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广州市2008-2017年注射吸毒人群HIV-1分子网络特征分析
编辑人员丨5天前
目的:分析2008-2017年广州市注射吸毒人群HIV-1分子网络的分布特征,为该人群艾滋病防控提供参考依据。方法:选取2008-2017年广州市新确证的注射吸毒HIV-1感染者血清样本,进行 pol区基因扩增及测序后,利用Cluster Picker 1.2.3软件识别系统进化树中的分子簇,使用HyPhy 2.2.4中TN93模型计算成簇序列间的基因距离,通过可视化软件Cytoscape 3.8.2构建分子网络,采用 χ2检验或确切概率法进行成簇分析和中心性分析。 结果:成功扩增获得 pol区基因片段586条(73.9%,586/793),共产生80个分子簇,成簇率为46.6%(273/586)。成簇样本与未成簇样本比较,汉族(48.4%,260/537)、广东籍(52.7%,146/277)和CRF55_01B(93.3%,14/15)的成簇比例更高。分子网络度值范围为1~7,度值≥3的节点占12.8%(24/187),其与网络中另外81个节点相关联(43.3%,81/187)。中心性分析结果显示,HIV-1感染者职业为家务/待业者在高程度中心性(19.0%,19/100)、高中介中心性(22.0%,22/100)和高亲近中心性(32.0%,32/100)的比例更高。 结论:广州市注射吸毒人群HIV-1分子成簇风险较高,应将具有本地及广西籍、家务/待业特征的注射吸毒人群作为重点干预目标,并实施精准干预,降低该人群HIV-1感染率。
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编辑人员丨5天前
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优化利奈唑胺、替考拉宁和达托霉素治疗葡萄球菌属血流感染给药方案的蒙特卡洛模拟研究
编辑人员丨5天前
目的:通过蒙特卡洛模拟预测和评价利奈唑胺、替考拉宁和达托霉素对葡萄球菌属血流感染的抗菌效果,优化临床给药方案。方法:借助全国血流感染细菌耐药监测联盟(Blood Bacterial Resistant Investigation Collaborative System,BRICS)平台收集2018年1月至2019年12月从全血标本中分离的1 847株葡萄球菌属菌株。利奈唑胺和达托霉素采用肉汤稀释法进行菌株的最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)测定,替考拉宁则采用琼脂稀释法测定MIC。利奈唑胺的给药方案为800 mg(1次/d)、500 mg(每12 h 1次)、600 mg(每12 h 1次)、600 mg(每8 h 1次)。替考拉宁的给药方案为400 mg(每12 h 1次)、600 mg(每12 h 1次)、800 mg(每12 h 1次)、1 000 mg(每12 h 1次)。达托霉素的给药方案为4 mg·kg -1·d -1、6 mg·kg -1·d -1、8 mg·kg -1·d -1、10 mg·kg -1·d -1和12 mg·kg -1·d -1。通过蒙特卡洛模拟计算3种药物不同给药方案的目标获得概率(probability of target attainment,PTA)和累计反应分数(cumulative fraction of response,CFR)。CFR≥90.0%的给药方案是抗菌药物经验治疗的合理选择。 结果:当MIC≤0.500 mg/L时,利奈唑胺剂量为800 mg(1次/d)、500 mg(每12 h 1次)、600 mg(每12 h 1次)、600 mg(每8 h 1次)对葡萄球菌属的PTA均>90.0%;当MIC为1.000 mg/L时,利奈唑胺500 mg(每12 h 1次)、600 mg(每12 h 1次)、600 mg(每8 h 1次)对葡萄球菌属的PTA分别为92.2%、96.6%、97.6%。4种利奈唑胺给药方案对应的CFR分别为73.9%、83.7%、90.8%和95.3%。在MIC≤1.000 mg/L时,替考拉宁400 mg(每12 h 1次)、600 mg(每12 h 1次)、800 mg(每12 h 1次)、1 000 mg(每12 h 1次)对葡萄球菌属的PTA均为100.0%;当MIC为2.000 mg/L时,替考拉宁800 mg(每12 h 1次)、1 000 mg(每12 h 1次)对葡萄球菌属的PTA均为100.0%。