IgG4相关性疾病是一种免疫介导的慢性炎症伴纤维化疾病，多种疾病或感染可出现类似的临床表现和血清IgG4浓度升高，导致误诊或漏诊。本文报道1例以肺内病变伴胸腔积液起病，之后发现合并纹带棒状杆菌肺部感染的IgG4 相关性疾病病例。

目的:比较侵袭性牙周炎（aggressive periodontitis，AgP）、慢性牙周炎（chronic periodontitis，CP）与牙周健康者（periodontally healthy，PH）龈下菌群的差异，为牙周病的病因学研究及基于菌群调控的牙周病新疗法提供参考。方法:按纳入标准收集2013年12月至2014年12月在南京大学医学院附属口腔医院·南京市口腔医院牙周病科门诊就诊的AgP（AgP组）、CP（CP组）患者和PH受试者（PH组）各10例，根据X线片和口内情况初步预估取样位点后，收集各组龈下菌斑并记录各项牙周临床指数，提取龈下菌斑样本中的DNA，PCR扩增、构建DNA文库并对16S rDNA测序。最终可成功构建文库并测序者包含：8例AgP患者的18个样本，10例CP患者的31个样本和8名PH志愿者的10个样本。对各组样本的α多样性和β多样性以及菌群构成进行分析和比较，并采用Pearson相关性分析评价细菌与探诊深度的相关性。结果:菌群分析显示，AgP组龈下菌群的α多样性显著低于其他两组（ P<0.05）。在门水平，AgP和CP组拟杆菌门丰度[分别为（36.8±7.4）%、（37.2±6.3）%]、螺旋体门丰度[分别为（16.0±5.4）%、（11.8±3.6）%]均显著高于PH组[分别为（27.5±11.2）%、（5.2±4.4）%]（ P<0.05），而放线菌门和变形菌门丰度[AgP组分别为（4.2±3.3）%、（12.9±5.1）%；CP组分别为（6.1±2.6）%、（12.1±4.0）%]均显著低于PH组[分别为（19.3±13.1）%、（23.0±10.1）%]（ P<0.01）；AgP组龈下菌群中螺旋体门和柔壁菌门的丰度[分别为（16.0±5.4）%、（1.7±1.2）%]均显著高于CP组[分别为（11.8±3.6）%、（0.7±0.6）%]（ P<0.05）。在属水平，AgP组龈下菌群中棒状杆菌属、放线菌属、 Saccharibacteria_norank、月形单胞菌属、 Oribacterium的丰度显著低于CP组，而产线菌属、 Lentimicrobiaceae_norank、 Defluviitaleaceae_UCG_011、 Family_XI_unclassified的丰度显著高于CP组( P<0.05）。主坐标分析显示，各组样本存在聚类现象。线性判别分析显示，AgP组富集菌包括螺旋体科等，CP组富集菌包括拟杆菌科等。相关性分析显示，AgP组中密螺旋体属、 Defluviitaleaceae_UCG_011、支原体属、卡氏菌属、 Fretibacterium的丰度与探诊深度呈显著正相关（ r=0.525~0.750， P<0.05），丛毛单胞菌科-未分类的属、链球菌属、二氧化碳噬纤维菌属、奈瑟菌属、普雷沃菌属、消化球菌属、劳尔菌属、 Bergeyella和放线菌属的丰度与探诊深度呈显著负相关（ r=-0.617~-0.490， P<0.05）；CP组小类杆菌属、 Family_XI_unclassified、卡氏菌属、消化链球菌属、 Pelospora和理研菌科_RC9_肠组的丰度与探诊深度呈显著正相关（ r=0.430~0.533， P<0.05）。 结论:牙周炎症和健康时其龈下菌群存在明显不同；AgP和CP的龈下菌群也存在明显差异，提示这可能是两种不同的疾病。

