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香菇单核菌丝生长速度差异的相关基因分析
编辑人员丨2024/4/6
以双核香菇Lentinula edodes菌株中分离获得 2 个亲和的单核体Y0040-1 和Y0040-3 为材料,在不同的培养基上进行培养,进行差异性状评价和表达差异性分析.结果表明在不同的培养基(PDA和 2%木屑PDA)上 2 个单核体菌丝生长速度都存在差异,其中Y0040-1 的生长速度显著高于Y0040-3.进一步分析转录组数据发现,在不同培养基上 2 个单核体比较组(Y0040-3 vs.Y0040-1)有1 633 个共同的差异基因,这些共同变化的基因可能是导致两者性状差异的主要原因,这些基因中共同上调的有 155 个,共同下调的有 136 个.对这些基因进行注释分析,发现共同上调的基因参与代谢过程中的氨基酸代谢和碳水化合物代谢等,分析木质纤维素酶发现,Y0040-1 上调基因数量高于Y0040-3,且Y0040-1 中的纤维素降解酶和木质素降解酶表达量都明显高于Y0040-3.
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编辑人员丨2024/4/6
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秀珍菇单孢子菌株原生质体制备条件的优化
编辑人员丨2023/8/6
以秀珍菇单核菌丝为材料,用溶壁酶进行原生质体的制备,考察各因素对原生质体产量的影响,用单因素试验和正交试验确定最佳条件.结果表明,菌龄为8 d菌丝体,0.6 mol/L甘露醇+10 mmol/L Tris-HCl为稳渗剂,酶解温度29℃、酶浓度1.6%的条件下酶解160 min.原生质体产量达到3.5×107 CFU/mL,原生质体再生率达到1.4%.
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编辑人员丨2023/8/6
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金针菇单孢菌株菌丝生长速度QTL定位分析
编辑人员丨2023/8/6
本研究以已经完成基因组测序的单核菌株“6-3”与“6-21”为出发菌株,配对后获得有锁状联合的异核菌株并进行出菇,收集担孢子,单孢分离获得90个菌株构成作图群体,对作图群体的每个菌株进行二代测序并测定菌丝在PDA培养基的生长速度.分析“6-3”与“6-21”两单核菌株的SNP,获得68 914个高质量SNP标记用于遗传连锁群分析,构建了14个遗传连锁群,总长度744.32cM,平均长度为53.17cM,标记间平均遗传距离为1.88cM.QTL分析获得一个控制菌丝生长速度的基因座qMGRP1-LG7,该基因座包含134个基因,富集了与物质代谢有关的通路和基因.
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编辑人员丨2023/8/6
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灵芝线粒体及其对菌丝生长、主要活性成分影响的分析
编辑人员丨2023/8/6
线粒体是为细胞提供能量(ATP)的细胞器,携带着自己的DNA——mtDNA,已有多种灵芝属菌株的线粒体基因组相继报道,但对于种内的线粒体基因组的分析较少,对核相同、线粒体不同的菌株间差异的研究也鲜有报道.本研究对两株灵芝线粒体基因组进行组装注释,根据差异片段构建分子标记进行种间分类.结果 显示:两株灵芝线粒体基因组大小分别为49 233bp、61 563bp的闭环结构,含有15个常见蛋白编码基因,rRNA大小亚基基因及26个携带氨基酸的tRNA基因,其差异区段主要为内含子序列、大亚基及基因间区.根据cob、cox2基因序列能够进行灵芝种间区分,用于灵芝种间鉴定.本研究还根据灵芝119、灵芝无孢的单核菌株构建同核异质体(TY-119、TY-W),分析线粒体对菌落形态、菌丝生长速度及多糖、三萜成分的影响,结果显示:同核异质体TY-W与TY-119菌落形态上有一定差异,同核异质体TY-W菌丝生长速度为4.77mm/d,是TY-119菌丝生长速度4.50mm/d的1.06倍,同核异质体TY-119菌丝、子实体阶段多糖含量分别为4.45mg/g、12.14mg/g是TY-W菌丝体多糖含量(3.23mg/g)的1.38倍、子实体多糖含量(10.24mg/g)的1.19倍;同核异质体TY-W菌丝、子实体阶段的三萜含量分别为6.82mg/g、11.45mg/g是同核异质体TY-119菌丝体三萜含量(9.26mg/g)的0.74倍,子实体三萜含量(9.10mg/g)的1.26倍.利用高效液相色谱分析同核异质体中灵芝酸含量显示同核异质体TY-W灵芝酸A、灵芝酸E、灵芝酸F含量分别为3.77Lg/mL、14.29Lg/mL、12.91μg/mL;是TY-119灵芝酸A含量(2.59μg/mL)的1.46倍、灵芝酸E含量(13.65μg/mL)的1.17倍、灵芝酸F含量(12.72μg/mL)的1.06倍.对同核异质体菌丝、子实体阶段多糖、三萜合成通路关键基因(pgm、ugp、gls、hmgs、hmgr、mvd、fps、sqs)表达量进行检测,显示两菌株间多数基因具有显著性差异.结果 表明线粒体的不同会影响灵芝菌落形态、菌丝生长速度及多糖、三萜的含量,有助于我们进一步研究线粒体基因组.
