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二甲双胍对2型糖尿病患者miRNA表达的影响及作用靶点预测研究
编辑人员丨6天前
目的:研究二甲双胍对2型糖尿病患者微小RNA(miRNA)表达水平的影响,并利用网络药理学进行分析,预测其治疗作用潜在的靶点及途径。方法:筛选本院入院治疗的初发2型糖尿病患者15例,住院期间及出院后均规律服用盐酸二甲双胍片。患者服药6个月后,对比其用药前后血清基质金属蛋白酶(MMP)-9、转化生长因子(TGF)-β1及心肌纤维化相关miRNA的表达水平。对呈现统计学差异表达的miRNA进行基因本体论(GO)和KEGG通路富集分析,并构建差异表达miRNA对应靶基因信使RNA(mRNA)网络图。结果:患者用药后,血清MMP-9水平较用药前明显下降( P<0.05)。二甲双胍可显著下调患者血清人类微小RNA(hsa-miR) 29a-3p、hsa-miR133a-5p、hsa-miR21-5p、hsa-miR30c-5p、hsa-miR1-3p表达水平( P<0.05或 P<0.01)。GO和KEGG分析结果显示,差异表达miRNA主要集中在内质网腔、突触、基膜等细胞组分中,通过胶原分解代谢过程、短时神经元突触可塑性调节、轴突延伸等生物过程来发挥Rho GTP酶(Rho GTPase)结合、参与细胞外基质结构成分等分子功能;其主要富集于糖尿病并发症晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、Wnt信号通路等多种细胞信号转导通路。miRNA-mRNA网络分析结果显示,与差异表达miRNA对应mRNA共230个。 结论:二甲双胍可通过下调相关miRNA表达,参与相关细胞信号通路转导,调控染色质、核酸结合及酶活性过程而发挥其治疗2型糖尿病的作用。
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编辑人员丨6天前
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微小RNA-182靶向调控特定富含AT碱基DNA序列结合蛋白2基因对结肠癌细胞增殖和迁移的影响
编辑人员丨6天前
目的:观察微小RNA(miRNA,miR)-182通过靶向特定富含AT碱基DNA序列结合蛋白2(SATB2)基因对结直肠癌细胞增殖迁移的作用,探讨其对SATB2/烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶4(nox4)通路的调节机制。方法:对数期生长人结肠癌细胞(HT-29)细胞,采用脂质体转染法将si-miR-182、Control-si转至HT-29细胞,分别设为Si-miR-182组、N-miR-182组,另取不做任何处理细胞为对照组。测定3组细胞中miR-182基因表达、增殖和迁移、SATB2、nox4、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)mRNA和蛋白表达。重复计量资料比较采用重复测量方差分析,两两样本比较采用LSD- t检验。 结果:Si-miR-182组miR-182基因相对表达量(0.35±0.05)低于对照组(1.24±0.26)和N-miR-182组(1.20±0.25),差异均有统计学意义( t=7.517、7.455, P<0.05);Si-miR-182组培养24、48、72 h MTT试验吸光度( A)值均低于对照组和N-miR-182组,差异均有统计学意义(24 h: t=2.667、2.664;48 h: t=4.559、4.524;72 h: t=7.257、6.981; P<0.05);与培养24 h比较,3组培养48、72 h MTT试验 A值均升高(48 h: t=5.507、5.092、3.741;72 h: t=11.330、10.637、9.229; P<0.05),且72 h MTT试验 A值高于48 h,差异均有统计学意义( t=7.411、6.941、5.214, P<0.05)。Si-miR-182组细胞迁移率[(53.90±3.19)%]低于对照组[(81.66±5.92)%]和N-miR-182组[(80.35±5.40)%],差异均有统计学意义( t=9.231、9.430, P<0.05);Si-miR-182组细胞SATB2、E-cadherin mRNA和蛋白相对表达量高于对照组和N-miR-182组(SATB2: t=10.930、11.158;E-cadherin: t=9.288、9.369; P<0.05),nox4、Vimentin mRNA和蛋白相对表达量低于对照组和N-miR-182组,差异均有统计学意义(nox4: t=8.955、7.590;Vimentin: t=6.543、6.644; P<0.05)。 结论:沉默miR-182基因可显著抑制结直肠癌细胞增殖及迁移能力,可能通过激活SATB2、E-cadherin的表达、抑制nox4、Vimentin的表达、参与SATB2/nox4通路共同调控。
