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136个耳聋家庭Usher综合征1型相关基因变异情况分析
编辑人员丨4天前
目的:探讨Usher综合征1型(Usher syndrome type 1,USH1)相关基因在136例中国河南籍耳聋家庭中的变异情况。方法:总结2016年11月至2019年12月在郑州大学第一附属医院遗传与产前诊断中心应用二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术进行耳聋基因检测的136个耳聋家庭的临床资料和测序数据,统计分析USH1相关基因( MYO7A、 USH1C、 CDH23、 PCDH15、 USH1G、 CIB2)的变异情况。 结果:共有5个耳聋家庭检测到USH1相关基因的9个致病或可能致病变异,占所有耳聋家庭的3.7%(5/136),其中4个耳聋家庭致病基因为 MYO7A,1个耳聋家庭致病基因为 CDH23,9个变异中的7个变异为首次报道,包括 MYO7A基因的c.313delG、c.5257dupA、c.5435A>T、c.5636G>C、c.5722T>G变异,以及 CDH23基因的c.155_166del、c.4802delA变异。其中家庭2和家庭3的患者视力目前无异常,但根据基因诊断及行走延迟考虑为USH1的可能性大。 结论:在本组河南籍耳聋患者中, MYO7A为USH1相关基因中最常见的致病基因。应用NGS技术可以在视觉症状出现之前对USH1患者进行初步诊断。
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编辑人员丨4天前
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Goldengate高通量耳聋基因芯片在大前庭水管综合征中的有效性验证及应用分析
编辑人员丨4天前
目的:将Goldengate高通量耳聋基因芯片应用于大前庭水管综合征患者,验证芯片的准确性及有效性,为制定更加详细的大前庭水管综合征遗传检测策略提供参考。方法:2016年8月至2018年2月利用本研究团队研发的Goldengate高通量耳聋检测芯片,检测15例确诊为大前庭水管综合征耳聋患者及60例健康人对照样本,并利用Sanger测序法验证芯片检测结果。所有大前庭水管综合征患者均进行 SLC26A4基因测序,并与芯片结果进行对比分析。 结果:12/15患者通过芯片检测出 SLC26A4基因突变,通过芯片检测和 SLC26A4基因直接测序共检出9种突变,其中7种突变被两种方法均检出,该芯片可检测出 SLC26A4基因直接测序法所提供的等位基因信息的93.33%(28/30)。除 SLC26A4基因以外,15例大前庭水管综合征患者通过芯片还同时检测出 GJB2、 PCDH15、 TMC1、 MYO6以及线粒体基因的突变,并均经过Sanger测序法得到验证。 结论:Goldengate高通量耳聋基因芯片具有检测覆盖广、准确性高等特点,可作为大前庭水管综合征患者的初步检测手段。
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编辑人员丨4天前
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一个双基因Usher综合征1D/F型耳聋家系的基因检测
编辑人员丨4天前
目的:探讨1个先天性重度耳聋家系的致病基因变异类型,明确其可能的遗传学病因。方法:运用高通量测序的方法对家系中的先证者进行415个遗传性耳聋相关基因的序列检测,应用Sanger测序法对高通量测序结果进行验证并对先证者父母和妹妹进行基因变异位点验证。结果:先证者基因组DNA中检测到与双基因Usher综合征1D/F型耳聋相关的 CDH23基因c.5131G>A(p.Val1711Ile)杂合变异和 PCDH15基因c.2884C>T(p.Arg962Cys)杂合变异,先证者父亲携带 PCDH15基因c.2884C>T(p.Arg962Cys)杂合变异,先证者母亲携带 CDH23基因c.5131G>A(p.Val1711Ile)杂合变异。先证者妹妹听力正常,携带 CDH23基因c.5131G>A(p.Val1711Ile)杂合变异,不携带 PCDH15基因c.2884C>T(p.Arg962Cys)杂合变异。按照美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南进行致病性评级, CDH23基因c.5131G>A(p.Val1711Ile)变异和 PCDH15基因c.2884C>T(p.Arg962Cys)变异均为可能致病性变异(PS1+PM2+PP3+PP4)。 结论:CDH23基因c.5131G>A(p.Val1711Ile)变异和 PCDH15基因c.2884C>T(p.Arg962Cys)变异可能为该家系耳聋发生的遗传学原因。