目的:早期明确肉芽肿性乳腺炎患者脓液中是否感染棒状杆菌，并根据结果制定不同的治疗方法指导早期临床抗菌用药方案。方法:回顾性分析2016年6月至2017年3月在广东省妇幼保健院乳腺中心诊治并随访资料完整的患者共42例，应用PCR方法检测患者脓液中的棒状杆菌。阳性组患者治疗方法分别为单纯抗生素、抗生素+激素及单纯激素，阴性组患者治疗方法分别为抗生素+激素及单纯激素。观察不同组别患者的术后复发率及治愈率。结果:治疗感染棒状杆菌的肉芽肿性乳腺炎患者的抗生素方案包括短效左氧氟沙星、阿奇霉素及长效抗分枝杆菌三联药物。42例患者，PCR检测脓液明确棒状杆菌阳性21例，术后复发率23.5%。单纯抗生素组、抗生素+激素组及单纯激素组对感染棒状杆菌的肉芽肿性乳腺炎患者间疗效差异有统计学意义（ χ2=5.494， P=0.036）。PCR检测棒状杆菌阴性21例，术后复发率16.7%，抗生素+激素组及单纯激素组对无细菌感染的GM患者间疗效差异无统计学意义（ χ2=1.129， P=0.719）。 结论:GM患者及早发现棒状杆菌的感染对临床指导亲脂抗生素的应用有意义。

目的:评价慢性心力衰竭（心衰）患者肠道菌群构成、功能及代谢产物的改变。方法:通过检索中国生物医学文献数据库（CBM）、中国期刊全文数据库（CNKI）、万方数据库、美国国立医学图书馆数据库（PubMed）、医学文摘数据库（EMbase）、Cochrane循证医学数据库（Cochrane Library）检索出有关慢性心衰患者肠道菌群改变的研究，检索时段为从各自数据库建库起至2019年12月，系统评价慢性心衰患者肠道菌群构成、功能及代谢产物的改变。结果:共纳入10篇关于慢性心衰患者肠道菌群的研究。系统评价结果显示慢性心衰患者肠道菌群β-多样性改变明显，粪杆菌属、布劳特菌属、拟杆菌属、普雷沃菌属、厌氧棒状菌属丰度降低，链球菌属、大肠杆菌/志贺氏菌属、韦荣球菌属、肠杆菌属丰度升高。慢性心衰患者增加的微生物功能模块是色胺酸代谢、脂质代谢和脂多糖合成等，且与氧化三甲胺生成相关的细菌基因明显增加，与生成有益性代谢物丁酸盐相关的细菌基因减少，有害代谢产物氧化三甲胺水平升高。结论:慢性心衰患者肠道菌群的构成、功能及代谢产物发生了明显的变化。

目的:了解儿童脑脊液培养常见菌及其体外耐药性，为其结果解读和临床经验性治疗提供参考。方法:查询实验室信息系统，回顾分析浙江大学医学院附属儿童医院2007至2019年所有脑脊液的培养结果，并通过电子病历系统追溯患儿的临床特点。结果:共分离到菌株1 312株（细菌1 294株，真菌18株），致病菌497株（37.9%，497/1 312），其中革兰阳性菌288株（57.9%），革兰阴性菌200株（40.3%），真菌9株（1.8%），前5位细菌为大肠埃希菌（20.5%，102/497）、肺炎链球菌（12.9%，64/497）、无乳链球菌（10.5%，52/497）、屎肠球菌（6.6%，33/497）和金黄色葡萄球菌（5.6%，28/497），研究年限内致病菌的分离率有逐年增高趋势（χ2=34.84， P<0.001）。除肺炎链球菌感染者主要为1岁以上儿童外（76.6%，49/64），其他4种菌主要见于1岁以下婴儿［大肠埃希菌（95.1%，97/102）、无乳链球菌（98.1%，51/52）、屎肠球菌（81.8%，27/33）和金黄色葡萄球菌（71.4%，20/28）］。815株（62.1%，815/1 312）为污染菌，以凝固酶阴性葡萄球菌（680株）、微球菌（50株）、棒状杆菌（28株）和屎肠球菌［23株，占屎肠球菌总数的41.1%（23/56）］为主，污染菌分离率在夏秋季较高，研究年限内其污染菌分离率逐年下降趋势明显（χ2=13.26， P<0.001）。 结论:儿童脑脊液培养致病菌以大肠埃希菌、肺炎链球菌、无乳链球菌、屎肠球菌和金黄色葡萄球菌为主，而凝固酶阴性葡萄球菌、微球菌、棒状杆菌、屎肠球菌是脑脊液培养常见污染菌，临床医师应结合菌种类型和临床特点分析脑脊液培养的意义。