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编辑人员丨6天前
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微小RNA-216a、324-5p、29a在急性胰腺炎患者外周血中的表达及其与并发肝损伤的相关性
编辑人员丨6天前
目的:探讨微小RNA(miR)-216a、miR-324-5p、miR-29a在急性胰腺炎(AP)患者外周血中表达的意义及与胰腺炎并发肝损伤的相关性。方法:采用病例对照研究设计,选取2017年6月至2019年5月商丘市第一人民医院收治的130例AP患者,分为轻症AP组(MAP组)和中重症AP组(SAP组),肝损伤组54例(MAP 20例、SAP 34例)与非肝损伤组76例(均为MAP);另选取40名健康志愿者为健康组。比较MAP组、SAP组、健康组以及肝损伤组与非肝损伤组外周血miR-216a、miR-324-5p、miR-29a表达水平,并分析其与临床指标相关性;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析外周血各miRNA水平对AP并发肝损伤的预测价值。结果:MAP组、SAP组外周血miR-216a、miR-29a水平均高于健康组,miR-324-5p水平低于健康组(均 P<0.01);SAP组外周血miR-216a、miR-29a水平均高于MAP组,miR-324-5p水平低于健康组(均 P<0.01)。Balthazar CT评分、急性生理与慢性健康状况评分(APACHEⅡ)评分、C反应蛋白水平、住院时间与外周血miR-216a、miR-29a水平均呈正相关(均 P<0.05),与miR-324-5p水平呈负相关(均 P<0.05)。肝损伤组外周血miR-216a、miR-29a水平高于非肝损伤组,且在肝损伤组中SAP患者高于MAP患者(均 P<0.05);肝损伤组外周血miR-324-5p水平低于非肝损伤组,且肝损伤组中SAP患者低于MAP患者(均 P<0.05)。外周血miR-216a、miR-324-5p、miR-29a预测AP并发肝损伤的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.694、0.750、0.814。 结论:miR-216a、miR-29a水平在AP患者外周血中表达增高,miR-324-5p水平降低,与Balthazar CT评分、APACHEⅡ评分、C反应蛋白水平、住院时间关系密切,且对AP并发肝损伤有一定预测价值,其中miR-29a预测价值最高。
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编辑人员丨6天前
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微小RNA-29a通过第10号染色体上缺失与张力蛋白同源的磷酸酯酶基因-磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B/雷帕霉素靶蛋白信号通路调节人神经母细胞瘤细胞的增殖和轴突生长
编辑人员丨6天前
目的:通过体外培养人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)观察微小RNA(miRNA)-29a与第10号染色体上缺失与张力蛋白同源的磷酸酯酶基因(PTEN)的调节对神经细胞增殖和轴突生长的作用。方法:通过上海中科院细胞库购买的SH-SY5Y细胞经过体外培养(4×10 4/ml)分别转染miRNA-29a的激动剂和抑制剂(40 nmol/L),构建miRNA-29a不同表达水平的细胞。通过实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)检测细胞转染效果(转染24 h)和人第10号染色体缺失的磷酸酶及张力蛋白同源基因(PTEN)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Akt)和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)基因表达水平(转染48 h)。