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基于MaxEnt和ArcGIS的山西省蒙古黄芪适宜性区划研究
编辑人员丨1天前
目的 掌握影响蒙古黄芪生长的主要环境因子,对蒙古黄芪在山西省适宜区分布进行预测,为山西省蒙古黄芪资源的合理布局提供参考.方法 采用山西省"第四次中药资源普查"数据库收录的蒙古黄芪样点经纬度信息,查询中国数字植物标本馆及检索文献记录补充,将筛选后的347个蒙古黄芪样点分布数据和环境因子添加到最大熵(MaxEnt)模型中运行,筛选出影响蒙古黄芪地理分布的主要环境因子及贡献率.应用地理信息系统软件ArcGIS对山西省蒙古黄芪生态适宜区进行划分.结果 建立的MaxEnt模型受试者工作特征曲线下面积为0.909,表明模型预测结果准确.共筛选出19个环境因子,其中气候因子是影响蒙古黄芪分布最重要的环境因子,其次是生物因子与地形因子,土壤因子的影响最小.山西省蒙古黄芪潜在适宜区主要分布在省内北部山区,呈现从北到南适宜等级逐渐降低的趋势,在当前气候条件下山西省蒙古黄芪最适宜区面积为15 424 km2,适宜区面积为19 856 km2,次适宜区面积为59 436 km2,不适宜区面积为61 894 km2.结论 基于MaxEnt模型和ArcGIS软件预测山西省蒙古黄芪适宜区分布状况,对山西省蒙古黄芪资源的保护与合理布局具有一定参考价值.
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编辑人员丨1天前
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利用Agisoft PhotoScan软件制作法医病理学3D数字标本的探索和教学应用
编辑人员丨1天前
法医病理学3D数字标本在法医病理学教学中发挥着越来越重要的作用。3D数字标本的传统手工建模存在制作过程复杂、耗时、技术要求高等不足,而激光扫描建模因其价格较贵且不方便在不固定的法医病理学解剖现场使用而难以推广。本文探索利用基于二维图像构建三维数字模型的Agisoft PhotoScan软件制作法医病理学3D数字标本的方法。在法医学专业学生中使用制作成功的3D数字标本进行教学,学生普遍认为该方法制作的3D数字标本与传统的大体标本相比,不仅能达到大体标本的清晰度,还能够随时随地进行学习,学习空间变得自由、开放。总之,利用Agisoft PhotoScan软件能够简便、真实地完成数字标本的制作,教学效果良好。虽然利用该软件制作数字标本还存在新鲜标本建模困难以及小标本建模后立体感不强的缺点,但是在心、脑、肺、肝、肾等大多数器官经短时间固定后的3D数字标本制作中值得推广。
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编辑人员丨1天前
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逆向骶骨翼-髂骨螺钉固定Tile C型骨盆骨折骶髂关节的最佳进针点及其初步临床应用
编辑人员丨1天前
目的:探讨逆向骶骨翼-髂骨螺钉(RSAIS)固定Tile C型骨盆骨折骶髂关节的最佳进针点及其初步临床应用效果。方法:收集2022年1月至2023年1月溧阳市人民医院放射科数据库中的90例骨盆结构无异常患者CT数据,男女各45例;年龄21~69岁[(45.5±6.4)岁]。利用CT数字重建技术模拟RSAIS固定方法,测量前方可进针范围面积;分别取自位于髋臼后上方的髂骨-髋臼隐窝(A1),以及自A1横向向后1 cm(A2)、2 cm(A3)和纵向向下1 cm(A4)、2 cm(A5)共5个进针点,以S 1椎弓根螺钉进针点作为出针点,行前、后连线所在5种钉道(对应5组)的横断面和矢状面CT扫描。2名观察者分别测量钉道解剖参数,包括钉道长度、宽度和高度,并分析观察者间的组内相关系数(ICC)。20具3D打印第5腰椎-骨盆-股骨标本,制作Tile C型骨盆骨折模型,分为5组,每组4具,前环均采用交叉螺钉固定,后环5组分别按上述5种钉道各置入1枚RSAIS固定,生物力学试验机测量300 N垂直载荷下各组整体位移和骶髂间隙局部位移。