-
希佩尔-林道基因3996位腺苷到肌苷编辑与人表皮生长因子受体2阳性乳腺癌预后的相关分析
编辑人员丨5天前
目的:探讨希佩尔-林道(VHL)腺苷到肌苷编辑(ATIE)与人表皮生长因子受体2阳性(Her-2 +)乳腺癌患者预后的关系及其机制。 方法:基于癌症基因组图谱数据库筛选与Her-2 +乳腺癌患者预后关联的VHL ATIE。随机选取2014年至2019年广东省妇幼保健院相关患者81例,直接测序法检测ATIE位点的水平。采用荧光定量聚合酶链反应和蛋白印记法检测VHL表达。细胞计数试剂盒检测乳腺癌细胞耐药的半数抑制浓度(IC 50)。生存分析采用Cox回归,组间比较采用 t检验和方差分析,相关分析采用Spearman等级相关检验。 结果:数据库分析显示VHL转录本3996位腺苷到肌苷编辑(c.A3996I; HR=3.612,95% CI=1.093~11.940, P<0.05)、c.A3914I( HR=4.985,95% CI=1.442~17.230, P<0.05)与Her-2 +乳腺癌患者预后显著相关。直接测序法证实c.A3996I真实存在,低编辑患者组的死亡风险高于高编辑组( HR=3.980,95% CI=1.075~14.740, P<0.05),且淋巴结转移2/3期患者组c.A3996I的编辑水平显著低于淋巴结转移1期和无转移患者组[(9.923±5.741)%比(13.980±7.532)%和(17.820±9.424)%, F=5.140, P<0.01]。该位点编辑水平与增殖细胞核抗原表达( r=-0.282, P<0.05)呈负相关。c.A3996I编辑水平与VHL信使RNA( r=0.406, P<0.05)和蛋白( r=0.467, P<0.01)表达水平呈显著正相关,且在c.A3996I低编辑组,miR-143-5p与VHL的表达呈显著负相关( r=-0.145, P<0.05),但在高编辑组中两者无相关( r=0.051, P>0.05)。并且,耐曲妥珠单抗乳腺癌细胞VHL的表达显著低于正常细胞(0.540±0.116比1.011±0.195, t=4.159, P<0.01),未敲低VHL的乳腺癌细胞IC 50低于敲低组(5.489 μg/ml比22.120 μg/ml, F=22.440, P<0.01),且敲低VHL的乳腺癌细胞迁移能力显著上升(1 634±204比1 140±252, t=3.049, P<0.05)。 结论:c.A3996I编辑可抑制VHL表达及其功能而影响Her-2 +乳腺癌患者预后。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
miR-143在甲状腺乳头状癌中的表达及临床意义
编辑人员丨5天前
目的:探究miR-143在甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)中的表达情况及临床意义。方法:收集2018年1月1日至2018年3月31日青岛大学附属烟台毓璜顶医院甲状腺外科52例PTC患者的癌组织标本及癌旁组织标本,采用RT-qPCR分析miR-143在PTC中的表达情况并统计分析miR-143表达与临床病理特点的关系。结果:RT-qPCR发现在PTC肿瘤组织中miR-143表达为(3.60±2.98),癌旁正常甲状腺组织中miR-143表达为(20.23±7.09),miR-143表达在PTC癌组织中较癌旁组织中明显降低( t=-21.39,95% CI,18.20~15.07),差异具有统计学意义( P<0.001)。miR-143低表达与PTC患者中央区转移数目≥3( t=10.13, P=0.012)及侧颈部淋巴结转移( t=-4.67, P<0.001)相关。 结论:miR-143在PTC中表达降低,其表达降低参与PTC淋巴结转移。miR-143可作为PTC治疗中潜在的干预靶点。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
DNA甲基转移酶3A在胰腺癌组织的表达及其调控因子筛选
编辑人员丨5天前
