症状出现之前对USH1患者进行初步诊断。
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编辑人员丨1天前
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新的 CDH23基因复合杂合模式导致的综合征型耳聋家系研究
编辑人员丨1天前
目的:采用高通量测序技术,对一个综合征型耳聋家系的致病基因及突变进行探究。方法:2018年6月至2020年7月,郑州大学第一附属医院耳科联合郑州大学相关机构对该家系进行了研究。该家系来自河南省濮阳市,2代4人,详细询问病史及家族史,绘制家系图。先证者及其妹患有先天性耳聋,其父母表型正常。对该家系进行临床表型分析,包括影像学、听力检查(包括纯音测听、声导抗、脑干诱发电位、耳声发射)、前庭功能检查及眼科检查(包括视力、视野、眼底检查、视觉诱发电位及视网膜电图)。靶向捕获129个耳聋相关基因的编码区域,采用高通量测序方法检测,并进行生物信息学分析,筛选疑似致病突变,使用Sanger测序和minigene试验进行验证。结果:该家系共2代4人,其中第二代2人(即2例患儿)均患有双耳重度感音神经性聋,伴有双眼视力下降、夜盲症、周边视野敏感度下降及部分视野缺损,前庭功能正常。2例患儿均携带 CDH23(NM_022124.5)、c.6049G>A (p.Gly2017Ser)、c.9856C>G(p.His3286Asp)及c.8699A>G (p.Asp2900Gly),其中c.6049G>A及c.9856C>G遗传自表型正常的父亲,c.8699A>G遗传自表型正常的母亲。错义突变c.9856C>G及c.8699A>G在gnomAD数据库中未收录。错义突变c.6049G>A位于第46号外显子的最后一个碱基位置,生物信息学软件预测其可能影响剪切,minigene试验表明,该突变位点会造成第46号外显子的跳跃,导致其所表达的蛋白功能异常。通过文献检索,并根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传突变分类标准与指南,将c.6049G>A及c.8699A>G归类为致病/可能致病突变,c.9856C>G归类为临床意义未明突变。 结论:该病例是由 CDH23剪切变异与错义变异复合杂合导致的Usher综合征1D型(USH1D), CDH23的这种复合杂合形式会导致USH1D。
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编辑人员丨1天前
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Usher综合征伴黄斑水肿1例
编辑人员丨1天前
患者女,33岁。因双眼视物模糊伴行走不稳2年,于2022年6月8日到南京市江宁中医院眼科就诊。患者诉近2年视物模糊明显,伴上下楼梯行走不稳、行走撞物等;青少年时期初即出现夜盲症;7岁时确诊听力障碍,配有助听器,未规律佩戴,听力无明显进行性下降。父母非近亲结婚,直系亲属无类似病症。患者闭目直立、快速轮替、指鼻试验均为阴性。眼科检查:右眼、左眼最佳矫正视力(BCVA)分别为0.3、0.25。右眼、左眼眼压分别为15、17 mm Hg(1 mm Hg= 0.133 kPa)。双眼眼前节未见明显异常。眼底检查,双眼视盘颜色淡红,视网膜动静脉细,广泛青灰色污秽状改变,骨细胞样色素沉着,黄斑中心凹反光减弱(图1A,1B)。荧光素眼底血管造影检查,双眼晚期视网膜血管纤细,动静脉充盈时间延迟,黄斑中心凹周围至赤道部视网膜斑驳状强荧光,黄斑区少量荧光素"花瓣样"积存(图1C,1D)。光相干断层扫描(OCT)检查,双眼黄斑中心凹视网膜厚度增加,视网膜外核层、外丛状层及内核层囊样弱反射(图2A,2B)。OCT血管成像检查,双眼黄斑区旁中心凹视网膜血流密度(PFD)降低(图2C,2D)。视野检查,双眼周边视野缺损,管状视野。全视野视网膜电图检查,双眼a波、b波波峰明显下降,峰时延长,暗适应0.01的振幅近乎呈熄灭型(图3A,3B)。眼底自发荧光检查,双眼黄斑中心凹"花瓣样"强荧光,中心凹旁强荧光环,环外弱荧光,骨细胞样色素沉着处无荧光(图4)。听力检查,气导和骨导呈一致性下降,呈陡降型,低频听力轻、中度损失,高频听力重度损失。采集患者及其父母外周静脉血行基因检测。对患者采用全外显子组测序,检测结果通过生物信息学分析后得到候选致病突变位点。运用Sanger测序进行验证及家系共分离分析,确定致病性突变位点。检测结果显示,患者临床信息相关的1个父源疑似致病性变异,一个母源疑似致病性变异,且均为 ADGRV1基因杂合移码突变(图5)。诊断:Usher综合征(USH)2型、视网膜色素变性(RP)伴黄斑囊样水肿(CME)。予以口服醋甲唑胺25 mg,2次/d治疗,持续2个月。OCT检查,双眼黄斑水肿明显改善,视网膜中央黄斑厚度(CMT)显著下降(图6)。双眼BCVA较治疗前无明显变化。停药后随访3个月,CME未见明显复发。
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编辑人员丨1天前
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基于类器官的视网膜色素变性疾病模型构建及研究进展
