目的:观察青海省青藏高原喜马拉雅旱獭分离的布鲁氏菌的多位点可变数目串联重复序列分析（multiple locus variable-number tandem repeat analysis，MLVA）分型，探讨其与既往青海省布鲁氏菌分离菌株间的亲缘关系。方法:2019年3月至2020年10月，采集青海省青藏高原喜马拉雅旱獭全血样本，对虎红平板凝集试验（rose bengal test，RBT）布鲁氏菌抗体阳性样本进行病原体分离培养，采用传统生物学方法和分子生物学方法（BCSP31-PCR和AMOS-PCR方法）进行菌株鉴定。同时，应用MLVA方法对分离菌株进行基因分型，并结合既往青海省不同宿主分离的70株布鲁氏菌的基因型，应用聚类分析方法探讨菌株间的亲缘关系。结果:共采集青藏高原喜马拉雅旱獭全血样本1 466份，从其中64份RBT阳性样本中分离培养出2株布鲁氏菌，分别命名为QH2013054、QH2013062，经传统生物学和分子生物学方法鉴定为羊种布鲁氏菌生物Ⅲ型。MLVA分型结果显示，QH2013054与QH2013062菌株在Bru16位点有差异，为不同的MLVA基因型。聚类分析结果显示，QH2013054菌株与7株菌株具有相同的MLVA基因型，其中6株来自共和县同一个家庭的3名农民和3只羊，1株来自门源回族自治县农民；QH2013062菌株与4株菌株具有相同的MLVA基因型，其中3株来自门源回族自治县的3名农民，1株来自互助土族自治县农民。结论:从青海省青藏高原喜马拉雅旱獭中分离的布鲁氏菌与在本省人、羊中分离的部分布鲁氏菌具有相同的MLVA基因型，推测宿主人、羊、青藏高原喜马拉雅旱獭可能具有共同的传染源。

登革热是由登革病毒引起的、在全球范围广泛传播的急性蚊媒传染病，其传播和流行受病原体、病媒生物、气候和社会环境等多种因素影响。目前，由输入病例引起的本土登革热疫情在我国呈现流行纬度越来越高、流行区域越来越广的趋势。然而，传统的登革热疫情监测预警模型，大多集中于单一因素、单一地区的研究，因此，迫切需要建立多因素监测预警系统，以提高早期预警能力。本文主要对我国登革热的流行特征、流行的影响因素及监测预警模型相关研究进展进行综述，以期为我国登革热疫情的科学防控提供参考。

目的:基于血凝素-神经氨酸酶蛋白(hemagglutinin-neuraminidase，HN)基因分析我国流行人副流感病毒3型(human parainfluenza virus 3, HPIV3)的基因变异规律和进化特征。方法:采用多重荧光PCR方法对2007—2020年5个省市(北京、浙江、安徽、河南、湖南)急性呼吸道感染病例的咽拭子标本进行常见病原体核酸筛查，对HPIV3阳性标本进行HN基因序列测定，与GenBank数据库的国外和我国10个省的HPIV3流行代表株HN基因序列进行比对，应用多种生物信息学方法开展分子进化分析。结果:本研究期间从5个省市共获得49株HPIV3的HN基因序列，核苷酸同源性在96.6%~100%之间，其中48株为C3基因亚型，1株为C5基因亚型。系统进化分析显示，我国12个省市在2003—2020年间存在C1、C3和C5基因亚型的毒株共流行，毒株间核苷酸和氨基酸同源性分别为95.4%~99.8%和97.9%~100%，其中C3是我国的优势流行基因亚型，分属于C3a、C3b、C3c、C3e和C3f进化分支，以C3f的传播范围和流行时间最为广泛。对C3基因亚型的进化分析显示，其最近共同祖先形成时间(tMRCA)可追溯到1990年，有效群体规模在2002—2010年间逐渐扩张而后趋于平稳；C3各进化分支HPIV3的HN基因进化速率在3.69×10 -4~5.82×10 -4替换/位点/年之间；C3基因亚型毒株HN蛋白共享N308、N351、N485和N523潜在N-糖基化位点，选择压力以负向选择为主。 结论:C3基因亚型是我国的本土优势HPIV3流行型别，形成了广泛传播和持续流行态势，并在流行过程中形成多个进化分支共同循环。

