探讨医院未处理污水中碳青霉烯类耐药菌的流行情况、基因组特征及临床相关性，为院内评估公共卫生情况、预防交叉感染提供参考依据。收集2023年3月苏州大学附属第二医院污水处理站内未处理污水和26个病区洗手池U型排污管内污水，离心稀释后涂布于含有美罗培南（2 μg/ml）的LB固体平板分离耐药细菌，进行菌种鉴定、药敏分析、碳青霉烯酶基因PCR检测和全基因组测序；对基因组序列进行耐药基因识别，并采用回顾性研究方法，结合多位点序列分型（multilocus sequence typing，MLST）和单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）分析，比较其与同季度临床分离株的同源性。结果显示，从医院污水中分离出56株耐碳青霉烯类革兰阴性菌，来源于13个属，其中17株分离自医院总污水，气单胞菌属为最优势属（35.3%，6/17）；39株分离自17个病区的污水，假单胞菌属为最优势属（30.8%，12/39）。本院常见污水分离株均为多重耐药细菌，对部分二、三代头孢菌素类药物耐药率可达100%。来源于污水分离株的碳青霉烯酶基因共8种，包括 blaKPC、 blaNDM、 blaIMP、 blaVIM、 blaIND、 blaOXA-58-like、 blaOXA-48-like和 blaOXA-427-like。共39株污水分离株携带碳青霉烯酶基因，医院总污水中携带 blaKPC-2细菌的分离率（35.3%，6/17）最高，病区污水中携带 blaIMP-8细菌的分离率（31.8%，7/22）最高。14株污水分离株同时携带两种碳青霉烯酶基因，共6种组合型。本院还发现了 blaIMP-101新亚型。筛选4株污水分离株和11株临床分离株纳入SNP分析，其中临床和污水来源的2株ST11型肺炎克雷伯菌仅有15个SNP差异，具有高度同源性。综上，医院未处理污水中存在多种多重耐药的条件致病菌，具有在环境中散播耐药基因的潜在风险；医院污水和临床分离的高度同源肺炎克雷伯菌表明医院污水与临床感染的紧密联系。医院需加强对污水环境中耐药细菌和耐药基因的监测，防止医院污水中耐药细菌和耐药基因的广泛传播，预防污水中耐药细菌引起的院内感染。

目的:探讨来自弗氏枸橼酸杆菌的产碳青霉烯酶的新型不相容群组质粒pNY2385-KPC的耐药机制及基因结构特征。方法:从宁波市医疗中心李惠利医院急诊病房的发热患者尿液样本中获得1株多药耐药菌。采用16S rRNA基因扩增和平均核苷酸一致性（ANI）进行菌种鉴定；采用全自动细菌鉴定及药敏分析系统检测细菌MIC值；通过“三代”测序方法获得基因组序列，然后通过BLASTP/BLASTN、RefSeq、ConservedDomains、ResFinder、Isfinder等对基因功能进行详细注释及比较基因组学分析。结果:弗氏枸橼酸杆菌NY2385携带的质粒pNY2385-KPC为一种新型不相容群组质粒，包含 blaKPC-2，具有接合转移（Ⅳ型分泌系统）基因，可发生接合转移。NCBI中共检索到同型质粒15个，来源于弗氏枸橼酸杆菌、黏质沙雷菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、肺炎克雷伯菌和植生拉乌尔菌等细菌，为泛宿主质粒。通过对来自弗氏枸橼酸杆菌中6个该新型质粒进行序列比较分析，发现该新型质粒结构具有一定的保守性，具有携带 blaKPC-2的Tn 6296变体结构，而且质粒pCF1807-3同时具有 repApNY2385-KPC和 repAIncX8。 结论:弗氏枸橼酸杆菌中的pNY2385-KPC型质粒均携带 blaKPC-2耐药基因，分为 repApNY2385-KPC单复制子和 repApNY2385-KPC/ repAIncX8双复制子两种亚型，属于泛宿主质粒，作为可移动遗传元件促进了 blaKPC-2的传播。

