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中缅边境蚊媒病毒的分子流行病学:发现乙脑的潜在疫源地
编辑人员丨2天前
位于中缅边境的云南省腾冲市蚊虫丰富多样,本研究于2018年在腾冲市采集了蚊虫,采用RT-PCR的方法对这些蚊虫进行研究,共检出15株乙型脑炎病毒(JEV)、2株伊蚊黄病毒(AeFV)、2株云南库蚊黄病毒、1株Culex theileri黄病毒、1株Yamadai黄病毒(YDFV)和1株按蚊相关黄病毒(AAFV),其中成功扩增到1株JEV和1株AeFV的全序。基于E基因的系统进化分析显示新检出的腾冲JEV均属于GI-b型,与2010年腾冲检出的毒株亲缘关系最近,与目前使用的乙脑疫苗比较在E蛋白上存在6个氨基酸残基的差异,且三带喙库蚊的JEV带毒率为2.4 (1.4~3.9)/1 000。上述研究结果提示腾冲是潜在的乙脑疫源地,存在暴发流行的风险,有必要在当地广泛持续的开展虫媒病毒监测。
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编辑人员丨2天前
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中缅边境麻疹暴发疫情中疫苗保护效率的评估
编辑人员丨2天前
目的:评价中缅边境地区8月龄~14岁儿童麻疹成分疫苗(MCV)的保护效率,探讨一起麻疹暴发疫情的原因。方法:对一起输入性麻疹暴发疫情的病例开展流行病学调查,收集病例血液样本和咽拭子或尿液进行检测。采用1 ∶ 4配对的病例对照方法评价8月龄~14岁儿童MCV的保护效率,共调查33例麻疹病例和132例对照。结果:本次暴发共确诊67例麻疹病例,包括4例境外输入病例。33例(49.3%)为8月龄~14岁儿童,其中25例(75.8%)至少有1剂次MCV免疫史。8月龄~14岁儿童接种MCV疫苗总体保护效率为88.7%(95% CI:56.9%~97.0%),2剂次MCV疫苗保护效率为89.7%(95% CI:49.9%~90.9%)。12月龄以后接种第1剂次MCV疫苗保护效率89.5%(95% CI:18.3%~97.8%),高于8~12月龄接种第1剂次的86.9%(95% CI:42.9%~96.7%)。最近一次接种MCV距离麻疹发病的时间间隔<5年的保护效率为92.0%(95% CI:38.4%~98.1%),时间间隔≥5年的保护效率下降至85.6%(95% CI:43.4%~96.7%)。 结论:边境地区适龄儿童MCV的保护效率较低是导致境外输入疫情传播蔓延的主要原因。有必要加强常规免疫,确保2剂次MCV接种率,提高免疫接种质量。
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编辑人员丨2天前
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2019年云南中缅边境基孔肯雅热暴发疫情的流行病学特征
编辑人员丨2天前
目的:阐明2019年位于中缅边境地区的云南省德宏傣族景颇族自治州瑞丽市基孔肯雅热暴发疫情的流行病学特征。方法:开展流行病学调查,收集病例个案调查表,采集患者急性期血清,用PCR-荧光探针法检测基孔肯雅病毒核酸。结果:2019年瑞丽市共确诊基孔肯雅热病例121例,其中本地病例98例(80.99%,包括2例孕妇及其母婴传播的3例新生儿病例即胞胎男婴2例和1例女婴),缅甸输入性病例23例(19.01%,木姐11例、南坎6例、曼德勒3例、九谷2例、腊戌1例)。疫情主要发生在瑞丽市主城区(勐卯镇)和口岸地区,主要流行期为9~11月份,高峰为10月份(74.38%,90/121)。除母婴传播的3例新生儿病例外,病例年龄最小为3月龄,最大72岁,以20~59岁组为主(77.69%,94/121)。男女性别比为1∶1.28(53:68)。职业分布以商业服务(33.06%)、家务及待业(21.49%)和离退人员(11.57%)居多。结论:2019年瑞丽市发生输入性病例和本地病例并存的基孔肯雅热流行,来自缅甸的输入性病例是引起本地流行的主要原因。此为云南省首次报道本地基孔肯雅热流行,应加强中国—缅甸边境地区基孔肯雅热跨境传播的防控。
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编辑人员丨2天前
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基于分子网络方法分析2009—2017年中缅边境未治疗16~25岁HIV-1感染者流行特征
编辑人员丨2天前