目的 为了解不同来源的人类条件病原体的特征和耐药机制,预防环境病原体和医院病原体交叉感染,对桑树中分离的克雷伯菌进行耐药性、毒力基因、分子分型特点的探究.方法 从广东和广西两地采集桑树和桑树根际土壤样本,其中共分离得到12株克雷伯菌,对其采用纸片扩散法(K-B法)检测菌株耐药性表征;采用PCR技术对6类9个抗生素相关耐药基因和毒力基因进行检测;采用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术进行遗传分析.结果 12株桑源克雷伯菌检测到blaSHV、tet(D)、tet(A)和aadA1 4种耐药基因,其中携带氨基糖苷类相关基因aadA1的有5株(41.67％);12株桑源克雷伯菌均对氨基糖苷类抗生素红霉素和链霉素表现出耐药,对6种以上抗生素耐药的菌株有6株(50％),对7种抗生素耐药的菌株有2株(16.67％);8株(66.67％)携带脂多糖相关的wabG毒力基因;MLST分析显示12株桑源克雷伯菌划分为3大类,包括产酸克雷伯菌复合体(Klebsiella oxytoca species complex,KoSC)、肺炎克雷伯菌复合体(K.pneumoniae species complex,KpSC)以及产气克雷伯菌(K.aerogenes);可分成7个序列型(sequence typing,ST),ST260为优势序列型,有5株(41.67％).结论 12株桑源克雷伯菌对氨基糖苷类抗生素耐药情况严峻,氨基糖苷类aadA1耐药基因检出率最高;ST260是主要的序列型,菌株之间存在遗传多样性,为环境中桑树来源的克雷伯菌病原体致病机制提供理论依据.

腹膜透析相关性腹膜炎(peritoneal dialysis-associated peritonitis, PDAP)是腹膜透析(peritoneal dialysis, PD)最常见的并发症，也是导致PD失败的主要原因之一。常见的病原体包括凝固酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌，布鲁氏菌引起的PDAP相对罕见，多在土耳其报道，且基本为成年患者，我国尚无青少年布鲁氏菌相关PDAP报道。布鲁氏菌病是世界范围内流行的一种人畜共患传染病[1] ，羊种布鲁氏菌是我国布鲁氏菌病的主要病原菌[2] ；与病畜、受染畜牧产品接触较多的牧民、牧医、屠宰户和皮毛加工等人员的感染率高于一般人群。本文报告一例布鲁氏菌引起的青少年PDAP，以提高对此病的认识。

植物-土壤反馈实验是研究植物与土壤生物群落互作的一种重要手段.植物-土壤反馈是指植物生长改变了土壤物理结构、化学性质和生物群落组成,这种改变反过来影响植物个体生长、种群消长和群落动态的过程.植物-土壤反馈研究可为生物多样性的维持、农业的可持续发展、退化生态系统的恢复等提供重要的理论依据.该文首先介绍了植物-土壤反馈的概念和研究方法.其次,综述了植物-土壤反馈的研究进展,即植物-土壤反馈在植物物种多样性的维持、植物群落演替、植物入侵与物种迁移、陆地生态系统对气候变化的响应、植物地上-地下多营养级生物互作、退化生态系统恢复、不同农业种植制度下的作物表现等方面具有的重要意义.最后,基于上述研究进展,提出了该领域的未来发展趋势,包括:(1)研究对象:从单一物种扩展到群落水平;(2)研究地点:从温室转移到自然生态系统;(3)实际应用:从理论研究到生态实践.

目的 了解我国内蒙古自治区(内蒙古)森林革蜱感染立克次体、无形体及埃立克体等病原体情况,并研究其遗传多样性.方法 在内蒙古乌兰察布市四子王旗、呼和浩特市土默特左旗家畜体表采集寄生婢成蜱76只,经形态学和分子生物学鉴定后,用针对16S rRNA基因和柠檬酸合成酶基因(gltA)保守区域的引物同时检测立克次体,用针对16SrRNA基因的属特异性引物检测埃立克体、无形体.对检出的阳性样本,使用巢式PCR扩增获得gltA和热休克蛋白基因(groEL).用PhyML 3.0软件进行最大似然法进化树构建.结果 采获蜱经鉴定均为森林革婢.从上述采集蜱中检出立克次体阳性8份,其中四子王旗6份(6/35,17.14％),土默特左旗2份(2/41,4.88％),测序结果显示均为劳氏立克次体.对3个基因序列的进化分析,上述菌株分成2个不同的分支,当地流行的劳氏立克次体有一定遗传多样性.未检出埃立克体和无形体.结论 内蒙古的革蜱中存在劳氏立克次体的流行,且存在一定遗传多样性.劳氏立克次体为人类病原体,在内蒙古局部地区较高的阳性率提示可能存在感染人的风险.

