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中国YqAZF微缺失筛查室间质量评价结果分析(2017—2019)
编辑人员丨5天前
目的:分析2017年至2019年连续3年不同实验室Y染色体长臂无精子因子(Yq azoospermia factor,YqAZF)微缺失检测的室间质量评价(YqAZF microdeletion external quality assessment,YEQA)结果,以期为改进和规范YqAZF微缺失检测质量管理体系提供指导意见。方法:总结2017年至2019年期间由中国医师协会男科医师分会组织开展YEQA质控,每年向参与单位发放3个全血抽提的DNA质控品,包括无YqAZF微缺失、YqAZFb+c微缺失、YqAZFc微缺失等不同类型样本。各单位按规定要求上报检测方法、仪器和试剂、检测结果和结果解释等信息。专家对反馈结果进行评判及分析,得出分数和整体描述性评价。结果:2017年至2019年YEQA参与单位数逐年递增,3年累计报名172家,有效结果回收148家,回收率86.0%(148/172)。3年回收率分别为90.2%、92.6%、79.2%。参与单位来自9类不同实验室,以检验科/中心实验室、生殖/遗传中心为主;检测方法上,91.9%(136/148)为实时荧光PCR法检测;检测结果总分存在波动性,其中基因型检测平均得分率逐年递增(2017年至2019年分别为88.3%、93.0%、94.7%),而对检测结果的临床解释最为薄弱。2018年总平均分最高,为86.8分。结论:中国YEQA连续3年调查结果整体情况令人满意。但仍存在个别单位基因型检测错误、报告格式不规范、临床解释不全面等问题。检测单位应加强质量控制意识,及时采取措施纠正检测过程中出现的偏差和错误,积极参与YEQA计划,以提高YqAZF微缺失检测整体水平。
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编辑人员丨5天前
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光学基因组图谱分析技术在不良生育史患者遗传学病因分析中的应用
编辑人员丨5天前
目的:探讨光学基因组图谱分析(OGM)技术在不良生育史患者遗传学病因分析中的价值。方法:选取2022年6月至2023年6月因不良生育史在南通大学附属医院就诊的4例患者(其中女性3例、男性1例)作为观察对象。所有对象均接受了400条带水平的G显带染色体核型分析和单核苷酸多态性微阵列(SNP array)技术检测;采用550条带水平的染色体核型分析对其中1例进行了验证;采用染色体C显带、N显带和荧光原位杂交(FISH)技术共同验证了另1例患者;综合判断得出4例患者均存在染色体结构变异后,采用OGM技术进行回顾性检测分析。结果:OGM技术能够准确识别隐匿性倒位inv(7)(q22.3q21.2)、复杂嵌合型X染色体缺失45,X[77]/46,X,der(X)dup(X)(q28q21.31)del(X)(q28)[32]、Y染色体无精子因子(AZF)基因区域微缺失del(Y)(q11.223q11.23);无法识别人类参考基因组中的空白区域,如核型46,XX,4qh,4qs中的随体及异染色质等。结论:OGM技术能够检测参考基因组空白区和无标记区域以外的平衡和(或)非平衡性的多种染色体畸变,可以作为新型诊断工具来分析不良生育史患者染色体显微及亚显微水平的改变。
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编辑人员丨5天前
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桂林地区男性不育患者Y染色体微缺失的检测分析
编辑人员丨5天前
目的:探讨Y染色体无精子因子(AZF)基因微缺失情况在男性不育症中的临床意义。方法:选取2017年7月至2019年6月在本院就诊的587例男性不育患者,分析其Y染色体AZF基因微缺失的情况。结果:共检出39例Y染色体微缺失,总检出率为6.6%。包括31例AZFc缺失,检出率为5.3%;2例AZFb缺失,检出率为0.3%;3例AZFb+c缺失,检出率为0.5%;1例AZFa缺失,检出率为0.2%;2例AZFa+b+c缺失,检出率为0.3%。结论:桂林地区AZFc区缺失发生率最高。Y染色体微缺失检测为男性不育临床诊断、遗传咨询和辅助生殖提供了科学依据。
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编辑人员丨5天前
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45,X/46,XY嵌合体患儿的临床特点和Y染色体异常
编辑人员丨5天前