利用上述解剖和力学试验结果的最佳进针点规划钉道,沿规划钉道经皮置入1枚直径7.3 mm RSAIS固定治疗1例Tile C1型骨盆骨折患者,记录螺钉置入透视时间、螺钉位置,以及末次随访时骨折愈合、疼痛数字评分、Oswestry功能障碍指数(ODI)和骨盆骨折Majeed功能评分等情况。 结果:前方可进针范围面积为(1 236.64±12.04)mm 2。3个横向进针点所在钉道长度自前向后逐渐减少,其中A1组的长度最大为(104.9±10.4)mm,A2组其次为(98.5±9.8)mm,A3组最小为(92.7±9.7)mm( P<0.01),而钉道宽度和高度差异均无统计学意义( P>0.05);3个纵向进针点(A1、A4和A5组)所在钉道长度、宽度和高度比较,差异均无统计学意义( P>0.05),但A1较A4、A5距离髋臼缘更远。2名观察者测量三个钉道解剖参数ICC的最小值为0.88,最大值为0.98;95% CI下限最小值为0.90,最大值为0.96;95% CI上限最小值为0.95,最大值为0.99。3个横向进针点置入螺钉固定后,A1、A2和A3组整体位移和骶髂间隙局部位移从前到后均逐渐增大,A1组分别为(2.93±0.09)mm和(1.49±0.14)mm,A2组分别为(3.14±0.12)mm和(1.63±0.54)mm,A3组分别为(3.23±0.12)mm和(1.67±0.67)mm,其中整体位移组间比较,差异均有统计学意义( P<0.01),骶髂间隙局部位移A1组较A2 组、A3组减少( P<0.01);3个纵向进针点置入螺钉固定后,A1、A4和A5组整体位移和骶髂间隙局部位移比较,差异均无统计学意义( P>0.05)。A1进针置入RSAIS治疗Tile C1型骨盆骨折患者的螺钉置入透视时间为66 s,螺钉位置优;末次随访时骨折愈合,疼痛数字评分由术前6分降至1分,ODI由术前41改善至18,Majeed功能评分81分。 结论:对于Tile C型骨盆骨折,从位于可进针范围前上部位的髂骨-髋臼隐窝进针,钉道最长、螺钉稳定性最好,且安全性较好,可作为RSAIS最佳进针点。按最佳进针点置入RSAIS的初步临床应用效果满意。
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编辑人员丨1天前
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人工智能辅助胃部组织病理学诊断的数据采集和标注专家共识
编辑人员丨1天前
当前聚焦于胃部组织病理数字图像的人工智能医疗器械的研发已成为行业热点。基于深度学习的人工智能算法所依赖的数据库质量对该类产品的安全和有效性有着重要影响,但目前尚未形成数字病理图像的采集以及数据标注的技术规范。本文从胃部黏膜活检与手术标本组织病理数字图像数据采集及其质量控制、标注规则、标注流程等各个方面介绍专家组达成的共识,目的在于为此类产品的数据集制造责任方提供思路,并有效促进胃部组织病理辅助诊断类产品的发展。
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编辑人员丨1天前
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来华留学生数字化系统解剖学双语试题库的建设与应用
编辑人员丨1天前
目的:探讨数字化系统解剖学双语试题库对临床医学专业留学生教学资源创新与教学质量提升的作用。方法:组建试题库并用于2018级留学生(实验组)教学。通过对比2017级留学生(对照组)平时测试、期末理论和实验考试成绩验证试题库应用价值。利用调查问卷获得留学生使用反馈,进一步评价试题库的开发可行性和教学改革推动作用。采用SPSS 20.0统计学软件进行数据分析,两组考核成绩进行独立样本 t检验,计量资料以(均数±标准差)表示。 结果:两组学生平时测试成绩差异无统计学意义( P>0.05),但实验组数字化标本考试与期末理论考试成绩均高于对照组( P<0.05)。问卷结果显示,89.55%(155人)以上的留学生在学习资源、试题质量、考试模式和使用评价等方面对试题库给予了高度评价,但仅有52.02%(90人)的留学生认可试题的双语体现形式。 结论:数字化系统解剖学双语试题库有效拓展了教学资源,推动了留学生教学改革。
