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间充质干细胞外泌体lncRNA ZEB1-AS1通过靶向miR-142-5p/PTEN调控糖尿病性肾病
编辑人员丨23小时前
目的:探讨脂肪源间充质干细胞(adMSC)的外泌体长链非编码RNA锌指E盒结合同源框1反义链1(Zinc finger E-box binding homeobox 1 antisense 1, ZEB1-AS1)在糖尿病肾病(DN)中的作用机制。方法:采用大鼠DN模型和高糖(HG)诱导的肾小球系膜细胞(GMCs)模型进行生化分析和炎症/氧化应激检测;双荧光素酶基因报告实验验证ZEB1-AS1、第10号染色体同源丢失性磷酸酶-张力蛋白基因(PTEN)与microRNA(miR)-142-5p的结合关系;Western blotting检测PTEN蛋白表达水平。结果:adMSC分泌的外泌体ZEB1-AS1可降低DN大鼠血糖、血清肌酐、24 h尿蛋白、肾脏重量、肾组织纤维化以及炎症细胞浸润水平。同时,在DN大鼠和HG诱导的GMCs中,肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-6(IL-6)和白细胞介素-1β(IL-1β)的表达下降,而谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)和谷胱甘肽(GSH)的表达上升。此外,miR-142-5p能与ZEB1-AS1、PTEN结合;miR-142-5p过表达或PTEN沉默逆转了外泌体ZEB1-AS1对炎症细胞因子水平的抑制作用和对抗氧化酶浓度的促进作用。结论:来自adMSC的外泌体ZEB1-AS1通过miR-142-5p/PTEN通路,控制炎症和氧化应激来抑制DN的进展。这表明ZEB1-AS1可能是治疗DN潜在、有效的靶点。
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编辑人员丨23小时前
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一例Mowat-Wilson综合征患儿的临床和遗传学分析
编辑人员丨23小时前
目的:分析1例Mowat-Wilson综合征轻症患儿的临床表型和基因变异,明确其致病原因,为临床诊断提供依据。方法:应用全外显子测序及Sanger测序对基因变异进行分析。结果:测序结果显示患儿ZEB2基因第8个外显子存在c.2609C>G(p.Ser870X)杂合无义变异,嵌合比率为30%,患儿父母均未检测到该变异,且为未报道过的新变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南,ZEB2基因c.2609C>G(p.Ser870X)变异评级为致病变异(PVS1+PS1+PS2+PM2)。结论:ZEB2基因c.2609C>G(p.Ser870X)变异可能为患儿的致病原因,变异的嵌合现象可能是导致患儿症状较轻的原因之一。
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编辑人员丨23小时前
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miR-5590-3p介导TGFBR2表达对胃癌细胞HS-746T侵袭和增殖的影响
编辑人员丨23小时前
目的:探讨微小RNA(miR)-5590-3p对转化生长因子βⅡ型受体(TGFBR2)基因表达的抑制作用及对胃癌细胞HS-746T侵袭和增殖的影响。方法:体外培养胃癌细胞系,实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测胃癌组织和细胞系中miR-5590-3p的表达。采用脂质体转染法分别转染miR-NC和miR-5590-3p模拟物至胃癌细胞HS-746T中,分别命名为miR-5590-3p组和miR-NC组。qRT-PCR检测转染效果。Transwell实验和CCK-8实验检测转染后胃癌细胞HS-746T侵袭和增殖能力。生物信息学软件预测和双荧光素酶报告基因系统验证miR-5590-3p的靶基因。qRT-PCR和Western blot检测转染后细胞中TGFBR2及下游蛋白的表达。结果:miR-5590-3p在胃癌组织的表达明显低于癌旁组织( P<0.01)。