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20例 NPHP1基因缺陷肾单位消耗病患者的临床和基因突变特点
编辑人员丨3天前
目的:探讨 1型肾单位消耗病(nephronophthisis,NPH)的临床表型及 NPHP1基因突变特点。 方法:本研究为病例系列分析,回顾性收集初步诊断1型NPH患者及其父母的外周血标本、临床、影像和病理资料。通过二代测序或微卫星标记检测 NPHP1基因变异。 结果:(1)本研究中,16个家系20例患者确诊为1型NPH。起病中位年龄为 9.5岁(3.0~21.0岁),发病至确诊的平均时间为2.1年(0.1~6.5年)。首诊表现方面,肾功能不全7例(35.0%),多饮、多尿或夜尿增多8例(40.0%),贫血4例(20.0%),生长迟缓7例(35.0%),其中1例以生长迟缓及胸廓畸形为首诊表现。肾脏表现方面,10例(50.0%)尿常规检查尿蛋白阴性,10例(50.0%)有少量蛋白尿,均无血尿;首诊时18例(90.0%)患者有不同程度的肾功能损害,进展至慢性肾脏病5期的中位年龄为 12岁(9.1~16.5岁)。17例接受尿蛋白成分分析患者中,15例存在α1微球蛋白和β2微球蛋白升高,包括6例尿常规检查尿蛋白阴性患者。11例(55.0%)患者双肾体积正常,9例(45.0%)肾脏体积缩小,其中7例双肾体积缩小,2例单个肾脏体积缩小。B超及磁共振水成像检查显示,12例(60.0%)患者皮髓质交接处和/或肾髓质处有单发或多发肾囊肿,8例(40.0%)未见囊肿。9例患者完成了肾活检,均可见肾小管萎缩及管腔扩张、肾小管基底膜增厚或分层、间质纤维化及炎性细胞浸润。5例存在肾外表现,如Senior-Loken综合征、弱视或屈光不正、Cogan综合征、肝囊肿等。16个家系20例确诊患者中, NPHP1外显子(exon 1~20)纯合缺失发生在8个家系10例患者,杂合缺失伴点突变发生在5个家系7例患者,复合杂合点突变发生在3个家系3例患者,不同基因突变类型患者的临床表型(性别、肾脏体积、囊肿形成、尿蛋白)的差异均无统计学意义(均 P>0.05)。16例进行了基因二代测序(靶向外显子组测序和全外显子组测序),其中8例合并其他纤毛病致病基因变异;而与无合并其他纤毛病致病基因变异的8例患者相比,合并其他纤毛病致病基因变异的8例患者在性别构成、发病年龄、就诊前病程、肾脏表型(包括肾脏大小改变及囊肿形成、尿蛋白)、进展至慢性肾脏病5期的年龄无明显改变(均 P>0.05)。(2)本研究另4个家系4例患者仅有 NPHP1单杂合突变,且无其他囊肿性肾病和/或纤毛病致病基因变异可以解释,经临床诊断为NPH。(3)本研究共发现点突变12个,其中新发现8个(c.728+1G>A,c.1630delA,c.1122+1G>T,c.2081A>G,c.1333C>G,c.625-2A>T,c.1374G>T,c.968C>T)。 结论:本系列患者 NPHP1基因突变类型与国外报道存在较大差异,新突变比例较高,遗传背景差异较大。不同突变类型患者的临床表型无明显差异。
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编辑人员丨3天前
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肿瘤免疫治疗疗效预测标志物的研究进展
编辑人员丨3天前
免疫检查点抑制剂成为近年来肿瘤治疗的热点,越来越多的肿瘤患者从免疫治疗中获益。由于免疫治疗费用较高,未检测人群免疫治疗获益率仅为20%。因此,精准地选择预测性生物标志物对于肿瘤患者个体化免疫治疗至关重要。反映肿瘤免疫微环境和肿瘤细胞内在特征的生物标志物,如程序性死亡蛋白1(PD-1)及其配体PD-L1、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性等,均已被证实与抗PD-1/PD-L1治疗效果相关。同时,基于组织和血清的标志物层出不穷,如何真正实现精确的肿瘤免疫治疗仍有待进一步临床研究。
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编辑人员丨3天前
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免疫检查点抑制剂治疗转移性胃癌疗效预测因子
编辑人员丨3天前
近年来,免疫治疗被更加频繁地用于化疗后进展的转移性胃癌,其中使用最多的是免疫检查点抑制剂(ICI)。然而ICI在不同患者中的疗效差别较大,所以越来越多地开展了关于预测ICI疗效的生物标志物的研究。微卫星不稳定及EB病毒亚型是目前预测ICI治疗反应率相对确切的生物标志物;程序性死亡配体1及肿瘤突变负荷的预测作用仍存在争议;肿瘤浸润淋巴细胞、肿瘤相关巨噬细胞、纤维蛋白样蛋白1、选择性启动子以及其他一些预测因子也正在研究中。