目的:通过对耐碳青霉烯类肺炎克雷伯杆菌（CRKP）的碳青霉烯酶表型的筛查及耐药基因检测，明确青岛市区该细菌耐药基因的分布及构成，为临床上合理应用抗菌药物治疗提供依据。方法:收集2016年10月至2019年9月青岛市区5家三甲医院临床分离出的非重复CRKP共54株，采用琼脂稀释法或纸片扩散法（K-B法）进行常用抗菌药物的药敏试验；应用改良Hodge试验进行碳青霉烯酶表型筛查；采用聚合酶链反应（PCR）扩增 blaKPC-2、 blaNDM-1、 blaOXA-48、 blaIMP、 blaVIM目的基因，扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳。 结果:药敏试验显示，CRKP对阿米卡星耐药率最低（35.2%），其次为复方新诺明（53.7%）、庆大霉素（55.6%）、左氧氟沙星（75.9%）、亚胺培南/西司他丁（88.9%），哌拉西林/他唑巴坦、美罗培南、头孢噻肟、头孢哌酮/舒巴坦钠的耐药率均高于90%。改良Hodge试验阳性菌株有43株（阳性率为79.63%），阴性菌株为11株。PCR耐药基因检测共检出带有碳青霉烯酶耐药基因的菌株40株，目的耐药基因检出率为74.07%。其中35株携带KPC-2基因，7株携带OXA-48基因，4株携带NDM-1基因，1株携带IMP基因，其中携带有OXA-48基因的菌株均同时携带KPC-2基因，未检测出携带VIM基因的菌株，剩余14株未检测出目标碳青霉烯酶基因。结论:青岛市区5家医院CRKP携带的产碳青霉烯酶基因主要为KPC-2，其次为OXA-48及NDM-1。

Background::Carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae (CP-Kp) poses distinct clinical challenges due to extensively drug resistant (XDR) phenotype, and sequence type (ST) 11 is the most dominant blaKPC-2-bearing CP-Kp clone in China. The purpose of this current retrospective study was to explore the genetic factors associated with the success of XDR CP-Kp ST11 strains circulated in the intensive care unit (ICU) of a Chinese tertiary hospital. Methods::Six ST11 XDR CP-Kp strains were identified between May and December 2014 and validated by minimum inhibitory concentration examination, polymerase chain reaction, and pyrosequencing. The six ST11 XDR CP-Kp, as well as three multi-drug resistant (MDR) and four susceptible strains, were sequenced using single-molecule real-time method. Comprehensively structural and functional analysis based on comparative genomics was performed to identify genomic characteristics of the XDR ST11 CP-Kp strains.Results::We found that ST11 XDR blaKPC-2-bearing CP-Kp strains isolated from inpatients spread in the ICU of the hospital. Functionally, genes associated with information storage and processing of the ST11 XDR CP-Kp strains were more abundant than those of MDR and susceptible strains, especially genes correlative with mobile genetic elements (MGEs) such as transposons and prophages. Structurally, eleven large-scale genetic regions taken for the unique genome in these ST11 XDR CP-Kp strains were identified as MGEs including transposons, integrons, prophages, genomic islands, and integrative and conjugative elements. Three of them were located on plasmids and eight on chromosomes; five of them were with antimicrobial resistance genes and eight with adaptation associated genes. Notably, a new blaKPC-2-bearing ΔΔTn1721- blaKPC-2 transposon, probably transposed and truncated from ΔTn1721- blaKPC-2 by IS903D and ISKpn8, was identified in all six ST11 XDR CP-Kp strains. Conclusion::Our findings suggested that together with clonal spread, MGEs identified uniquely in the ST11 XDR CP-Kp strains might contribute to their formidable adaptability, which facilitated their widespread dissemination in hospital.

