-
脓毒血症患者急性肺损伤的差异基因表达分析
编辑人员丨4天前
目的:借助生物信息学分析脓毒血症患者急性肺损伤(ALI)的差异基因,为临床的进一步研究提供理论支持。方法:首先下载基因芯片数据集GSE10474,并使用limma包对数据进行了标准化处理,接着利用贝叶斯算法筛选脓毒血症和ALI的差异靶点基因并对其结果进行可视化处理,之后利用R的ClusterProfile包对所筛选出的差异基因进行功能注释(GO)和通路分析(KEGG),最后借助string数据库和cytoscape软件对差异基因进行蛋白互作网络分析并构建及识别网络中的核心驱动基因。结果:脓毒血症合并ALI组( n=13)和单纯脓毒血症组( n=21)数据经标准化处理前,其基线较为紊乱,而在进行标准化处理后,基线基本趋于一致。初步筛选出73个差异基因(45个上调基因和28个下调基因)。前10个差异基因中,上调基因为BTNL8、CDKN1A、TREM1、TAK1、H4FH,下调基因为CYBRD1、HOPX、UPB1、NME8、FAR2;且前10个差异基因在脓毒血症患者和脓毒血症合并ALI患者中的表达差异有统计学意义。GO富集分析可见这些差异基因主要富集在反式高尔基网络膜、细胞膜腔侧以及IRE1介导的未折叠蛋白反应中。KEGG分析其通路信号有3条,即ZAP-70酪氨酸激酶、CD3和TCR Zeta链的磷酸化以及PD-1信号通路。string数据库和cytoscape软件分析发现FCGR2B、HLA-DQB1、HLA-DRA、CD74、CD86、CD4、SEC31A与其他基因存在较强的互作关系。 结论:应用生物信息学可有效分析脓毒血症患者合并ALI的差异基因,为研究脓毒血症的发病机制提供一定方向。
...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
-
产前诊断嵌合型双着丝粒染色体1例
编辑人员丨4天前
39岁,G 2P 1,因孕16周B超提示胎儿室间隔缺损、肺动脉狭窄、颈部水囊瘤、脉络丛囊肿、双肾积水(图1)于2022年10月于义乌市妇幼保健院产前诊断中心就诊。孕妇既往体健,否认近亲结婚以及有毒、有害物质接触史。在签署知情同意书后,于孕18周对孕妇进行羊膜腔穿刺,常规进行G显带核型及染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)。核型分析提示胎儿为罕见的嵌合型双着丝粒染色体45,X,dic(X;18)(p11.2;p11.2)[31]/45,X[26](图2)。CMA检测结果为arr[GRCh37] 18p11.32p11.21(136228_15181208)×1-2;arr[GRCh37] Xp22.33p11.22(168552_52154982)×1;arr[GRCh37] Xp11.22q28(52705315_155233098)×1-2,均判断为致病性。结合CMA以及染色体G显带及C-显带分析的结果,胎儿被确定为双着丝粒染色体dic(X;18)(p11.2;p11.2)(图3)。夫妻经遗传咨询后于选择于孕23周终止妊娠。本研究通过了本院伦理委员会的审查(批准号:A00016)。
...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
-
基于网络药理学和动物体内试验验证云实感冒合剂对呼吸道合胞病毒作用
编辑人员丨4天前