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编辑人员丨3天前
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神经内分泌肿瘤免疫治疗研究进展
编辑人员丨3天前
神经内分泌肿瘤(NEN)是少见的异质性肿瘤,不同病理类型、分化程度、分级和分期的NEN治疗和转归差异较大。晚期NEN可供选择的药物较少,目前尚缺乏有效治疗手段。免疫治疗是近几年肿瘤治疗领域最重要的突破,免疫检查点抑制剂在多个实体瘤中显示出较好疗效。免疫治疗在NEN中的探索研究结果显示,免疫单药治疗NEN的疗效有限,对于部分选择性人群可以考虑应用。与免疫治疗效果相关的生物标记物包括PD-L1表达、肿瘤突变负荷高(TMB-H)和微卫星高度不稳定/错配修复缺陷(MSI-H/dMMR)等。抗CTLA-4联合PD-1/PD-L1抑制剂、免疫联合靶向治疗或细胞毒药物在NEN患者中取得了一定的疗效,值得进一步探讨其获益人群。
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编辑人员丨3天前
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淋巴脉管间隙浸润在不同分子分型子宫内膜癌中的临床意义
编辑人员丨3天前
目的:分析不同癌症基因组图谱(TCGA)分子分型子宫内膜癌(EC)中淋巴脉管间隙浸润(LVSI)的情况,并评估LVSI对不同分子分型EC患者预后的影响。方法:回顾性分析2016年1月—2022年6月在北京大学人民医院接受手术治疗的258例EC患者的临床病理资料。其中,TCGA分子分型为POLE超突变型14例,高度微卫星不稳定性(MSI-H)型43例,低拷贝数(CNL)型155例,高拷贝数(CNH)型46例;LVSI阳性54例,LVSI阴性203例,不详(术后失访,为CNL型)1例。结果:(1)LVSI阳性率:不同分子分型EC患者的LVSI阳性率依次为CNH型(32.6%,15/46)、MSI-H型(27.9%,12/43)、CNL型(16.9%,26/154)、POLE超突变型(1/14),4种分子分型患者的LVSI阳性率比较,差异有统计学意义( χ2=7.79, P=0.044)。(2)临床病理资料:除POLE超突变型外,其余3种分子分型EC中LVSI阳性患者的手术病理分期、深肌层浸润比例均显著高于LVSI阴性者( P均<0.05);在MSI-H型和CNL型EC中,LVSI阳性患者的病理分级、淋巴结转移率及细胞增殖相关核抗原(Ki-67)指数均显著高于LVSI阴性者( P均<0.05);在CNL型EC中,LVSI状态还与患者年龄、病理类型及孕激素受体(PR)表达状态均显著有关( P均<0.05)。(3)复发率:257例EC患者(1例失访)中,随访期内复发25例,复发率为9.7%(25/257);其中,LVSI阳性患者的复发率为22.2%(12/54),显著高于LVSI阴性者(6.4%,13/203; χ2=12.15, P<0.001)。其中,14例POLE超突变型EC患者均无复发;CNL型EC患者中,LVSI阳性患者的复发率为19.2%(5/26),显著高于LVSI阴性者(5.5%,7/128; χ2=3.94, P=0.047);而在MSI-H型[LVSI阳性、阴性患者的复发率分别为2/12、9.7%(3/31)]和CNH型[LVSI阳性、阴性患者的复发率分别为5/15、9.7%(3/31)]EC患者中均未发现这种差异( P均>0.05)。log-rank检验显示,CNL型和CNH型EC中LVSI阳性患者的3年无复发生存(RFS)率(分别为80.8%、66.7%)均显著低于LVSI阴性者(分别为94.5%、90.3%; P均<0.05)。(4)预后影响因素:单因素分析显示,在MSI-H型EC患者中,淋巴结转移( HR=6.93,95% CI为1.15~41.65; P=0.034)显著影响患者的3年RFS率;在CNL型EC患者中,手术病理分期、病理分级、淋巴结转移、ER表达、PR表达、p53表达、Ki-67表达、手术途径、术后辅助化疗均显著影响患者的3年RFS率( P均<0.05)。多因素分析显示,PR表达( HR=0.04,95% CI为0.01~0.14; P<0.001)为影响CNL型EC患者3年RFS率的独立危险因素。 结论:LVSI在CNH型中阳性率最高,其次为MSI-H型、CNL型,在POLE超突变型中阳性率最低。LVSI与CNL型EC患者的不良预后明显相关,与CNH型EC患者的预后可能相关。但在各分子分型EC患者中,LVSI均不是影响其复发的独立危险因素。