miR-5590-3p在胃癌细胞系的表达明显低于正常胃黏膜上皮细胞( P<0.05),在HS-746T细胞中表达最低( P<0.01)。转染后miR-5590-3p组miR-5590-3p的表达(11.76±0.21)明显高于miR-NC组(1.06±0.21),差异有统计学意义( P<0.01)。miR-NC组和miR-5590-3p组侵袭细胞数量分别为(101.20±15.47)个和(26.53±6.53)个,miR-5590-3p组细胞侵袭能力明显下降( P<0.01)。与miR-NC组比较,miR-5590-3p组细胞增殖能力明显降低( P<0.05)。生物信息学软件显示miR-5590-3p的靶基因是TGFBR2。双荧光素酶报告基因系统证实miR-5590-3p可靶向结合TGFBR2基因( P<0.01)。Western blot结果显示,与miR-NC组比较,miR-5590-3p组HS-746T细胞中TGFBR2的表达明显降低( P<0.01)。肿瘤侵袭相关蛋白ZEB-1、ZEB-2表达降低,细胞周期相关蛋白CDK1和Cyclin B表达降低。 结论:miR-5590-3p可通过靶向结合并调控TGFBR2基因的表达,抑制胃癌细胞HS-746T的侵袭和增殖能力。
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编辑人员丨23小时前
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野黄芩素通过miRNA-496和基质细胞衍生因子1对子宫颈癌细胞增殖及迁移的影响
编辑人员丨23小时前
目的:探讨野黄芩素通过miRNA-496(miR-496)、基质细胞衍生因子1(SDF-1)对子宫颈癌细胞株HCC94细胞增殖及迁移能力的影响。方法:取对数生长期的HCC94细胞,分别加入20 μmol/L野黄芩素溶液(野黄芩素组)和二甲基亚砜(DMSO)(对照组)。分别采用CCK-8法和Transwell实验检测两组HCC94细胞增殖和迁移能力,实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测miR-496和SDF-1 mRNA的相对表达量。采用生物信息学软件TarBase预测miR-496的靶基因,并用双荧光素酶报告基因实验进行验证。采用蛋白质印迹法检测相关蛋白的表达情况。结果:与对照组比较,培养第3、4、5天,野黄芩素组HCC94细胞增殖能力均降低(均 P<0.05)。野黄芩素组和对照组HCC94细胞的穿胶细胞数分别为(25±5)个和(134±19)个,野黄芩素组细胞迁移能力较对照组降低( t=5.61, P<0.01)。对照组和野黄芩素组miR-496相对表达量分别为1.07±0.12和11.24±2.75,差异有统计学意义( t=3.68, P<0.01)。双荧光素酶报告基因实验结果证实SDF-1是miR-496的下游靶基因。野黄芩素组和对照组HCC94细胞中SDF-1 mRNA相对表达量分别为0.29±0.05和1.01±0.07,差异有统计学意义( t=7.22, P<0.01)。与对照组比较,野黄芩素促进miR-496表达后,SDF-1蛋白、细胞增殖蛋白细胞周期蛋白依赖激酶3(CDK3)、细胞迁移蛋白Slug和Zeb-2表达均降低。 结论:野黄芩素可通过miR-496-SDF-1轴抑制子宫颈癌HCC94细胞的增殖及迁移。
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编辑人员丨23小时前
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ZEB1-AS1靶向微RNA-297调控脂多糖诱导的人牙周膜细胞损伤
编辑人员丨23小时前
目的:探讨ZEB1-AS1对脂多糖(LPS)诱导的人牙周膜细胞损伤的影响和可能机制。方法:体外培养人牙周膜细胞,分为对照组(Con组)、LPS组、LPS+si-NC组、LPS+si-ZEB1-AS1组、LPS+miR-NC组、LPS+miR-297组、LPS+si-ZEB1-AS1+anti-miR-NC组和LPS+si-ZEB1-AS1+anti-miR-297组,RT-PCR法检测细胞中ZEB1-AS1和miR-297表达水平,酶联免疫吸附法检测TNF-α和IL-1β表达水平,流式细胞术检测细胞凋亡,Western Blot检测细胞中Bcl-2和Bax蛋白表达水平。