目的:使用分子网络方法分析2009—2017年中缅边境的德宏州未治疗的16~25岁HIV-1感染者流行特征,为精准防控和降低HIV-1在德宏州的传播提供参考。方法:筛选HIV-1感染者,静脉采血并分离血浆,提取RNA用以扩增HIV-1 pol区序列,使用HIV-TRACE程序构建分子网络并进行统计学分析。结果:573名入组感染者中,中国籍319名(55.67%)、缅甸籍254名(44.33%);男性351名(61%),女性222名(39%);异性性传播404名(HET,70.51%),注射毒品110名(PWID,19.20%),男男性行为者51名(MSM,8.9%);亚型包括独特重组型193个(33.68%)、流行重组型201个(CRF,35.1%)、C亚型156个(27.23%)、B亚型23个(4.01%)。通过HIV-TRACE构建的83个分子网络涉及249名感染者,86.7%的网络由CRF01_AE,C或URF构成,49%为中缅混合网络(41/83),缅甸籍进入中缅混合网危险度高( AOR=2.676, p=0.002);中国籍男性PWID网络同配性为0.34,缅甸男性PWID为0.20,MSM为0.18。 结论:中缅边境德宏州存在潜在的HIV-1跨境传播风险;需注意MSM和缅甸籍男性PWID人群与其他传播途径混合传播的现象。
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编辑人员丨2天前
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2019年云南省耿马县发热病例中登革病毒、基孔肯雅病毒和寨卡病毒感染情况分析
编辑人员丨1个月前
目的 探讨2019年中缅边境地区云南省临沧市耿马县发热病例感染虫媒病毒的种类,回顾性分析其流行病学与病原学特征,为本地区发热病例的早期诊断及虫媒传染病的防控提供科学依据.方法 收集2019年9-10月耿马县定点医院收治的发热病例信息,采集病例血清用美国登革病毒(DENV)NS1抗原检测试剂检测抗原,并提取病毒RNA用三重实时荧光反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)进行DENV、基孔肯雅病毒(CHIKV)和寨卡病毒(ZIKV)的核酸检测;对DENV阳性样本再用实时荧光RT-PCR法进行血清型分型检测;选取病毒载量较高的样本,对目的基因测序后进行系统进化分析.结果 在946份本地发热病例血清样本中,共检出104份DENV阳性(10.99%),其中33份DENV-1,21份DENV-2,36份DENV-3,14份未分型,DENV NS1抗原检测试剂法的假阴性率为20.19%;43份CHIKV阳性(4.54%);6例ZIKV阳性(0.63%).对阳性RNA进行RT-PCR产物测序,获得8条DENV-1 NS5基因序列,相似性为97.70%~100.00%,均属基因Ⅰ型,与近年来缅甸等东南亚国家的流行株亲源关系较近;获得1条DENV-2 NS5基因序列,属城市基因型,与2013年新加坡输入株进化关系较近;获得4条CHIKVE2基因序列,相似性为9930%~100.00%,均属中东南非基因型,与同年云南省瑞丽市流行株亲源关系较近.结论 2019年中缅边境地区临沧市耿马县发生了登革热、基孔肯雅热和寨卡病毒病的混合流行,在本地发热病例血清中首次检出CHIKV和ZIKV,提示中缅边境地区应提高对登革热、基孔肯雅热及寨卡病毒病等虫媒病毒病的诊断意识,优化虫媒病毒检测方案,尽可能发现潜在传染源,为有效预防和控制中缅边境地区虫媒传染病提供科学依据.
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编辑人员丨1个月前
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舟翅桐属(锦葵科,梧桐亚科),中国植物一新分布属
编辑人员丨2024/6/22
[目的]文章报道了云南省勐腊县中老边境地区舟翅桐属(Pterocymbium R.Br.)及其属下热带落叶大乔木——大花舟翅桐(P.macranthum Kosterm.)在中国的分布新记录.此外,还完善了其属和种的描述,评估了境内种群规模和濒危程度.[方法]利用体视显微镜对其标本进行解剖观察,并用数码相机对关键分类特征进行拍摄记录;利用无人机航拍对大花舟翅桐境内种群进行规模快速评估;采用访谈法并结合经验对其IUCN物种受威胁等级进行评估.[结果]大花舟翅桐在中国境内约有1 000株,分布区面积约2 000 hm2,建议将其评为IUCN红色物种名录易危(VU)物种.[结论]舟翅桐属为中国新记录属,属下大花舟翅桐为中国新记录种.该发现将其分布区向北扩展至热带亚洲北缘,有助于深入理解中国与东南亚热带植物区系之间的联系.