目的:探讨胰腺癌组织和癌旁组织中DNA甲基转移酶3A的表达水平,并采用转录组学筛选调控DNA甲基转移酶3A的微小RNA(miRNA,miR)家族。方法:选取2021年6月到2023年6月新乡医学院第一附属医院住院部手术切除的胰腺癌组织和对应癌旁组织作为研究对象。采用蛋白质免疫印迹分析DNA甲基转移酶3A的表达水平。随机选取6例癌旁组织和胰腺癌组织作为研究对象,采用转录组学分析癌旁组织和胰腺癌组织中差异表达的(microRNA,miRNA),并采用生物信息学和荧光素酶报告基因分析差异表达miRNA对DNA甲基转移酶3A的调控关系。结果:癌旁组织中DNA甲基转移酶3A表达水平(0.77±0.16)明显低于胰腺癌组织(1.48±0.21),差异有统计学意义( t=19.690, P<0.05)。胰腺癌组织和癌旁组织共有390个miRNA差异表达,其中上调259个,下调131个。这些miRNA主要生物学过程包括细胞增殖、细胞发育、细胞分化等;分子功能主要包括肿瘤细胞运动、细胞迁移、细胞侵袭、细胞增殖和细胞间信号转导等。发现下调的miRNA与DNA甲基转移酶3A存在碱基互补,其中差异最为显著排序前10个的miRNA分别为miR-143-3p、miR-129-5p、miR-493-5p、miR-367-3p、miR-29a-3p、miR-212-3p、miR-323A-3p、miR-5195-3p、miR-4465和miR-532-5p。癌旁组织中miR-143-3p、miR-129-5p、miR-493-5p、miR-367-3p、miR-29a-3p、miR-212-3p、miR-323a-3p、miR-5195-3p、miR-4465和miR-532-5p表达水平(1.09±0.11、0.97±0.08、1.08±0.31、1.17±0.121、1.07±0.08、1.01±0.10、0.97±0.08、1.01±0.05、0.99±0.03、1.04±0.10)明显高于胰腺癌组织(0.51±0.10、0.46±0.11、0.47±0.15、0.62±0.12、0.37±0.07、0.56±0.10、0.66±0.04、0.68±0.06、0.73±0.05、0.66±0.13),差异有统计学意义( t=11.860、12.170、5.590、9.910、21.070、9.941、11.180、14.030、13.570、7.470, P<0.05)。miRNA对照和荧光素酶报告基因共转染细胞荧光素酶活性(0.97±0.02、0.96±0.02、0.97±0.02、0.98±0.02、0.97±0.02、0.97±0.04、0.95±0.03、0.96±0.03、0.97±0.02、0.96±0.02)明显高于miR-143-3p、miR-129-5p、miR-493-5p、miR-367-3p、miR-29a-3p、miR-212-3p、miR-323a-3p、miR-5195-3p、miR-4465和miR-532-5p模拟物和荧光素酶报告基因共转染细胞荧光素酶活性(0.32±0.07、0.33±0.06、0.35±0.09、0.50±0.04、0.50±0.05、0.53±0.07、0.58±0.03、0.63±0.03、0.65±0.05、0.81±0.05),差异有统计学意义( t=22.400,24.470,16.730,24.480、20.530,14.010,21.360,19.040,15.960,6.751, P<0.05)。 结论:DNA甲基转移酶3a在胰腺癌组织中表达水平显著增加,miR-143-3p、miR-129-5p、miR-493-5p、miR-367-3p、miR-29a-3p、miR-212-3p、miR-323a-3p、miR-5195-3p、miR-4465和miR-532-5p等miRNA参与调控DNA甲基转移酶3a在胰腺癌组织中的表达。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
基于微小RNA测序技术的儿童扩张型心肌病的诊断学研究
编辑人员丨5天前