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编辑人员丨2023/8/6
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食用外共生菌根真菌兰茂牛肝菌Lanmaoa asiatica纯培养条件下不同发育时期的核相
编辑人员丨2023/8/6
食用外共生菌根菌是一类可食用并与植物共生的大型真菌,其在纯培养条件下菌丝生长缓慢,不会扭结发育成原基,不能完成生活史.因此关于食用菌根菌纯培养条件下生活史的研究报道极少.本研究的兰茂牛肝菌Lanmaoa asiatica已能在纯培养条件下诱导出原基,这使生活史的研究得以完成.利用扫描电子显微镜、透射电子显微镜及荧光显微镜对兰茂牛肝菌子实体担子、担孢子、纯培养菌丝和原基的核相进行了观察.结果 表明,子实体菌丝细胞为双核,担子经过减数分裂形成4个单核担孢子;担孢子萌发时长轴端长出芽状突起伸长为菌丝,原孢子中的细胞核不分裂,直接进入菌丝,形成单核初生菌丝;初生菌丝5d后变为双核菌丝;纯培养菌丝及原基细胞均为双核,其菌丝表面光滑,未观察到锁状联合.
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编辑人员丨2023/8/6
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基于转录组分析香菇不同漆酶活性单核菌丝体基因表达
编辑人员丨2023/8/5
漆酶是香菇生长发育过程中一种重要的木质素降解酶,其活性高低对于香菇木质素降解能力和香菇品质形成具有重要作用.为探讨香菇不同漆酶活性的单核菌丝体基因表达变化,对漆酶活性存在差异的单核菌丝体进行转录组测序分析,共获得15 522个注释基因.GO (gene ontology)分析表明差异基因在氧化还原酶活性节点大量富集,包括参与木质素降解的酶类及55个细胞色素P450基因;KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析发现淀粉和蔗糖代谢、戊糖和葡萄糖醛酸相互转化途径中糖苷水解酶、UDPG脱氢酶等基因上调表达.通过搜索转录因子数据筛选到172个差异表达的转录因子,预测了可能与漆酶结合的bZIP、C2H2、C4转录因子家族.由此推测,在漆酶高产单核菌株中木质素降解和碳水化合物代谢的相关基因的表达发生变化,及糖醛酸和磷酸戊糖途径相关基因上调表达,促进了木质素降解产物高效转化成糖、核酸等生物大分子,有助于香菇菌丝体的生长,转录因子在漆酶活性调控中起了重要作用.本研究为深入理解香菇漆酶高产菌株的生理代谢机制提供了重要的基因数据资源.
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编辑人员丨2023/8/5
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刺芹侧耳交配型基因敲入单核体后锁状联合和核相的表征观察
编辑人员丨2023/8/5
刺芹侧耳是一种典型的具四极性交配型系统的担子菌,通常需要一对可亲和的单核菌丝体才能够形成稳定的双核菌丝体.本研究将刺芹侧耳单核菌株181 (A1B1)中A和B交配型基因HD1和HD2以及信息素前体基因PEphb3.1和PEphb3.3克隆后,通过PEG介导的方式敲入到可亲和的单核菌株183(A2B2)中,获得了22个阳性转化子.运用荧光显微镜对其中11个具有锁状联合的转化子进行了详细观察,描述了锁状联合和细胞核相.研究结果为进一步开展交配型基因的遗传操作研究提供了方法学上的借鉴和参考.本文还探讨了同核双核体的概念和应用价值.