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编辑人员丨4天前
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一个 PCDH15基因变异所致的Usher综合征家系的遗传学分析及产前诊断
编辑人员丨4天前
目的:对1个Usher综合征家系的临床特征及基因变异进行分析,明确其遗传病因。方法:对家系中患儿进行全外显子测序,就发现的可疑致病变异用Sanger测序法对患儿及其父母进行检测,明确先证者病因后,进一步对家系中的胎儿进行产前诊断。结果:测序结果显示先证者 PCDH15基因(NM_033056)存在c.17_18insA(p.Tyr6Ter*)及c.4095_4096insA(p.Arg1366Lys fs*38)复合杂合变异,变异分别来源于其父母。同时对100名正常人DNA进行 PCDH15基因(NM_033056)c.17_18insA及c.4095_4096insA变异筛查均未发现相同变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南,以上两个变异判定为致病性变异(PVS1+PM2+PP4)。经验证,胎儿为 PCDH15基因(NM_033056)c.4095_4096insA变异携带者,预测胎儿不会出现Usher综合征,该胎儿出生后通过了新生儿听力筛查,至1岁多未发现明显听觉、视觉功能异常。 结论:PCDH15基因(NM_033056)c.17_18insA(p.Tyr6Ter*)及c.4095_4096insA(p.Arg1366Lys fs*38)插入移码变异可能是该家系罹患Usher综合征的遗传病因。
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编辑人员丨4天前
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PCDH15基因复合杂合新突变致无色素性视网膜色素变性表型的1F型Usher综合征一家系
编辑人员丨4天前
目的:确定1个具有无色素性视网膜色素变性(RPSP)表型的Usher综合征(USH)家系的致病基因及其与眼部表现相关性。方法:回顾性临床研究。2019年11月于河南省人民医院眼科门诊检查确诊的具有RPSP表现的1F型USH患儿1例和其父母纳入研究。患儿女,9岁。双眼夜盲4年余;听力下降7年,目前双耳感音神经性耳聋。双眼最佳矫正视力0.5 +。眼底未见明显色素沉着。外围视野视敏度下降。光相干断层扫描检查,周边视网膜外层变薄,椭圆体带消失。视网膜电图检查,视杆、视锥系统反应重度下降。患儿父母临床表型正常。抽取患儿及其父母外周静脉血,提取全基因组DNA,采用自主研发的靶向捕获试剂盒(PS400),使用二代基因测序技术检测基因变异,对可疑致病突变位点通过Sanger测序进行验证,并在家系成员中进行共分离。依据序列变异解读标准和指南对变异进行致病性评估;利用生物信息学技术评估变异对编码蛋白的影响。 结果:基因检测结果显示,先证者检测到 PCDH15基因c.4109dupA (p.K1370fs)(M1 )、c.17dupA (p.Y6_L7delinsX)(M2 )复合杂合突变位点,经Sanger测序验证,变异在该家系中呈共分离状态。经序列变异解读标准和指南评估,M1、M2均为 PCDH15基因致病性变异,M1导致编码蛋白跨膜结构完全改变,M2导致基因仅能翻译出6个氨基酸,预测不能合成PCDH15蛋白。根据临床表型、基因变异致病性以及蛋白结构预测,最终临床诊断为 PCDH15相关1F型USH。 结论:PCDH15基因c.4109dupA、c.17dupA为该家系患儿USH的致病突变位点,该复合杂合新突变导致PCDH15蛋白无法正常合成,从而引起眼部及耳部表现。
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编辑人员丨4天前