目的:研究广泛耐药肺炎克雷伯菌（XDRKP）耐药表型特点及相关耐药机制。方法:收集山西白求恩医院2018年1月至2020年12月内分离的3 201株肺炎克雷伯菌并根据已有药敏结果筛选116株广泛耐药肺炎克雷伯菌纳入研究。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）及梅里埃VITEK-compact 2进行菌株鉴定及药敏试验，药敏结果K-B法或微量肉汤稀释法复核。改良碳青霉烯酶灭活试验（mCIM）联合乙二胺四乙酸协同碳青霉烯酶灭活试验（eCIM）检测XDRKP碳青霉烯酶表型，并与碳青霉烯酶基因扩增结果比对。聚合酶链反应（PCR）扩增耐药基因：碳青霉烯酶基因（blaKPC、blaNDM、blaVIM、blaIMP、blaOXA）；氨基糖苷耐药基因：16S rRNA甲基化酶基因（rmtA、rmtC、rmtD、rmtG、rmtH、armA、npmA、rmtB、rmtE、rmtF），氨基聚糖苷修饰酶基因变体［aac（6′）-Ib-cr］；喹诺酮耐药基因：DNA解旋酶保护蛋白qnr家族基因（qnrA、qnrB、qnrC、qnrD、qnrS），外排泵蛋白基因（oqxAB、qepA），氨基聚糖苷修饰酶基因变体［aac（6′）-Ib-cr］；替加环素耐药Tet蛋白基因［外排泵蛋白基因：tet（A）和tet（L）］，核糖体保护蛋白基因［tet（M）］，替加环素修饰酶基因［tet（X）］。对照分析各XDRKP耐药表型与相应耐药基因携带情况间的关系。结果:共收集到XDRKP 116株。头孢菌素类及喹诺酮类抗菌药物耐药率100%（116/116），碳青霉烯类抗菌药物耐药率99.14%（115/116），氨基糖苷类抗菌药物庆大霉素、妥布霉素、阿米卡星耐药率分别为95.69%（111/116）、94.83%（110/116）、88.79%（103/116），磺胺类抗菌药物耐药（44/116）与替加环素耐药（3/116）检出率较低。mCIM联合eCIM试验结果与碳青霉烯酶基因扩增结果一致率95.65%（110/115）。各耐药基因阳性率：blaKPC 90.52%（105/116），blaNDM 10.34%（12/116），rmtB 81.90%（95/116），armA 2.59%（3/116），oxqAB 65.52%（76/116），qnrB 6.03%（7/116）、qnrS 12.93%（15/116）、aac（6′）-Ib-cr 7.76%（9/116），tet（A）21.55%（25/116）。其余各耐药基因未检出。匹配分析发现，共有65株XDRKP耐药表型与耐药基因型不匹配，即抗菌药物耐药表型不能用携带相应耐药基因来解释。结论:XDRKP中各类耐药基因的广泛分布和某些基因［如aac（6′）-Ib-cr、oqxAB］的多重耐药作用是广泛耐药产生的潜在原因。不同菌株针对同一类抗菌药物可能携带一种或多种耐药基因。此外，部分菌株耐药表型与耐药基因不匹配，提示耐药基因的表达调控及存在其他耐药机制也与XDR的产生有关。

探讨耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌（carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae，CRKP）的临床分布及耐药特征，为预防CRKP的感染和治疗提供参考依据。回顾性分析2017年1月至2021年12月临床分离的510株CRKP菌株，应用 MALDI-TOF质谱仪和VITEK-2 Compact微生物药敏分析仪进行菌种鉴定和药敏试验，采用碳青霉烯酶抑制剂增强试验对CRKP菌株进行碳青霉烯酶表型检测，通过免疫显色法对CRKP菌株进一步分型并用聚合酶链反应（polymerase chain reaction，PCR）进行基因检测。结果显示，510株CRKP菌株主要来源于痰液302株（59.2%）、尿液127株（24.9%）、血液47株（9.2%）；科室主要分布于重症医学科231株（45.3%），其次为呼吸内科108株（21.2%）和神经外科79株（15.5%）；药敏试验结果显示对常用抗菌药物的耐药率均较高，仅对替加环素和头孢他啶/阿维巴坦保持很好的敏感性，但对替加环素的耐药率逐年上升，从2017年的1.0%上升到2021年的10.1%，差异有统计学意义（ χ2=14.444， P<0.05）。碳青霉烯酶抑制剂增强试验结果显示，510株CRKP中产碳青霉烯酶 461株（90.4%），其中丝氨酸酶 450株（88.2%），金属酶 9株（1.8%），既产丝氨酸又产金属酶2株（0.4%）；不产酶的有49株（9.6%）；免疫显色法进一步分型显示 461株CRKP中分型检测为KPC 450株（97.6%），IMP 2株（0.4%）；NDM 7株（1.5%）；KPC+NDM 2株（0.4%）；PCR基因检测结果：blaKPC 450株（97.6%），blaIMP 2株（0.4%），blaNDM 7株（1.5%），blaKPC+NDM 2株（0.4%）。综上，CRKP菌株主要来源于痰液标本，分布于重症医学科，耐药特征以产碳青霉烯酶中的KPC型为主，临床微生物实验室应加强对CRKP菌株的监测，为预防CRKP的感染，减少细菌耐药的产生提供参考依据。