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编辑人员丨2023/8/5
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担孢子介导传播对香菇双分体病毒LePV1群体形成的影响
编辑人员丨2023/8/5
[背景]LePV1为中国香菇种质资源中携带的主要病毒之一.在前期研究中,根据分子序列特征将LePV1带毒菌株群体分为两个分子类群(亚型Ⅰ和亚型Ⅱ),亚型Ⅰ包含大部分带毒香菇菌株,而亚型Ⅱ仅包含少数几个供试带毒香菇菌株,在地理上相距遥远的不同遗传背景香菇菌株中发现了同一LePV1分子类型.[目的]探究担孢子介导传播对香菇双分体病毒LePV1群体形成的影响.[方法]比较不同亚型菌株的有性担孢子后代带毒率差异,并采用单单杂交和单双杂交方式分析杂交对LePV1群体形成的影响等.[结果]亚型Ⅰ中栽培菌株ZP51和野生菌株YS94的担孢子带毒率分别为70%和100%,亚型Ⅱ中栽培菌株ZP28和野生菌株YS5的担孢子带毒率分别为45%和55%,暗示亚型Ⅰ菌株担孢子传毒效率高于亚型Ⅱ;当杂交配对的任一亲本携带LePV1时,无论是单单杂交还是单双杂交,获得的杂交子带毒率为100%.[结论]不同亚型担孢子病毒携带率的不同和杂交在香菇双分体病毒LePV1群体形成中可能发挥着重要作用;此外,LePV1不能在杂交不亲和的单核体之间传播,也不能在不亲和的单双杂交配对中进行传播;在杂交可亲和的单双杂交配对中,杂交成功的杂交子在与亲本双核体菌丝接触一段时间后,可以将病毒LePV1通过胞质传播传给亲本双核体菌丝体.该研究为明确香菇双分体病毒LePV1传播规律及LePV1群体形成机制提供了线索.
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编辑人员丨2023/8/5
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巨噬细胞对马尔尼菲篮状菌免疫作用机制研究进展
编辑人员丨2023/8/5
马尔尼菲篮状菌(Talaromyces marneffei),旧称为马尔尼菲青霉菌(Penicillium marneffei),流行于东南亚和中国南部.法国Capponi等[1]在1956年从竹鼠体内分离的青霉菌属温控双相条件致病菌,室温25 ℃条件下表现为菌丝相, 37 ℃环境下表现为酵母相,酵母相菌体具有致病性.马尔尼菲篮状菌病主要集中于免疫力低下人群,尤其HIV患者,若得不到有效的治疗,病死率极高[2,3].近年来,感染T.marneffei发病率上升趋势明显[4],其传播途径最常见是经呼吸道吸入T. marneffei孢子导致感染.T.marneffei属胞内寄生真菌,其宿主细胞主要为巨噬细胞,易侵犯免疫系统受损患者的单核-巨噬细胞系统,但机体对其免疫机制尚不明确.本文就巨噬细胞对T. marneffei的识别机制,巨噬细胞抗T.marnef-fei机制及T.marneffei在巨噬细胞内的存活机制进行总结如下.
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编辑人员丨2023/8/5
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胶质射脉革菌(Phlebia tremellosa)单核菌株的制备与单核体筛选
编辑人员丨2023/8/5
为获得胶质射脉革菌(Phlebia tremellosa)BBEL0901的单核体,本研究首先考察了溶壁酶的浓度、菌龄、酶解时间、稳渗剂浓度等因素对原生质体产量的影响,进而采用正交试验优化影响原生质体制备的关键条件,最后基于细胞核染色的方法鉴定单核菌株,基于ITS序列对单核体进行分子鉴定后采用二代测序技术对单核体的全基因组DNA进行检测.结果表明:采用马铃薯葡萄糖(PDB)加富培养基中静置培养4.5 d的菌丝,以0.65 mol/L氯化钠为稳渗剂,用5%的溶壁酶酶解3 h的原生质体产量最大;通过荧光染色和显微镜观察获得了三株单核菌株,对单核菌株M73的全基因组测序显示胶质射脉革菌的基因组为36.1 Mb,杂合度较低.本研究为胶质射脉革菌全基因组测序及基因功能的验证提供了可靠的实验材料.
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编辑人员丨2023/8/5