4种替考拉宁给药方案对应的CFR分别为90.8%、92.8%、93.5%和94.6%。在MIC≤0.500 mg/L时,达托霉素4 mg·kg -1·d -1、6 mg·kg -1·d -1、8 mg·kg -1·d -1、10 mg·kg -1·d -1、12 mg·kg -1·d -1对葡萄球菌属的PTA均>90.0%;当MIC为1.000 mg/L时,达托霉素8 mg·kg -1·d -1、10 mg·kg -1·d -1、12 mg·kg -1·d -1对葡萄球菌属的PTA分别为96.9%、100.0%和100.0%。5种达托霉素给药方案对葡萄球菌属的CFR分别为97.4%、99.2%、99.9%、100.0%和100.0%。 结论:针对葡萄球菌属引起的血流感染,利奈唑胺600 mg(每12 h 1次)、替考拉宁400 mg(每12 h 1次)、达托霉素4 mg·kg -1·d -1的给药方案可达到有效的抗菌效果。
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编辑人员丨5天前
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头孢比罗与万古霉素、利奈唑胺、达托霉素对血流感染葡萄球菌的体外药效学比较
编辑人员丨5天前
目的:分析头孢比罗、万古霉素、利奈唑胺、达托霉素对血流感染金黄色葡萄球菌(SAU)和凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)的体外药效,并评价各给药方案的抗菌效果,为临床用药提供依据。方法:全国血流感染细菌耐药监测联盟收集了2021年1月至12月来自我国51家医院血培养的葡萄球菌共1 777株,采用稀释法测定头孢比罗、万古霉素、利奈唑胺、达托霉素对葡萄球菌的最低抑菌浓度(MIC);通过蒙特卡罗模拟(MCS)预测4种药物不同给药方案的目标获得概率(PTA)和累积达标率(CFR)。结果:头孢比罗对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)表现出较强的抗菌活性,MIC 50(抑制50%细菌的MIC值)、MIC 90(抑制90%细菌的MIC值)分别为0.500、1.000 mg/L,MIC范围为≤0.060~4.000 mg/L;对SAU和CNS的耐药率分别为0.1%(1/1 073)和7.7%(54/704)。万古霉素、达托霉素未检测到葡萄球菌耐药。4种药物对甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)均未见耐药。MCS发现,标准给药方案头孢比罗500 mg(每8 h 1次)、达托霉素6 mg·kg -1·d -1对葡萄球菌均可达到较高的PTA和CFR;万古霉素、利奈唑胺的标准给药方案对葡萄球菌均CFR低。万古霉素1 000 mg(每8 h 1次)给药时,MRSA、MSSA的CFR均≥90.0%,而CNS的CFR仍<80.0%。利奈唑胺600 mg(每8 h 1次)给药时,对葡萄球菌的CFR均≥90.0%。 结论:头孢比罗、万古霉素、利奈唑胺、达托霉素对葡萄球菌均有较强的抗菌活性。头孢比罗、达托霉素标准给药方案可达到有效的抗菌效果,万古霉素、利奈唑胺有必要根据MIC及菌种适当增加用药剂量。
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编辑人员丨5天前
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远程生活方式干预对超重及肥胖人群体重及相关指标管理的效果评价
编辑人员丨5天前