目的:基于网络药理学和体内试验探讨云实感冒合剂抗呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)的作用机制。方法:网络药理学预测:运用TCMSP、GeneCards等数据库预测云实感冒合剂干预RSV的活性成分及作用靶点。利用Cytoscape 3.2.1软件构建中药成分-疾病靶点网络图。通过STRING数据库分析蛋白质相互作用关系。借助Metascape数据库进行富集分析。采用分子对接技术分析验证网络药理学结果。云实感冒合剂干预RSV感染验证试验:滴鼻法建立RSV小鼠模型,灌胃合剂后检测血常规、肺指数,观察肺组织病理变化,流式细胞术检测外周血T细胞亚群,ELISA检测血清TNF-α、IL-6、IL-1β含量,RT-PCR检测肺组织中TLR4、NF-κB和RSV-N基因mRNA相对水平。结果:分析获得云实感冒合剂有效活性成分41个,抗RSV靶点111个,富集得到167条信号通路,主要是PI3K/AKT、MAPK、Toll-like等信号通路。分子对接结果显示,云实感冒合剂活性成分木犀草素、山奈酚、槲皮素与RSV-G、RSV-F、PI3K、AKT1、Bcl-2结合能均小于0 kcal/mol。体内试验结果显示,与RSV组相比,云实感冒合剂高剂量组白细胞、淋巴细胞计数升高、肺指数降低,差异有统计学意义( P<0.05)。HE染色显示RSV组肺组织增生,肺泡壁变厚,间质内有炎性细胞浸润,利巴韦林组和云实感冒合剂低、中、高剂量组中肺泡大小趋向均匀,肺泡壁厚度均一。与RSV组相比,云实感冒合剂低、中、高剂量组的CD3 +、CD4 +、CD8 + T淋巴细胞数量明显升高,CD4 +/CD8 +T细胞数量比值降低,血清中TNF-α、IL-6、IL-1β含量下降,肺组织中病毒载量和TLR4、NF-κB mRNA水平降低,差异均具有统计学意义( P<0.05)。 结论:云实感冒合剂通过多成分、多靶点、多通路发挥调控RSV感染,主要通过缓解肺组织病理损伤,减轻炎症反应,其机制可能与抑制TLR4/NF-κB通路激活有关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
-
基于细胞通讯探讨免疫细胞分化相关肺泡—毛细血管屏障损伤对脓毒性ARDS的影响
编辑人员丨4天前
目的:探讨免疫细胞分化对脓毒性ARDS肺泡-毛细血管屏障损伤的影响。方法:基于转录组数据构建脓毒性ARDS的WGCNA网络,并筛选ARDS相关基因(ARDS-related genes,ARGs)。基于单细胞测序数据构建脓毒性ARDS分化轨迹和细胞通讯,并筛选免疫分化相关基因(immunodifferentiation-related genes,IDRGs)。Lasso回归分析构建ARDS的免疫相关风险评分(risk Score,RS)。ESTIMATE、CIBERSORT和ssGSEA评估免疫微环境。Metascape、GSVA和GO富集分析展示信号通路和生物学过程。结果:免疫细胞、成纤维细胞和内皮细胞通过24条信号通路进行细胞通讯。由DSTN、SNRPA和FGL2组成的RS在正常、单纯脓毒症和脓毒性ARDS的患者中差异表达,涉及免疫细胞、内皮细胞和成纤维细胞的分化,影响脓毒性ARDS的免疫浸润和免疫功能。脓毒性ARDS相关免疫细胞包含记忆B细胞、浆细胞、CD8 +T和M0。DSTN与M0负相关( r=-0.29, P<0.05),SNRPA与CD8 +T正相关( r=0.28, P<0.05),FGL2与记忆B细胞正相关( r=0.32, P<0.05)。RS组间差异表达的免疫细胞包括CD4幼稚型T细胞、CD4记忆激活T细胞、调节T细胞、γ-δ T细胞、M0、激活的树突状细胞。富集分析提示DSTN、SNRPA和FGL2的差异表达影响了免疫细胞的分化、免疫功能的激活、抗原的呈递,以及肌动蛋白丝的解聚/切断。 结论:DSTN、SNRPA和FGL2通过调控免疫细胞、成纤维细胞和内皮细胞的分化,影响脓毒性ARDS的免疫性肺泡-毛细血管屏障损伤,是预测脓毒性ARDS进展的潜在标志物。
...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
-
脓毒症外源性ARDS关键基因及信号通路的转录组学分析
编辑人员丨4天前
