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南洋鼠线粒体基因组结构特征及其属级分类关系的分子证据
编辑人员丨1周前
南洋鼠(Chiromyscus langbianis)是亚洲特有的一种树栖鼠类,其属级分类一直存在争议,不同的分类系统将其归入白腹鼠属(Niviventer)或费氏树鼠属(Chiromyscus),影响了对其生物学特性的认识.本研究旨在通过测定和分析南洋鼠的线粒体基因组,探讨其线粒体基因组结构特征,并利用近邻相接法(neighbor-joining method,NJ)和最大似然法(maximum likeli-hood method,ML)构建22个近缘物种线粒体基因组的系统发育树,厘清南洋鼠的属级分类关系.结果表明,南洋鼠线粒体基因组总长度为16 288 bp,包含22个tRNA基因、13个蛋白编码基因、2个rRNA基因和一段非编码区(non-coding region,NCR),线粒体基因组碱基组成为 A 36.6%、T 28.9%、G 15.0%和 C 19.5%,AT 偏斜(AT-skew)为 0.092,GC 偏斜(GC-skew)为-0.337.在22个tRNA基因中,除tRNASer(AGY)缺少D环外,其余的21个tRNA基因均能够折叠成典型的三叶草结构.同时,部分tRNA基因,如tRNAPhe出现了A-A,tRNAVa1、tRNALeu、tRNAI1e出现了C-U等非经典配对,以维持tRNA二级结构的稳定性.基于近邻相接法和最大似然法构建的系统发育树表明,南洋鼠与费氏树鼠属的亲缘关系更近.进一步基于线粒体Cytb和Cox1构建的系统发育树及遗传距离分析结果,均支持南洋鼠划入费氏树鼠属.本研究为南洋鼠的分类地位和系统发育关系提供了分子证据,也为其种群遗传学的研究提供了数据参考.
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编辑人员丨1周前
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鉴别6种常见食用肉类的多重PCR检测体系的构建及验证
编辑人员丨1周前
目的 建立一种快速、准确、灵敏的多重PCR检测方法,用于同时鉴别6种常见食用肉类(牛、羊、鸡、猪、鹅、鸭),并评估其在肉类食品掺假鉴定中的应用价值.方法 基于GenBank数据库中6个物种的线粒体全基因组序列,筛选具有种内保守性、种间特异性的DNA序列(牛16S rRNA、羊COX-1、鸡Cytb、猪COX-1、鹅NADH2、鸭16S rRNA),并设计物种特异性引物,以此构建一个可同时鉴别6种常见食用肉类的多重PCR检测体系.对该体系进行种属特异性、灵敏度和重复性研究,并进行模拟混合样品检测.结果 成功构建了一个可同时鉴别6种常见食用肉类的多重PCR检测体系,该体系在非目标物种的DNA中均未有效扩增;在DNA模板量为0.0625~2 ng/μL时,6个物种的扩增产物均能检见.在鸭肉和牛肉混合比例低至0.5%时,仍能检测到鸭肉成分.结论 本研究构建了一个特异性强、灵敏度高、重复性好的多重PCR检测体系,可准确鉴别6种常见食用肉类食品中的动物源性成分,为我国常见食用肉类及肉制品的掺假鉴定提供了一种简单、实用的检测技术.
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编辑人员丨1周前
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云南省大理白族自治州亚洲带绦虫线粒体Cytb基因遗传多样性分析
编辑人员丨1周前
目的:了解云南省大理白族自治州(简称大理州)亚洲带绦虫线粒体细胞色素b(Cytb)基因的遗传多样性。方法:2019年5月至2021年8月,在大理州血吸虫病防治研究所收治的绦虫病患者中,共采集131份带绦虫样本,涉及大理市(58份),巍山彝族回族自治县(简称巍山县,14份),弥渡县(18份),漾濞彝族自治县(简称漾濞县,24份),洱源县(17份)5个地区(即5个群体)。基于线粒体Cytb基因序列设计引物,采用PCR法扩增Cytb基因部分序列,并进行测序及同源性比对;使用MEGA 7.0、DNASP 5.10.01软件对测得序列进行分析,得到碱基组成、遗传距离、遗传多样性参数、遗传分化指数、基因流等数据。结果:131份带绦虫样本的Cytb基因扩增片段大小均为235 bp,经同源性比对均为亚洲带绦虫,A、T、G、C碱基的平均含量分别为23.8%、42.3%、24.0%、9.9%。131份亚洲带绦虫样本,共定义12个单倍型,单倍型多样性和核酸多样性分别为0.295 9和0.006 0;5个群体间的遗传分化指数和基因流范围分别为- 0.053 00~0.050 40和4.710 31~162.087 66。5个群体间的遗传距离范围为0.003 5~0.009 0,其中弥渡县与巍山县的遗传距离最大,大理市与漾濞县的遗传距离最小。结论:大理州亚洲带绦虫线粒体Cytb基因具有丰富的遗传多样性,各群体间存在频繁的基因交流,未形成显著的遗传分化。
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编辑人员丨1周前
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单体型B与携带线粒体m.1555A>G突变耳聋相关性研究