目的:探讨45,X/46,XY性发育异常(DSD)患儿的临床和遗传学特点。方法:回顾性分析2018至2022年郑州大学第一附属医院收治的20例45,X/46,XY或45,X/46,X,+mar核型的患儿,总结临床资料、性腺病理、治疗及随访,应用SRY基因检测、Y染色体无精子因子(AZF)检测、低深度全基因组拷贝数变异(CNV)测序等进行遗传学检测。采用独立样本 t检验比较男童与女童组的初诊年龄差异。 结果:20例患儿中男3例、女17例,初诊年龄(7.6±5.5)岁,男童组初诊年龄低于女童组[(2.1±1.9)比(8.7±5.4)岁, t=-3.86, P=0.004]。男童均为外生殖器发育异常,女童为身材矮小(13例)或外生殖器发育异常(4例)。5例女童伴特纳综合征表型。性腺表型为混合型性腺发育不良(MGD,6例),完全型性腺发育不良(CGD,10例),卵睾型DSD(2例),1例性腺可能为卵巢,1例暂无法确定。1例外生殖器发育异常的女童改变为男性,余性别不变。7例女童接受重组人生长激素治疗,随访时间(2.9±1.2)年,身高增长(17±7)cm。20例患儿均未见性腺恶变。16例核型为45,X/46,XY,4例核型为45,X/46,X,+mar,经CNV测序确认,额外标记染色体均为Y染色体来源。20例患儿均检测到SRY基因扩增,7例女童存在AZF缺失。 结论:45,X/46,XY DSD患儿表现为外生殖器发育异常或女性身材矮小,性腺表型包括MGD、CGD和卵睾型等多种形式,多数女童Y染色体存在微缺失。
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编辑人员丨5天前
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基于机器学习转移性鼻咽癌关键特征基因的筛选及其免疫细胞浸润分析
编辑人员丨2024/7/13
目的 利用机器学习算法筛选转移性鼻咽癌(mNPC)的关键特征基因,并分析其肿瘤微环境中免疫细胞浸润情况.方法 首先,通过 GEO 数据库下载训练集 GSE103611 数据,并对数据进行差异表达基因(DEGs)筛选、基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)以及免疫细胞浸润分析.其次,通过最小绝对收缩和选择器操作(LASSO)回归筛选DEGs中的预测基因,并利用预测基因的表达水平和受试者工作特征曲线(ROC)筛选特征基因.再次,进一步分析特征基因与免疫细胞的相关性,从而判断关键特征基因.最后,利用反向验证集GSE1245 数据,对关键特征基因的表达水平和ROC进行验证.结果 共获得 136 个DEGs,其KEGG主要富集在细胞色素P450、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、朊病毒疾病以及EB病毒感染等通路.GO主要富集在肽基酪氨酸磷酸化修饰、病毒基因表达以及B细胞和白细胞活化的负调节过程.22 种免疫细胞在鼻咽癌(NPC)和mNPC中的浸润程度差异不明显.LASSO回归最终得到 2 个mNPC的关键特征基因无精子蛋白 1 缺失(DAZ1)和酵母氨酸脱氢酶(SCCPDH),且两者与mNPC微环境中的免疫细胞显著相关(P<0.05).在反向验证数据集中,DAZ1 和SCCPDH在非鼻咽癌(nNPC)和 NPC 组间的差异表达不显著(P>0.05),且两者 ROC 的曲线下面积(AUC)值均<0.6.结论 DAZ1 和SCCPDH是mNPC的关键特征基因,可作为mNPC及其免疫治疗的重要标志物.
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编辑人员丨2024/7/13
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男性不育的遗传病因研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨染色体结构与数目异常,以及Y染色体无精子因子AZF微缺失和AZFc区部分缺失与男性不育的关系.方法 运用多重PCR检测技术对494例无精子症、严重少精子症、少精子症患者和2 36例精液正常已生育男性进行AZF微缺失和AZFc部分缺失检测,并对494例男性不育患者进行外周血染色体核型分析.结果 在无精子症、严重少精子症和少精子症患者中染色体数目与结构异常的发生率分别为11.86% (21/177)、3.39% (6/177)、2.08% (3/144).无精子症和严重少精子症患者Y染色体AZF微缺失率明显高于少精子症组,差别有统计学意义(P<0.05).生精障碍组和严重少精子症组与正常对照组b2/b3缺失率差异均有统计学意义,而在各组间gr/gr缺失显示相似的频率.结论 无精子症、严重少精子症和少精子症患者中存在较高频率的染色体结构、数目异常与AZF基因微缺失现象,提示染色体结构、数目异常与AZF基因微缺失可能是男性不育的重要遗传原因;Y染色体AZFc区存在多种部分缺失类型,gr/gr缺失可能对生精功能的影响较小,仅是一种基因组多态,b2/b3缺失是男性生精障碍的的风险因素.