目的:评价远程生活方式干预对超重及肥胖人群体重及相关指标管理的效果。方法:选取2015年5月至2018年12月在深圳市人民医院健康管理科参加远程生活方式干预的400例超重及肥胖人群作为远程干预组,同时选取400例年龄及性别与之相匹配的超重及肥胖体检人群作为对照组。营养师与远程干预组建立个人微信小群,运用微信平台对其进行远程生活方式干预,包括设定体重控制目标,对基于照片的食物日志及时反馈,给予运动指导及心理支持。对照组接受个性化的饮食和运动处方,但未接受远程干预。应用倾向性评分匹配法调整数据后,利用单因素和多因素logistic回归模型分析两组1年后的体重及相关指标管理效果。结果:经过1年的干预,共获得有效数据755例(远程干预组371例,对照组384例),倾向性匹配后保留有效数据446例(远程干预组223例,对照组223例)。远程干预组的体质指数(BMI)、收缩压、空腹血糖、三酰甘油、总胆固醇、低密度脂蛋白、血尿酸分别为(24.85±2.52)kg/m 2、(110.21±10.53)mmHg(1 mmHg=0.133 kPa)、(4.96±0.65)mmol/L、(1.25±0.82)mmol/L、(4.87±1.11)mmol/L、(2.88±0.74)mmol/L、(306.01±95.66)mmol/L,均明显低于对照组的(27.76±2.28)kg/m 2、(121.14±14.07)mmHg、(5.10±0.87)mmol/L、(1.54±0.83)mmol/L、(5.28±0.96)mmol/L、(3.13±0.80)mmol/L、(355.16±92.68)mmol/L(均 P<0.05)。干预后,BMI减低4%~12%时,干预措施均为影响因素(均 P<0.05),远程干预组BMI降低12%的概率为对照组的112.486倍(95% CI:16.852~890.266);同时,初始BMI为BMI恢复正常的影响因素,初始BMI每减少1 kg/m 2,其恢复正常的概率为减少前的4.76倍(95% CI:3.222~5.057)。 结论:远程生活方式干预对于超重及肥胖人群的体重及相关指标管理有一定效果,其对超重及轻度肥胖的人减重效果显著,但对中重度肥胖人群的干预效果有限。
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编辑人员丨5天前
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应用蒙特卡罗模拟优化肾功能亢进患者万古霉素给药方案的研究
编辑人员丨5天前
目的:根据万古霉素在肾功能亢进(ARC)和肾功能正常患者中的药物代谢动力学/药物效应动力学(PK/PD)原理,应用蒙特卡罗模拟优化ARC和肾功能正常患者万古霉素对常用革兰阳性菌的初始给药方案。方法:使用文献公开发表的ARC及肾功能正常患者中的群体PK模型,收集2017至2019年南京医科大学附属苏州医院甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(MRSA)、甲氧西林耐药表皮葡萄球菌(MRSE)、粪肠球菌、屎肠球菌的最小抑菌浓度(MIC)分布。采用蒙特卡罗模拟计算不同万古霉素日剂量的目标获得概率(PTA)和累积反应分数(CFR),以预测达到与PK/PD参数指标AUC 0~24 h/MIC的万古霉素给药剂量,推荐最佳给药方案。 结果:蒙特卡罗模拟结果显示,MIC=0.5时ARC患者对革兰阳性菌万古霉素日剂量2.0 g/d的PTA为97.30%,而肾功能正常患者只需要1.5 g/d,PTA即可达99.16%。MIC=1时,肾功能正常患者需要万古霉素2.5 g/d,PTA可达92.91%,而ARC患者需要万古霉素3.5 g/d,PTA才可达88.71%。当MIC≥2时,万古霉素常规推荐的给药剂量(2.0~4.0 g/d)很难达到理想的PTA值。对于常见革兰阳性菌,肾功能正常患者需要万古霉素3.0 g/d,CFR可达91.36%,而ARC患者需要万古霉素4.5 g/d,CFR可达90.60%。MRSA和屎肠球菌的MIC≤1的占比分别为97.25%和94.50%。肾功能正常患者MRSA感染给予万古霉素2.5 g/d,CFR可达93.95%,屎肠球菌给予万古霉素3.0 g/d,CFR可达94.46%;而ARC患者MRSA感染给予万古霉素3.5 g/d,CFR可达91.42%,屎肠球菌给予4.0 g/d,CFR可达93.07%。MRSE的MIC=1和2占比分别为64.64%和27.44%,粪肠球菌为77.09%和20.13%。肾功能正常患者粪肠球菌感染给予万古霉素4.0 g/d,CFR可达92.55%,MRSE需要万古霉素4.5 g/d,CFR可达92.79%,而ARC患者MRSE和粪肠球菌需要万古霉素6.0 g/d,CFR才可达88.35%和92.03%。当革兰阳性菌MIC≤0.5时ARC患者给予万古霉素2.0 g/d和肾功能正常者予1.5 g/d,PTA均可≥90%。MIC=1时肾功能正常患者推荐万古霉素3.0 g/d,ARC患者推荐万古霉素4.5 g/d,PTA和CFR可达90%以上。MIC≥2的革兰阳性菌万古霉素常规给药日剂量(2.0~4.0 g/d)对于ARC和肾功能正常患者均很难达到目标的PTA及CFR。结论:与肾功能正常患者相比,ARC患者万古霉素需要更大的日剂量才可达目标PTA和CFR。MIC≥2的革兰阳性菌感染,建议改用其他敏感性更好的抗革兰阳性菌药物治疗。
