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弗氏枸橼酸杆菌中发现介导 blaKPC-2传播的新型质粒及比较基因组学分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨来自弗氏枸橼酸杆菌的产碳青霉烯酶的新型不相容群组质粒pNY2385-KPC的耐药机制及基因结构特征。方法:从宁波市医疗中心李惠利医院急诊病房的发热患者尿液样本中获得1株多药耐药菌。采用16S rRNA基因扩增和平均核苷酸一致性(ANI)进行菌种鉴定;采用全自动细菌鉴定及药敏分析系统检测细菌MIC值;通过“三代”测序方法获得基因组序列,然后通过BLASTP/BLASTN、RefSeq、ConservedDomains、ResFinder、Isfinder等对基因功能进行详细注释及比较基因组学分析。结果:弗氏枸橼酸杆菌NY2385携带的质粒pNY2385-KPC为一种新型不相容群组质粒,包含 blaKPC-2,具有接合转移(Ⅳ型分泌系统)基因,可发生接合转移。NCBI中共检索到同型质粒15个,来源于弗氏枸橼酸杆菌、黏质沙雷菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、肺炎克雷伯菌和植生拉乌尔菌等细菌,为泛宿主质粒。通过对来自弗氏枸橼酸杆菌中6个该新型质粒进行序列比较分析,发现该新型质粒结构具有一定的保守性,具有携带 blaKPC-2的Tn 6296变体结构,而且质粒pCF1807-3同时具有 repApNY2385-KPC和 repAIncX8。 结论:弗氏枸橼酸杆菌中的pNY2385-KPC型质粒均携带 blaKPC-2耐药基因,分为 repApNY2385-KPC单复制子和 repApNY2385-KPC/ repAIncX8双复制子两种亚型,属于泛宿主质粒,作为可移动遗传元件促进了 blaKPC-2的传播。
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编辑人员丨6天前
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154株枸橼酸杆菌的临床分布及耐药性分析
编辑人员丨2024/5/18
目的 了解枸橼酸杆菌在医院感染中的临床分布及耐药性.方法 采用VITEK 2全自动微生物分析仪和配套的GNI、GNS-13,对2013年1月—2022年12月分离的枸橼酸杆菌进行鉴定和药敏试验,药敏结果使用Whonet 5.6软件进行分析.结果 共分离到154株枸橼酸杆菌,主要来自尿液标本(53.25%),其次是脓液/切口(16.88%).其中,弗氏枸橼酸杆菌最多,占49.35%;其次是克氏枸橼酸杆菌,占33.12%.枸橼酸杆菌对头孢唑啉耐药率在97.8%~100.0%,对碳青霉烯类的耐药率均为0.0%,对三代或四代头孢菌素、头孢替坦、氨曲南、庆大霉素、妥布霉素和哇诺酮类的耐药率均小于15.8%,对哌拉西林/他唑巴坦和呋喃妥因耐药率均小于1.7%,对复方新诺明的耐药率在11.8%~40.8%.结论 枸橼酸杆菌耐药机制复杂,临床应以药敏结果为指导,哌拉西林/他唑巴坦和呋喃妥因可作为首选药物.