目的:研究血清中微小核糖核酸(miRNA)的特异性表达与儿童扩张型心肌病(DCM)发生的相关性。方法:收集2013年11月至2016年3月就诊于北京安贞医院小儿心脏中心且被确诊为DCM的儿童血清(DCM组,16例)及同期于北京安贞医院体检的年龄性别匹配的健康儿童血清(健康对照组,12例),并进行miRNA测序。后期扩大样本量(DCM组扩大为30例,对照组扩大为16例),对测序结果中有统计学意义的11种miRNAs行实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)验证。结果:血清miRNA测序结果,DCM组患儿较健康对照组儿童有172个miRNAs上调(fold change>2, P<0.001),未发现下调的miRNAs。选择显著上调的top11miRNAs进行qRT-PCR试验验证,发现DCM组患儿血清中8个miRNAs(let-7f、let-7g、miR142-5p、miR143-3p、miR26a、miR27a-3p、miR27b-3p、miR126-3p)显著上调,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。在诊断DCM的受试者工作特征(ROC)曲线中,血清miR142-5p、miR143-3p、miR27b-3p、miR126-3p的曲线下面积分别为0.983、0.992、0.915、0.950,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。 结论:本研究发现4个血清miRNAs(miR-142-5p、miR-126-3p、miR-143-3p和miR-27b-3p)可用来区分DCM患儿和健康儿童。循环miRNAs可作为有效的儿童DCM筛查工具。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
下咽鳞状细胞癌组织LncRNA SNHG1、miR-143-3p表达与临床病理特征和预后的关系
编辑人员丨5天前
目的:探讨下咽鳞状细胞癌(HSCC)组织长链非编码RNA(LncRNA)小核仁RNA宿主基因1(LncRNA SNHG1)、微小RNA(miR)-143-3p表达与临床病理特征和预后的关系。方法:前瞻性选择2016年3月至2018年3月邯郸市中心医院收治的97例HSCC患者,取手术切除的HSCC组织和癌旁正常黏膜组织,采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测LncRNA SNHG1、miR-143-3p表达,出院后随访患者生存情况。比较不同临床病理参数HSCC组织中LncRNA SNHG1、miR-143-3p表达的差异,分析LncRNA SNHG1与miR-143-3p表达的相关性以及LncRNA SNHG1、miR-143-3p表达与HSCC患者预后的关系。结果:HSCC组织中LncRNA SNHG1表达高于癌旁正常黏膜组织( P<0.05),miR-143-3p表达低于癌旁正常黏膜组织( P<0.05)。TNM分期Ⅲ期、低中分化、淋巴结转移HSCC患者癌组织中LncRNA SNHG1表达高于TNM分期Ⅰ~Ⅱ期、高分化、无淋巴结转移HSCC患者(均 P<0.05),miR-143-3p表达低于TNM分期Ⅰ~Ⅱ期、高分化、无淋巴结转移HSCC患者(均 P<0.05)。HSCC组织中LncRNA SNHG1表达与miR-143-3p表达呈负相关( r=-0.522, P<0.05)。LncRNA SNHG1高表达HSCC患者5年累积生存率低于LncRNA SNHG1低表达HSCC患者( P<0.05),miR-143-3p低表达HSCC患者5年累积生存率低于miR-143-3p高表达HSCC患者( P<0.05)。多因素Cox回归分析显示:TNM分期Ⅲ期、高表达LncRNA SNHG1是HSCC患者预后不良的危险因素(均 P<0.05),高表达miR-143-3p是其保护因素( P<0.05)。 结论:HSCC组织中LncRNA SNHG1表达上调,miR-143-3p表达下调,两者表达呈负相关,与HSCC恶性病理特征以及不良预后有关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
多发性大动脉炎患者血浆外泌体携带的差异微小RNA和蛋白表达谱分析
