目的:探讨粪菌移植治疗IBS的有效性、安全性及其对IBS患者肠道菌群的影响。方法:选择2016年9月至2017年8月在广州市第一人民医院行粪菌移植的IBS住院患者28例。所有IBS患者于粪菌移植前、粪菌移植后4和12周完成肠易激综合征生活质量量表(IBS-QOL)、肠易激综合征严重程度系统评分(IBS-SSS)和胃肠道症状分级(GSRS)评分。IBS患者粪菌移植前和粪菌移植后4周行16S rDNA测序，从门、科、属水平分别分析粪菌移植对IBS患者肠道菌群多样性和菌群结构的影响，进一步应用线性判别分析效应量(LEfSe)筛选差异菌属。采用配对 t检验和配对秩和检验进行统计学分析。 结果:粪菌移植后12周，IBS-QOL心境恶劣、行为障碍、自体意象、健康担忧、进食逃避和关系拓展6个维度的评分均低于粪菌移植前[分别为43.750分(22.656分，56.250分)比48.438分(32.031分，60.938分)、37.500分(18.750分，56.250分)比46.429分(21.429分，62.500分)、31.250分(14.063分，42.188分)比31.250分(18.750分，50.000分)、41.667分(27.083分，56.250分)比50.000分(41.667分，66.667分)、54.167分(43.750分，72.917分)比66.667分(58.333分，83.333分)、8.333分(0.000分，33.333分)比16.667分(8.333分，33.333分)]，差异均有统计学意义( Z＝-2.157、-3.429、-2.274、-3.197、-3.042、-2.329， P均<0.05)。粪菌移植后12周，IBS-QOL行为障碍和关系拓展2个维度的评分均低于粪菌移植后4周[分别为37.500分(18.750分，56.250分)比39.286分(19.643分，62.500分)和8.333分(0.000分，33.333分)比16.670分(2.083分，41.667分)]，差异均有统计学意义( Z＝-1.998、-2.110， P均<0.05)。粪菌移植后4和12周的IBS-SSS、GSRS评分均低于粪菌移植前[(190.32±106.51)、(201.43±102.48)分比(245.93±86.10)分和5.50分(4.00分，9.00分)、5.50分(4.00分，8.75分)比7.00分(6.00分，9.75分)]，差异均有统计学意义( t＝4.402、3.848， Z＝-3.081、-3.609； P均<0.01)。粪菌移植后患者均无严重不良反应发生。门水平中，粪菌移植后IBS患者粪便中疣微菌门的丰度高于粪菌移植前(6.74%比0.37%)；科水平中，粪菌移植后IBS患者粪便中疣微菌科的丰度高于粪菌移植前(6.74%比0.37%)；属水平中，粪菌移植后IBS患者粪便中艾克曼菌的丰度高于粪菌移植前(6.74%比0.37%)，差异均有统计学意义( Z均＝-2.589， P均＝0.010)。LEfSe法发现，粪菌移植后4周，IBS患者肠道菌群中艾克曼菌的丰度高于粪菌移植前(6.74%比0.37%)，差异有统计学意义(线性判别分析值＝4.5， P＝0.049)。 结论:初步证实粪菌移植治疗IBS安全、有效，其作用机制可能是通过上调IBS患者肠道菌群多样性和改变菌群结构发挥疗效。