转染72 h后通过蛋白免疫印迹(Western blot)检测不同细胞中PTEN、Akt和mTOR蛋白的表达和磷酸化水平,通过神经形态学和二苯基四氮唑溴盐比色法(MTT)检测细胞的增殖和轴突长度。通过单因素方差分析及LSD- t法检验比较各组数据。 结果:转染miRNA-29a激动剂组的miRNA-29a表达水平明显高于miRNA-29a抑制组(9.03±0.12比0.31±0.03, t=241.70, P<0.05),而激动组PTEN基因和蛋白的表达水平明显低于抑制组(0.31±0.02比3.26±0.23、0.30±0.06比3.36±0.15, t=45.09、58.79, P<0.05)。miRNA-29a激动组中Akt、mTOR蛋白的磷酸化水平明显高于抑制组(3.26±0.13比0.42±0.03、2.57±0.13比0.31±0.04, t=71.45、51.55, P<0.05)。在miRNA-29a激动组中,SH-SY5Y细胞增殖活性和轴突长度明显高于miRNA-29a抑制组[0.86±0.07比0.44±0.03、(157.56±11.13) μm比(43.48±4.92) μm, t=13.89、31.11, P<0.05]。 结论:miRNA-29a可以通过干预PTEN表达,调节磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/Akt/mTOR信号通路中Akt和mTOR蛋白的磷酸化水平,促进SH-SY5Y细胞增殖和轴突生长。
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编辑人员丨6天前
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DNA甲基转移酶3A在胰腺癌组织的表达及其调控因子筛选
编辑人员丨6天前
目的:探讨胰腺癌组织和癌旁组织中DNA甲基转移酶3A的表达水平,并采用转录组学筛选调控DNA甲基转移酶3A的微小RNA(miRNA,miR)家族。方法:选取2021年6月到2023年6月新乡医学院第一附属医院住院部手术切除的胰腺癌组织和对应癌旁组织作为研究对象。采用蛋白质免疫印迹分析DNA甲基转移酶3A的表达水平。随机选取6例癌旁组织和胰腺癌组织作为研究对象,采用转录组学分析癌旁组织和胰腺癌组织中差异表达的(microRNA,miRNA),并采用生物信息学和荧光素酶报告基因分析差异表达miRNA对DNA甲基转移酶3A的调控关系。结果:癌旁组织中DNA甲基转移酶3A表达水平(0.77±0.16)明显低于胰腺癌组织(1.48±0.21),差异有统计学意义( t=19.690, P<0.05)。胰腺癌组织和癌旁组织共有390个miRNA差异表达,其中上调259个,下调131个。这些miRNA主要生物学过程包括细胞增殖、细胞发育、细胞分化等;分子功能主要包括肿瘤细胞运动、细胞迁移、细胞侵袭、细胞增殖和细胞间信号转导等。发现下调的miRNA与DNA甲基转移酶3A存在碱基互补,其中差异最为显著排序前10个的miRNA分别为miR-143-3p、miR-129-5p、miR-493-5p、miR-367-3p、miR-29a-3p、miR-212-3p、miR-323A-3p、miR-5195-3p、miR-4465和miR-532-5p。癌旁组织中miR-143-3p、miR-129-5p、miR-493-5p、miR-367-3p、miR-29a-3p、miR-212-3p、miR-323a-3p、miR-5195-3p、miR-4465和miR-532-5p表达水平(1.09±0.11、0.97±0.08、1.08±0.31、1.17±0.121、1.07±0.08、1.01±0.10、0.97±0.08、1.01±0.05、0.99±0.03、1.04±0.10)明显高于胰腺癌组织(0.51±0.10、0.46±0.11、0.47±0.15、0.62±0.12、0.37±0.07、0.56±0.10、0.66±0.04、0.68±0.06、0.73±0.05、0.66±0.13),差异有统计学意义( t=11.860、12.170、5.590、9.910、21.070、9.941、11.180、14.030、13.570、7.470, P<0.05)。