编辑人员丨5天前
目的:检测初治多发性大动脉炎(TAK)患者血浆外泌体携带的微小RNA和蛋白,分析其在TAK发病机制中的可能作用。方法:选2020年6月至11月北京协和医院风湿免疫科确诊的初治TAK患者10例,另选与之年龄性别匹配的健康对照者5例,分别通过RNA测序和蛋白质谱技术检测血浆外泌体携带的微小RNA和蛋白,筛选出差异表达的微小RNA和蛋白,并对其进行层次聚类分析、功能、信号通路和结构域富集分析,最终筛选出与血管炎有关的微小RNA和蛋白,探究其在TAK发病机制中的可能作用。统计学采用Fisher精确概率检验或 χ2检验。 结果:TAK患者血浆外泌体携带的差异表达的微小RNA 29个,其中miR-101-3p、miR-122-5p、miR-143-3p、miR-185-3p、miR-192-5p、miR-194-5p、miR-19a-3p、miR-19b-3p、miR-20b-5p、miR-21-5p、miR-22-3p、miR-335-5p、miR-34a-5p、miR-3613-5p、miR-548ad-5p、miR-590-3p、miR-7-5p表达上调,miR-1249-3p、miR-141-3p、miR-199a-5p、miR-199b-5p、miR-200a-3p、miR-200c-3p、miR-204-5p、miR-29c-5p、miR-335-3p、miR-381-3p、miR-4433b-5p、miR-584-5p表达下调。差异表达的蛋白357个,其中236个表达上调,121个表达下调,最终筛选前激肽释放酶、激肽原1、桥粒蛋白。结论:血浆外泌体携带的miR-34a-5p、miR-200c-3p、miR-143-3p、miR-22-3p、miR-21-5p、前激肽释放酶、激肽原1、桥粒蛋白可能通过调节血管生理过程、炎症反应、自身免疫等过程参与TAK的发病机制,具有作为TAK生物标志物和治疗靶点的潜在作用。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
circTNPO1通过下调miR-338-3p的表达促进骨肉瘤增殖迁移
编辑人员丨5天前
目的:探讨circTNPO1通过下调miR-338-3p的表达促进骨肉瘤细胞增殖迁移的作用及其分子机制。方法:采用实时荧光定量聚合酶链反应检测骨肉瘤细胞中circTNPO1、miR-338-3p、Ki-67和Vimentin的表达水平。构建circTNPO1稳定敲降的143B细胞系,细胞计数试剂盒8实验与细胞划痕实验检测细胞增殖迁移能力,荧光素酶报告基因实验验证circTNPO1与miR-338-3p的关系。建立裸鼠sh-circTNPO1 143B细胞皮下成瘤模型,瘤内注射miR-338-3p抑制剂与miR阴性对照,观察肿瘤重量与体积的变化。免疫组化法检测肿瘤组织中Ki-67的表达。结果:骨肉瘤细胞系U2OS、HOS、MG63、143B、ZOS和ZOSM中circTNPO1 mRNA表达水平分别为2.73±0.27、3.18±0.54、4.33±0.52、5.75±0.65、4.50±0.49和3.96±0.35,均高于成骨细胞hFOB1.19(1.00±0.09,均 P<0.05)。培养48和72 h后,sh-circTNPO1#1组143B细胞吸光度( A)值分别为0.81±0.05和1.09±0.06,sh-circTNPO1#2组143B细胞 A值分别为0.84±0.04和1.2±0.04,均低于对照组(1.00±0.06和1.49±0.06,均 P<0.05)。转染48和72 h时,sh-circTNPO1#1+miR-338-3p抑制剂组143B细胞 A值分别为0.92±0.06和1.32±0.07,均高于sh-circTNPO1#1+miR阴性对照组(分别为0.82±0.04和1.07±0.08,均 P<0.05)。细胞划痕实验显示,sh-circTNPO1#1组和sh-circTNPO1#2组143B细胞迁移率分别为(24.43±2.15)%和(39.70±4.20)%,均低于对照组[(56.51±3.27)%,均 P<0.05]。