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编辑人员丨5天前
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基于全国血流感染耐药监测联盟的耐碳青霉烯类革兰阴性菌对替加环素的蒙特卡洛模拟研究
编辑人员丨5天前
目的:通过蒙特卡洛模拟评估不同剂量替加环素对碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌(CRE)、碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)和碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌(CRAB)的疗效。方法:借助全国血流感染细菌耐药监测联盟平台收集2018年1月1日至2019年12月31日626株CRE及317株CRAB,CRE中包括517株CRKP。根据替加环素的三种给药方案(50 mg次/12 h、75 mg次/12 h及100 mg次/12 h)及CRE、CRKP和CRAB的最低抑菌浓度(MIC)分布,基于药代动力学/药效学模型,设置10 000次的蒙特卡洛模拟计算,计算在每个MIC值的目标获得概率(PTA)及每种给药方案下的累积响应分数(CFR),设定90%为达标PTA值及目标CFR值。结果:对于CRE,当MIC≤0.5 mg/L时,三种给药方案对CRE的模拟结果为PTA均>99%;当MIC=1 mg/L时,75 mg次/12 h和100 mg次/12 h两种方案对应的PTA分别为94.42%和99.65%,50 mg次/12 h给药方案对应的PTA为71.02%;当MIC≥2 mg/L时,三种给药方案对CRE的PTA均不达标。对于CRKP,当MIC≤0.5 mg/L时,三种给药方案对CRKP的模拟结果PTA均>99%;当MIC=1 mg/L时,75 mg次/12 h和100 mg次/12 h两种方案对应的PTA分别为94.27%和99.19%,50 mg次/12 h给药方案未达到目标PTA值;当MIC≥2 mg/L时,三种给药方案对CRKP的PTA均不达标。对于CRAB,当MIC≤0.5 mg/L时,三种给药方案对CRAB的模拟结果PTA均>98%;当MIC=1 mg/L时,75 mg次/12 h和100 mg次/12 h两种方案对应的PTA分别为94.45%和99.00%,50 mg次/12 h给药方案未达到目标PTA值;当MIC≥2 mg/L时,三种给药方案对CRKP的PTA均不达标。替加环素对CRE具有较高的CFR, 75 mg次/12 h和100 mg次/12 h替加环素用药方案所对应的CFR分别为92.62%和97.62%。对于CRKP,替加环素50 mg次/12 h、75 mg次/12 h和100 mg次/12 h给药方案下的CFR分别为86.53%、94.40%和97.16%。对于CRAB,三种给药方案对应的CFR分别为41.76%、60.73%和72.21%。结论:当MIC≥1 mg/L时,推荐剂量(50 mg次/12 h)的替加环素对CRE、CRKP和CRAB均无效,对于CRE或CRKP,75 mg次/12 h和100 mg次/12 h的剂量可能是更优给药方案。
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编辑人员丨5天前
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机器人辅助全髋关节置换术的临床疗效
编辑人员丨5天前