编辑人员丨1周前
目的:探究单体型B与线粒体m.1555A>G突变致聋的相关性。方法:采集单体型为B且携带m.1555A>G家系(TP023)成员外周血,建立永生化淋巴细胞系作为实验组(D组);选取单体型非B但携带m.1555A>G的永生化淋巴细胞(S组)和单体型为B但不携带m.1555A>G的永生化淋巴细胞(C组)为对照组;分别对三组细胞的线粒体膜电位(mitochondrial membrane potential,MMP)、线粒体蛋白表达、细胞活性氧(reactive oxygen species,ROS)、三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)水平进行检测,评估线粒体功能。结果:相比于C组,D组细胞的MMP下降29.5%( P<0.001),ROS水平上升30.8%( P<0.001),ATP产量下降39.0%( P<0.001),S组细胞MMP下降21.3%( P=0.002),ROS水平上升8.7%( P=0.202),ATP产量下降11.2%( P=0.661);两组细胞的ND4、CytB等蛋白表达均有不同程度的下降。 结论:线粒体单体型B可能是导致m.1555A>G突变携带者的耳聋外显率增高的原因。
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编辑人员丨1周前
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肉制品中牛源性成分芯片数字PCR定量检测方法的建立
编辑人员丨2周前
目的 为了对肉制品中牛肉源性成分进行准确定量,本文采用数字PCR(dPCR)技术对牛肉的线粒体Cytb基因进行定量检测,根据基因拷贝数建立了肉制品中牛肉源性成分PCR的定量检测方法.方法 参照标准设计的牛源性特异性引物、探针,猪源性特异性引物、探针,鸭源性特异性引物、探针以及动物源性成分通用引物、探针,建立了双重数字PCR体系.结果 在一定范围内生鲜牛肉质量与DNA含量、DNA含量与DNA拷贝数之间均呈现明显的线性关系,并以DNA含量为中间值计算出DNA拷贝数(C)与生鲜牛肉质量之间的换算公式:M 牛=0.020 9C+0.676.应用建立的dPCR方法对构建的肉样模型进行检测,结果显示牛肉定量检测值与实际质量基本一致,且受外源物种的干扰小.运用该方法对抽取的10份市售牛肉样品检测,同时通过特异/通用引物扩增的拷贝数之比(%)辅助判断肉制品中是否存在非牛源性的其他动物源性成分掺假,检测出部分样品不符合标签规定.结论 该方法可实现对牛源性成分的量化检测,能够作为区分故意添加和无意污染的依据,为执法监管部门提供有力的技术保障.
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编辑人员丨2周前
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低剂量莠去津暴露饮用水诱导小鼠肝损伤模型的建立及验证
编辑人员丨1个月前
目的 建立长期饮喂低剂量莠去津诱发小鼠肝损伤模型,并评价莠去津引起的肝毒性作用.方法 C57BL/6-N雄性小鼠随机分为对照组以及1.5 mg/L和150 mg/L剂量(ATR-L、ATR-H)组,于饮喂后第35天和63天检测血清肝功能生化指标和炎性因子水平,计算肝体比并对肝进行病理组织学和超微结构观察,检测肝组织中脂质过氧化水平和抗氧化能力,以及主要 Ⅰ相代谢酶和Ⅱ相解毒酶的活性及相关蛋白表达.结果 与对照组相比,莠去津组AST/ALT比值,促炎性因子CCL2、TNF-α和IL-6,H2O2含量以及代谢酶NCR、CYT b5和UDPGT活性均有显著变化(P<0.05);150 mg/L剂量组肝功能GGT含量,过氧化物MDA水平及CYP1A2表达量极显著升高(P<0.01),而GSH含量显著降低(P<0.05),观察肝细胞损伤和线粒体空泡化更严重.结论 在建立低剂量莠去津诱导小鼠肝损伤模型时,1.5 mg/L和150 mg/L莠去津饮用水暴露均能够引起小鼠肝损伤,其中150 mg/L莠去津暴露63 d后引起的肝代谢毒性更强.
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编辑人员丨1个月前
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花鲈前脂肪细胞系的建立及油酸诱导分化
编辑人员丨2024/7/27
花鲈(Lateolabrax maculatus)前脂肪细胞系为探索鱼类脂肪细胞分化和脂肪沉积的调控作用及相关分子机制提供了一种新的体外模型.研究将花鲈腹腔脂肪组织用胶原酶消化后原代培养,再以胰酶消化后传代,总共经过150次传代培养后,得到花鲈前脂肪细胞系.进而,染色体核型分析表明该细胞系长期培养仍能保持正常表型,进一步使用线粒体cox1和cytb基因鉴定该细胞系来源于花鲈.用pEGFP-C1质粒转染细胞系,观察到明显的绿色荧光,表明可用于研究外源基因的表达.用不同浓度的油酸培养细胞系,3d后细胞有明显脂滴聚集,7d后脂滴达到最大;油红O染色表明,400 μmol/L油酸诱导7d后细胞即可正常分化成熟.综上所述,实验建立了花鲈前脂肪细胞系,该细胞系形态典型、可正常分化,为后续研究鱼类脂肪细胞分化及脂肪沉积提供了良好的实验材料.
