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基于网络药理学和大鼠体内验证的藏药红景天改善脑微循环障碍作用机制研究
编辑人员丨1周前
目的 基于文献研究、网络药理学、分子对接与实验验证的方法,探究藏药红景天改善脑微循环障碍的核心靶点、关键成分和作用机制.方法 通过文献和数据库收集红景天化学成分,利用反向药效团匹配预测红景天的潜在靶点;获取脑微循环障碍靶点,并与红景天靶点映射,构建交集靶点蛋白互作网络,获取核心靶点;构建"中药-成分-核心靶点-疾病"调控网络并获取关键成分;进行GO和KEGG富集分析,构建"核心靶点-信号通路-生物过程"网络;进行分子对接验证;采用RT-qPCR和Western blot进行动物实验验证,进一步证实网络药理学分析结果.结果 从红景天中筛选出76个活性成分和285个靶点,获取脑微循环障碍靶点1 074个,交集靶点97个,核心靶点6个,关键成分6个.分子对接结果表明,有3个关键成分与核心靶点的结合性大于核心靶点蛋白与其原始配体结合性.RT-qPCR结果显示红景天能下调核心靶点CASP3、AKT1 mRNA水平,Western blot检测结果显示藏药红景天能降低CASP3、AKT1蛋白表达(P<0.05).结论 藏药红景天可通过多成分、多靶点、多通路协同改善脑微循环障碍,该研究为临床应用藏药红景天治疗脑微循环障碍提供实验依据.
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编辑人员丨1周前
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基于UPLC-Q/TOF-MS整合网络药理学的刺五加注射液治疗缺血性脑卒中作用机制研究
编辑人员丨1周前
目的:运用超高效液相色谱-飞行时间质谱联用技术(UPLC-Q/TOF-MS)整合网络药理学研究刺五加注射液治疗缺血性脑卒中的物质基础及潜在作用机制。方法:利用UPLC-Q/TOF-MS鉴定刺五加注射液的化学成分,通过Swiss Target Prediction、GeneCards和OMIM数据库预测刺五加注射液治疗缺血性脑卒中的潜在作用靶点,利用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,通过Omicshare平台对治疗靶点进行GO和KEGG富集分析,运用Autodock软件进行分子对接。结果:分析鉴定了刺五加注射液中53种成分,并以此为基础得到刺五加注射液治疗缺血性脑卒中的相关靶点189个及10个核心靶点,反向筛选发现刺五加注射液中的25个成分可能是治疗缺血性脑卒中的主要有效成分;KEGG富集结果显示,刺五加注射液可能主要通过调节PI3K-Akt信号通路来治疗缺血性脑卒中。结论:刺五加注射液治疗缺血性脑卒中的作用机制可能与抑制炎症反应、抗氧化应激、促进血管新生和保护神经细胞等作用有关。
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编辑人员丨1周前
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柚皮素通过核因子κB预防缺血再灌注性急性肾损伤
编辑人员丨1周前
目的:探究柚皮素(naringenin)对缺血再灌注(ischemia-reperfusion,IR)致急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)的预防作用及其机制。方法:为探究柚皮素的肾脏保护作用,大鼠经柚皮素预处理后,使用经典的双侧肾蒂夹闭法构建IR-AKI大鼠模型,HE染色检测大鼠病理损伤程度,苦味酸法检测肾功能,实时荧光定量PCR法检测炎症相关基因表达水平。进一步通过差异基因分析和蛋白质互作网络筛选IR-AKI过程中的枢纽基因,预测其转录因子并构建调控IR-AKI的转录因子蛋白库,经反向分子对接筛选可与柚皮素结合的转录因子并对其结合模式进行进一步分析以探究柚皮素对IR-AKI的保护机制。