sh-circTNPO1#1+miR-338-3p抑制剂组143B细胞迁移率[(46.10±5.71)%]高于sh-circTNPO1#1+miR阴性对照组[(26.70±2.21)%, P=0.005]。sh-circTNPO1#1+miR阴性对照组裸鼠肿瘤重量[(262.50±82.09)mg]与体积[(203.30±144.20)mm 3]均低于对照+miR阴性对照组[分别为(458.80±158.10)mg和(593.00±228.40)mm 3,均 P<0.05]。sh-circTNPO1#1+miR-338-3p抑制剂组裸鼠肿瘤重量[(395.40±137.60)mg]与体积[(488.60±208.60)mm 3]均高于sh-circTNPO1#1+miR阴性对照组(均 P<0.05)。 结论:circTNPO1通过靶向吸附miR-338-3p并下调miR-338-3p的表达促进骨肉瘤细胞的增殖与迁移,circTNPO1下调miR-338-3p可能是参与骨肉瘤进展的新机制。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
全反式维甲酸调控miRNA-34a-E2F1-Eag1信号通路抑制骨肉瘤细胞增殖和侵袭的体外研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨全反式维甲酸(ATRA)对骨肉瘤143B细胞增殖和侵袭的影响及其可能的调控机制。方法:采用不同浓度ATRA处理人骨肉瘤143B细胞,选取影响细胞增殖的最佳浓度和处理时间。分别采用MTS法、Transwell迁移和侵袭实验检测ATRA处理后143B细胞增殖、迁移和侵袭能力变化。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白质印迹法检测ATRA处理后骨肉瘤143B细胞中miRNA-34a(miR-34a)、E2F1和Eag1的表达变化。干扰miR-34a和过表达E2F1,检测143B细胞增殖、侵袭和迁移能力以及miR-34a、E2F1和Eag1表达的变化。结果:ATRA浓度为10 μmol/L、处理72 h对143B细胞增殖的抑制作用最明显。10 μmol/L ATRA作用72 h的迁移细胞数、侵袭细胞数均低于阴性对照组[(73±3)个比(182±5)个, t=21.46, P<0.01;(94±3)个比(203±7)个, t=13.70, P<0.01]。10 μmol/L ATRA可促进143B细胞中miR-34a的表达,抑制Eag1和E2F1的表达(均 P<0.01)。与ATRA组比较,处理72 h后ATRA+miR-34a干扰组可恢复细胞的增殖能力[细胞存活率(41.0±2.2)%比(25.0±3.6)%, t=108.68, P<0.01]。与ATRA组比较,ATRA+miR-34a干扰组可恢复细胞的迁移和侵袭能力[(122±14)个比(64±10)个, t=21.06, P<0.01;(103±10)个比(59±8)个, t=24.27, P<0.01],并可促进细胞中Eag1和E2F1的mRNA和蛋白表达(均 P<0.01)。与ATRA组相比,ATRA+E2F1过表达组可恢复细胞的增殖能力[细胞存活率(40.0±3.4)%比(24.0±3.1)%, t=108.74, P<0.01],可恢复细胞迁移和侵袭能力[(78±12)个比(29±8)个, t=13.52, P<0.01;(75±12)个比(49±10)个, t=6.28, P<0.01)],并促进细胞中Eag1和E2F1的mRNA和蛋白表达(均 P<0.01)。 结论:ATRA通过调控miRNA-34a-E2F1-Eag1信号通路抑制骨肉瘤细胞增殖和侵袭,其可能成为骨肉瘤有效的治疗药物之一。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
人脐带间充质干细胞来源的外泌体通过miRNAs促进胰腺癌细胞生长
编辑人员丨5天前