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编辑人员丨1天前
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下颈椎“钉道安全核区”的构建及辅助徒手椎弓根钉置钉的可行性研究
编辑人员丨1天前
目的:构建下颈椎“钉道安全核区”并验证其指导椎弓根置钉的准确性与可行性。方法:本研究为实验研究。根据纳入和排除标准从赣南医学院第一附属医院CT数据库中进行筛选,纳入2015年1月至2020年3月行颈椎CT检查的60例患者的CT图像。将CT图像导入Mimics 20.0软件,按自行设计的“下颈椎椎弓根钉道虚拟构建法”,构建C 3~7的虚拟椎弓根钉道及钉道安全核区。记录虚拟“钉道安全核区”的构建成功率;测量安全核区的空间位置数据,包括冠状位平面安全核区与上下钩椎关节外缘连线间距离、矢状位平面安全核区与椎体后壁线的距离。测量后方进钉区皮质至安全核区中心点的钉道长度、横断面椎弓根钉外展角可变区间、冠状位平面进钉区域投影面积。应用8例成人颈椎标本进行模拟置钉实验,在X线机实时监测下以虚拟“钉道安全核区”为影像参考标志徒手置钉。椎体左侧采用“钉道安全核区参考法”徒手置钉(实验组);右侧采用传统徒手置钉法(Abumi法)置钉(对照组)。术者依据X线片对徒手置钉操作的准确性所做主观评判,并以CT扫描结果验证,比较两种置钉方法的术者判断正确率及实际置钉准确率。组间数据比较采用 χ2检验。 结果:下颈椎“钉道安全核区”的有效构建率为97.0%(291/300);冠状面上安全核区与上、下钩椎关节外缘连线的距离[ M(IQR)]为0.91(0.98)mm(范围:0~1.85 mm);椎体矢状面安全核区与椎体后壁线的距离为(2.01±0.86)mm(范围:0.67~3.53 mm)。前段钉道长度为(11.58±1.00)mm(范围:8.27~14.93 mm)。进钉区冠状面投影面积为(36.18±11.67)mm 2(范围:13.38~83.11 mm 2)。人体标本置钉实验结果方面,实验组的钉道制备修正率为7.5%(3/40),对照组为12.5%(5/40)( χ2=0.139, P=0.709)。钉道制备完成后行CT检查,实验组正确率为100%(40/40),对照组正确率为82.5%(33/40),差异有统计学意义( χ2=5.638, P=0.018)。置钉完成后CT检查结果显示实验组置钉准确率为100%(40/40),对照组为90.0%(36/40)( χ2=2.368, P=0.124)。将术者主观判断置钉准确与否的结果与CT检查结果对比,实验组术者主观判断的正确率为100%(83/83),对照组为92.9%(79/85),差异有统计学意义( χ2=4.199, P=0.040)。 结论:下颈椎“钉道安全核区”的构建成功率高,“钉道安全核区”辅助徒手椎弓根钉置钉技术可提高术者依据X线影像监测所作主观判断的准确性,进而提高下颈椎椎弓根钉技术的准确性,但仍需在临床实践中进一步验证。
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编辑人员丨1天前
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本科病理实训教学资源库的构建与应用
编辑人员丨1天前
传统病理实训教学中使用的实物大体标本和组织切片易损耗,部分疾病样本资源稀缺、难补充,实训教学受地点和时间限制,影响了实训教学效果。数字化技术的发展助推了医学实训课教学模式变革。通过构建实物标本的数字化图像,有效保存和扩充了样本资源,形成实物与数字标本相结合的病理实训教学资源库;通过构建远程访问网络平台,提高了病理实训课程学习的灵活性和自主性;通过整合临床信息到样本,借助二维码技术与语音播报技术解读标本,实现人机互动学习。结果显示,使用资源库进行病理实训教学提高了学生的学习效果和授课满意度。