目的:观察老年下呼吸道痰液纹带棒状杆菌阳性患者的易感因素，分析其临床治疗效果。方法:回顾性分析2019年1月至2021年6月福建医科大学附属泉州第一医院192例下呼吸道痰液检出纹带棒状杆菌老年住院患者的临床资料，计算纹带棒状杆菌检出率，并对感染组(102例)与定植组(90例)患者的易感因素及临床疗效进行比较。结果:福建医科大学附属泉州第一医院2019年1—12月送检合格下呼吸道痰标本8 976例，72例(0.8%)检出纹带棒状杆菌；2020年1—12月送检合格下呼吸道痰标本5 877例，134例(2.3%)检出纹带棒状杆菌；2021年1—6月送检合格下呼吸道痰标本4 039例，121例(3.0%)检出纹带棒状杆菌，差异有统计学意义( χ2＝93.93， P<0.01)；其中老年患者纹带棒状杆菌检出率分别为0.6%(57/8 976)、1.4%(81/5 877)和1.9%(78/4 039)，差异有统计学意义( χ2＝45.57， P<0.01)。感染组患者高龄、入住重症医学科、营养不良、应用激素、联合应用抗菌药物、有创机械通气、纤维支气管镜、咳嗽反射减弱、基础疾病等方面的发生率均高于定植组，但差异无统计学意义(均 P>0.05)；感染组和定植组患者治疗临床有效率分别为41.2%(42/102)和48.9%(44/90)，差异无统计学意义( P>0.05)；感染组25例(24.5%)患者根据药敏结果治疗纹带棒状杆菌，与无药敏结果治疗患者的临床有效率分别为68.0%(17/25)和32.5%(25/77)，差异有统计学意义( χ2＝9.84， P<0.01)；未治疗组的临床有效率低于定植组，差异有统计学意义( χ2＝4.62， P<0.05)。 结论:老年患者纹带棒状杆菌检出率高并呈逐年增加趋势，感染者通常存在多种易感因素，未采取有效治疗措施可导致不良结局。在临床工作中，需关注且减少纹带棒状杆菌易感因素，正确解读病原学报告并采取合理有效的治疗方案。