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编辑人员丨3天前
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TCGA分子分型在子宫内膜癌中的应用及其临床意义
编辑人员丨3天前
目的:探讨癌症基因组图谱(TCGA)分子分型在子宫内膜癌(EC)中的应用及其临床意义。方法:收集2018年12月至2021年3月于北京大学人民医院行手术治疗且采用高通量测序技术进行TCGA分子分型的EC患者共66例,EC的TCGA分子分型分为4种,DNA聚合酶ε(POLE)超突变型、高度微卫星不稳定性(MSI-H)型、低拷贝型、高拷贝型。回顾性分析4种TCGA分子分型患者的临床病理特征、免疫相关分子学特征以及预后情况。结果:(1)临床病理特征:66例EC患者的中位年龄为56岁(范围:24~78岁)。其中,POLE超突变型3例(5%),MSI-H型11例(17%,其中Lynch综合征2例),低拷贝型42例(64%),高拷贝型10例(15%)。4种TCGA分子分型患者的合并其他器官恶性肿瘤情况、肿瘤家族史、手术方式、分期、肌层浸润深度、淋巴脉管间隙浸润(LVSI)、病理类型分别比较,差异均有统计学意义( P<0.05),其中高拷贝型患者晚期(Ⅲ~Ⅳ期)、深肌层浸润、LVSI阳性所占比例显著升高;而4种TCGA分子分型患者的年龄、绝经状态、体质指数、代谢综合征相关合并症、术前血清CA 125及人附睾蛋白4水平、肿瘤最大径、病理分级(仅指子宫内膜样癌)、淋巴结转移情况分别比较,差异均无统计学意义( P>0.05)。(2)免疫相关分子学特征:66例EC患者中,27例患者行细胞程序性死亡配体1(PD-L1)蛋白免疫组化法检测,28例患者行肿瘤突变负荷(TMB)检测,POLE超突变型及MSI-H型患者的PD-L1阳性表达率、TMB高表达率均显著高于低拷贝型、高拷贝型患者( P<0.05)。(3)预后分析:66例EC患者的中位随访时间为10个月(范围:0~28个月),随访期内死亡2例(低拷贝型1例、高拷贝型1例),盆腔复发和远处转移3例(低拷贝型1例、高拷贝型2例)。POLE超突变型、MSI-H型、低拷贝型、高拷贝型患者的无进展生存率(PFS)分别为100%、100%、98%、80%,4者比较,差异有统计学意义( P=0.034);总生存率(OS)分别为100%、100%、98%、90%,4者比较,差异无统计学意义( P=0.361)。其中,POLE突变型、MSI-H型患者的PFS、OS较高,高拷贝型患者最低。 结论:EC的TCGA分子分型在临床应用中具有可行性及应用价值,对于EC患者的预后有一定的预测作用,可为患者的个体化诊断和治疗提供新策略。
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编辑人员丨3天前
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海南金鲳人工养殖群体遗传多样性与遗传结构的微卫星分析
编辑人员丨3天前
为评估海南省金鲳(Trachinotus blochii)人工养殖群体的种质资源背景及群体遗传结构,研究利用16对微卫星标记对采集自海南东方基地(晨海群体,CH)、陵水基地(青利群体,QL)、三亚基地(蓝粮群体,LL)共3家繁育公司的210尾金鲳进行了群体遗传学分析.结果显示,16个微卫星标记在3个群体中共检测到251个等位基因(Na),平均观测杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)及平均多态信息含量(PIC)分别为0.630、0.714及0.679,各位点的基因流(Nm)平均为5.217.其中QL群体具有较高的遗传多态性.群体间的Nei's遗传分化系数(Fst)介于0.017-0.038,AMOVA结果显示个体间的遗传变异占总变异的87%.STRUCTURE遗传聚类分析将3个群体分为两个亚群(K=2),QL与LL构成遗传亚群I,而CH构成遗传亚群II.UPGMA聚类分析结果与STRUC-TURE基本一致,并进一步揭示了CH群体与QL、LL群体之间在遗传结构上的差异.综上,3个不同来源的海南省金鲳养殖群体尚保持较高的遗传多样性,且存在一定的遗传结构差异.研究结果可为金鲳种质资源的评价与利用提供一定的数据支撑.