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生长分化因子15在甲状腺乳头状癌中的表达及其临床意义
编辑人员丨4天前
目的:探讨生长分化因子15(GDF-15)在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达及临床意义。方法:收集2019年1月至2月在湖南中医药大学第一附属医院行甲状腺癌根治术的3例PTC患者的肿瘤组织及淋巴结转移灶组织,使用高通量测序筛选差异表达基因;收集20例PTC患者肿瘤原发灶及淋巴结转移灶,用于验证测序结果;另收集20例PTC原发灶及癌旁组织(距肿瘤边缘>2 cm),用于验证目的基因在肿瘤组织及癌旁组织的表达情况;同时收集湖南中医药大学第一附属医院2014年1月至12月行甲状腺癌根治术PTC患者病理标本64例,其中31例患者伴淋巴结转移。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测GDF-15的表达情况,验证测序结果;采用免疫组织化学法检测GDF-15蛋白在PTC原发灶、癌旁组织以及淋巴结转移灶组织中表达水平。根据GDF-15蛋白在PTC患者原发灶组织中的表达,将其分为高表达组(35例)与低表达组(29例),分析GDF-15表达水平与患者临床病理特征的关系;Kaplan-Meier法分析两组患者5年无瘤生存率。结果:3例PTC原发灶与转移灶组织mRNA高通量测序结果显示,前10位差异表达基因为CDH2、CDF15、DKK1、GLIPR1、PCDH7、ID3、FBN1、MYPN、UBASH3B、CCDC80。20例PTC原发灶组织及癌旁组织中GDF-15 mRNA表达量分别为4.1±0.5、2.8±0.3,差异有统计学意义( t=2.220, P=0.032)。另20例PTC原发灶及淋巴结转移灶组织中GDF-15 mRNA表达量分别为3.1±0.4、5.8±0.7,差异有统计学意义( t=3.556, P=0.001)。免疫组织化学结果显示,GDF-15在癌旁组织、PTC原发灶及转移灶中免疫组织化学评分分别为(4.0±0.3)分、(6.1±0.3)分和(9.0±0.4)分,PTC原发灶与癌旁组织、转移灶与癌旁组织、转移灶与原发灶组织GDF-15蛋白表达比较,差异均有统计学意义(均 P<0.01)。GDF-15高表达组与低表达组患者肿瘤长径、肿瘤T分期、肿瘤N分期构成比比较,差异均有统计学意义(均 P<0.05);GDF-15高表达组患者5年无瘤生存率为60%,低表达组为83%,差异有统计学意义( P=0.033)。 结论:GDF-15在癌旁组织、PTC组织及淋巴结转移灶组织中表达逐渐增高,且其表达水平与患者肿瘤进展、复发、转移相关,可作为潜在的临床判断预后的预警分子及治疗靶点。
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编辑人员丨4天前
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一对常染色体隐性遗传性聋夫妻的遗传学及产前诊断分析
编辑人员丨1个月前
目的 对一对常染色体隐性非综合征型聋备孕夫妻患者进行基因分析,以明确其可能的遗传学病因,并为其提供产前诊断.方法 应用遗传性听力损失Panel对先证者进行基因分析,应用Sanger测序法对可疑致病位点进行验证,孕妇18周采集羊水后进行产前基因诊断.结果 妻子检测到常染色体隐性遗传性聋3型相关基因 MYO15A c.10419_10423delCAGCT/c.10294_10308delCCTTGCATCCTTGCC 复合杂合变异,分别遗传自其父母.丈夫检测到常染色体隐性遗传性聋77型相关基因LOXHD1 c.6388C>T/exon 33-38 del复合杂合变异,分别遗传自其父母.胎儿羊水检测到母源MYO15A c.10294_10308del CCTTGCATCCTTGCC杂合变异与父源LOXHD1 exon 33-38 del杂合变异,同时还检测到父源CDH23 c.6693delT杂合变异与母源PCDH15 c.5048_5051dupAGAA杂合变异,这两个杂合变异导致胎儿可能患ID/F型Usher综合征.结论 该耳聋夫妻为两个不同的耳聋基因变异所致,胎儿患与该夫妻双方相同耳聋的概率很低,但胎儿患二基因突变引起的耳聋的可能性大.对于双方均为耳聋患者的家庭进行产前诊断时应关注二基因突变导致的耳聋.