最后通过实验方法验证生物信息学结果。结果:与AKI组相比,柚皮素预处理组大鼠肾脏病理明显改善,肾小管损伤评分减少( P<0.01),血肌酐水平及肾损伤分子1(KIM-1)mRNA表达明显下降(均 P<0.05),证实柚皮素对IR-AKI的预防作用。实时荧光定量PCR结果显示,柚皮素预处理可减轻IR-AKI后核因子κB(NF-κB)、肿瘤坏死因子α及白细胞介素1β的表达(均 P<0.05),即柚皮素对IR-AKI的炎症损伤具有抑制作用。对GSE98622数据集进行差异基因分析,得到359个差异基因。反向分子对接结果显示,在IR-AKI中,柚皮素可与NFKBIA、BCL3、NFKB2、RELA等主要富集在NF-κB相关炎症通路中的转录因子结合,且显著升高AKI后 BCL3的表达量( P<0.05),抑制 RELA、 NFKB2表达(均 P<0.05)。 结论:柚皮素可预防由IR-AKI导致的炎性反应,其机制与促进BCL3表达从而抑制NF-κB通路有关。
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编辑人员丨1周前
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超声内镜引导下近端胰管穿刺反向引导支架植入成功1例
编辑人员丨1周前
本文报道1例因4次胰管未能深插管导致ERCP下胰管支架植入失败的患者,改行超声内镜引导下经胃后壁行近端胰管穿刺,导丝选择从副乳头穿入十二指肠降段,随后从口腔拉出导丝,插入切开刀顺导丝经副乳头插入胰管内,最终成功完成胰管支架植入术。本病例比较罕见,操作难度大,成功案例少。
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编辑人员丨1周前
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基层中医药健康管理服务质量影响因素模型构建及政策建议
编辑人员丨1周前
目的:构建基层中医药健康管理服务质量影响因素模型,并提出相应的政策建议。方法:本研究为横断面研究,采用典型抽样和随机抽样相结合的方法,于2022年8—10月抽取浙江省15个社区39名基层中医药健康管理服务知情人,针对服务开展项目、实施效果和影响因素进行访谈,基于扎根理论研究方法对访谈记录进行三级编码,根据编码后结果构建基层中医药健康管理服务质量影响因素模型,并提出相应的政策建议。结果:对39份原始访谈资料进行开放式编码,共获得516个参考点,形成了与主题相关的53个初始概念,并归纳为17个一级范畴。通过主轴编码进一步归纳,提取出“政策环境”“健康素养”“社区定位”“能力建设”“健康偏好”“利益冲突”6个主范畴,通过选择式编码分析6个主范畴之间的逻辑关联,以服务质量影响因素的故事线为基础构建了影响因素模型。该模型的故事线为:首先,政策环境是服务质量的外部保障;其次,作为服务需求侧,居民的健康素养、健康偏好是服务质量的调节因素;最后,社区作为服务供给侧,服务能力是关键影响因素,社区职能和目标定位是内驱因素,内/外部利益冲突则对服务质量起到反向制约作用。结论:现阶段对基层中医药外部政策环境保障力度有限,服务需求侧重视不足,服务供给侧功能也存在缺位,应进一步完善外部政策环境,深化中医药服务领域的供需对接,持续推进基层中医药服务能力建设,平衡中医药相关部门利益,进而提升服务质量。
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编辑人员丨1周前
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金黄色葡萄球菌类肠毒素W的超抗原活性位点预测与克隆表达
编辑人员丨1周前