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编辑人员丨2024/6/22
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2010-2018年云南中缅边境地区恶性疟原虫抗磺胺多辛-乙胺嘧啶药物基因多态性分析
编辑人员丨2024/6/22
目的 分析云南中缅边境地区恶性疟原虫抗叶酸类药物磺胺多辛-乙胺嘧啶抗性基因的多态性和抗性回复突变趋势.方法 收集2010-2018年中缅边境恶性疟病例滤纸血样品,巢式PCR扩增恶性疟原虫二氢叶酸还原酶(pfdhfr)基因和恶性疟原虫二氢蝶酸合酶(pfdhps)基因,采用Geneious Prime软件比对测序结果,Microsoft Excel 2016和GraphPad prism 8.0.2软件分析突变频率和单体型分布差异,卡方检验分析抗性相关基因位点单核苷酸多态性特征和不同年份单体型分布差异,Haploview软件分析pfdhfr和pfdhps基因连锁不平衡情况.结果 共收集中缅边境地区190份恶性疟样品,PCR扩增出pfdhfr180份、pfdhps 178份.测序结果显示,pfdhfr和pfdhps均出现等位基因的多重感染,其中pfdhfr检出17个多重感染,突变位点分别位于第51、59、108、164位氨基酸密码子,其表型为511/59R/108N/164L;pfdhps检出4个多重感染,突变位点分别位于第436、437、540、581位氨基酸密码子,其表型为436A/437A/540E\N/581G("\"表示并列关系).pfdhfr第N51I、C59R、S108N、I164L位点的突变率分别为 57.8%(108/187)、90.1%(172/191)、93.3%(168/180)、59.6%(109/183);pfdhps第 S436A\C、A437G、K540E\N、A581G 位点抗性突变率分别为 54.7%(99/181)、86.5%(154/178)、84.9%(152/177)、28.7%(51/178).pfdhfr单体型主要集中在三点、四点突变型(51I59R108N/59R108N164L、51I59R108N164L),分别占44.9%(84/187)和36.9%(69/187).pfdhfr和pfdhps野生型在2010年均未检出.2011年的pfdhfr三点、四点突变单体型(同上)分布频率分别为 35.9%(23/64)、37.5%(24/64),均小于 2010 年的 46.2%(30/65)、49.23%(32/65)(P<0.05),与 2014-2018 年的 53.4%(32/58)、22.4%(13/58)比较差异有统计学意义(P<0.05).2014-2018年的pfdhps三点突变单体型(436A\C437G540E\N,437G540E\N581G)分布频率为62.1%(36/58),小于2010年的82.3%(51/62)和2011年的78.7%(48/61)(均P<0.05).连锁不平衡分析显示,pfdhfr C59R与S108N基因关联性强(D'=1,r2=0.8),pfdhps S436A 与 A581G 关联性强(D'=1,r2=0.6),且 S108N 与 K540E 存在较强关联性(D'=0.8,r2=0.2).结论 云南中缅边境恶性疟原虫pfdhfr和pfdhps基因的抗性分子突变单体型仍是优势基因,且随着停药时间延长突变频率逐渐降低.