目的:分析脓毒症外源性急性呼吸窘迫综合征(ARDS)大鼠的差异表达基因(DEG),从转录组水平探讨脓毒症ARDS的早期诊断及防护机制。方法:将12只6~8周龄雄性SD大鼠按随机数字表法分为脂多糖(LPS)致脓毒症ARDS模型组(模型组,腹腔注射LPS 15 mg/kg)与对照组(腹腔注射等量生理盐水),每组6只。分别提取两组大鼠左肺组织RNA,采用illumina Hiseq测序平台的双端测序模式进行高通量测序。采用DESeq2软件以| log 2差异倍数(FC)|≥3且 P<0.001筛选DEG。对DEG进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)通路富集分析。使用STRING在线数据库和CytoScape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并筛选关键基因。分离并提取2021年3月至11月连云港市第一人民医院急危重症医学部收治的20例脓毒症患者及20例年龄匹配的同期健康体检者的外周血单个核细胞(PBMC),采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)对关键基因进行验证。 结果:共筛选出DEG 286个,其中上调基因202个,下调基因84个。GO富集分析表明,DEG主要参与了中性粒细胞趋化迁移、抗菌体液反应、宿主免疫应答及体液免疫反应等生物学过程;KEGG富集分析显示,DEG主要通过参与白细胞介素-17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路及趋化因子信号通路发挥生物学作用。PPI分析共筛选出节点蛋白262个,相互作用关系852条边;筛选出前15位关键基因,分别为IL-6、TNF、IL-10、IL-1β、CXC趋化因子配体1(CXCL1)、CXCL10、CXC趋化因子受体3(CXCR3)、CXCR2、CXCL9、CC趋化因子配体7(CCL7)、CXCL11、CCL1、CXCL13、CCL12、CCL22。采用RT-qPCR对脓毒症ARDS患者与健康对照者PBMC进行差异基因测序验证,结果显示,脓毒症患者5个代表性关键基因表达明显高于健康对照者〔IL-6 mRNA(2 -ΔΔCt):2.803±1.081比0.951±0.359,TNF mRNA(2 -ΔΔCt):2.376±0.799比1.150±0.504,CXCL10 mRNA(2 -ΔΔCt):2.500±0.815比1.107±0.515,CXCR3 mRNA(2 -ΔΔCt):1.655±0.628比0.720±0.388,CCL22 mRNA(2 -ΔΔCt):1.804±0.878比1.010±0.850,均 P<0.05〕,与RNA测序结果一致。 结论:炎症细胞趋化迁移脱颗粒、细胞因子免疫应答反应等生物学过程和CXCL10/CXCR3、IL-17等信号通路在脓毒症外源性ARDS发生发展过程中起着重要的作用,可作为进一步研究肺损伤机制和临床防治的新思路及新靶点。
...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
-
脓毒症科学计量学图谱特征
编辑人员丨4天前
目的:阐明我国在脓毒症领域的研究内容、当下热点及未来趋势等相对完整的知识体系,以帮助重症领域学者把握其科研方向与临床重心。方法:基于科学网(Web of Science)来源数据,筛选出1985至2019年我国脓毒症研究的关联文献;借助CiteSpace 5.6.R2和VOSviewer 1.6.13可视化软件,运用数据挖掘、信息处理和知识计量方法,绘制脓毒症研究的网络知识图谱,呈现脓毒症相关研究内容,分析我国脓毒症研究的历史演变进程并预测其发展趋势。结果:共纳入我国学者发表的有关脓毒症论著及综述类文献8 189篇,1985至2019年我国脓毒症发文量逐年递增,2019年达发文高峰(1 276篇)。在研究方法上,形成了以脓毒症流行病学研究和动物实验为中心的两大支撑点。通过聚类分析发现,脓毒症研究热点主要集中在脓毒性大鼠、坏死性小肠结肠炎、脓毒症相关性脑病、急性肾损伤、肠源性脓毒症和炎性介质六大主题,涉及肠、脑、肝、肾等器官损伤的科研工作较多,而心、肺研究较为边缘化。此外,基于突现关键词强度与时间,内毒素、内毒素休克等为持续关注热点,炎症、免疫、多器官功能障碍综合征(MODS)关联研究为核心研究热点,诊断、化学疗法等综合管理为新增研究热点。结论:我国脓毒症研究现状偏于动物实验、流行病学等基础层面,其研究内容多围绕炎症反应、免疫功能或某一器官功能障碍展开。预测在流行病学、诊断、危险因素、发病机制、治疗等科研基础上,有关儿童脓毒症、MODS相关器官损伤机制和干预挖掘,以及中西医结合实行综合管理脓毒症研究或为未来研究方向。