双荧光素酶报告基因实验验证ZEB1-AS1和miR-297调控关系。结果:与Con组比较,LPS组ZEB1-AS1(3.65±0.24比1.00±0.07)、TNF-α[(8.87±0.73)ng/ml比(3.26±0.31)ng/ml]和IL-1β[(6.06±0.47)ng/ml比(1.96±0.14)ng/ml]水平、细胞凋亡率[(23.58±2.04)%比(7.69±0.45)%]和Bax蛋白水平(0.78±0.05比0.30±0.02)均升高( P<0.05),miR-297(0.49±0.05比1.00±0.05)和Bcl-2蛋白水平(0.21±0.02比0.63±0.04)均降低( P<0.05)。与LPS+si-NC组比较,LPS+si-ZEB1-AS1组TNF-α[(5.05±0.41)ng/ml比(8.95±0.58)ng/ml]和IL-1β[(3.35±0.27)ng/ml比(6.11±0.57)ng/ml]水平、细胞凋亡率[(11.53±1.07)%比(24.08±2.33)%]和Bax蛋白水平(0.39±0.04比0.79±0.07)降低( P<0.05),Bcl-2蛋白水平升高(0.56±0.04比0.20±0.02, P<0.05)。与LPS+miR-NC组比较,LPS+miR-297组TNF-α[(6.11±0.56)ng/ml比(9.14±0.62)ng/ml]和IL-1β[(3.93±0.27)ng/ml比(6.53±0.32)ng/ml]水平、细胞凋亡率[(14.04±1.05)%比(25.45±2.34)%]和Bax蛋白水平(0.43±0.03比0.80±0.05)降低( P<0.05),Bcl-2蛋白水平升高(0.52±0.05比0.19±0.02, P<0.05)。ZEB1-AS1在人牙周膜细胞中负调控miR-297表达。与LPS+si-ZEB1-AS1+anti-miR-NC组比较,LPS+si-ZEB1-AS1+anti-miR-297组TNF-α[(7.56±0.54)ng/ml比(4.94±0.35)ng/ml]和IL-1β[(5.25±0.32)ng/ml比(3.04±0.23)ng/ml]水平、细胞凋亡率[(19.92±1.05)%比(10.64±1.02)%]和Bax蛋白水平(0.67±0.04比0.39±0.03)升高( P<0.05),Bcl-2蛋白水平降低(0.30±0.02比0.58±0.04, P<0.05)。 结论:下调ZEB1-AS1可能通过靶向负调控miR-297降低LPS诱导的人牙周膜细胞炎症反应和凋亡,减轻细胞损伤。
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编辑人员丨23小时前
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长链非编码RNA Opa相互作用蛋白5-反义转录物1在结直肠腺癌组织的表达及其与细胞增殖和转移的关系
编辑人员丨1天前
目的:探讨长链非编码RNA Opa相互作用蛋白5-反义转录物1(lncRNA OIP5-AS1)在结直肠癌组织中的表达及其与结直肠癌细胞增殖和转移的关系。方法:选取2023年2月至2024年2月期间于河南省驻马店市中心医院和新乡医学院第一附属医院就诊并行结直肠癌根治术的51例结直肠癌患者,荧光定量聚合酶链反应(PCR)法检测所有患者结直肠癌组织和癌旁组织中lncRNA OIP5-AS1的mRNA表达水平;将短发卡RNA(shRNA)空载体(shRNA-Control)、OIP5-AS1敲低质粒(shRNA-OIP5-AS1)转染至HCT116结直肠癌细胞中,采用噻唑蓝(MTT)比色法检测shRNA-Control和shRNA-OIP5-AS1细胞的增殖活力;采用Transwell实验检测shRNA-Control和shRNA-OIP5-AS1细胞的迁移和侵袭能力;采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测两组细胞中波形蛋白(Vimentin)、N-钙黏蛋白(N-Cadherin)、锌指E-盒结合同源盒蛋白1(ZEB 1)、E-钙黏蛋白(N-Cadherin)的蛋白表达,组间计量数据采用独立样本 t检验。 结果:lncRNA OIP5-AS1 mRNA在结直肠癌组织(1.50±0.13)中的表达水平明显高于癌旁组织(0.54±0.08),差异有统计学意义( t=45.99, P<0.05)。