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编辑人员丨1个月前
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原钙黏蛋白7的结构和功能及与肿瘤的关系
编辑人员丨2024/7/6
钙黏附蛋白是一类钙依赖性的黏附分子,是一种细胞跨膜糖蛋白,介导正常组织、肿瘤组织中细胞-细胞间的黏附作用,原钙黏蛋白(protocadherin,PCDH)是其最大的亚家族.PCDH 广泛分布于中枢神经系统,根据基因结构分为非成簇原钙黏蛋白和成簇原钙黏蛋白.PCDH7 属于非成簇PCDHs家族,在人类基因组中定位于 4p15,主要在人类的脑和心脏中表达,具有与经典钙黏附蛋白相似的作用,介导细胞之间的识别和黏附.在多种肿瘤中均检测到不同程度PCDH7的异常表达,PCDH7 可能与肿瘤的增殖、侵袭、转移和预后相关.本文对PCDH7 的基因结构和功能与肿瘤的关系作一综述.
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编辑人员丨2024/7/6
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肺癌患者PCDH20、VEGF蛋白和HE4表达水平与临床病理的相关性研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨肺癌患者原钙黏蛋白20(PCDH20)、血管内皮生长因子(VEGF)蛋白和人附睾蛋白4(HE4)表达水平与临床病理的相关性.方法 手术切除的原发性肺癌患者104例组织标本作为研究对象(肺癌组),选取其中15例肺癌周边正常肺组织作为对照组.检测2组中PCDH20 mRNA、VEGF蛋白和HE4表达水平,采用免疫组化方法对肺癌组织中PCDH20、VEGF蛋白和HE4阳性细胞标注.结果 肺癌组PCDH20 mRNA表达水平低于对照组, VEGF蛋白、HE4表达水平高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).2组PCDH20、VEGF蛋白和HE4阳性表达情况、阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05).PCDH20在不同性别间阳性率比较差异无统计学意义(P>0.05),不同病变部位、病理分期、分化程度和淋巴结转移间阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05).VEGF在不同性别、病变部位间阳性率比较差异无统计学意义(P>0.05),不同病理分期、分化程度、淋巴结转移间阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05).HE4在不同性别、病变部位、分化程度、淋巴结转移间阳性率比较,差异无统计学意义(P >0.05),不同病理分期间阳性率比较差异有统计学意义(P<0.05).通过对临床和病理因素筛选以多因素Logistic回归分析发现,病理分期、分化程度、淋巴结转移是影响PCDH20和VEGF蛋白表达的因素,病理分期是影响HE4表达的因素,差异均有统计学意义(P<0.05).结论 PCDH20、VEGF蛋白和HE4高表达于肺癌组织,且与病理分期、分化程度、淋巴细胞转移有不同程度的相关性.
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编辑人员丨2023/8/6
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三种遗传性耳聋基因交互作用与高频听力损失易感性的关系
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨EYA4基因、粒状头样2(grainyhead-like-2,GRHL2)基因和原钙黏蛋白15 (protocadherin 15,PCDH15)基因的交互作用与噪声性高频听力损失(noise-induced high-frequency heating loss,NIHL)之间的关系.方法 将双耳高频平均听阈≥40 dB (A)的343名噪声作业工人作为观察组;按匹配标准,选择双耳高频平均听阈及平均语频均<25 dB (A)的343名噪声作业工人作为对照组.应用条件Logistic回归方法探讨基因单个位点与NIHL易感性之间的关系,应用广义多因子降维法(generalized muhiple dimensionality reduction,GMDR)分析基因一基因之间交互作用对NIHL易感性的作用.结果 在校正吸烟、饮酒、高血压和身高因素后,EYA4基因rs3813346位点在共显性、显性和隐性遗传模型下与NIHL关联(P值分别为0.012、0.024和0.043);GRHL2基因rs3735715位点在共显性和显性遗传模型下与NIHL关联(P值分别为0.047和0.046).PCDH 15基因rs11004085 CT基因型与TT基因型相比,发生NIHL的风险增加.EYA4基因的rs3813346、rs9321402和GRHL2基因rs3735715间的交互作用可能与NIHL之间存在关联(P=0.012),交叉验证一致性和预测准确率均为最高,分别为10/10和54.47%.结论 EYA4基因和GRHL2基因可能通过独立和/或交互作用与NIHL易感性之间发生关联.
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编辑人员丨2023/8/6