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编辑人员丨2023/8/6
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Y染色体AZF基因微缺失在诊断男性不育中的意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨佛山地区男性不育症患者Y染色体无精症因子(AZF)微缺失检测的临床意义.方法应用荧光定量PCR技术对212例无精症或严重少精症患者(观察组)和120例健康体检者(对照组)的AZF区微缺失分析.结果 共14例出现Y染色体AZF基因微缺失,总缺失率为6.6%,其中严重少精症患者缺失率为5.6%,无精子症患者缺失率为7.3%,AZF a 区缺失1例,AZF b 区缺失2例,AZF c区缺失8例, AZFb+c缺失2例,AZFa+b+c区缺失1例,c区发生率最高,其次为b区,a区发生率最低,对照组120例未发现微缺失,两组微缺失发生率比较,差异具有统计学意义(P<0.05).结论 Y染色体AZF微缺失的检测对原发性男性不育患者的诊断有重要的指导价值.
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编辑人员丨2023/8/6
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Y染色体AZFc区域DAZ基因拷贝类型与生精障碍相关性研究
编辑人员丨2023/8/6
Y染色体上“无精子因子”区(azoospermia factor,AZF)的微缺失已是男性生精障碍的重要遗传因素之一[1-2].AZF分为AZFa、AZFb和AZFc 3个区域,约80%的微缺失出现在AZFc区[3].该区域主要有两大功能基因家族,DAZ和CDY基因家族.DAZ家族由3个同源性基因组成,包括BOULE、DAZL和DAZ.AZFc区的微缺失中DAZ基因拷贝数差异是影响男性遗传性生精障碍的主要因素之一[4].但其具体表型以及在男性生精障碍中的缺失率存在群体差异,在不同地域与人种间存在差异性[2,5].本研究选取本地区男性生精障碍病患者,进行AZFc微缺失率与DAZ基因拷贝数定量分析,并结合一原发不育病例家系分析,进一步阐述DAZ缺失类型在男性生精障碍中的分子遗传特征.
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编辑人员丨2023/8/6
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PCR荧光探针法在Y染色体微缺失检测中的应用
编辑人员丨2023/8/6
目的 比较无精子症因子(azoospermia factor,AZF) PCR荧光探针法与多重聚合酶链反应结合琼脂糖凝胶电泳检测法的结果吻合度.方法 收集2016年6月至2017年6月来我院就诊的208例男性不育患者外周血.根据WHO 2010年第5版精液分析操作指南将208例患者分为正常精子症组、无精子症组和少精子症组.用PCR荧光探针法对208例男性不育患者检测Y染色体无精子症因子,然后采用多重聚合酶链反应结合琼脂糖凝胶电泳检测208例不育患者Y染色体无精子症因子.结果 在208例不育男性患者中,正常精子症组有100例,无精子症组47例,少精子症组61例.PCR荧光探针法检测Y染色体无精子症因子,少精子症组1例AZFc区(SY254/SY255)缺失,无精子症组1例AZFabc区缺失,正常精子症组未发现基因缺失类型.多重聚合酶链反应结合琼脂糖凝胶电泳检测法结果与PCR荧光探针法检测结果一致. 结论 2种方法检测的患者无精子症因子基因的结果吻合度一致.与多重聚合酶链反应结合琼脂糖凝胶电泳检测法相比,PCR荧光探针法一次上样可以做48个样本,节省了时间与成本,结果自动保存,可以作为Y染色体微缺失检测的推荐方法.
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编辑人员丨2023/8/6
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200例无精症患者染色体核型分析及Y染色体AZF基因微缺失情况观察
编辑人员丨2023/8/6
目的 观察无精症患者染色体核型及Y染色体长臂上的无精子因子(azoospermia factor,AZF)基因微缺失情况.方法 对200例无精症患者进行外周血染色体核型分析,采用多重PCR电泳技术和荧光定量PCR技术对Y染色体AZF的6个标签序列位点进行检测.结果 200例受检无精症患者中,染色体核型异常9例(其中性染色体异常8例、常染色体易位1例);Y染色体AZF基因微缺失18例(其中AZFb+c区缺失11例、AZFc区缺失5例、AZFb区缺失1例、AZFa区缺失1例),多重PCR电泳技术和荧光定量PCR技术对Y染色体AZF的6个标签序列位点的检测结果一致.结论 无精症患者染色体核型异常及Y染色体AZF基因微缺失多见,可能是男性不育的重要原因;多重PCR电泳技术与荧光定量PCR技术检测对Y染色体AZF基因的检测结果一致,后者因省时省力,可作为Y染色体AZF基因微缺失的筛查方法.
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编辑人员丨2023/8/6