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编辑人员丨2024/7/27
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绿带闭目天蛾和构月天蛾在海南岛及周边大陆的遗传分化
编辑人员丨2024/7/13
海南岛是与周边大陆存在地理隔离的大陆性岛屿,探索该岛屿与邻近大陆上生物的遗传分化有助于理解地理隔离对生物遗传分化的影响.在海南岛及其周边大陆 15 个地点采集两种鳞翅目天蛾科(Lepidoptera:Sphingidae)昆虫(绿带闭目天蛾Callambulyx rubricosa 88 头和构月天蛾Parum colligata 57 头),选择线粒体基因COI、Cytb和核基因 EF-1α作为分子标记开展遗传多样性研究.基于COI-Cytb分析的结果表明,两物种的核苷酸多样性均较低(分别为 0.00434 和 0.00818),且均在广东广西、越南和海南岛群体之间存在明显的谱系地理结构.两个物种在三个群体间均检测出低水平的基因流(Nm分别为0.09-1.22 和0.18-0.57)和高水平的遗传分化(FST分别为 0.29-0.84 和 0.47-0.73).两个物种最高的遗传分化都发生在海南岛与大陆群体之间,且海南岛群体的单倍型数量少于周边大陆群体.Mantel检验结果表明遗传距离与地理距离之间存在显著正相关关系,中性检验结果表明两个物种均未经历显著的种群扩张.综上,研究认为绿带闭目天蛾(C.rubricosa)和构月天蛾(P.colligata)的海南岛群体与邻近大陆群体间的基因交流较少,遗传分化程度较高,推测地理隔离可能是其产生遗传分化的重要原因之一,这一结果将为海南岛生物多样性的保护提供宝贵的建议.
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编辑人员丨2024/7/13
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湖南省爬行动物新纪录——华西腹链蛇及其系统发育分析
编辑人员丨2024/6/1
2023年5月24日于湖南省高望界国家级自然保护区(28°41 ′36"N,110°09′30"E;212m)采集到东亚腹链蛇属(Hebius)一雌性物种标本,经形态特征比较,符合华西腹链蛇(Hebius maximus)形态描述;基于线粒体cytb基因构建的东亚腹链蛇属部分物种的贝叶斯系统发育树显示,该标本与华西腹链蛇(H.maximus)聚为一支,其遗传距离为1.7%~2.2%.综合形态数据与系统发育分析,确定此次采集到的标本为华西腹链蛇.同时,根据已有研究对华西腹链蛇在中国分布情况的报道,确定该标本系湖南省分布新纪录.本研究将湖南省东亚腹链蛇属种类提升至8种.
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编辑人员丨2024/6/1
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Cardioprotective Potential of Cymbopogon citratus Essential Oil against Isoproterenol-induced Cardiomyocyte Hypertrophy:Possible Involvement of NLRP3 Inflammasome and Oxidative Phosphorylation Complex Subunits
编辑人员丨2024/6/1
Objective:Cymbopogon citratus(DC.)Stapf is a medicinal and edible herb that is widely used for the treatment of gastric,nervous and hypertensive disorders.In this study,we investigated the cardioprotective effects and mechanisms of the essential oil,the main active ingredient of Cymbopogon citratus,on isoproterenol(ISO)-induced cardiomyocyte hypertrophy.Methods:The compositions of Cymbopogon citratus essential oil(CCEO)were determined by gas chromatography-mass spectrometry.Cardiomyocytes were pretreated with 16.9 μg/L CCEO for 1 h followed by 10 μmol/L ISO for 24 h.Cardiac hypertrophy-related indicators and NLRP3 inflammasome expression were evaluated.Subsequently,transcriptome sequencing(RNA-seq)and target verification were used to further explore the underlying mechanism.Results:Our results showed that the CCEO mainly included citronellal(45.66%),geraniol(23.32%),and citronellol(10.37%).CCEO inhibited ISO-induced increases in cell surface area and protein content,as well as the upregulation of fetal gene expression.Moreover,CCEO inhibited ISO-induced NLRP3 inflammasome expression,as evidenced by decreased lactate dehydrogenase content and downregulated mRNA levels of NLRP3,ASC,CASP1,GSDMD,and IL-1β,as well as reduced protein levels of NLRP3,ASC,pro-caspase-1,caspase-1(p20),GSDMD-FL,GSDMD-N,and pro-IL-1β.The RNA-seq results showed that CCEO inhibited the increase in the mRNA levels of 26 oxidative phosphorylation complex subunits in ISO-treated cardiomyocytes.Our further experiments confirmed that CCEO suppressed ISO-induced upregulation of mf-Nd1,Sdhd,mt-Cytb,Uqcrq,and mt-Atp6 but had no obvious effects on mt-Co1 expression.Conclusion:CCEO inhibits ISO-induced cardiomyocyte hypertrophy through the suppression of NLRP3 inflammasome expression and the regulation of several oxidative phosphorylation complex subunits.
Cymbopogon citratus essential oil cardiac hypertrophy NLRP3 inflammasome oxidative phosphorylation complex subunits...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/6/1