shRNA-OIP5-AS1细胞(0.80±0.06)的吸光度值明显低于shRNA-Control细胞(1.30±0.04),差异有统计学意义( t=16.62, P<0.05)。shRNA-OIP5-AS1细胞迁移细胞数[(74.50±3.73)个]和侵袭细胞数[(66.50±5.09)个]明显低于shRNA-Control细胞[(126.33±6.28)、(109.67±3.88)个],差异有统计学意义( t=17.38、16.52, P<0.05)。shRNA-OIP5-AS1细胞E-Cadherin[(5.36±0.28) ng/ml]蛋白表达水平明显高于shRNA-Control细胞[(2.96±0.13) ng/ml],差异有统计学意义( t=18.97, P<0.05)。shRNA-OIP5-AS1细胞N-Cadherin[(231.02±27.11)pg/ml]、Vimentin[(5.61±0.40) ng/ml]和ZEB1[(2.59±0.28) ng/ml]蛋白表达水平明显低于shRNA-Control细胞[(656.48±39.49)pg/ml、(8.31±0.36) ng/ml、(6.04±0.26) ng/ml],差异有统计学意义( t=21.76、12.32、22.12, P<0.05)。 结论:lncRNA OIP5-AS1在结直肠癌组织中表达水平上调,敲低结直肠癌细胞lncRNA OIP5-AS1的表达可通过抑制细胞的上皮-间充质转化,从而减缓结直肠癌细胞的增殖、转移和侵袭。
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编辑人员丨1天前
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三例Mowat-Wilson综合征患儿的临床特征及基因分析
编辑人员丨1天前
目的:探讨3例伴有特殊面容的智力障碍/发育迟缓患儿的遗传学特征。方法:采集患儿的外周血样,分别进行G显带染色体核型分析和染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA),并对患儿3进行全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)。结果:3例患儿的染色体核型均未见异常。CMA检测患儿1为arr[GRCh37]:2q22.3(145 128 071-145 159 029)×1,存在大约31 kb的缺失,为致病性拷贝数变异,涉及 ZEB2基因第8 ~ 10外显子;患儿2为arr[hg19]:2q22.3(145 071 457-146 881 759)×1,存在1.81 Mb的缺失,涉及 ZEB2和 GTDC1基因;患儿3为arr[GRCh37]:9p23p23(11 698 261-12 106 261)×1,存在408 kb的缺失,未涉及相关基因。WES结果显示其 ZEB2基因第8外显子存在c.2102C>A(p.Ser701*)的无义变异,该变异已被ClinVar数据库收录,评级为致病性,Sanger测序验证为新发变异。 结论:Mowat-Wilson综合征的临床表型和遗传异质性较大,对不明原因的发育迟缓/智力障碍患儿,尤其是合并特殊面容和多种先天畸形者,CMA和WES检测将有助于明确病因。
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编辑人员丨1天前
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miR-4698介导GALNT4表达对肝癌细胞增殖和迁移的影响
编辑人员丨1天前
目的:检测miR-4698在肝癌组织及细胞系中的相对表达,分析其对肝癌细胞增殖和迁移的影响及分子作用机制。方法:采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测肝癌组织和肝癌细胞系中miR-4698的相对表达。在表达最低的肝癌细胞系中,采用脂质体转染法分别转染miR-4698模拟物和对照模拟物,命名为实验组和对照组。qRT-PCR检测转染效率。细胞计数试剂盒(CCK-8)和Transwell迁移实验分别检测过表达miR-4698对肝癌细胞增殖和迁移能力的影响。采用生物信息学和双荧光素酶报告基因实验预测并验证miR-4698与靶基因的结合。qRT-PCR和Western blot分别检测靶基因在mRNA水平和蛋白水平的相对表达。