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编辑人员丨2024/5/18
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抗菌肽SAAP-148对家蚕细菌性肠道病病原细菌的抗性分析
编辑人员丨2023/9/2
[目的]细菌性肠道病是家蚕Bombyx mori主要病害之一.本研究旨在探究广谱性抗菌肽SAAP-148对家蚕细菌性肠道病病原细菌的抑制效果,为进一步采用抗菌肽替代抗生素预防家蚕细菌病提供参考.[方法]采用qRT-PCR检测家蚕抗菌肽基因在健康和感染细菌性肠道病5龄第4天幼虫中肠中的表达量;分离感染细菌性肠道病家蚕5龄第4天幼虫中肠中的菌群,采用最大似然法构建系统发育树;采用添食法(1 × 1010和1 × 1014 CFU/mL菌悬液)和穿刺法(2 × 108和2 ×109 CFU/mL菌悬液)检测分离的8种细菌及4种常见细菌病病原细菌粪肠球菌Enterococcus faecalis、黑胸败血芽孢杆菌Bacillus bombyseptieus、苏云金芽孢杆菌B.thuringiensis和灵杆菌Serratia marcescens对5龄健康家蚕幼虫的致病性;采用琼脂平板扩散法分析抗菌肽SAAP-148对分离的肠道病病原细菌和黑胸败血芽孢杆菌等其他常见细菌病病原细菌的抑制效果.[结果]测定的家蚕抗菌肽基因的表达量在感染细菌性肠道病的家蚕5龄第4天幼虫中肠中较健康个体中均显著上调,表明家蚕自身抗菌肽在抵抗细菌性肠道病的过程中发挥了 一定的作用;感染细菌性肠道病的家蚕5龄第4天幼虫中肠中共分离出8种病原细菌,即松鼠葡萄球菌Mammaliicoccus sciuri、嗜水气单胞菌 Aeromonas hiydrophila、生癌肠杆菌 Enterobacter cancerogenus、布甘氏肠杆菌 E.bugandensis、霍氏肠杆菌E.hormaechei、弗劳地枸橼酸杆菌Citrobacter freundii、肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniae和变栖克雷伯菌K.variicola;穿刺结果显示8种细菌均具有致病性,其中松鼠葡萄球菌、嗜水气单胞菌、生癌肠杆菌和布甘氏肠杆菌致病性较强,霍氏肠杆菌、弗劳地枸橼酸杆菌、肺炎克雷伯菌和变栖克雷伯菌致病性较弱.抗菌肽SAAP-148对分离出的8种病原细菌和家蚕其他4种常见细菌病病原细菌均具有体外抑制效果,且抑制效果随SAAP-148浓度增大而增强.[结论]抗菌肽SAAP-148不仅对可能引起家蚕细菌性肠道病的病原细菌具有明显抑制效果,对引起家蚕黑胸败血症、灵菌败血症、细菌性中毒症的病原细菌和对氨苄青霉素已经产生抗性的霍氏肠杆菌等也具有抑制效果,可作为理想的抑菌剂用于预防家蚕细菌病的发生.
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编辑人员丨2023/9/2
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关节置换术后不同拔管时间的引流管尖端细菌培养结果分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 对关节置换术后不同拔管时间负压引流管尖端细菌培养的结果进行临床分析.方法 前瞻性选择行单侧关节置换84例,其中单侧膝关节置换40例,单侧髋关节置换44例.每位患者手术结束时均于切口筋膜层之下放入一根负压引流管,随后立即拔除,引流管尖端约3 cm送细菌培养,此设为对照组.再根据术后拔管时间不同分为两个实验组:24 h组42例,术后24 h拔除;48 h组42例,术后48 h拔除.引流管尖端约3 cm送细菌培养.所有患者术后随访3个月,观察有无发生关节感染.对细菌培养结果及随访结果进行分析.结果 对照组引流管尖端无细菌生长.实验组中24 h组拔除的引流管中有6例(7.14%)细菌培养阳性,其中皮氏罗尔斯顿菌5例(5.95%),大肠埃希菌1例(1.19%);48 h组拔除的引流管中有2例(2.38%)培养阳性,其中皮氏罗尔斯顿菌1例(1.19%),弗劳地枸橼酸杆菌1例(1.19%),24 h组与48 h组细菌培养阳性率比较差异无统计学意义(P>0.05).根据关节置换类型分析,髋关节置换术后拔除的引流管中有5例(5.95%)培养阳性,膝关节置换术后拔除的引流管中有3例(3.57%)培养阳性,两者阳性率比较差异无统计学意义(P>0.05).所有患者随访3个月,均未出现关节感染症状,包括培养阳性的患者.结论 关节置换术后引流管尖端细菌培养结果用来诊断关节感染价值不大,在应用预防性抗生素的情况下,术后48 h内拔管都是安全的.