目的:探讨七氟烷麻醉致认知功能障碍模型老龄小鼠肠道菌群变化及NLRP3炎性小体的作用机制。方法:将18只14月龄雄性SPF级C57BL/6J鼠按照体质量相匹配原则分为对照组和七氟烷组，每组9只。七氟烷组小鼠接受3%七氟醚麻醉，2 h/d，持续3 d。造模24 h后，收集2组小鼠的粪便进行16S rRNA测序，随后进行Morris水迷宫实验检测小鼠的认知能力。用Western blot检测小鼠海马突触相关蛋白、NOD样受体蛋白3(NOD-like receptor protein 3 inflammasome，NLRP3)炎性小体相关蛋白，结肠NLRP3炎性小体相关蛋白的表达。高尔基染色法观察海马区树突棘的数量。qPCR法检测小鼠结肠组织及海马组织炎性细胞因子白介素1β(interleukin-1β，IL-1β)、白介素18(interleukin-18，IL-18)、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor alpha，TNF-α)mRNA的表达。用GraphPad Prism 7软件进行统计分析，组间比较采用 t检验。 结果:(1)Morris水迷宫结果显示，在定位航行训练期间，七氟烷组逃避潜伏期长于对照组，第5天时差异具有统计学意义( P<0.05)；空间探索实验中，七氟烷组逃避潜伏期高于对照组[(49.50±9.99)s，(18.67±7.63)s； t＝6.005， P<0.001]，平台穿越次数[(0.83±0.75)次，(2.33±1.03)次； t＝2.87， P＝0.017]低于对照组。(2)Western blot和高尔基染色结果显示，七氟烷引起海马突触相关蛋白表达及树突棘数目明显减少( P<0.05)。(3)16S rRNA测序结果显示，2组β多样性存在显著差异( P<0.05)。与对照组相比，七氟烷组潜在致病菌脱硫杆菌门及脱硫弧菌属多( P<0.05)，有益菌疣微菌门及阿克曼菌属少( P<0.05)。(4)qPCR结果显示，七氟烷组小鼠结肠和海马组织炎性细胞因子TNF-α、IL-1β mRNA表达均高于对照组(均 P<0.05)；Western blot结果显示，七氟烷组结肠和海马组织NLRP3炎性小体相关蛋白水平高于对照组(均 P<0.05)；组织免疫荧光结果显示，七氟烷组海马DG区ASC表达水平高于对照组( P<0.01)。 结论:七氟烷所致认知功能障碍模型老龄小鼠出现神经炎性反应和突触损伤，这可能与肠道菌群失调及NLRP3炎性小体的激活有关。

目的:了解获得性免疫缺陷综合征（AIDS）合并感染性葡萄膜炎患者眼内液病原微生物分布情况。方法:回顾性病例研究。2018年6月至2019年12月于上海市公共卫生临床中心住院或门诊就诊的AIDS合并感染性葡萄膜炎患者31例纳入研究。其中，男性30例，女性1例；平均年龄（38.51±11.17 ）岁。全葡萄膜炎20例，后葡萄膜炎10例，感染性眼内炎1例。同期血清CD4 +T淋巴细胞计数（CD4 +TC）0~239个/μl。采用二代基因测序技术对采集的眼内液进行检测。31份标本中，房水、玻璃体液分别为27、4份。 结果:31份标本中，检测到巨细胞病毒（CMV）18份（58.1%，18/31 ）；水痘-带状疱疹病毒（VZV）5份（16.1%，5/31）；Epstein-Barr病毒（EBV）9份（29.0%，9/31 ）；人类β疱疹病毒6型（HHV6）3份（9.7%，3/31 ），人乳头状软疣病毒（HPV ）、人多瘤病毒、庚型肝炎病毒各1份（3.2%，1/31 ），均与其他微生物共存；细环病毒8份（25.8%，8/31 ）；梅毒螺旋体5份（16.1%，5/31 ）；刚地弓形虫和哈蒙哈蒙球虫1份（3.2%，1/31）；Synitelium Polycarpum 1份（3.2%，1/31 ）；结核分支杆菌复合群、真菌、微杆菌共存1份（3.2%，1/31）。CMV 18份标本中，基因序列数>10 5 9份（50.0%），10 4～10 5 5份（27.7%）。VZV 5份标本中，基因序列数>10 4 4份（80.0% ）。结核分支杆菌复合群、真菌、微杆菌共存的1份标本，基因序列数均<100。所有标本中读取到的HHV6、HPV、人多瘤病毒、庚型炎病毒、细环病毒基因序列数均较低。31份标本中，检测到病原微生物≥2种15份（48.4% ）。 结论:CMV、VZV是血清CD4 +TC <100个/μl AIDS患者感染性葡萄膜炎的主要致病微生物；梅毒螺旋体、刚地弓形虫或其他原虫、结核杆菌、真菌引起的感染性葡萄膜炎更常见于血清CD4 +TC>100个/μl的AIDS患者。合并感染性葡萄膜炎的AIDS患者眼内液中可检测到2种或以上微生物共存。