miRNA对照和荧光素酶报告基因共转染细胞荧光素酶活性(0.97±0.02、0.96±0.02、0.97±0.02、0.98±0.02、0.97±0.02、0.97±0.04、0.95±0.03、0.96±0.03、0.97±0.02、0.96±0.02)明显高于miR-143-3p、miR-129-5p、miR-493-5p、miR-367-3p、miR-29a-3p、miR-212-3p、miR-323a-3p、miR-5195-3p、miR-4465和miR-532-5p模拟物和荧光素酶报告基因共转染细胞荧光素酶活性(0.32±0.07、0.33±0.06、0.35±0.09、0.50±0.04、0.50±0.05、0.53±0.07、0.58±0.03、0.63±0.03、0.65±0.05、0.81±0.05),差异有统计学意义( t=22.400,24.470,16.730,24.480、20.530,14.010,21.360,19.040,15.960,6.751, P<0.05)。 结论:DNA甲基转移酶3a在胰腺癌组织中表达水平显著增加,miR-143-3p、miR-129-5p、miR-493-5p、miR-367-3p、miR-29a-3p、miR-212-3p、miR-323a-3p、miR-5195-3p、miR-4465和miR-532-5p等miRNA参与调控DNA甲基转移酶3a在胰腺癌组织中的表达。
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编辑人员丨6天前
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微小RNA-29a-5p通过Endoglin改善心肌梗死后心肌纤维化
编辑人员丨6天前
目的:观察微小RNA(miRNA,miR)-29a-5p在心肌梗死后心室重塑心肌纤维化中的作用,探讨miR-29a-5p通过靶基因Endoglin调控心肌梗死后心肌纤维化的作用机制。方法:选取2019年1月至2019年10月在郑州大学第二附属医院收治的30例心肌梗死患者和20例非急性冠脉综合征的患者,取血液标本,分别进行血清miR-29a-5p和NTPRO-脑钠肽(BNP)的检测。体内实验,建立小鼠心肌梗死模型,尾静脉分别注射miR-29a-5p mimics和阴性对照试剂。4周后处死小鼠,取部分心肌组织用实时定量聚合酶链反应(Real-time PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)分别对miR-29a-5p、Endoglin、BNP进行检测。体外实验,处死1日龄小鼠,分离获得心肌成纤维细胞并进行培养。将培养的细胞用脂质体2000对细胞进行转染miR-29a-5p mimics和阴性对照试剂,转染后加入50 μmol/L血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)或等体积的磷酸盐缓冲液(PBS)持续48 h。用图像J软件检测各组成纤维细胞的表面积。另取细胞用miR-29a-5p mimics或antagomir,pRL-TK-endoglin-3’端非编码区(3’UTR)载体,pGL3-basic质粒进行共转染。转染48 h,获得细胞,用双荧光素酶报告试验系统检测细胞相对荧光素酶活性,并用Real-time PCR和Western blot分别检测Endoglin在各组的表达。采用单因素方差分析和LSD检验。结果:急性心肌梗死(AMI)患者血清中miR-29a-5p含量[(3.57±0.53) ng/ml]明显降低( F=935.899, P<0.01),NTPRO-BNP含量明显升高[(9.47±5.06) ng/ml, F=65.440, P<0.01]。小鼠MI组miR-29a-5p表达水平明显降低(0.51±0.12, t=4.315, P<0.01),在AngⅡ诱导的心肌纤维化模型中同样发现miR-29a-5p的表达水平明显降低(0.65±0.26, t=4.511, P<0.01)。miR-29a-5p mimics处理心肌成纤维细胞中Endoglin蛋白含量和mRNA表达水平降低(0.49±0.09, t=352.312, P<0.01),在miR-29a-5p antagomir处理心肌成纤维细胞中Endoglin蛋白含量和mRNA表达水平升高(2.15±0.14, t=7.814, P<0.05)。 结论:miR-29a-5p是心肌纤维化的重要调节因子。
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编辑人员丨6天前