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编辑人员丨2023/8/6
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65例肛周脓液细菌培养结果分析
编辑人员丨2023/8/6
探讨肛周脓液需氧(兼性厌氧菌)、厌氧培养病原菌的检出率及主要需氧病菌耐药比例,以指导临床合理选择抗菌药物.对2017年1—12月确诊为肛周脓肿的65例患者的脓液标本进行需氧和厌氧培养,用纸片扩散法表型确证试验检测超广谱β-内酰胺酶(ESBLs),回顾性分析主要需氧(兼性厌氧)菌药敏结果.65份肛周脓液培养厌氧菌感染率46.2%(30/65),在有氧状态下培养生长的需氧(兼性厌氧)菌感染率为80.0%(52/65).有氧培养阳性的肛周脓肿患者中,病原菌以革兰氏阴性杆菌为主(48/52,92.3%),主要菌种为大肠杆菌、肺炎克雷伯菌、弗劳地枸橼酸杆菌、阴沟肠杆菌、普通变形杆菌;革兰染色阳性球菌占7.7%(4/52),菌种为金黄色葡萄球菌和粪肠球菌.32株大肠杆菌对阿米卡星、哌拉西林、替卡西林、头孢吡肟、头孢他啶、头孢西丁敏感性高,约70%,对环丙沙星、复方新诺明、庆大霉素耐药率>50%,未检出对美罗培南和亚安培南耐药的革兰氏阴性菌.ESBLs阳性的大肠埃希菌15株,分离率为46.9%(15/32).肛周脓肿感染多数为需氧(兼性厌氧)菌、厌氧菌混合感染,临床应根据药敏试验结果合理使用抗菌药物.
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编辑人员丨2023/8/6
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利用GeneXpert法检测耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌耐药基因及耐药性分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 利用GeneXpert Carba-R(R)全自动病原体快速检测系统检测碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌的耐药基因,了解该院耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌(CRE)耐药情况和耐药基因分布,为了解临床CRE感染趋势提供依据.方法 采用回顾性调查方法,收集2016年3月至2017年10月分离自非呼吸道标本的141株耐碳青霉烯类肠杆菌科菌株.结果 肺炎克雷伯杆菌114株,大肠埃希菌13株,阴沟肠杆菌8株,产气肠杆菌2株,弗氏枸橼酸杆菌3株,魏氏柠檬酸杆菌1株.blaKPC 103株,blaNDM 22株,blaoxA-485株,含两种及两种以上耐药基因12株.结论 GeneXpert Carba-R(R)全自动病原体快速检测系统能快速检测出耐碳青霉烯类肠杆菌的耐药基因,耐碳青霉烯类抗菌药物的细菌对多种抗菌药物同时耐药,检出的耐药基因型为KPC、NDM、OXA-48及IMP.含不同耐药基因的肠杆菌科细菌其耐药情况不同.
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编辑人员丨2023/8/6
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2016-2018年湖南地区儿童感染性腹泻病原学监测结果分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 分析2016-2018年湖南地区儿童感染性腹泻病原学监测结果,为病例诊断、救治及感染性腹泻的流行病学研究和有效预防控制提供科学依据. 方法 收集2016-2018年湖南地区儿童感染性腹泻患者的粪便标本,进行病原菌分离及鉴定,同时采用免疫荧光法对易导致儿童腹泻的四种肠道病毒(轮状病毒、腺病毒、星状病毒、诺如病毒)进行检测分析. 结果 在1 580例腹泻患儿粪便标本中,病原菌的总检出率为17.78%,其中沙门氏菌占20.64%、弗劳地枸橼酸杆菌占18.86%,白色念珠菌占15.66%;病毒总检出率13.99%,以轮状病毒感染(73.30%)为主.在轮状病毒感染的患儿中,1岁以下患儿占87.04%,5岁以下占轮状病毒感染的98.14%.细菌感染的高峰在夏、秋季,而轮状病毒感染的高峰在秋冬和春季. 结论 导致儿童感染性腹泻的病原体较多,且具有季节和年龄分布的不同,应加强感染性腹泻病原的监测与分析.