目的:探讨游泳池肉芽肿的临床病理特征。方法:回顾性分析2018年1月至2021年1月天津市中医药研究院附属医院56例游泳池肉芽肿的临床及病理特点。结果:56例患者中，男16例，女40例，平均年龄60.84岁。水产从业人员及居民日常烹饪中处理受感染的鱼或海产品是本组病例感染的主要暴露方式（31/56），平均潜伏期4.58周，平均诊断时间为3.19个月；56例患者皮损均位于上肢，以红斑、丘疹结节为主，有时表现为脓疱、溃疡、肉芽肿或疣状斑块。单发孤立性皮损11例，36例表现为孢子丝菌病串珠样皮损，6例表现为双侧串珠样皮损。组织病理学上除4例无特异性改变外，52例患者表现为感染性肉芽肿，其中37例出现特征性的渗出坏死，中央为不等量的纤维素样渗出或坏死物，其内或周边伴随大量中性粒细胞、组织细胞及多核巨细胞浸润。56例病原微生物宏基因组DNA测序均检测到海分枝杆菌序列。结论:天津地区游泳池肉芽肿以老年女性患病为主，处理受感染的鱼或海产品是最主要的暴露方式，组织病理可表现为特征性的渗出坏死性肉芽肿。

目的:分析菌群移植（FMT）治疗脑出血继发急性肠假性梗阻（AIPO）患者的临床效果。方法:分析南方医科大学南方医院收治的1例脑干出血继发AIPO患者的临床资料，比较粪菌制剂供者与患者主要菌群组成，以及患者FMT治疗前和治疗后第25天菌群的变化情况。结果:该患者主要表现为严重腹胀、肠管扩张及腹腔高压，常规保守治疗1周仍无法缓解，并逐渐加重至影响呼吸功能，粪便菌群分析提示肠道菌群失调，遂尝试FMT挽救性治疗。经FMT治疗，患者消化道症状缓解明显；FMT后25 d随访，该患者未再次出现消化道症状；复查粪便菌群分析提示定植于肠道的菌群以益生菌阿克曼菌、双歧杆菌为主，潜在的促炎及产气菌明显减少，菌群多样性增加。患者在FMT治疗后的25 d部分菌群组成趋向于与供者一致；在门水平上，拟杆菌门、疣微菌门、厚壁菌门和放线菌门细菌大幅增加，变形菌门比例大幅下降；在纲水平上，疣微菌纲、拟杆菌纲、放线菌纲、红蝽菌纲和梭状芽孢杆菌均明显增加，丙型变形菌纲明显减少；在目水平上，拟杆菌目、疣微菌目、梭菌目、红蝽菌目增加，β-变形菌目和肠杆菌目减少；在科水平上，双歧杆菌科、阿克曼菌科、瘤胃菌科增加，肠杆菌科减少；在属水平上，阿克曼菌、双歧杆菌增加，埃希-志贺菌和克雷伯菌水平减少。1年后随访，该患者已生活自理，格拉斯哥预后评分（GOS）5分。结论:FMT治疗对脑出血继发AIPO患者可能有较好疗效，其可能是通过调节患者的肠道菌群，重建适宜的肠道屏障，从而维持肠道微生态的稳定。

目的:研究IgA肾病（IgA nephropathy, IgAN）患者肠道菌群结构及多样性的特点，探讨IgAN患者肠道微生物与临床指标及肾脏病理的相关性。方法:回顾性选择包头医学院第一附属医院2020年5月至2020年9月IgAN患者15例作为IgAN组，健康家属8例和健康体检者7例作为健康对照组。采用Illumina高通量测序技术对粪便样本中所有细菌的16S rDNA-V4区进行DNA测序，使用QIIME2分析流程对原始序列进行处理、分析，与Greengenes（v138）数据库进行对比，调用DADA2软件包对数据进行去噪，相当于以100%的相似度聚类（OTU是以97%的相似度聚类）。采用PCoA主坐标分析法分析肠道菌群结构及多样性，以Spearman相关分析法或Pearson相关分析法分析差异性菌群与肾脏病理和临床指标的相关性。结果:（1）健康对照组和IgAN组肠道微生物Beta多样性差异具有统计学意义（ P=0.010）。（2）与健康对照组比较，IgAN组患者肠道菌群物种数目在1个门、3个科和22个属水平显著增加。