为了解东北林区啮齿动物蜱媒传染病感染状况,采用间接免疫荧光法对吉林省集安、辽宁省宽甸林区捕获的野鼠进行7种蜱媒病原体IgG抗体检测,检测鼠血清75份,斑点热立克次体、粒细胞无形体、查菲埃立克体、伯氏疏螺旋体、蜱媒脑炎病毒、新布尼亚病毒、土拉弗菌抗体阳性率分别为13.33％、8.00％、14.67％、4.00％、1.33％、6.67％、1.33％,统计学处理差异非常显著(χ2=19.83,P=0.003).不同鼠种对7种蜱媒病原体抗体检出阳性率各不相同,但差异无统计学意义.75份野鼠标本中,复合感染率为8％.调查地区野鼠中7种蜱媒病原体感染比较普遍,以斑点热立克次体和查菲埃立克体阳性率为高.

人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)分为 HIV-1和 HIV-2,是引起艾滋病的病原体,艾滋病流行的主要病原体是 HIV-1,在全球范围内传播广泛[1].不含结核分枝杆菌(mycobacterium tuberculosis,MTB)复合物且不引起汉森病的分枝杆菌被称为非结核分枝杆菌(non-tuberculosis mycobacteria,NTM).NTM 可机会性引起动物或人类的疾病,越来越多地被认为是人类的病原体[2].目前,至少有5 5种 NTM 已被鉴定,NTM在环境中普遍存在,在炎热的气候中比在寒冷的气候中更普遍,并且通常与土壤和供水有关.大约一半的物种能够引起人类和动物感染,尽管这些感染通常是机会性的,并且经常影响具有一定程度的免疫抑制的人[3].分枝杆菌属种类超过150种.NTM是机会性感染的原因,经常出现与结核病相似的临床特征[4],严重阻碍了 MTB 和 NTM引起疾病的诊断和治疗[2].重要的是,大多数NTM(堪萨斯分枝杆菌除外)本身对标准抗结核药物存在固有的抗性或仅部分易感.因此,NTM 感染的诊断对于选择有效的治疗计划至关重要[2].NTM是新兴的肺及肺外疾病的重要病原体,识别NTM引起的疾病并随后治疗这种疾病变得越来越重要[5].由于 NTM肺部疾病在上升,而 NTM 又是普遍存在的生物,故仅仅依靠肺部样本证明NTM肺部疾病的存在,证据并不充分.因此,诊断还应结合临床表现、影像学特征、实验室检查等[6].近年来,NTM肺病在全球的患病率呈快速增长趋势,且HIV/获得性免疫缺陷综合征 (acquired immunodeficiency syndrome,AIDS)患者的增多更加剧了 NTM 肺病的流行,临床常见的是 HIV/AIDS合并 NTM肺病.因 NTM肺病临床症状与结核病相似,故易误诊为结核病,且 HIV/AIDS 合并NTM肺病更加速了死亡,提高了病死率.因此,针对 HIV/AIDS合并 NTN 肺病患者的早期诊断、治疗非常重要.现就近几年关于 HIV/AIDS 合并NTM肺病临床诊疗方面的研究进展综述如下.

目的 对贵州省织金县一起疑似皮肤炭疽疫情来源标本进行病原体分离鉴定和基因分型,了解菌株的分子流行病学特征,为疫情判定提供病原学依据.方法 对患者皮肤渗出液、血液及病死牛刨剐地土壤进行炭疽芽胞杆菌分离鉴定,采用Real-time PCR检测炭疽芽胞杆菌PagA、Cap及rpoB基因,进一步采用基于15个串联重复序列(Variablenumber tandem repeat,VNTR)的多位点可变数量串联重复序列分析(Multiple locus VNTRs analysis,MLVA-15)和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)技术对炭疽芽胞杆菌进行分子分型.结果 从本次疫情中患者皮肤渗出液和血液各分离出1株疑似炭疽菌株,传统方法将2株分离菌株鉴定为炭疽芽胞杆菌,土壤标本未分离到炭疽菌.2株菌PagA、Cap和rpoB阳性,其15个VNTR位点的重复次数谱型均为9-20-12-53-16-2-8-8-8-4-4-4-4-10-4,SNP结果显示2株菌同属A.Br.001/002簇.结论 从本次疫情患者皮肤渗出液和血液检出具有致病基因的炭疽芽胞杆菌,2株菌的MLVA-15和SNP型别特征一致,提示该起疫情为感染炭疽芽胞杆菌所致.