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编辑人员丨2023/8/6
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弗劳地枸橼酸杆菌噬菌体的分离及溶菌谱的测定
编辑人员丨2023/8/5
作者分离到弗劳地枸橼酸杆菌噬菌体80株,其中63株可分为三个类群。根据三类噬菌体的溶菌谱可将弗劳地枸橼酸杆菌分为三个相应的噬菌体群。这三类噬菌体可以裂解弗劳地枸橼酸杆菌O群标准菌33株中的26株,地方菌193株中的153株。它们对310株沙门氏菌无裂解作用,并对克雷伯氏菌族72株、变形杆菌族9株和H 2S阴性的枸橼酸杆菌10株均无裂解作用。但其中的φⅡ类噬菌体能裂解艾希氏菌属和志贺氏菌属中的许多菌株。作者认为利用这三类噬菌体可对79.3%弗劳地枸橼酸杆菌的纯培养物于数小时内作出快速诊断,可以作为弗劳地枸橼酸杆菌与沙门氏菌的鉴别试验。
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编辑人员丨2023/8/5
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GeneXpert技术对耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌耐药基因分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 分析西安市第一医院耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌(CRE)的药物敏感性及碳青霉烯酶基因携带情况,了解其分子流行病学特征,为CRE的防控提供依据.方法 采用WHONET 5.6软件对本院2017年3月至2019年3月培养的CRE菌株进行初筛,采用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱仪进行细菌鉴定,Vitek 2-Compact全自动微生物鉴定及药敏分析系统进行药物敏感性实验,GeneXpert检测碳青霉烯酶基因KPC、NDM、IMP-1、VIM、OXA-48.结果 70株CRE以肺炎克雷伯菌为主(37.14%),其次为大肠埃希菌(21.43%)和弗氏枸橼酸杆菌(10.00%).标本来源以痰液为主(58.57%),其次为血液(18.57%)和尿液(18.57%).临床科室分布以康复重症医学科为主(28.57%),其次为神经外科和呼吸内科(均各占18.57%).药敏结果提示CRE对大部分β-内酰胺类药物呈现高度耐药,耐药率>80%,对阿米卡星有较好的敏感性,敏感率为56.0%.GeneXpert结果显示57株菌携带碳青霉烯酶,其中KPC和NDM检出率较高,分别为51.43% 和47.14%;IMP-1检出率较低,为5.71%;未检测出VIM和OXA-48耐药基因.患者不同预后情况中,CRE菌株耐药基因检出情况差异无统计学意义(χ2=1.57,P=0.456).结论 本院分离的CRE对多种抗菌药物高度耐药,耐药基因以KPC为主,其次为NDM,临床应加强对CRE的监控,根据药物敏感性结果合理选用抗菌药物,预防CRE菌株院内传播流行.
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编辑人员丨2023/8/5
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2013—2020年7次实验动物病原菌项目国际比对结果分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 通过评估自身检测能力,促进国内实验动物能力验证活动的开展和检测水平的提高.方法 中国食品药品检定研究院于2013—2020年共7次参加国际实验动物科学理事会(International Council for Laboratory Animal Science,ICLAS)实验动物检测能力验证活动[即诊断实验室性能评估程序(Performance Evaluation Program for Diagnostic Laboratories,PEP)](简称"国际比对").PEP活动中,通过培养、生化鉴定、PCR和测序等方法对PEP病原菌样品开展检测,并对国际比对结果进行总结分析.结果 7次国际比对能力验证活动共检测40份样品,涉及27种病原菌,结果符合率分别为8/8、2/2、5/8、9/9、5/5、6/7和1/1;其中病原检测33项,抗体检测7项.国内各项标准中尚缺少辛氏鲍特菌、黏质沙雷菌、乳腺炎棒状杆菌、CAR(Cilia-associated respiratory)杆菌、小鼠放线杆菌、弗劳地枸橼酸杆菌、产酸克雷伯杆菌、无乳链球菌和致病性大肠埃希菌共9种病原菌的检测项目.结论 通过参加国际比对活动,发现了国内外标准差异以及自身急需提升的检测能力,希望早日与国际接轨.
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编辑人员丨2023/8/5