与健康对照组比较，在门到科水平内，IgAN患者厚壁菌门（Firmicutes）及瘤胃球菌科（Ruminococcaceae）物种数目减少，绿屈挠菌门（Chloroflexi）及盖勒菌科（Gaiellaceae）、葡萄球菌科（Staphylococcaceae）和Family-XⅢ科物种数目增加（均 P<0.05）；在属水平，IgAN患者舌下肌菌属（ Subdoligranulum）物种数目显著减少（ P=0.020），而活泼瘤胃球菌属（ Ruminococcus- gnavus- group）物种数目显著增加（ P=0.004）。（3）在门水平，IgAN患者厚壁菌门物种数目与血白蛋白（ r=0.637， P=0.003）、IgG（ r=0.452， P=0.046）呈正相关，芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）物种数目与血肌酐呈负相关（ r=-0.453， P=0.045），疣微菌门（Verrucomicrobia）物种数目与IgM呈负相关（ r=-0.450， P=0.046），杆菌门（Patescibacteria）物种数目与IgA呈正相关（ r=0.469， P=0.037）。在属水平，IgAN患者活泼瘤胃球菌属（ r=-0.614， P=0.004）和巨单胞菌属（ Megamonas）（ r=-0.451， P=0.042）物种数目与血白蛋白呈负相关；舌下肌菌属物种数目与血白蛋白呈正相关（ r=0.563， P=0.009）；戴阿利斯特杆菌属（ Dialister）物种数目与补体C3呈负相关（ r=-0.427， P=0.041），与IgA呈正相关（ r=0.434， P=0.035）；韦荣菌属（ Veillonella）物种数目与估算肾小球滤过率呈正相关（ r=0.452， P=0.043）。艾森伯格菌属（ r=-0.850， P=0.007）、霍尔德曼菌属（ r=-0.845， P=0.008）、 Flavonifractor（ r=-0.845， P=0.008）、葡萄梭状芽孢杆菌属9（ r=-0.845， P=0.008）物种数目与牛津病理分型中肾小球节段性硬化或粘连（S）呈负相关， Fusicatenibacter物种数目与系膜细胞增多呈负相关（ r=-0.845， P=0.008），而粪球菌属2物种数目与S（ r=0.738， P=0.037）和肾小管萎缩或间质纤维化（ r=0.756， P=0.030）呈正相关。（4）以活泼瘤胃球菌属和舌下肌菌属建立随机森林模型，拟合后受试者工作特征曲线下面积为0.927。 结论:IgAN患者和健康对照的肠道菌群具有差异性，IgAN患者肠道菌群的变化与其临床指标和肾脏病理相关，尤其活泼瘤胃球菌属和舌下肌菌属可能在IgAN中发挥了重要作用。

目的:探讨食管癌患者食管微生态状况，并比较其与健康人群食管菌群的差异。方法:选择2018年7月至2019年7月在十堰市太和医院就诊的82例食管癌患者和同期年龄、性别相匹配的20名健康对照者，30份食管癌病理组织根据分化程度分为低分化(8份)、中分化(9份)和高分化(13份)。采集食管癌患者和健康对照者的食管组织样本，提取样本DNA，对细菌16S rRNA V4区域行PCR扩增。运用Illumina HiSeq 4000测序平台测序，行α多样性分析和主坐标分析(PCoA)，采用线性判别分析效应量(LEfSe)的线性判别分析(LDA)值筛选差异物种，ROC曲线验证随机森林模型，BugBase数据库预测食管细菌表型。采用非参数Kruskal-Wallis H检验和Wilcoxon秩和检验进行统计学分析。 结果:食管癌患者Chao1指数高于健康对照者[362.51(284.29，646.13)比284.83(244.31，344.74)]，差异有统计学意义( Z＝-2.857， P＝0.004)。