...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
-
早产儿巨细胞病毒感染致败血症样综合征的临床分析
编辑人员丨4天前
目的:探讨早产儿巨细胞病毒感染致败血症样综合征(CMV-SLS)的临床特征及预后,为临床早期识别和治疗提供参考。方法:选取2019年1月1日至2022年12月31日郑州大学附属儿童医院收治的CMV-SLS早产儿为研究对象,对其临床特征、治疗及预后进行回顾性分析。结果:共纳入CMV-SLS早产儿7例,胎龄为(26.8±1.2)周,出生体质量为(890±121) g;发病日龄为55(45, 60) d,诊断日龄为67(56,71) d。7例早产儿出生后均采用纯母乳喂养,诊断CMV-SLS时母乳巨细胞病毒(CMV) DNA均阳性。常见的临床特征为发热、腹胀、肝功能损伤,中性粒细胞计数和血小板计数减少,主要引起肺炎、新生儿坏死性小肠结肠炎、听力损害和脉络膜视网膜炎。7例早产儿诊断明确后均给予静脉制剂更昔洛韦和口服制剂缬更昔洛韦序贯治疗,疗程为5~7周。2例早产儿采用更昔洛韦玻璃体注射治疗脉络膜视网膜炎。7例早产儿均存活,校正胎龄12月龄时随访发现1例智力和运动发育均落后,2例出现运动发育落后,其余均发育正常。结论:早产儿CMV-SLS主要发生于超低出生体质量儿,临床表现不典型,易误诊。接受CMV DNA阳性母乳喂养的超低出生体质量儿如出现败血症样症状,应考虑CMV感染的可能,早期诊断和治疗能防止不良结局发生。
...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
-
非编码RNA在砷毒性作用中调控机制的研究进展
编辑人员丨4天前
砷是一种非金属元素,国际癌症研究机构已经明确砷及其化合物是致癌物质。砷及其化合物可经呼吸道、皮肤和消化道吸收,分布于肝、肾、肺以及皮肤中,并对其造成损伤。而非编码RNA与砷所致神经系统紊乱、细胞坏死、生殖毒性和癌变等密切相关。近年来,非编码RNA中的微小RNA(miRNAs)、长链非编码RNA(lncRNAs)和环状RNA(circRNAs)在砷诱导的各种疾病中的网络调控已成为新的研究领域。本文通过总结已有的科研成果,对miRNAs、lncRNAs和circRNAs在砷毒性中的作用机制进行阐述,为砷中毒的防治提供基础资料和理论依据。
...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
-
基于网络药理学和动物实验探讨三阳合治法治疗流感的作用及机制
编辑人员丨4天前
目的:探讨基于三阳合治法的麻杏石甘汤合小柴胡汤治疗流感的治疗作用及潜在靶点、作用机制。方法:基于TCMSP数据库筛选麻杏石甘汤合小柴胡汤的活性成分及靶点,通过OMIM、Genecards、DisGeNET及TTD数据库获取流感相关靶点,取二者交集得到共同靶点,导入STRING数据库,构建蛋白互作网络,筛选药物治疗流感的关键靶点。通过DAVID数据库,对共同靶点进行富集分析。基于CytoScape3.9.0平台构建成分-流感靶点-通路网络图。应用Sailvina对关键靶点与主要活性成分进行对接验证。同时构建流感病毒性肺炎动物模型,验证三阳合治法对流感小鼠肺指数、肺组织病理损伤及炎性损伤的保护作用。结果:共检索并筛选到麻杏石甘汤合小柴胡汤活性成分184种,靶点316个,流感靶点2 894个,二者共同靶点152个,构建PPI网络筛选关键靶点有AKT1、STAT3、TNF等。GO和KEGG富集分析提示,麻杏石甘汤合小柴胡汤可能是通过调节IL-17、TNF、Toll样受体等信号通路治疗流感。分子对接显示,关键靶点与主要活性成分具有较好的结合能力。动物实验表明,麻杏石甘汤合小柴胡汤能改善病毒性肺炎小鼠体重下降、肺指数及肺组织炎症情况,并改善肺组织病理损伤、血清CCL3、CCL5因子水平。结论:三阳合治法对于流感病毒性肺炎小鼠具有较好的保护作用,可通过多靶点、多通路发挥抗病毒作用。