目的:探讨改良碳青霉烯灭活试验（modified carbapenem inactivation method， mCIM）联合EDTA改良碳青霉烯灭活试验（EDTA-modified carbapenem inactivation method， eCIM）检测感染患者分离的耐碳青霉烯肠杆菌科细菌 （Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae， CRE）碳青霉烯酶的方法对诊控CRE感染的应用价值。 方法:回顾性分析2017年1至12月天津医科大学总医院临床感染患者分离的78株非重复对碳青霉烯类抗生素耐药的肠杆菌科细菌的耐药情况，应用Vitek2 Compact全自动细菌鉴定仪鉴定至种并检测其对厄他培南和亚胺培南的最低抑菌浓度（minimum inhibitory concentration， MIC），用分子生物学PCR试验检测其碳青霉烯酶基因 blaKPC、 blaNDM、 blaIMP和 blaVIM，基因测序确定基因型作为金标准，同时采用mCIM联合eCIM试验对所收集的细菌进行碳青霉烯酶检测。以PCR结果为标准，计算mCIM和eCIM的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值及Kappa值，进行mCIM和eCIM联合检测结果与PCR结果的一致性检验。 结果:78株碳青霉烯耐药肠杆菌科细菌应用PCR法检测出碳青霉烯酶基因阳性74株，阴性4株，其中 blaKPC-2阳性60株， blaNDM-1阳性2株， blaNDM-5阳性7株， blaNDM-9阳性3株， blaIMP-4阳性1株， blaKPC-2和 blaNDM-1同时阳性1株。mCIM检测碳青霉烯酶的敏感度为100%，特异度为100%， Kappa值为1.000；mCIM和eCIM联合检测丝氨酸碳青霉烯酶敏感度为100%，特异度为100%，Kappa值为1.000；联合检测金属碳青霉烯酶敏感度为92.9%，特异度为100%， Kappa值为0.955。 结论:采用mCIM、eCIM联合试验对CRE中的碳青霉烯酶进行检测，实用性强，结果易于判读，依据CRE细菌中基因型的不同，将为临床CRE诊断与抗菌药物精准治疗和感染控制提供重要诊断依据。

目的:明确本地区碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药特点和分子流行病学特征，为临床抗感染治疗提供依据。方法:收集宁波大学附属第一医院和宁波市第二医院碳青霉烯类不敏感肺炎克雷伯菌92株。用VITEK2 Compact全自动微生物分析仪进行药敏试验；全基因组测序技术确定其荚膜血清型、多位点序列分型(MLST)与耐药基因等分子特征；使用PlasmidFinder确定菌株的质粒复制子类型；Parsnp进行细菌核心基因组系统发育分析。结果:CRKP主要分离自病情较为危重的老年患者，标本以痰液居多(51.09%，47/92)，其次是尿液(13.04%，12/92)和血液(8.70%，8/92)，感染高发科室为重症监护病房(33.70%，31/92)。所有菌株对常用抗菌药物耐药率高，但对多黏菌素B耐药率较低(6.52%，6/92)。耐药基因以 blaKPC-2为主(78.26%，72/92)，荚膜血清型以KL64为主(48.91%，45/92)，MLST分型以ST11为主(54.35%，50/92)。ST11-KL64是优势克隆型，检出率高达46.74%(43/92)，且携带多个质粒，以IncR和IncFⅡ型为主。 结论:本地区CRKP对临床常用抗菌药物高度耐药，主要携带 blaKPC-2耐药基因，克隆型ST11-KL64在本地区广泛克隆传播，两家医院流行的菌株存在相似性，应加强监控。