目的:探讨人乳头瘤病毒（HPV）16亚型感染的子宫颈鳞状细胞癌患者下生殖道菌群的分布及特征。方法:前瞻性横断面研究。选取2019年8月至2020年6月就诊于中国医学科学院肿瘤医院的6例HPV16单一型别阳性子宫颈鳞状细胞癌患者（子宫颈癌组），选取同期体检人群中液基薄层细胞学检查未见异常且HPV阴性6名健康女性为健康对照组。患者抗肿瘤治疗前、健康对照者体检时用无菌棉拭子采集子宫颈后穹窿处分泌物，采用高通量测序技术扩增细菌16S rRNA基因V1-V2高变区，分析菌群分布及特征。结果:子宫颈癌组和健康对照组年龄分别为（51±8）岁、（48±3）岁，差异无统计学意义（ t=0.63， P=0.540），两组均有孕产史，无吸烟史。α多样性分析结果显示，与健康对照组比较，子宫颈癌组sobs指数（ t=3.25， P=0.009）及chao指数（ t=2.91， P=0.016）均高，差异均有统计学意义；子宫颈癌组shannon指数高（ t=2.07， P=0.065），simpson指数低（ t=1.74， P=0.113），但差异均无统计学意义。采用基于bray-curtis距离的主坐标分析（PCoA）进行数据降维分析显示，子宫颈癌组与健康对照组间β多样性差异具有统计学意义（ R2=0.154， P=0.018）。门水平上，与健康对照组相比，子宫颈癌组厚壁菌门占比低（30.21%比68.28%），拟杆菌门占比略低（6.87%比8.11%），而放线菌门（26.91%比14.42%）及变形菌门（27.33%比0.67%）占比高。属水平上，与健康对照组相比，子宫颈癌组乳杆菌属及棒状菌属占比低，失去优势菌群，而红球菌属、克雷伯菌属、气球菌属等占比明显高，且子宫颈癌组菌群种类较健康对照组多。线性判别分析（LDA）显示，属水平上，红球菌属（LDA=5.04）、克雷伯菌属（LDA=4.71）、肠杆菌属（LDA=4.29）、罗尔斯通菌属（LDA=4.28）、苍白杆菌属（LDA=4.23）、韦荣球菌属（LDA=4.14）为子宫颈癌组特征菌群；门水平上，健康对照组厚壁菌门（LDA=5.23）可为标志性物种；种水平上，子宫颈癌组红球菌（ P=0.025）、罗尔斯通菌（ P=0.045）、韦荣氏球菌（ P=0.044）、卡氏伯克霍尔德菌（ P=0.045）、假单胞菌（ P=0.043）等均较健康对照组多，差异均有统计学意义。 结论:HPV16单一型别阳性子宫颈鳞状细胞癌患者下生殖道菌群多样性、丰富度较健康女性增加，乳杆菌属丰度下降；红球菌属、克雷伯菌属可作为其标志性下生殖道菌群，但仍需进一步验证。

目的:探讨慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者鼻腔微生物多样性，以及术后复发者鼻腔微生物组学特征和炎性细胞及因子特点，以了解微生物组学因素对CRSwNP手术预后的影响。方法:2017年12月至2018年12月期间，招募于四川大学华西医院耳鼻咽喉科接受手术治疗的77例CRSwNP患者，其中男34例，女43例，年龄29~76岁。收集患者的鼻腔分泌物和鼻息肉组织。于分泌物中提取鼻腔微生物DNA，基于16S核糖体RNA（16S rRNA）进行高通量测序，检测细菌群落组成。使用Luminex分析鼻息肉组织中白细胞介素（IL）-5、IL-8、IL-17A、IL-17E、IL-18、IL-27和干扰素γ（IFN-γ）等细胞因子。计数外周血和鼻息肉组织中嗜酸粒细胞和中性粒细胞含量。术后随访1年，记录鼻息肉的复发情况，分析鼻息肉复发与炎性因子、炎性细胞计数及鼻腔微生物多样性特征的相关性。对二分类变量采用卡方检验，对连续变量采用Mann-Whitney U检验，两组之间平均相对丰度的差异比较采用Wilcoxon秩和检验。结果:随访1年时复发患者12例，其中男5例，女7例。复发组与未复发组患者在年龄、性别、哮喘、变应性鼻炎、湿疹等方面的差异无统计学意义。复发组的鼻部症状总分［42.3（30.2，67.1）， M（ Q1， Q3），后同］明显高于未复发组［37.8（29.4，50.3）］， Z=-4.930， P<0.001。鼻息肉组织中，复发组患者嗜酸粒细胞［40.83（22.33，102.00）个/HP，HP为高倍视野，后同］和中性粒细胞［30.83（20.33，56.44）个/HP］数量显著高于未复发组［13.72（13.50，48.33）个/HP和18.50（12.00，26.08）个/HP， Z值分别为-6.997、-8.243， P值均<0.001］。复发组IFN-γ、IL-17A、IL-17E、IL-18的表达量明显高于未复发组，但阳性率差异无统计学意义。属水平上，未复发组患者鼻腔棒状杆菌属的平均相对丰度为（11.90±20.31）%，高于复发组的（0.15±0.20）%，但校正后差异无统计学意义（FDR P=0.638）。未复发组葡萄球菌属平均相对丰度为（8.17±27.70）%，低于复发组的（8.99±15.89）%，但校正后差异无统计学意义（FDR P=0.638）。 结论:CRSwNP患者中性粒细胞介导的炎性反应与鼻息肉复发密切相关。鼻内镜术后鼻息肉的复发可能与保护性微生物丰度的减少和致病微生物数量的增加有关。