PCoA显示食管癌患者和健康对照者样本间距离较近，两者微生态菌群构成差异无统计学意义( P>0.05)。食管癌患者食管蓝藻菌门和疣微菌门的丰度均高于健康对照者(0.2%比0.1%、0.4%比0)，而食管变形菌门、 SR1菌门和 TM7菌门的丰度均低于健康对照者(21.9%比34.2%、0.1%比0.2%和0.2%比0.5%)，差异均有统计学意义( Q＝0.090、0.077、0.010、0.026、0.001， P均<0.05)。低分化，中分化和高分化食管癌患者食管梭状芽孢杆菌纲、梭状芽孢杆菌目、巴斯德氏菌目、巴斯德氏菌科、埃肯菌属、放线杆菌属和嗜血杆菌属的相对丰度分别为28.3%、24.2%和17.0%，28.3%、24.2%和17.0%，3.2%、0.3%和5.0%，3.2%、0.3%和5.0%，0、1.5%和0.1%，0.5%、0和0.7%，1.3%、0.2%和3.9%，比较差异均有统计学意义( Q＝0.579、0.557、0.390、0.711、0.768、0.768、0.768， P均<0.05)。LEfSe分析显示，食管癌患者梭杆菌目、瘤胃球菌属、气味杆菌属和S24_7科的丰度均高于健康对照者(21.5%比11.7%、0.5%比0.1%、0.1%比0、0比0)，差异均有统计学意义(LDA值＝2.591、2.379、2.790、2.927， P均<0.05)。ROC曲线证实随机森林模型可靠，AUC值为0.92。BugBase数据库预测显示，食管癌患者生物膜形成、致病潜力、移动元件、氧需求(厌氧菌、需氧菌、兼性菌)和氧化胁迫耐受食管细菌表型较健康对照者更丰富( P均<0.05)。 结论:食管癌患者的食管菌群发生改变，梭杆菌目、瘤胃球菌属、气味杆菌属和S24_7科可作为潜在的菌群标志物。

目的:利用胰岛素抵抗动物模型(eLtaS trans小鼠)探讨胰岛素抵抗与肠道菌群变化之间的关系。 方法:检测eLtaS trans小鼠和野生型(WT)小鼠葡萄糖耐量；收集小鼠粪便样本进行宏基因组和16S rDNA测序及相关分析；通过"脏笼"共享实验将eLtaS trans小鼠的粪便移植到WT小鼠体内，检测移植后不同时间点的小鼠葡萄糖耐量。 结果:eLtaS trans小鼠与WT小鼠的肠道菌群组成和功能上存在显著差异( P＝0.028)。与WT小鼠相比，eLtaS trans小鼠的肠道菌群多样性显著增加；在菌群组成上，eLtaS trans小鼠中的厚壁菌门的相对丰度显著升高( P<0.001)，而拟杆菌门、疣微菌门的相对丰度明显下降( P＝0.042, P＝0.033)；与代谢性疾病相关的嗜黏蛋白-阿克曼菌和狄氏副拟杆菌的丰度在eLtaS trans小鼠肠道菌群中显著降低( P＝0.033, P＝0.013)。eLtaS trans小鼠的肠道菌群在碳水化合物代谢、脂质代谢、其他次级代谢物的生物合成、其他氨基酸的代谢、能量产生和转化等方面与WT小鼠存在显著差异。eLtaS trans小鼠粪便移植后7、8、9周后的WT小鼠葡萄糖耐量异常，而停止移植1周后小鼠的葡萄糖耐量恢复正常。 结论:胰岛素抵抗能够导致小鼠肠道菌群发生明显改变，同时胰岛素抵抗小鼠的肠道菌群能够进一步诱发机体葡萄糖耐量异常。

目的:建立高脂饮食和益生菌干预的结直肠癌小鼠模型，探讨益生菌干预高脂膳食结构下肠道微生态异常及结直肠癌发生的疗效。方法:8周龄雄性C57BL/6J小鼠40只随机分为4组，每组10只：高脂饮食组（HFD）、高脂饮食+益生菌干预组（HFD+P组）、普通饮食组（ND组）、普通饮食+益生菌干预组（ND+P组），益生菌组给予益生菌制剂灌胃，实验期间采用氧化偶氮甲烷（AOM）联合葡聚糖硫酸钠（DSS）诱导小鼠肠癌模型，定期记录小鼠体质量并评估机体状态。促癌前后小鼠粪便通过16S rDNA高通量测序分析评估菌群结构变化。实验结束收集小鼠肠组织并记录附睾脂肪质量及肿瘤负荷。采用Alpha多样性指数对每组小鼠肠道的菌群丰度和多样性进行分析（Chao1指数越高，菌群丰度越高；Simpson指数越大，多样性越低）。