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基于微小核糖核酸-信使核糖核酸网络探讨重复经颅磁刺激治疗缺血性脑卒中的分子机制
编辑人员丨6天前
目的:基于微小核糖核酸(miRNA)-信使核糖核酸(mRNA)调控网络探讨重复经颅磁刺激(rTMS)促进缺血性脑卒中(IS)神经修复的潜在分子机制。方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载rTMS干预7 d后的IS大鼠皮质miRNA表达谱。使用R软件分析差异miRNAs,通过在线数据库预测其对应的下游mRNAs,构建miRNA-mRNA调控网络,筛选关键miRNAs。对靶基因进行功能富集分析,构建靶基因所编码的蛋白质相互作用网络,识别网络中的核心mRNAs。选取无特定病原体动物(SPF)级雄性Sprague-Dawley大鼠24只,按随机数字表法随机分为假手术组、模型组和磁刺激组,每组8只大鼠。模型组和磁刺激组制备IS大鼠模型,仅磁刺激组接受连续7 d的rTMS干预,其余2组不进行干预。采用改良神经功能评分(mNSS)于造模前和造模成功1 d、3 d、7 d后评价3组大鼠的神经功能缺损程度;于造模成功8 d后深度麻醉大鼠,取脑组织行苏木精-伊红和尼氏染色观察组织缺失情况和神经元形态,利用实时荧光定量聚合酶链反应验证差异基因在3组大鼠缺血侧皮质中的表达趋势。结果:共筛选出167个差异miRNAs和预测到25个mRNAs。富集分析表明,这些基因与细胞迁移的正向调节、神经营养因子受体信号通路的正向调节等生物学过程有关,涉及腺苷酸激活蛋白激酶、神经营养因子通路、大鼠肉瘤等信号通路。通过构建miRNA-mRNA调控网络,识别出miR-206-3p、miR-378a-3p、miR-107-3p、miR-92a-3p和miR-29b-3p共5个关键miRNAs;通过蛋白互作网络分析筛选出4个核心mRNAs,分别为整合素亚基β1、水通道蛋白4、脑源性神经生长因子(BDNF)、溶质载体家族2成员4。造模成功7 d后,磁刺激组的mNSS评分显著低于模型组同时间点( P<0.05)。与模型组相比,磁刺激大鼠右侧皮质的miR-206-3p表达明显降低( P<0.05),BDNF表达则显著增高( P<0.05)。 结论:miR-206-3p-BDNF调控网络和相关作用途径在rTMS促进IS大鼠神经修复过程中发挥重要的作用。
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编辑人员丨6天前
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不同细胞来源外泌体对眼表的作用研究进展
编辑人员丨6天前
外泌体是由细胞分泌的一种膜性囊泡,可广泛参与细胞间通讯、抗炎、免疫调节等。眼表相关的外泌体来源细胞有间充质干细胞(MSC)、调节性T细胞(Treg)、未成熟树突状细胞(imDC)和髓源性抑制细胞(MDSC)。不同细胞来源的外泌体通过递送不同的生物分子给受体细胞而发挥作用。MSC来源的外泌体通过抑制T细胞增生、转换巨噬细胞表型、调控辅助性T(Th)细胞分化、上调Treg表达等机制对眼表炎症与免疫相关疾病有积极作用,同时可减少新生血管和炎症反应,培育了一个可促进角膜损伤修复的微环境。Treg来源外泌体内含微小RNA(miRNA)(miR-503、miR-330和miR-9)和诱导型NO合成酶,可通过干扰细胞周期进程,诱导凋亡和其他T细胞分化为Treg表型,抑制T细胞的同种异体排斥反应从而诱导免疫耐受。imDC来源外泌体通过递送miR-682抑制角膜植片免疫排斥。MDSC来源外泌体在体内外促进Treg扩增,抑制活化T细胞的增生和细胞毒性反应,还表达miR-29a-3p和miR-93-5p,可抑制Th1和Th17细胞分化。鉴于上述外泌体的抗炎及免疫抑制作用,本文就其对眼表炎症与免疫相关疾病如角膜损伤、黏多糖贮积症、干眼、干燥综合征和眼部移植物抗宿主病等的研究进行综述。
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编辑人员丨6天前
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氟对小鼠睾丸微小RNA表达谱的影响
编辑人员丨6天前