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编辑人员丨2024/6/22
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中缅边境地区间日疟原虫几丁质酶基因的遗传特性分析
编辑人员丨2024/6/15
目的 明确中缅边境地区间日疟原虫几丁质酶(Plasmodium vivax chitinase,PvCHT1)基因的遗传多样性,探究PvCHT1基因的地理差异,为我国间日疟疫苗的设计提供参考.方法 收集中缅边境地区(云南腾冲)、中国内陆地区(安徽合肥、河南郑州)PvCHT1基因序列,同时从美国国家生物技术信息中心(National Center for Bio-technology Information,NCBI)下载获取缅甸、柬埔寨、泰国、越南、印度尼西亚、马来西亚、巴布亚新几内亚、巴西、哥伦比亚、秘鲁和墨西哥等11个国家的PvCHT1基因序列.采用MEGA、DnaSP、KaKs_Calculator、Arlequin、STRUCTURE和 NETWORK软件,分别对所有基因序列的遗传多样性、基因进化、遗传分化、种群结构和单倍型网络进行分析.结果 共获得中缅边境地区(6条)、中国内陆地区(10条)PvCHT1基因序列16条,从NCBI下载其他11个国家的PvCHT1基因序列551条.遗传多样性分析显示,中缅边境地区的PvCHT1基因有25个多态位点,其中16个为非同义突变,最常见的突变位点是E617D(占31.57%)和I272M(占31.04%);中缅边境地区的PvCHT1基因核苷酸多样性(π=0.000 79)略高于中国内陆地区(π=0.000 71)和缅甸(π=0.000 75).基因进化分析显示,中缅边境PvCHT1基因的中性检验(Tajima's D)值<0,非同义替换与同义替换之比(Ka/Ks)>1.遗传分化分析显示,中缅边境地区PvCHT1基因与中国内陆之间的近交系数(FST)为0.31,与缅甸的FST为-0.05,与柬埔寨、泰国、越南、印度尼西亚、马来西亚之间的范围为0.04~0.15,与巴布亚新几内亚、巴西、哥伦比亚、秘鲁、墨西哥之间的FST范围为0.24~0.56.种群结构分析显示,所有种群结构的最佳组数为7,其中,中缅边境种群由K1~K6组分构成,以K5为主.单倍型网络分析显示,存在4个单倍型地理集群,除中国内陆和墨西哥外,其他国家均共享单倍型H5.结论 中缅边境地区PvCHT1基因高度保守,提示其可作为传播阻断疫苗候选靶标;PvCHT1基因在不同种群中存在明显的地理差异,因此在设计疫苗时应更具针对性.
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编辑人员丨2024/6/15
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基于时空多成分模型的中缅边境地区景洪市登革热流行特征分析
编辑人员丨2024/6/15
目的 了解中缅边境地区景洪市2019年登革热时空分布特征及传播影响因素.方法 收集中缅边境地区景洪市2019年登革热本地病例逐日发病数,将人口密度、人均GDP、日平均气温、日平均相对湿度和日照时数等因素作为协变量,构建基于Power-law算法的时空多成分模型,通过赤池信息量(Akaike information criterion,AIC)来评价模型的拟合效果.结果 中缅边境地区景洪市2019年累计报告3 303例登革热本地病例,发病率为763.44/10万.将人均GDP纳入时间自相关成分,同时将人口密度、日平均气温、日平均最高气温和日平均相对湿度纳入局部特性成分的时空多成分模型的拟合效果最优(AIC=2 317),此时时间自相关成分为0.215 1[95%CI:(0.081 2,0.570 2)]、空间流行成分为0.000 4[95%CI:(0.000 2,0.001 0)]、局部特性成分为3.015 2[95%CI:(1.650 7,5.507 8)].协变量日平均相对湿度、人口密度、人均GDP、日平均气温、日平均最高气温的作用强度依次为2.815 9[95%CI:(0.021 6,367.168 5)]、1.822 7[95%CI:(1.497 6,2.218 3)]、1.208 8[95%CI:(1.057 7,1.381 6)]、0.356 1[95%CI:(0.011 9,10.673 9)]、0.310 4[95%CI:(0.003 6,126.548 2)].对发病数>20例的区域分析发现,允景洪街道、西双版纳旅游度假区和景洪工业园区时间自相关成分影响较大,嘎洒镇、勐龙镇和勐罕镇局部特性成分影响较大.结论 景洪市不同区域登革热时空构成存在差异性,具有不同的时空传播特征.人均GDP会扩大前期疫情对后期疫情传播的影响,人口密度、日平均气温、日平均最高气温和日平均相对湿度则会影响研究区域登革热本地风险水平.
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编辑人员丨2024/6/15
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云南边境地区疟疾输入再传播风险和防控需求
编辑人员丨2024/5/25
近年来缅甸北部边境地区疟疾发病急剧回升,其中克钦邦拉咱及附近地区2023年年带虫发病率是2019年21.47(95%CI:18.84-24.48)倍,导致云南输入病例数从2019年的188例回升到2023年398例.缅北地区除军事冲突影响外,也因国际新冠疫情影响,我国与缅甸建立的边境疟疾联防联控合作机制及其疟疾控制措施得不到落实.为此,建议相关部门从技术上评估出中缅边境地区现行疟疾跨境传播措施的执行质量和效果,并针对目前缅北地区以间日疟为主的流行特点,需要提供大量能阻断疟疾传播和根治间日疟的伯氨喹啉,同时为有效减少输入疟疾病例死亡和防止输入再传播,云南边境地区仍需进一步提高临床医生疟疾诊治知识、意识和警觉性,以及中国对输入性疟疾作出适当反应的能力和质量.
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编辑人员丨2024/5/25