结果:与癌旁组织相比,miR-4698在肝癌组织的表达明显降低( P<0.01)。与正常肝细胞系相比,miR-4698在肝癌细胞系的表达明显降低( P<0.05),在Huh7细胞的表达最低( P<0.01)。转染后,与对照组相比,实验组Huh7细胞中miR-4698的表达明显增加( P<0.01)。过表达miR-4698可抑制肝癌Huh7细胞的增殖能力( P<0.05)和迁移能力( P<0.05)。生物信息学显示miR-4698的靶基因是多肽-N-乙酰氨基半乳糖转移酶4(GALNT4),双荧光素酶报告基因证实miR-4698可互补结合GALNT4( P<0.01)。qRT-PCR结果显示,过表达miR-4698可抑制GALNT4基因的表达( P<0.01)。Western blot实验显示,miR-4698过表达后,Huh7细胞中GALNT4蛋白表达降低,细胞增殖相关蛋白Cyclin B和CDK1表达降低,细胞转移相关蛋白N-cadherin和ZEB-2表达降低。 结论:miR-4698在肝癌组织和细胞系中表达明显下降,过表达miR-4698可通过抑制GALNT4基因的表达,降低肝癌Huh7细胞的增殖和迁移能力。
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编辑人员丨1天前
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Rab27A蛋白调控转录因子E盒结合锌指蛋白1对白细胞介素-6/信号转导与转录激活因子3信号通路的影响
编辑人员丨1天前
目的:探索三阴性乳腺癌中Rab27A蛋白调控转录因子E盒结合锌指蛋白1(ZEB1)对白细胞介素(IL)-6/信号转导与转录激活因子3(STAT3)信号通路的影响。方法:通过生信分析Rab27A与ZEB1在三阴性乳腺癌中表达,在体外培养三阴性乳腺癌细胞(MDA-MB-231、MDA-MB-468)使用慢病毒转染技术进行Rab27A、ZEB1过表达及敲减,并通过回复实验构建Rab27A过表达ZEB1敲减、Rab27A敲减ZEB1过表达的三阴性乳腺癌细胞系。运用蛋白质印迹法(Western blot)验证其蛋白表达。通过免疫印迹技术研究Rab27A调控ZEB1对IL-6/STAT3信号通路的影响,Shapiro-Wilk检测实验数据均服从正态分布。结果:在三阴性乳腺癌MDA-MB-231细胞系中,蛋白质印迹法(Western blot)结果显示,ZEB1过表达组高于阴性对照组,差异有统计学意义(0.607±0.019比0.460±0.073, F=124.111, P<0.05),Rab27A敲减组低于阴性对照组,差异有统计学意义(0.118±0.003比0.460±0.073, F=124.111, P<0.05),ZEB1敲减组低于阴性对照组且有统计学意义(0.156±0.048比0.460±0.073, F=124.111, P<0.05)。在三阴性乳腺癌MDA-MB-468细胞系中,蛋白质印迹法(Western blot)结果显示Rab27A过表达组高于阴性对照组,差异有统计学意义(0.735±0.007比0.667±0.006, F=1 859.845, P<0.05),ZEB1过表达组高于阴性对照组,差异有统计学意义(0.905±0.014比0.667±0.006, F=1 859.845, P<0.05),Rab27A敲减组低于阴性对照组,差异有统计学意义(0.310±0.002比0.667±0.006, F=1859.845, P<0.05),ZEB1敲减组低于阴性对照组,差异有统计学意义(0.278±0.003比0.667±0.006, F=1 859.845, P<0.05)。Rab27A过表达时ZEB1表达量高于ZEB1阴性对照组表达量,差异有统计学意义(0.735±0.007比0.905±0.014, F=1 859.845, P<0.05),Rab27A敲减时ZEB1表达量低于ZEB1阴性对照组,差异有统计学意义(0.310±0.002比0.278±0.003, F=1 859.845, P<0.05)。在三阴性乳腺癌MDA-MB-231细胞系中,Rab27A过表达时IL-6/STAT3信号通路被显著激活(2.010±0.092比1.440±0.089, F=196.692, P<0.05),三阴性乳腺癌MDA-MB-468细胞系中,结果与MDA-MB-231相同(1.963±0.007比1.282±0.011, F=2 211.290, P<0.05)。