目的:探究过量氟暴露对小鼠睾丸微小RNA(microRNA,miRNA)表达谱的影响,并探讨氟的生殖毒性机制。方法:24只8周龄C57BL/6J雄性小鼠,体重为(23 ± 1)g,按体重采用随机数字表法分为对照组[0 mg/L氟化钠(NaF)]和氟暴露组(50 mg/L NaF),每组12只,处理90 d后麻醉处死小鼠,采集精子检测其数量、活率、畸形率,并对睾丸组织进行HE染色;提取小鼠睾丸组织RNA,利用高通量测序技术检测氟对小鼠睾丸miRNA表达谱的影响,并进行差异表达miRNA筛选及其靶基因预测,同时进行功能注释和通路富集分析;利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证差异表达miRNA的表达量。结果:与对照组[精子数量:(11.30 ± 2.52)× 10 6/ml、活率:(90.07 ± 4.34)%、畸形率:(15.49 ± 3.25)%]相比,氟暴露组小鼠精子数量[(9.01 ± 2.25)× 10 6/ml]和活率[(84.34 ± 4.21)%]均下降( P = 0.041、0.003),而畸形率[(22.36 ± 6.51)%]上升( P = 0.003);且HE染色显示,氟暴露组小鼠睾丸间质间距增大,生精小管管腔内精子数量减少,细胞排列紊乱。通过测序,发现氟暴露组小鼠睾丸中存在34个差异表达miRNA;经qRT-PCR验证,与对照组相比,氟暴露组小鼠睾丸mmu-miR-29b-1-5p( P < 0.001)、mmu-miR-196a-5p( P = 0.002)和mmu-miR-196b-5p( P = 0.031)的表达量均显著上升;而mmu-let-7a-2-3p( P < 0.001)和mmu-miR-466n-3p( P = 0.018)的表达量均明显下降,与测序结果一致。通过对差异表达miRNA靶基因的KEGG富集,发现氟暴露可改变小鼠睾丸中轴突导向(axon guidance)信号通路、嗅觉传导(olfactory transduction)通路、神经活动配体-受体相互作用(neuroactive ligand-receptor interaction)通路和溶酶体(lysosome)信号通路等。 结论:氟暴露可能通过改变睾丸中miRNA的表达谱,以及通过介导转录后调节的信号通路进而诱导睾丸损伤。睾丸miRNA可能是氟生殖毒性的潜在生物标志物,可为氟中毒机制的探究提供新思路和观点。
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编辑人员丨6天前
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转化生长因子-β1相关血清微小核糖核酸对糖尿病肾病早期诊断的临床价值
编辑人员丨6天前
目的 探讨转化生长因子β1(TGF-β1)相关血清微小核糖核酸(miRNA)对糖尿病肾病(DKD)早期诊断的临床价值.方法 收集2019年1月至2021年12月在缙云县壶镇镇中心卫生院及缙云县人民医院就诊的2型糖尿病(T2DM)患者260例作为研究对象.根据尿白蛋白排泄率(UAER),研究对象分为单纯T2DM组135例、早期DKD组82例、临床DKD组43例.另选取50名健康志愿者作为对照组.检测各组血清miR-27a、miR-27b、miR-29c、miR-200c水平和TGF-β1水平,并进行指标间的相关关系分析.利用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清miRNAs对DKD的早期诊断价值.结果 单纯T2DM组、早期DKD组和临床DKD组患者血清miR-27a、miR-27b、miR-200c水平及TGF-β1水平均高于对照组,miR-29c水平低于对照组(F=235.624、70.351、108.127、672.304,P均<0.001).TGF-β1与血清 miR-27a、miR-27b、miR-200c呈正相关,与 miR-29c 呈负相关(r=0.668、0.429、0.618、-0.502,P均<0.001).血清 miR-27a、miR-27b、miR-29c、miR-200c对T2DM患者发生DKD的诊断曲线下面积(AUC)为0.913、0.775、0.812、0.894,miR-27a和miR-200c的敏感度和特异度均>0.7.验证队列中血清miR-27a、miR-27b、miR-29c、miR-200c对T2DM患者发生DKD的诊断AUC 分别为 0.901、0.787、0.802、0.896,差异有统计学意义(Z=-9.012,P<0.0l).结论 血清 miR-27a、miR-27b、miR-29c、miR-200c对于早期DKD都有一定的诊断价值.
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编辑人员丨6天前