目的:预测金黄色葡萄球菌类肠毒素W(SElW)与T细胞受体(TCR)的对接和超抗原活性位点,并对SElW进行克隆表达和纯化。方法:利用AlphaFold对SElW蛋白单体进行三维结构预测,借助SAVES在线服务器使用ERRAT、拉氏图和Verify_3D等软件对蛋白模型进行评估。用ZDOCK服务器模拟SElW与TCR的对接构象,并对SElW与其他肠毒素的氨基酸序列进行比对。设计引物扩增 selw基因,将该片段重组于pMD18-T载体中并进行测序;经限制性内切酶 BamHⅠ和 Hind Ⅲ双酶切后将目的片段重组于表达质粒pET-28a(+)中,重组质粒鉴定后用IPTG诱导表达;用亲和层析法对表达于上清中的SElW蛋白进行纯化,用BCA法对蛋白进行定量。 结果:三维结构预测结果显示,SElW蛋白由氨基末端和羧基末端两个结构域组成,其中氨基末端结构域由3个α-螺旋和6个β-片层组成,羧基末端结构域由2个α-螺旋和7个反向平行的β-片层组成。SElW蛋白模型的整体质量因素得分为98.08,其中93.24%的氨基酸Verify_3D得分≥0.2,且无氨基酸位于不允许区。模拟对接预测选择评分最高的对接构象(评分值为1 521.328)作为分析对象,采用PyMOL软件分析SElW与TCR之间形成的19个氢键。结合序列比对和既往研究结果,本研究预测发现了SElW蛋白的5个重要超抗原活性位点,分别是Y18、N19、W55、C88和C98。通过克隆表达和蛋白纯化,获得了高纯度的可溶性重组蛋白SElW。结论:研究预测了SElW蛋白中5个可能的超抗原活性位点,成功构建并表达了SElW蛋白,为进一步探索SElW免疫识别机制奠定了基础。
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编辑人员丨1周前
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荔枝草抗炎质量标志物的研究
编辑人员丨1个月前
目的 阐明荔枝草抗炎质量标志物,并对其含量进行测定,为荔枝草药材质量控制提供参考.方法 采用高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱法(UPLC-Q-TOF-MS/MS)表征荔枝草的主要成分,根据二级质谱裂解碎片信息,并结合文献数据,进行分析鉴定.进一步通过SwissADME平台,从鉴定获得的化学成分中筛选出口服生物利用度(Oral bioavailability,OB)高且符合类药五原则的活性成分;运用SwissTargetPrediction数据库查找和预测荔枝草的成分靶点;通过在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、GeneCards数据库等筛选疾病靶点.采用String11.5 数据库和Cytoscape3.7.2软件构建PPI网络,并筛选核心靶点.利用DAVID6.8进行基因本体(Gene ontology,GO)注释和KEGG通路富集分析,对富集得到的通路进行实验验证,以阐明其作用机制.对关键通路采用反向溯源分析潜在的药效物质基础进行实验验证,并建立高效液相含量测定方法.结果 从荔枝草中共鉴定出36个主要成分,包括黄酮类、萜类化合物等;进一步筛选出活性成分与疾病交集靶点190个;通过网络拓扑筛选获得核心靶点18个;富集分析发现荔枝草抗炎作用主要涉及的通路为NF-κB信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路.对NF-κB信号通路进行反向溯源得到高车前苷、高车前素、木犀草素和异鼠李素4个相关成分,分子对接发现其与PTGS2的活性位点的结合能分别为-9.5、-9.7、-9.4和-9.4 kcal·mol-1,均具有良好的对接活性.根据质量标志物的可测性,确定高车前苷和高车前素可作为荔枝草的抗炎质量标志物.Western blot实验结果表明高车前苷和高车前素能显著降低COX-2和NF-κB p-p65的表达(P<0.05,P<0.01).结论 荔枝草抗炎质量标志物为高车前苷和高车前素,可通过NF-κB通路发挥抗炎作用.