编辑人员丨1天前
基于多能干细胞定向诱导分化视网膜类器官(RO)技术可以高度模拟人类视网膜的发育过程,帮助深入理解视网膜的发育机制,并为视网膜疾病提供新的治疗方法。目前,RO广泛应用于视网膜疾病的机制和治疗研究,尤其在视网膜色素变性(RP)中取得了较为突出的进展。本文总结了利用人多功能干细胞制备RO的方法,阐述了RO-RP疾病模型在 PRPF31、 RPGR、 CRB1、 RP2、 IMPG2、 NR2E3、 USH2A、 PDE6B和 TRNT1等不同突变基因中的机制与治疗应用,概括其在药物筛选、药物毒性试验、基因疗法和细胞疗法方面的研究进展,讨论了RO的研究及应用挑战。
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编辑人员丨1天前
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PCDH15基因复合杂合新突变致无色素性视网膜色素变性表型的1F型Usher综合征一家系
编辑人员丨1天前
目的:确定1个具有无色素性视网膜色素变性(RPSP)表型的Usher综合征(USH)家系的致病基因及其与眼部表现相关性。方法:回顾性临床研究。2019年11月于河南省人民医院眼科门诊检查确诊的具有RPSP表现的1F型USH患儿1例和其父母纳入研究。患儿女,9岁。双眼夜盲4年余;听力下降7年,目前双耳感音神经性耳聋。双眼最佳矫正视力0.5 +。眼底未见明显色素沉着。外围视野视敏度下降。光相干断层扫描检查,周边视网膜外层变薄,椭圆体带消失。视网膜电图检查,视杆、视锥系统反应重度下降。患儿父母临床表型正常。抽取患儿及其父母外周静脉血,提取全基因组DNA,采用自主研发的靶向捕获试剂盒(PS400),使用二代基因测序技术检测基因变异,对可疑致病突变位点通过Sanger测序进行验证,并在家系成员中进行共分离。依据序列变异解读标准和指南对变异进行致病性评估;利用生物信息学技术评估变异对编码蛋白的影响。 结果:基因检测结果显示,先证者检测到 PCDH15基因c.4109dupA (p.K1370fs)(M1 )、c.17dupA (p.Y6_L7delinsX)(M2 )复合杂合突变位点,经Sanger测序验证,变异在该家系中呈共分离状态。经序列变异解读标准和指南评估,M1、M2均为 PCDH15基因致病性变异,M1导致编码蛋白跨膜结构完全改变,M2导致基因仅能翻译出6个氨基酸,预测不能合成PCDH15蛋白。根据临床表型、基因变异致病性以及蛋白结构预测,最终临床诊断为 PCDH15相关1F型USH。 结论:PCDH15基因c.4109dupA、c.17dupA为该家系患儿USH的致病突变位点,该复合杂合新突变导致PCDH15蛋白无法正常合成,从而引起眼部及耳部表现。
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编辑人员丨1天前
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2型Usher综合征和视网膜色素变性家系USH2A基因突变及临床表型分析
编辑人员丨1天前
目的:观察2型Usher综合征(USH2)和视网膜色素变性(RP)患者的基因突变型及其临床表型。方法:2018年8月至2019年1月于河南省立眼科医院就诊的USH2和RP 3个家系的4例患者和11名正常家系成员纳入研究。详细询问病史并行视力、眼底彩色照相、OCT、视野、全视野ERG检查。3个家系中,家系1为USH2;家系2、3为RP。采集患者及其家系成员外周静脉血,提取全基因组DNA,应用基于靶向捕获的二代测序技术进行基因测序,对可疑致病突变位点通过Sanger进行验证,并在家系成员中进行共分离。结果:家系1先证者除眼底有RP表现外,同时合并神经性耳聋。基因检测结果显示,先证者USH2A基因第64、5号外显子分别存在c.13877-13880 del AGAC (p. Q4626P)(M1)、c.798 del T (p. F266L)(M2)2个杂合性移码突变。家系2、3先证者仅有眼底典型RP表现。基因检测结果显示,家系2先证者USH2A基因第70、37、29号外显子分别存在c.15178T> c (p. S5060P)(M3)、c.6986C> A (p. P2329H)(M4)2个杂合性错义突变和c.5836C> T (p. R1946X)(M5)终止突变。家系3先证者USH2A基因第67、57号外显子分别存在c.14951C> T (p. P4984L) (M6)、c.11156G> A (p. R3719H) (M7)2个杂合性错义突变。保守性分析结果显示,USH2A p. Q4626P、p. F266L、p. S5060P、p. P2329H、p. P4984L所对应的氨基酸位点在多个物种中均高度保守。检测出的7个致病突变中,M1~ M4、M6为新发现突变位点。结论:USH2A基因突变是导致USH2和非综合征性RP的主要原因;不同突变位点影响蛋白质翻译和合成,导致不同临床表型。
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编辑人员丨1天前
