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实验室监测在传染病预警中的应用及思考
编辑人员丨1周前
新型冠状病毒肺炎疫情的暴发流行,使全社会重新认识了传染病发生、流行及防控所面临的巨大挑战,即便是当前对传染病防范的认知、应对技术和社会经济条件已有历史上最好的基础。在传染病的监测预警中,研究和利用各类传染病发生与传播相关因素的数据,以期在传染病发生的早期甚至发生前识别疫情信号,成为传染病防控研究的重要命题。病原体是传染病发生的原因,所以以病原学为核心的实验室监测是传染病预警体系的重要组成部分。我国目前已经初步建成了基于国家致病菌识别网的细菌性传染病实验室监测预警系统,其核心是识别病原、识别暴发、识别来源,在鼠疫、霍乱、流脑等细菌性传染病的早期发现、溯源和精准防控中起到重要作用。本期重点号围绕实验室监测在细菌性传染病预警和防控中的作用,从流行和暴发菌株特征分析、与流行病学调查的联合应用、与常规病例监测体系的融合等方面开展研究,体现了实验室监测在传染病风险评估和疫情调查中的作用,同时对实验室监测预警技术及应用场景进行了综述和展望,以期为推动我国传染病监测预警体系的跨越发展提供新思维。
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编辑人员丨1周前
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“2021年传染病防控与生物安全新思维研讨会”专家共识
编辑人员丨1周前
2021年4月15—17日,来自疾控、医疗、高校和科研院所的80余位专家聚焦我国传染病防控与生物安全面临的挑战与机遇,聚焦大数据和监测网络、检测与溯源技术、耐药控制和疫苗研发策略的关键问题等内容展开深入讨论,并达成共识:(1)针对我国面临的传染病防控现状和保障生物安全的需要,亟需建立跨部门、全方位的微生物科学数据库和实验室监测网络;(2)病原筛查鉴定和分型溯源技术需向超灵敏、智能化和网络化的方向发展,应规范基于高通量测序的病原鉴定和溯源技术的标准及应用范围;(3)亟需建立跨部门的耐药监测体系,加强耐药菌跨物种传播监测;(4)应用科学理论和新技术指导和改进未来疫苗应急研发及接种策略。根据以上问题提出专家建议。
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编辑人员丨1周前
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细菌性传染病实验室病原学监测预警技术发展及其应用
编辑人员丨1周前
人类目前依然面临着细菌性传染病带来的公共卫生挑战。开展系统的传染病监测预警是预防和控制传染病最直接的手段。病原学是传染病监测预警的重要组成部分。敏感准确的病原学监测可以在第一时间识别病原、识别暴发、识别来源。本研究对细菌性传染病的病原学监测预警技术研究和应用现状进行综述,总结病原学在传染病监测预警中的重要性和应用场景以及病原学监测预警技术研究进展,并在我国现有的国家致病菌识别网等实验室监测网络的工作基础上,提出了传染病实验室网络化监测发展趋势和展望,为建立健全传染病监测预警体系提供参考。
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编辑人员丨1周前
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2021年1月哈尔滨市新型冠状病毒肺炎疫情流行病学特征及传播链分析
编辑人员丨1周前
目的:观察哈尔滨市新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情的流行特征并进行溯源分析,为完善COVID-19防疫措施、优化防控策略提供流行病学依据。方法:应用中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统、突发公共卫生事件管理信息系统,黑龙江省卫生健康委员会公开发布的疫情信息,以及黑龙江省疾病预防控制中心和哈尔滨市疾病预防控制中心流行病学调查(流调)报告,采用描述流行病学方法进行2021年1月哈尔滨市COVID-19疫情分析。结合现场流调、血清学检测、基因测序和大数据等手段,梳理主要传播链。结果:2021年1月12日至2月4日,哈尔滨市共报告COVID-19感染者(包括确诊病例和无症状感染者)295例,波及哈尔滨市6个区,集中分布在全市274个乡镇中的41个乡镇。病例男女性别比为1.00∶1.12(139∶156);年龄中位数为45岁,范围为1 ~ 86岁。确诊病例和无症状感染者比例为1.00∶1.02(146∶149),二者年龄分布比较差异有统计学意义( P = 0.042)。感染者主要通过集中隔离人员健康筛查发现(178例,60.3%);其次为主动筛查(87例,29.5%),居家隔离人员筛查(26例,8.8%),医疗机构就医(4例,1.4%)。疫情主要传播链为某食品加工企业关联病例,总计259例,占病例总数的87.8%,基因测序结果显示与黑龙江省绥化市望奎县病例序列同源。 结论:哈尔滨市此次COVID-19疫情中某食品加工企业为主要传播链,提示COVID-19疫情防控工作需进一步加强对食品加工企业、冷链储存公司等企业的监督和管理,对大中小型企业存在密闭空间的新型冠状病毒传播隐患应予以高度重视,认真落实各项防控措施。
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编辑人员丨1周前