马红球菌是人类机会致病菌，偶见于艾滋病或恶性肿瘤患者。非艾滋病患者肺部感染该菌并形成占位性病变非常罕见，临床、影像及病理医师对其普遍认识不足，易误诊为各种肿瘤。本文报道1例患有自身免疫性贫血的患者，因咳嗽行胸部CT检查发现右肺下叶占位性病变，考虑恶性病变可能性大，遂行外科手术切除。镜下组织学和免疫组织化学提示病变由大量增生的组织细胞构成。特殊染色、电镜均查见组织细胞胞质内含有大量的短棒状杆菌。最后经微生物宏基因组二代测序以及微生物培养确诊该病原体为马红球菌。

探索SLE患者的肠道菌群特征，并进一步挖掘SLE的菌群与CD4 +T细胞亚群和疾病活动情况的关系。 方法:收集96例SLE患者和96例性别和年龄匹配的健康对照（HC）的粪便样本。采用16s rRNA测序法检测肠道菌群，流式细胞仪检测外周血Th1、Th2、Th17、Treg等CD4 +T细胞亚群。同时记录患者的ESR、CRP、血红蛋白（Hb）、补体C3和C4等疾病活动指标，并记录每位患者的SLEDAI。利用edgeR算法进行差异丰度分析。采用Wilcoxon秩和检验比较各组间的alpha多样性指数、细菌丰度和F/B比值。采用R软件4.0.1进行统计学分析，采用Pearson相关分析评估样品中细菌属相对丰度与血清ESR、CRP、C3和C4水平、CD4 +T细胞亚群之间的相关性。 结果:与HC相比，SLE肠道菌群的丰度（ACE和Chao1）和多样性（Shannon和Simpson）指数显著降低。通过edgeR算法，发现SLE和HC之间的肠道菌群差异有统计学意义。与HC相比，SLE患者在属水平上有24种细菌差异有统计学意义（ P<0.05）。相关性分析提示：CRP与粪球菌属（ Coprococcus）有显著正相关性（ r=0.30， P=0.014）；C4与棒状杆菌（ Corynebacterium）（ r=0.31， P=0.013）和粪杆菌属（ Faecalibacterium）（ r=0.25， P=0.048）呈正相关，血红蛋白与摩根菌属（ Morganella）（ r=0.41， P=0.001）呈正相关；而疾病整体活动度与棒状杆菌属呈正相关关系（ r=0.25， P=0.047）。B细胞（ r=0.52， P=8.45×10 -6）、Treg细胞（ r=0.26， P=0.036）与挑剔真杆菌（ Eubacterium eligens group）呈正相关关系，CD8 +T细胞（ r=0.20， P=0.034）、CD4 +T（ r=0.32， P=0.010）细胞、NK细胞（ r=0.56， P<0.001）与棒状杆菌呈正相关关系，除此之外，Th1与大肠志贺杆菌（ Escherichia Shigella）（ r=0.33， P=0.008）呈正相关关系，Th2与Dielma （ r=0.51， P<0.001）呈正相关。 结论:SLE患者肠道菌群的丰度和多样性显著降低，多种差异表达的菌与患者的CD4 +T淋巴细胞亚群和疾病活动指标密切相关。