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编辑人员丨1天前
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东北地区野生茶藨子属物种多样性与分布格局
编辑人员丨2024/3/30
东北地区是中国野生茶藨子属(Ribes L.)重要的分布区之一,很多资料对该区茶藨子属的记载是不全面甚至是错误的,急需对该地区野生茶藨子属的种类及分布情况进行归纳总结.通过对东北地区野生茶藨子属进行实地考察,查阅《中国植物志》《东北植物检索表》《东北维管束植物考》等志书,相关论文和植物名录,以及植物智、中国植物图像库、中国数字植物标本馆和中国珍稀濒危植物信息系统等网站,结果表明:东北地区野生茶藨子属共有6个亚属22种(含8个变种).黑龙江省野生茶藨子属种类最多,有12种2变种,吉林省有8种4变种,辽宁省有5种4变种,内蒙古自治区东部有7种2变种.东北地区野生茶藨子属主要分布于大兴安岭地区、小兴安岭地区、长白山区和辽东半岛沿岸及岛屿;东北地区该属种类和亚属的数量在水平分布上具有一致性,小兴安岭地区的野生茶藨子属无论在种数上还是在亚属的数量上都是最多的,是东北地区野生茶藨子属的现代分布中心;东北北部地区的茶藨子属以两性花类群为主,而东北南部地区多为单性花类群.该属从低海拔(≤200 m)到高海拔(1 800~2 100 m)均有分布,且多数种类集中分布于海拔300~800 m.该属特有现象十分明显,国内区域特有种多达15种(含6变种),占比68%.东北地区野生茶藨子属种类繁多、资源丰富、分布广泛且发展潜力巨大,但其生存环境面临威胁,应当密切关注其种群数量及分布区域的动态变化,以便采取措施及时予以保护.
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编辑人员丨2024/3/30
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植物模式标本数据整合新的机遇与挑战
编辑人员丨2024/2/3
命名模式是分类群名称永久依附的成分,在分类学研究中有不可替代的价值.中国复杂的植物采集历史以及对中国植物标本开展研究的单位各异,导致我国植物模式标本零散分布于全球各大标本馆,给分类工作的开展带来了极大的困难.标本数字化的开展为模式标本数据整合提供了新的机遇,同时也给我们带来了人名和地名标准化以及模式类型确认等方面的挑战.我国于 2006 年开始对模式标本数据进行收集和整理,迄今已完成国内外 20 余家标本馆 9 万余条标本数据的收集.模式考证和模式类型清理是我们下一步亟须开展的工作,同时我们应将地名变更资料、人名考证资料进行整合并建立相应的数据库以推动模式标本数据的标准化.这将在很大程度上有助于我们摸清中国模式标本的家底.
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编辑人员丨2024/2/3
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贵州师范大学植物标本室的历史与沿革
编辑人员丨2024/2/3
自 2017 年参加"国家标本资源共享平台"植物子平台以来,贵州师范大学地理与环境科学学院植物标本室除了数字化植物标本以外,还挖掘、整理了贵州师范大学植物分类学、植物地理学的建设和发展历程.经过 3 年的艰苦努力,最后向中国数字植物标本馆(CVH)提供了10 044份信息齐全的植物标本.通过此次植物标本数字化工作,彻底摸清了贵州师范大学地理与环境科学学院植物标本的家底,盘活了标本室的库存,使得老一辈植物地理学家黄威廉等老先生 60 余年的科研成果重新展现在世人面前.通过植物标本的数字化工作,挖掘整理出老一辈精彩的植物标本采集史和学术故事.在标本数字化的过程中,学生和老师都对植物标本以及植物标本背后的故事有了新的认识,对植物标本数字化的重要性和必要性也有了更深的体会.
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编辑人员丨2024/2/3