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编辑人员丨1个月前
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基于数据挖掘和网络药理学探讨中医药治疗支气管扩张症组方规律及作用机制
编辑人员丨2024/8/10
目的 运用数据挖掘和网络药理学方法探讨中医药治疗支气管扩张症(支扩)的用药规律及作用机制.方法 检索中国知网、万方、维普、PubMed等数据库中收集运用中药复方治疗支扩的临床研究文献,提取方药信息并构建数据库,分析组方规律;运用网络药理学分析高频药物组合的作用机制并通过分子对接进行反向验证.结果 纳入文献 252 篇,收集处方284 首,涉及中药242 味,使用频率较高的中物有甘草、黄芩、桔梗、桑白皮、薏苡仁、鱼腥草,具有强关联性的药物组合是薏苡仁、冬瓜子;薏苡仁、冬瓜子主要成分有谷甾醇、豆甾醇、扁桃醇、奥马因、亚麻酸等,治疗支扩的靶点 86 个,蛋白激酶 1(AKT1)、白介素-6(IL-6)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)、信号传导及转录激活蛋白 3(STAT3)、表皮生长因子受体(EGFR)为其核心靶点,通过细胞对化学压力、氧化应激、细菌分子的反应和炎症细胞的迁移、黏附等生物过程发挥作用,涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)、核转录因子-κB(NF-κB)等信号通路.分子对接结果表明核心靶点与主要活性成分对接良好,具有稳定的结合能.结论 初步阐明了中药复方治疗支扩多以清肺解毒、化痰消痈为主,从分子水平揭示了核心药物组合薏苡仁-冬瓜子治疗支扩的机制,为临床应用和药物开发提供理论基础.
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编辑人员丨2024/8/10
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基于数据挖掘和网络药理学探讨类风湿关节炎骨破坏的用药规律及机制
编辑人员丨2024/6/22
目的 探究中医药治疗类风湿关节炎骨破坏的规律,预测核心中药组合的药理机制.方法 2022年12月至2023年2月,通过搜索中国知网(CNKI)、万方(Wanfang)、维普(VIP)、PubMed数据库中关于中医药改善类风湿关节炎骨破坏的文献,建立处方数据库,统计出处方中药的性、味、归经和功效类别;通过关联规则分析确定核心药物组合;通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Uniprot、GeneCards、DrugBank等数据库获取核心药物和疾病的靶点信息,并统计出交集靶点;通过对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析、基因本体(GO)功能分析和京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析预测核心中药的作用机制;最后,通过分子对接法反向检验关键靶点和中药成分的关系.结果 纳入78首方剂,涉及137味中药,以补虚药和祛风湿药为主,多性温,味苦、甘,归肝、肾经.关联规则结果表示"甘草-防风-白芍"为具有强关联性的核心药物组合,其主要成分为槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、柚皮素、刺芒柄花素等.PPI分析得到信号转导及转录活化因子3(STAT3)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、转录因子p65(RELA)、蛋白激酶B(AKT)1、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)等为关键靶点.KEGG结果表示白细胞介素-17(IL-17)、肿瘤坏死因子(TNF)等信号通路可能与类风湿关节炎骨破坏相关.分子对接结果表示关键靶点与药物主要成分的对接活性较好,其中山柰酚与TP53具有最低的结合能,对接活性最好.结论 中医药改善类风湿关节炎骨破坏以补益肝肾,祛风除湿为主."甘草-防风-白芍"为核心药物组合,其作用机制以改善炎症、调整免疫、改善骨代谢过程为主.
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编辑人员丨2024/6/22
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基于网络药理学探讨苦参治疗结直肠癌活性成分、作用靶点及潜在作用机制
编辑人员丨2024/3/30
目的 使用网络药理学方法分析抗肿瘤中药苦参活性成分及其治疗结直肠癌的潜在靶点与作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选中药苦参活性成分,并使用PubChem数据库验证所收集活性成分化合物结构,运用SwissTargetPrediction数据库反向分子对接预测苦参活性成分可能作用靶点.采用GeneCards、DisGeNET、TTD、MalaCards数据库预测结直肠癌疾病靶点,通过Cytoscape 3.8软件构建"药物-活性成分-靶点-疾病"关系网络图,利用STRING数据库分析苦参-结直肠癌共同靶蛋白PPI蛋白间相互作用网络,采用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体论(GO)富集分析以及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 共筛选获得中药苦参活性成分45个,通过调控结直肠癌相关作用靶点54个,参与体内信号传导、蛋白质磷酸化、凋亡等生物学过程,并通过调控癌症相关信号通路、PI3K-Akt信号通路、癌症蛋白聚糖信号通路等途径发挥治疗作用.结论 中药苦参能够通过多途径、多靶点协同发挥抗结直肠癌作用.
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编辑人员丨2024/3/30
