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通过加权基因共表达网络分析脓毒症相关基因
编辑人员丨5天前
目的:通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别脓毒症发生发展过程中的关键基因。方法:从基因表达数据库(GEO)中下载基因表达数据集GSE154918,其中包含对照40例、无症状感染12例、脓毒症39例、脓毒症随访14例,共105例芯片数据。采用R软件筛选出脓毒症差异表达基因(DEG),用分布式访问视图集成数据库(DAVID)、检索交互基因的搜索工具(STRING)和可视化软件Cytoscape进行基因功能和通路富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析及关键基因分析,筛选出脓毒症发生发展过程中的关键基因。结果:通过WGCNA并结合DEG表达分析得到46个候选基因,对这46个基因进行基因本体(GO)、京都市基因与基因组百科全书(KEGG)途径富集分析得到基因功能和参与的信号通路。进一步使用STRING数据库构建PPI网络,通过PPI网络可视化软件Cytoscape选出5个关键基因,包括肥大细胞表达膜蛋白1基因(MCEMP1)、S100钙结合蛋白A12基因(S100A12)、脂肪因子抵抗素基因(RETN)、c型凝集素结构域家族4成员基因(CLEC4D)、过氧化酶增殖因子活化受体基因(PPARG),对这5个基因分别进行表达差异分析,结果显示,在脓毒症患者中上述5个基因的表达水平较健康对照者显著性上调。结论:本研究通过构建WGCNA方法筛选出有关脓毒症的5个关键基因,可能成为潜在的脓毒症诊疗相关候选靶点。
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编辑人员丨5天前
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COVID-19传染病区域性防控辅助信息系统的设计与初步应用
编辑人员丨5天前
目的:提出新型冠状病毒肺炎传染病暴发期区域性防控(Regional Control and Prevention, RCP)系统概念,设计基于区域现有网络架构和信息系统的应急性防疫辅助信息系统,建立远程智能医疗会诊与咨询及远程办公平台,研发区域内人群的风险评级与预警技术,提高区域性的应急重大传染病防控能力。方法:以高校、附属(教学)医院及云应用为典型RCP区域单元,建立云与高校及附属(教学)医院现有局域网交互方法,实现网络环境的远程办公、远程医学影像、心理与伦理会诊与咨询互动;应用基于复杂网络的多主体传播模型,结合全球定位系统(Global Positioning System,GPS)、射频识别(Radio Frequency Identification, RFID)和电子围栏技术,实现区域内单元、人员的风险分级与早期预警。结果:在RCP内采用校园网、附属(教学)医院内网以及互联网相结合的系统架构,用分布式技术、云存储方式进行动态衔接,网间中间库数据缓冲区机制,实现各单元远程医疗会诊与远程办公。依托平台,应用基于复杂网络的多主体传播模型和元胞自动机模型等,利用GPS、RFID和电子围栏技术,实现区域内人群暴露风险评分与预警。结论:在重大传染病流行阶段,RCP系统的建设可提高应急情况下防疫响应速度,提供基于数据的合理预警和风险评级,减少易感人群的暴露风险。RCP系统的设计开发是系统化工程,需要结合区域结构与功能特点,并且区域内前期的信息化工作基础与应急开发团队水平决定了开发进度、维护和实际应用的效果,建议建立平战结合RCP模式,纳入政府疾控体系,以提升国家和区域重大传染病防控水平和能力。
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编辑人员丨5天前
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健康医疗大数据互联互通模式的经验与挑战
编辑人员丨5天前
互联互通是目前全球各国健康医疗大数据使用面临的最大壁垒。互联互通涉及业务、安全、伦理、语义和技术5个维度,本文在比较政府主导、企业主导和研究机构主导3种常见互联互通模式的基础上,结合中国健康医疗大数据的发展现状,提出高校牵头、企业助力和政府支持的工作模式。同时,归纳出目前我国健康医疗大数据互联互通面临的3大挑战:行业标准与规范、数据安全与伦理、激励机制与考核。唯有采用切实可行的模式,攻克相关关键技术,真正将数据打通共享,才能最大限度的整合多来源数据,挖掘多应用场景,培育多业态模式,全面提升人口健康科学决策和服务管理水平。
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编辑人员丨5天前
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大型综合性医院业务全面上云实践
编辑人员丨5天前
2020年11月,某三级甲等医院为响应"健康中国2030"规划,加快医院信息平台云化转型,推进智慧医院建设和提升医院信息化服务能力,启动医院业务全面上云实践,通过租借运营商互联网数据中心,配置高扩展性基础设施,组建多环路自愈式光纤专用网络,应用基于微服务和分布式存储的云化软件架构,实施分布式系统全链路日志和性能监控,构建了适合大型综合性医院的高可用性医疗云平台。2021年2月,医院医疗业务和运营管理业务全面上云,实现了多院区统一管理,降低了人力和机房建设资金投入,保障了医院业务连续性,促进了区域医疗协同和优质医疗资源下沉,为加快推进全国范围内医院业务上云提供参考。
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编辑人员丨5天前
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基于Hadoop环境BP改进算法的脉象识别应用研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 分析脉象识别误差大小的影响因素,提高对海量脉诊数据的处理速度,探索减小脉象主观识别误差的方法.方法 运用基于Hadoop环境的MapReduce分布式计算方法改进BP算法,采用改进的BP算法对脉诊样本数据进行自学习,从而减小拟和误差.将中医电子脉诊仪采集的脉诊数据作为神经网络输入层,采用动量-学习率自适应调整快速BP算法对神经网络进行训练.结果 在训练集(75%)768 M共35890条数据中,单机模式正确预测29150条,正确率为81.22%;MapRedece并行改进的BP算法模式正确预测35841条,正确率为99.86%.结论 与传统BP算法相比,基于Hadoop环境的MapReduce分布式计算方法改进的BP算法模型拟合度误差更小,精确度更高.