利用Beta多样性分析4组间肠道菌群分布差异的显著性（当 R>0，说明菌群在组间的分布差异大于组内差异）。 结果:实验15周后，HFD组、HFD+P组、ND组和ND+P组小鼠体质量分别为（33.70±0.52）g、（28.70±0.32）g、（25.90±0.34）g和（25.60±0.40）g，差异有统计学意义（ F=700.89， P<0.01），其中HFD组体质量分别高于ND组和HFD+P组，而HFD+P组体质量又高于ND组，差异均有统计学意义（均 P<0.01）。HFD组、HFD+P组、ND组和ND+P组小鼠附睾周围脂肪重量分别为（1.36±0.15）g、（0.67±0.08）g、（0.58±0.10）g和（0.54±0.05）g，4组间比较差异有统计学意义（ F=114.03， P<0.01），两两比较提示，HFD组附睾周围脂肪重量分别高于ND组和HFD+P组，差异均有统计学意义（均 P<0.017），且HFD+P组与ND组附睾周围脂肪重量相当（ P=0.09）。饮食干预条件下，HFD组、HFD+P组、ND组和ND+P组的Chao1指数分别为217.62、235.32、301.51和305.71，Simpson指数分别为0.93、0.89、0.91和0.90。通过Beta多样性分析显示，4组组间菌群分布差异大于组内差异，差异有统计学意义（ R=0.655， P=0.001）。物种丰度分析显示，与ND组比较，在门水平层面，HFD组小鼠肠道菌群中拟杆菌门和厚壁菌门等菌群的比例更高，而疣微菌门等菌群的比例更低；在属水平层面，HFD组中拟杆菌属和颤杆菌克属等菌群的比例更高，而艾克曼菌属和拟普雷沃菌属等菌群的比例更低。经过益生菌干预后，上述菌群除了拟普雷沃菌属外，均有改善。HFD组、HFD+P组、ND组和ND+P组小鼠肿瘤数量分别为（4.63±1.19）个、（2.33±0.52）个、（2.56±0.73）个和（2.38±0.52）个，差异有统计学意义（ F=14.92， P<0.01）。 结论:益生菌治疗可通过调节肠道菌群紊乱来减轻HFD引起的小鼠肥胖和菌群失调，有助于降低结直肠癌发生的风险。

目的:探讨糖尿病肾病(diabetes kidney disease, DKD)模型小鼠肠肾组织晚期糖基化终产物(advanced glycosylation end product, AGEs)/钠-葡萄糖1型协同转运体(sodium-glucose cotransporter-1, SGLT-1)及肠道菌群的变化。方法:选取KKay小鼠20只，分为糖尿病组(DM组， n＝10)和糖尿病肾病组(DKD组， n＝10)，检测血清AGEs、脂多糖(lipopolysaccharide, LPS)、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-α，TNF-α)、白细胞介素6(intereukin-6，IL-6)的浓度，Western blot技术检测AGEs及SGLT-1在肠肾组织的蛋白表达，高通量测序分析肠道菌群的差异。 结果:与DM组比较，DKD组小鼠炎症指标TNF-α、IL-6及内毒素水平升高，血清、肠肾组织中AGEs的含量升高、SGLT-1在肠道组织含量升高( P<0.05)。Metastats检验显示DKD组门水平上疣状微生物菌门丰度减低，变形菌门丰度升高( P<0.05)，气单胞菌属、肠杆菌属、摩根氏菌属、克雷伯菌属、沙雷氏菌属、伯克霍尔德菌属等G -菌相对优势分布，阿克曼氏菌属丰度显著低于DM组( P<0.05)。 结论:DKD小鼠肠道AGEs的升高可能诱发肠道菌群失调，尤其是变形菌门升高、疣状微生物菌门及阿克曼氏菌属降低，导致G -菌渗漏入血产生肠源性内毒素血症引起炎症反应，这可能是DKD发病的重要因素。SGLT-1在肠道组织升高，这可能进一步参与DKD的病情发展。