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编辑人员丨3天前
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团头鲂选育家系亲子鉴定方法的建立
编辑人员丨1个月前
研究旨在建立一套准确、经济的团头鲂(Megalobrama amblycephala)家系鉴定体系,以期为团头鲂的遗传参数评估及基因组和分子标记育种奠定基础.精选8个高多态性的微卫星标记对二段法筛选后的228尾耐低氧快生长团头鲂"浦江2号"子代进行亲子鉴定分析,利用CERVUS软件分析实验结果.等位基因频率分析结果显示8个微卫星标记的平均等位基因数(Na)为8个,平均观测杂合度(Ho)为0.813,平均期望杂合度(He)为0.775,平均多态信息含量(PIC)为0.743.亲子鉴定结果显示双亲性别已知时8个微卫星标记的累积排除概率为0.9999,说明筛选出的8个微卫星标记适用于团头鲂家系的亲子鉴定分析.当使用筛选的8个微卫星标记进行亲子鉴定时,228尾团头鲂子代中有221尾子代能找到其父母本,实际鉴定率为96.93%,这与实际记录的系谱信息一致.研究成功地为筛选后的耐低氧团头鲂个体找到父母本并划分家系,为进一步开展遗传参数的评估工作奠定了基础.
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编辑人员丨1个月前
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2022年浙江省嘉兴市湖北钉螺的群体遗传学分析
编辑人员丨1个月前
[目的]基于微卫星遗传标记法对浙江省嘉兴市不同有螺环境的湖北钉螺进行基因分型,开展群体遗传学分析,探讨钉螺存在或扩散的原因及其影响因素,为有效监测和控制钉螺提供依据.[方法]选取嘉兴市2022年重点有螺环境的平湖市姚浜(YB)村和三兴(SX)村,以及秀洲区的运河(YH)农场3个种群共90只钉螺样本,采用9个微卫星位点对钉螺进行基因分型和群体遗传学分析.[结果]共观察到84个等位基因,YB、SX和YH种群平均等位基因数分别为7.889、5.667、3.778;有效等位基因数分别为4.807、3.329和2.294;近交系数分别为0.400、0.377、0.493.在无限等位基因模型下,SX和YH近期可能出现瓶颈效应.NeEstimator和LDNe软件计算的有效种群均>31.9.分子方差分析显示3个种群钉螺的变异主要存在于个体间,占总变异的41.44%,群体间遗传分化指数为0.286,表示遗传分化程度很大.主坐标分析与系统发生树结果一致,3个种群分为2个谱系,YB和SX为1个谱系,YH分属另一个独立谱系.种群历史及动态分析显示3个种群基因流不充分.溯源分析表示可能为YH首先从SX分化,YB由SX和YH接触融合形成.[结论]嘉兴市钉螺种群遗传多样性总体较低,钉螺种群较不稳定,遗传分化程度很大,各种群之间基因流不充分.
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编辑人员丨1个月前
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11例SMARCA4(BRG1)缺失性癌的临床病理分析
编辑人员丨2024/7/20
目的 探讨SMARCA4(BRG1)缺失性癌患者的临床病理特征、免疫表型及诊治要点.方法 回顾性分析11例SMARCA4(BRG1)缺失性癌患者的临床资料,总结其HE染色后的形态及免疫组织化学特征,并结合文献进行分析.结果 11例患者中男性8例,女性3例;中位年龄60岁.8例行根治性手术切除,3例行传统化疗联合靶向及免疫治疗.镜下肿瘤细胞胞质丰富、红染,呈上皮样、横纹肌样或梭形,具明显的嗜酸性核仁,核分裂象易见(>5/10 HPF),肿瘤组织内见多灶状坏死,脉管内见大量癌栓,可伴间质黏液样变性.11例肿瘤细胞SMARCA4(BRG1)表达缺失,同时表达上皮源性CK和间叶源性Vim标记,SMARCB1(INI1)表达保留,p53突变型,肿瘤细胞呈高增殖活性(Ki-67>60%),突触素Syn呈中等强度阳性.3例为错配修复蛋白缺陷,分别表现为MLH1/PMS2、PMS2、MSH6表达缺失,其中1例经Sanger测序法检测证实为高度微卫星不稳定型.结论 SMARCA4(BRG1)缺失性癌发病率低,易与其他肿瘤混淆,术前诊断困难,需依靠免疫组织化学明确诊断.
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编辑人员丨2024/7/20