目的:探讨人脐带间充质干细胞来源的外泌体(hucMSCs-exo)对胰腺癌细胞增殖、侵袭的影响及其分子机制。方法:hucMSCs-exo来自首都医科大学宣武医院顺利分娩后的产妇(3例,脐带长约20 cm),将hucMSCs-exo分别加入胰腺癌细胞BxPC3和Panc-1中,采用细胞计数试剂盒8(CCK-8)法和Transwell实验检测BxPC3和Panc-1细胞的增殖和侵袭能力。小鼠皮下接种人胰腺癌Panc-1细胞(1×10 6个),hucMSCs-exo组小鼠直接于肿瘤内注射hucMSCs-exo,对照组注射磷酸盐缓冲液,测量小鼠模型肿瘤的体积及重量。采用高通量测序方法检测外泌体中miRNAs的表达,通过基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析高表达miRNAs的靶基因相关功能以及主要代谢通路。 结果:CCK-8实验显示,hucMSCs-exo组BxPC3和Panc-1细胞吸光度值分别为4.68±0.09和5.20±0.20,高于Control组(分别为3.68±0.01和3.45±0.17,均 P<0.05)。Transwell实验显示,hucMSCs-exo组BxPC3和Panc-1细胞侵袭数分别为(129.40±6.02)个和(134.40±7.02)个,高于Control组[分别为(89.40±4.39)个和(97.00±6.08)个,均 P<0.05]。hucMSCs-exo组肿瘤体积[(884.57±59.70)mm 3]和肿瘤质量[(0.94±0.21)g]均高于Control组[分别为(695.09±57.81)mm 3和(0.60±0.13)g,均 P<0.05]。高通量测序结果显示,hucMSCs-exo中miR-148a-3p、miR-100-5p、miR-143-3p、miR-21-5p和miR-92a-3p呈高表达,GO以及KEGG分析结果显示,高表达miRNAs的靶基因主要参与调节细胞葡萄糖醛酸化,主要代谢通路是抗坏血酸和醛酸代谢。 结论:hucMSCs-exo可促进胰腺癌细胞的生长,其机制与外泌体中高表达的miRNAs相关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
微小RNA-143通过调控Kras表达影响前列腺癌PC-3细胞的增殖与迁移
编辑人员丨5天前
目的:探究微小RNA(miRNA,miR)-143通过调控Kras的表达影响前列腺癌PC-3细胞的增殖与迁移的机制。方法:选用购自美国典型培养物保藏中心细胞株PC-3,保持在补充有10%胎牛血清(Hyclone)的F-12培养基(Hyclone)中。细胞在5%CO 2和37 ℃的湿润环境下生长。根据实验需求对细胞进行实验分组,随机分为PC-3转染组、PC-3对照组。通过细胞计数试剂盒(CCK-8)试剂盒对细胞活力进行测定。通过实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测各组细胞中miR-143与Kras mRNA表达;通过蛋白质印迹反应检测各组细胞因子CD133、Oct4、Klf4的蛋白表达情况。组间比较采用单因素方差分析或者重复测量的方差分析,组间两两比较采用LSD- t检验。 结果:RT-qPCR分析各组miR-143 mRA和Kras mRNA表达为:miR-143 mRNA PC-3对照组(1.06±0.02)较PC-3转染组(3.17±0.23)降低;Kras mRNA PC-3对照组(2.75±0.11)较PC-3转染组(1.23±0.03)升高,差异有统计学意义( t=5.167, P<0.05)。蛋白印迹检测发现CD133、Oct4、Klf4的蛋白表达PC-3对照组(2.67±0.11、3.18±0.23、2.84±0.26)较PC-3转染组(1.15±0.03、1.26±0.14、1.18±0.15)升高,差异有统计学意义( t=4.862, P<0.05)。细胞活力检测发现PC-3对照组(1.62±0.14)较PC-3转染组(0.58±0.02)细胞活力值升高,差异有统计学意义( t=4.154, P<0.05)。 结论:miR-143可通过抑制Kras的基因表达来控制前列腺PC-3的增殖及迁移状况,miR-143的高表达可有效抑制前列腺癌细胞的增殖及侵袭。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前