探讨重症监护病房耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌（carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae，CRKP）碳青霉烯酶分布情况，并比较耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌（carbapenem-resistant hypervirulent Klebsiella pneumoniae，CR-hvKP）和耐碳青霉烯非高毒力肺炎克雷伯菌（carbapenem-resistant non-hypervirulent Klebsiella pneumoniae，CR-non-hvKP）两者之间的临床特征。收集并回顾性分析2020年5月至2021年3月西安交通大学第二附属医院重症监护病房49例患者分离的53株非重复CRKP菌株，使用碳青霉烯酶抑制剂增强试验进行产碳青霉烯酶菌株初筛，拉丝试验进行高黏液表型初筛，使用PCR方法检测5种主要的碳青霉烯酶基因（ blaKPC-2、 blaNDM、 blaIMP、 blaVIM和 blaOXA-48-like），常见血清型（K1和K2）和毒力基因（rmpA和iutA），将同时检测出rmpA和iutA基因的菌株视为高毒力肺炎克雷伯菌（hypervirulent Klebsiella pneumoniae，hvKP），并对CR-hvKP进行全基因组测序。针对49例感染患者的临床资料，采用独立样本 t检验，Mann-Whitney U检验，χ2检验或Fisher精确概率法比较CR-hvKP和CR-non-hvKP两者的临床特征差异。重症监护病房分离的CRKP存在广泛耐药，对多黏菌素B和替加环素仍具有良好的敏感性。CRKP主要的耐药机制为产碳青霉烯酶（52/53，98.1%），53株CRKP除1株未检测到碳青霉烯酶外，其余52株CRKP至少检测到1种碳青霉烯酶耐药基因，其中45株携带单一酶型，包括36株 blaKPC-2（36/53，67.9%）、8株 blaNDM（8/53，15.1%）和1株 blaIMP（1/53，1.9%），7株携带两种酶型 blaKPC-2和 blaNDM（7/53，13.2%）。拉丝试验和毒力基因检测结果显示，53株CRKP检出7株（13.2%）CR-hvKP，其中2株拉丝试验阳性。测序结果表明CR-hvKP主要属于ST11型。CR-hvKP感染患者年龄几乎都在60岁以上（7/7），存在侵入性治疗（7/7）、肺部感染高黏液表型（2/7）以及具有较高的死亡率（5/7）；CR-hvKP感染患者的中性粒细胞百分比（86.44±4.70）%高于CR-non-hvKP感染患者（78.90±19.15）%，差异有统计学意义（ t =-2.225， P=0.032）。综上，重症监护病房CR-hvKP菌株以产KPC-2酶，荚膜血清型K2和ST11序列型为主，需加强对CR-hvKP菌株的监测与控制，防止耐药和高毒力菌株的共同进化。

探讨碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）基因组特征并进行相关聚类分析，为防治CRKP引起的感染提供实验依据。采用回顾性病例-队列研究方法，对2023年1—6月南方医科大学第十附属医院临床非重复的19株CRKP进行全基因组测序（WGS）分析和多位点序列分型（MLST），比较菌株间基因组特征，对菌株携带的耐药基因及同源性进行相关聚类分析。结果显示，19株CRKP分离自8个不同临床科室，主要来源于呼吸道标本。全基因组测序结果显示CRKP基因组长度在4.90~5.85 Mbp之间，每个CRKP基因组的重叠群（contigs）N50均>20 kb；总体GC含量中位数 M（ Q1， Q3）为 57.0%（50.4%，57.1%）；比较基因组特征发现3个基因组变异度较高的区域。WGS检测到11类共32种耐药基因，19株CRKP均携带碳青霉烯类耐药基因（ blaKPC-2和 blaOXA-48）、 blaTEM-1B超广谱β-内酰胺酶耐药基因、 qnrS1喹诺酮类耐药基因和 fosA磷霉素耐药基因，且每株菌仅携带一种碳青霉烯酶基因， blaKPC-2检出率高达94.7%（18/19）。MLST分型为ST11、ST437和ST147三种型别，ST11型占89.5%（17/19），属优势克隆型别，以获得性耐药基因为基础作聚类分析，发现菌株72和菌株90，菌株88、84、66和菌株79等耐药基因聚类分析较为接近，存在3个克隆传播模式。综上，CRKP菌株同时携带多种耐药基因，聚类分析显示院内克隆传播与获得性耐药基因密切相关，以ST11- blaKPC-2型菌株为优势菌株，应加强CRKP监控，并制定有效的防控策略，以减少院内传播。