在三阴性乳腺癌MDA-MB-231细胞系中。在三阴性乳腺癌MDA-MB-231细胞系中,Rab27A能回复ZEB1过表达时对IL-6/STAT3信号通路有激活趋势,差异有统计学意义(1.808±0.053比1.440±0.089, F=196.692, P<0.05),在三阴性乳腺癌MDA-MB-468细胞系中,Rab27A能回复ZEB1过表达时对IL-6/STAT3信号通路有激活趋势,差异有统计学意义(1.545±0.007比1.282±0.011, F=2 211.290, P<0.05)。 结论:在三阴性乳腺癌中Rab27A通过正向调控ZEB1的表达可激活IL-6/STAT3信号通路。
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编辑人员丨1天前
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长链非编码RNA DHRS4-AS1与骨肉瘤患者无病生存的关系及其体外对骨肉瘤细胞增殖和迁移的影响
编辑人员丨1天前
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)DHRS4-AS1与骨肉瘤患者无病生存的关系及其体外对骨肉瘤细胞增殖和迁移影响的机制。方法:收集GEPIA数据库建库以来骨肉瘤患者DHRS4-AS1转录组水平和生存情况数据,依据DHRS4-AS1转录组中位水平将患者分为DHRS4-AS1高表达组和低表达组,各59例,采用Kaplan-Meier法分析两组无病生存情况。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测DHRS4-AS1在骨肉瘤细胞株MG-63、HOS、143B、U-2OS、Saos2及正常成骨细胞株hFOB1.19中的表达,选择DHRS4-AS1表达水平最低的骨肉瘤细胞株进行后续实验。将载有DHRS4-AS1序列的质粒和载有阴性对照序列的质粒分别转染至选取的骨肉瘤细胞中,分别为DHRS4-AS1组和对照组。CCK-8法检测各组细胞增殖情况,以吸光度值为细胞增殖能力;细胞划痕实验检测各组细胞迁移情况。采用生物信息学网站starBase V2.0预测DHRS4-AS1的靶基因,双荧光素酶报告基因法验证DHRS4-AS1与靶基因的靶向关系。采用qRT-PCR和蛋白质印迹法检测对照组和DHRS4-AS1组骨肉瘤细胞靶基因及下游基因表达水平。结果:生存分析显示,GEPIA数据库中DHRS4-AS1高表达组骨肉瘤患者无病生存优于DHRS4-AS1低表达组( P<0.001)。与正常成骨细胞hFOB1.19细胞相比,各骨肉瘤细胞中DHRS4-AS1的表达水平均低(均 P<0.01),其中U-2OS细胞中DHRS4-AS1的表达水平最低( P<0.001)。DHRS4-AS1组U-2OS细胞培养1、2、3、4 d后细胞增殖能力均较对照组降低(均 P<0.05)。DHRS4-AS1组U-2OS细胞迁移率低于对照组[(31±6)%比(63±4)%, t=4.38, P=0.005]。starBase V2.0网站预测DHRS4-AS1与miRNA-411-3p(miR-411-3p)互补结合;双荧光素酶报告基因实验显示,miR-411-3p过表达降低了野生型DHRS4-AS1报告基因的荧光素酶活性( P<0.001),但对突变型DHRS4-AS1报告基因荧光素酶活性无影响( P>0.05)。qRT-PCR检测显示,与对照组相比,DHRS4-AS1组U-2OS细胞miR-411-3p相对表达量低(0.22±0.06比1.06±0.23, t=3.55, P=0.012),转移抑制因子MTSS1 mRNA相对表达量高(5.58±1.03比1.06±0.22, t=4.28, P=0.005);蛋白质印迹法检测显示,MTSS1表达升高,细胞增殖表型蛋白CDK3、cyclin C和细胞迁移表型蛋白ZEB2、KLF8表达水平均低。 结论:lncRNA DHRS4-AS1高表达骨肉瘤患者无病生存较好,其在骨肉瘤细胞株中低表达。DHRS4-AS1可能通过靶向下调骨肉瘤细胞miR-411-3p的表达,促进MTSS1基因表达,抑制细胞增殖和迁移。
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编辑人员丨1天前