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"病原微生物监测、检测、溯源与疫苗研发关键前沿问题学术交流会"专家共识
编辑人员丨1周前
来自疾病控制、高校科研院所、医疗机构的48位专家于2019年10月24—27日围绕我国传染病监测网络面临的挑战与机遇,病原微生物检测与溯源技术的探索和未来发展需求,以及疫苗研发面临的关键问题等内容展开了深入的讨论,并达成共识:(1)我国传染病监测网络亟须跨部门进行业务和数据整合,建设并完善以人为核心的全生命周期疾病监测与健康管理系统;(2)传统病原分离培养技术仍需进一步规范和加强,病原微生物检测技术亟须发展多靶标、超灵敏、高特异、便捷化和数字化的高中通量的新技术,并发展基于致病共栖菌谱新靶标的疾病诊断新技术;(3)亟须建立基因组学、生物信息学、微生物学等多学科交叉的溯源技术体系;(4)疫苗研发亟须相关基础研究支撑,并需加强疫苗接种策略和上市后评价与评估策略的研究。同时根据以上问题提出了专家建议。
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编辑人员丨1周前
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SEIR动力学模型辅助北京市新发地新型冠状病毒肺炎疫情传播起始时间溯源和防控效果评价
编辑人员丨1周前
目的:推测2020年6月北京市新发地新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情首例感染的传播时间起点,辅助传染病溯源,评价当前综合防控效果。方法:根据北京市卫生健康委员会官方报告统计每日发病人数,建立SEIR传染病动力学模型,基于每日发病人数拟合动力学模型,并搜寻本次疫情的传播时间起点;考虑不同的防控效果而拟合6月12日至7月1日的累计发病人数,以评估当前综合防控措施效果。结果:北京市新发地疫情传播首例感染应起始于5月22日至5月28日之间(累计概率为95 %),起始于5月25日的概率最大(23 %)。本次疫情 R0为4.22(95 %CI:2.88~7.02)。模型拟合结果提示,截至6月11日,累计发病为99例(95 %CI:77~121),符合实际情况。若不加控制,则截至7月1日累计发病估计将达到65 090例(95 %CI:39 068~105 037)。截至7月1日,较之无防控措施的理论情况,实际感染人数减少了99 %。自6月12日起,北京市采取了强有力的综合防控措施,疫情实际走势接近于传播率降低95 %的推演结果,敏感性分析支持这一结果。 结论:针对突发性疫情,传染病动力学模型可用来辅助推演传染病传播起始时间,辅助疫情溯源。北京市针对本次突发疫情所及时采取的综合防控措施迅速控制了95 %以上的传播途径,减少了99 %的感染人数,快速遏制了疫情,对于未来疫情防控具有重要的指导意义。
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编辑人员丨1周前
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2017—2019年我国炭疽流行特征及炭疽芽胞杆菌分子分型分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨2017—2019年我国炭疽流行特征及发病规律,对部分省份(自治区)的炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。方法:收集中国疾病预防控制传染病监测信息系统和突发公共卫生事件报告管理信息系统中2017—2019年报告的炭疽发病资料,采用描述性流行病学方法分析流行特征和时间、地区及人群分布情况;以2017—2019年分离的47株炭疽芽胞杆菌作为研究对象,应用经典单核苷酸多态性分析(canSNP)和15个位点的可变数量串联重复序列分析(MLVA15)方法对炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。结果:2017—2019年共报告的炭疽病例数为951例,其中938例是皮肤炭疽,达到总报告数的98.63%,分布地区主要在我国西部和东北地区,累计病例数前三位的省份是甘肃(215例)、四川(202例)和青海(191例);全年均有病例报告,夏秋季发病较多,8月份达到发病高峰,2017—2019年的6至10月份发病数分别占全年发病数的66.35%(211/318)、72.32%(243/336)和68.01%(202/297);年龄范围分布主要在20~59岁,约占总病例数的80%以上;男性病例明显多于女性,男女性别比约为3∶1。职业以牧民和农民为主,牧民病例占当年全部报告发病数的49.70%~58.18%,农民病例占当年全部报告发病数的31.45%~36.70%。每年均有突发公共卫生事件报告,2017—2019年共报告29起突发公共卫生事件。canSNP分析显示,47株菌中有37株属于A.Br.001/002亚群,10株属于A.Br.Ames亚群。MLVA15分析显示,测试菌株可以分成17个基因型,其中有10个基因型只包括1株菌。结论:我国2017—2019年炭疽主要以皮肤炭疽为主,有明显地区性、季节性和人群分布特征;canSNP和MLVA15等分子分型方法可以在传染病溯源工作中发挥作用,为炭疽的预防控制提供技术支持。
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编辑人员丨1周前
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成都市农村地区境外输入新型冠状病毒肺炎病例关联聚集性疫情分析