...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
-
基于网络药理学和整体动物实验探讨凉膈散通过ERK1/2与PI3K/AKT通路治疗脓毒症急性肺损伤
编辑人员丨4天前
目的:探讨凉膈散对脓毒症大鼠急性肺损伤(ALI)的保护作用及其机制。方法:于2021年4至12月,采用网络药理学方法对凉膈散成分及其抗脓毒症ALI的靶点进行分析,富集相关信号通路。将90只雄性SD大鼠随机分为假手术组,脓毒症ALI模型组(模型组),凉膈散低、中、高剂量组。其中,假手术组10只,其他4组每组20只。采用盲肠穿孔结扎法(CLP)建立大鼠脓毒症ALI模型。假手术组:灌胃生理盐水2 ml,不进行盲肠结扎穿孔手术;模型组:进行手术且灌胃生理盐水2 ml;凉膈散低、中、高剂量组:进行手术且分别灌胃凉膈散3.9、7.8、15.6 g/kg。检测大鼠肺组织湿/干质量比,评价肺泡毛细血管屏障通透性。HE染色观察大鼠肺组织病理形态表现,ELISA法检测肺泡灌洗液中肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素(IL)-6和IL-1β浓度,蛋白免疫印迹法检测p-磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)、p-蛋白激酶B(AKT)、p-细胞外调节蛋白激酶(ERK)相对蛋白表达水平。结果:通过网络药理学筛选出凉膈散177个活性成分,抗脓毒症ALI靶点88个。GO功能富集到354个条目,KEGG富集到基因通路108条。PI3K/AKT信号通路在凉膈散抗脓毒症ALI中起重要作用。与假手术组比较,模型组大鼠肺组织湿/干质量比(6.35±0.95)增加( P<0.001),HE染色可见模型组大鼠肺组织正常结构破坏,肺泡灌洗液IL-6[(392.36±66.83)pg/ml]、IL-1β[(137.11±26.83)pg/ml]、TNF-α[(238.34±59.36)pg/ml]含量升高( P<0.001、=0.001、<0.001),肺组织中p-PI3K、p-AKT、p-ERK1/2蛋白表达水平(1.04±0.15、0.51±0.04、2.31±0.41)升高( P=0.002、0.003、0.005)。与模型组比较,凉膈散各剂量组肺组织病理改变较轻,凉膈散中剂量组肺组织湿/干质量比(4.29±1.26)降低( P=0.019), TNF-α含量[(147.85±39.05)pg/ml]降低( P=0.022),p-PI3K(0.37±0.18)、p-ERK1/2(1.36±0.07)相对蛋白表达水平降低( P=0.008、0.017);高剂量组肺组织湿/干质量比(4.16±0.66)降低( P=0.003),IL-6、IL-1β、TNF-α含量[(187.98±53.28)pg/ml、(92.45±25.39)pg/ml、(129.77±55.94)pg/ml]降低( P=0.001、0.027、0.018),p-PI3K、p-AKT、p-ERK1/2相对蛋白表达水平(0.65±0.05、0.31±0.08、1.30±0.12)降低( P=0.013、0.018、0.015)。 结论:凉膈散对脓毒症ALI大鼠具有治疗作用,其机制可能与抑制肺组织ERK1/2与PI3K/AKT通路激活有关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前