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编辑人员丨2023/8/6
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神经系统编码时间节律信息的机制
编辑人员丨2023/8/6
时间节律信息的提取和编码极其重要,是人们识别语音、欣赏音乐和产生节律运动等的基础.但人们对神经系统提取和处理外部输入中时间节律信息的机制迄今还知之甚少.本课题组提出了一个具有无标度拓扑结构的神经网络模型,并考虑通过神经元之间的电突触或连接效率随突触连接而减弱的化学突触,来实现枢纽神经元难以被激活等特性.在该模型中,枢纽神经元能触发网络的同步化发放,连接度相对较低的神经元形成的环路决定了同步发放的周期,且枢纽神经元难以被激活的特性避免了网络的爆炸性发放.该模型很好地再现了实验中观察到的长时程周期性同步发放现象,证明神经系统能通过局部网络动力学分布式地处理时序信息.本综述旨在对神经系统编码时间节律信息的机制进行阐述和总结.
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编辑人员丨2023/8/6
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银屑病患者数据信息管理系统的设计与初步实现
编辑人员丨2023/8/6
目的:探讨在临床皮肤疾病诊治过程中,建立银屑病患者数据信息管理系统的必要性,使之与现代数字医院相结合,为皮肤疾病的临床诊疗、教学和科研提供有价值的资料.方法:根据临床需求设计并建立银屑病网络数据库,收集患者个人病史、皮肤受损情况、量表计分、图片资料、实验室检查数据等,并将以上信息录入到数据库中,基于医院内部网络,与医院现有的HIS系统建立数据通讯接口,在Internet网络环境支持下进行分布式应用,采用B/S体系的运行模式,将收集的数据信息进行分析、计算,在此过程中探讨数据信息管理系统在银屑病患者临床评估和诊疗中的应用.结果:该系统数据信息收集详尽,储存量大,计算、分析准确,系统安全性高,稳定性、兼容性及临床实用性强.结论:银屑病患者数据信息管理系统通过现代科技手段将患者的疾病资料进行管理,建立并完善了银屑病患者的信息资料,提高了银屑病临床诊断的科学性、规范性及诊疗效率,对银屑病临床决策和科学研究具有重要意义.
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编辑人员丨2023/8/6
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基于Hadoop的医疗大数据智能辅助诊疗平台的构建
编辑人员丨2023/8/6
目的:高效处理医疗大数据,将医疗大数据技术应用于临床,构建临床辅助诊疗平台.方法:采用Hadoop大数据技术框架,分布式计算存储医疗数据;利用人工神经网络模型与方法,开展智能诊疗应用探索.结果:构建了大数据智能辅助诊疗平台的模型.结论:运用Hadoop大数据技术与人工神经网络模型,可构建大数据辅助诊疗平台,实现临床智能辅助诊疗.
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编辑人员丨2023/8/6
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协同分布式实验2.0(CDE 2.0):生态学野外研究新方法
编辑人员丨2023/8/6
全球野外实验网络是近年来兴起的生态学实验方法,产生了“协同分布式实验”(CDE)、“分布式协作实验”(DCE)的野外实验网络和英国生物学记录中心(BRC)的野外观察网络等具体方法,但均存在尺度小、周期短或数据偏差问题.野外实验网络的协议设计应秉持实验优于观察测量、数据数量优于数据质量和尺度优于操作的原则.综合上述方法,本研究提出利用公众科学(citizen science)获得大范围、多尺度和长周期的数据,采用环境因子作为协变量对公众参与者的实验数据集进行验证后,将其作为后验概率与作为主观概率的生态学家实验数据集进行比对,以完成数据有效性验证,克服公众参与者数据质量瑕疵,并提出了相应的统计学模型.讨论了生态学实验数据中应用先验概率、先验与后验概率的逻辑关系以及后验概率发现演化过程新关系的可能性.这种方法更符合统计学采样规范,并增加了大尺度时空的样本量.该方法有望为生态学研究所寻找的一般性理论提供方法支持,新方法可称之为“协同分布式实验2.0”(CDE 2.0).
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编辑人员丨2023/8/6
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基于多频合路分布式基站的无线网络在医疗环境下的应用
编辑人员丨2023/8/6
目的:随着医院信息化的不断发展,基于无线网络的各类应用越来越多,无线网络建设成为医院当前信息化发展的重要支撑.为了临床移动应用提供无线网络环境,规划并设计实施了基于多频合路分布式基站的无线网络.方法:在数据中心部署集中管理平台,各病区部署多频合路分布式基站,病房内部署室内信号分布系统,基站与本楼层接入交换机互联,提供本病区统一信道设置、VLAN配置、IP地址规划、安全接入策略管理.结果:目前该无线网络系统已成功部署在宁夏医科大学总医院,承载了移动护理、移动心电、移动DR等无线数据应用,以及基于RFID的库房资产管理、科研冷链监测等物联网应用.结论:无线网络系统已正常运行三年,符合医院临床应用场景和实际需求,实现临床信息化延伸到患者床旁、服务于临床.
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编辑人员丨2023/8/6