编辑人员丨1周前
对2020年12月成都市农村地区一起由境外输入新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例引发的本土聚集性疫情开展流行病学调查分析,查明感染来源和病例传播链。按照《新型冠状病毒肺炎防控方案(第七版)》要求,采用现场流行病学调查方法,结合大数据技术、视频图像调查、基因测序等方法开展新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染病例调查及传染源追踪溯源,分析其流行病学关联并绘制传播链。2020年12月7—17日成都市共确诊COVID-19本土病例13例,无症状感染者1例,其中12例(85.71%)有成都市郫都区太平(P区TP村)村院落的居住及活动史。P区TP村毗邻辖区指定的入境人员隔离酒店,该酒店11月8—28日入住了一批尼泊尔入境人员,且在隔离期间有5例隔离者陆续被检出SARS-CoV-2核酸阳性。通过基因测序比对,本土病例与同期尼泊尔输入病例同源,为L2.2.3分支(Pangolin分型为B.1.36),结合流行病学调查溯源线索,本土指示病例可能是由于接触隔离点生活垃圾而致感染。综上,COVID-19疫情常态化防控形势下,入境人员隔离点生活垃圾的规范管理是预防发生本土关联病例的关键环节,而基层医疗机构发热门诊哨点监测是疫情早发现关键,多部门联合流行病学调查以及基因技术的运用是现代传染病疫情调查溯源的核心环节,各地亟需加强隔离酒店管理,降低发生本土关联病例风险,同时加强农村地区公共卫生资源配置,提高农村地区疫情早期监测预警能力。
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编辑人员丨1周前
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微视频追根溯源培训模式在急诊科护士新发传染病培训中的应用
编辑人员丨1周前
目的:探讨微视频追根溯源培训模式应用于新发传染病(emerging infectious diseases,EID)知识培训对急诊科护士自主学习能力和学习效果的影响。方法:本研究从EID的历史发展视角制定培训内容,以微视频归类模块、基于微信群分期推送的自主学习形式构建培训方案。采用方便抽样法选取上海市某三级甲等综合医院85名急诊科护士( n=85),进行微视频追根溯源培训,通过含有启发性思考、微视频学习、要点巩固、要点解析、延伸拓展五个环节的11期模块对其进行EID知识培训。比较干预前后急诊科护士自主学习能力和EID知信行水平,并调查其对该培训模式的满意度评价。使用SPSS 20.0及GraphPad Prism 9.3.0进行四分位数( Q25, M, Q75)的非参数Wilcoxon配对检验。 结果:急诊科护士接受培训前后,其自主学习能力整体( Z=-4.69, P<0.001)及自我动机概念( Z=-4.48, P<0.001)、任务分析( Z=-4.06, P<0.001)、自我监控与调节( Z=-4.50, P<0.001)、自我评价( Z=-4.82, P<0.001)各维度得分差异均有统计学意义,培训后高于培训前;其EID知信行整体( Z=-4.65, P<0.001)及知识( Z=-4.04, P<0.001)、态度( Z=-3.24, P=0.001)、行为( Z=-4.05, P<0.001)各维度得分差异均有统计学意义,培训后高于培训前。急诊科护士对该培训模式满意度评价较高(各条目满意度均>90%)。 结论:微视频追根溯源培训模式能有效提高急诊科护士自主学习能力和EID知信行水平,培训满意度较高,可尝试推广使用。
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编辑人员丨1周前
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管式磁微粒非洲猪瘟病毒pp62蛋白化学发光抗体检测方法的建立
编辑人员丨2024/4/6
[背景]非洲猪瘟(African swine fever,ASF)作为高致病性传染病,给我国生猪养殖业造成了严重的经济损失,因此建立快捷、灵敏的诊断方法至关重要.[目的]建立一种管式非洲猪瘟病毒pp62 蛋白化学发光抗体检测方法.[方法]以重组pp62 蛋白作为包被抗原,羧基磁珠(carboxylic magnetic beads)作为固相载体,碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,AP)标记的兔抗猪IgG作为酶标二抗,通过对反应条件进行优化,采用非洲猪瘟国家参考品作为溯源血清绘制出标准曲线,建立基于ASFV pp62 蛋白的化学发光抗体检测方法.[结果]用建立的化学发光方法检测 277 份临床样品血清,通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析确定阴性、阳性临界值,并确定判定标准:浓度值>140.02 U时为抗体阳性,浓度值<140.02 U时为抗体阴性.此方法对 6 种不同的病原血清抗体进行检测均无交叉反应,且批内和批间变异系数均在 10%以内,与商品化非洲猪瘟抗体检测试剂盒的符合率达 96.7%.[结论]本研究建立的管式非洲猪瘟病毒化学发光抗体检测方法具有良好的特异性、敏感性和重复性,可为非洲猪瘟早期监测及试剂盒研发提供参考.
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编辑人员丨2024/4/6