目的:探讨机器人辅助全髋关节置换术(total hip arthroplasty,THA)对假体放置精准性的影响以及临床疗效。方法:回顾性收集2018年8月至2022年10月解放军总医院第四医学中心骨科432例(549髋)机器人辅助初次THA患者,男174例、女258例,年龄(54.2±12.7)岁,体质指数为(23.2±4.3)kg/m 2;左侧301髋、右侧248髋。所有患者均在机器人术前规划、辅助术中定位及测量下采用标准后外侧手术入路行THA。采用Harris髋关节评分(Harris hip score,HHS)、遗忘关节评分(forgotten joint score,FJS)、西安大略和麦克马斯特大学(the Western Ontario and McMaster University,WOMAC)骨关节炎指数评分量表及患者满意度评分等评价临床结果;影像学指标包括比较术前规划、术中测量和术后3个月X线片测量的髋臼杯前倾角、外展角、双下肢长度差及髋关节旋转中心的位置,计算髋臼杯位于安全区的构成比。 结果:连续549髋(432例)均顺利由机器人辅助完成THA,手术时间为(86.2±35.4)min,术中出血量为(236.7±94.5)ml;随访时间为(23.6±16.2)个月。末次随访时549髋HHS为(91.4±15.4)分,WOMAC骨关节炎指数为(8.4±6.5)分,FJS为(77.4±23.4)分,患者满意度评分为(9.1±2.7)分。术后3个月髋臼杯前倾角为21.2°±4.8°,外展角为40.8°±4.3°。93.1%(511/549)的髋臼杯位于目标角度±10°的安全区范围内,84.5%(464/549)的髋臼杯位于目标角度±5°的安全区范围内。1例发育性髋关节发育不良(developmental dysplasia of the hip,DDH)患者出现急性假体周围感染,通过保留假体清创术治愈;1例DDH患者出现不明原因大腿疼痛,行二次手术治疗,术后疼痛缓解;1例DDH患者出现大腿中上段血肿形成伴神经压迫损伤,探查后结扎出血血管,神经损害表现于1个月内恢复;1例DDH患者出现术后即刻不稳定脱位,即行二次手术更换股骨头,术后恢复良好。16髋出现机器人相关的不良事件,除机器人本身的软件及机械故障外,复杂的髋关节疾病可能是机器人辅助手术中止的危险因素,考虑到机器人辅助手术存在一定的中止率,在复杂髋关节疾病中应用机器人辅助技术时应当做好充足的准备。结论:通过机器人辅助THA术前计划可被精准执行,相对于前倾角20°±10°、外展角40°±10°的安全区,可获得准确、可重复的髋臼杯位置,提高髋臼杯位于安全区的概率,在恢复髋关节旋转中心和下肢长度方面获得满意的结果。
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编辑人员丨5天前
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烟草香气相关基因CRISPR/Cas9 编辑突变体库的构建
编辑人员丨3周前
为探究CRISPR/Cas9 基因编辑技术构建烟草突变体库的可行性,该研究以烤烟品种'红花大金元'为实验材料筛选了 100 个可能参与烟草香气代谢的基因,设计相应的 100 个 sgRNA 并构建了由 100 个CRISPR/Cas9 编辑载体组成的质粒库,获得转基因材料后分析了载体的共转化率、靶向编辑率和脱靶编辑情况.结果表明:(1)通过农杆菌介导 100 个sgRNA的共转化后,在 172 个阳性转化株中检测到了其中的77 个sgRNA,共转化率为 77%.(2)在 77 个携带sgRNA的转基因后代中,69 个sgRNA对目标基因进行了靶向编辑,编辑率为 89.6%.(3)脱靶位点测序检测发现,只有 1 个sgRNA在非目标靶位点产生了脱靶编辑,表明CRISPR/Cas9 基因编辑技术在烟草中的脱靶概率非常低.综上所述,利用CRISPR/Cas9 载体库共转化对烟草基因进行高通量靶向编辑以构建突变体库的方法切实可行,并且该方法有共转化率高、编辑率高和脱靶编辑概率低等特点.
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编辑人员丨3周前
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蒙特卡洛模拟评价万古霉素治疗金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌引起血流感染的给药方案
编辑人员丨2023/12/30
目的 利用蒙特卡洛模拟评价万古霉素治疗金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌引起血流感染的合理性.方法 由全国血流感染细菌耐药监测联盟(BRICS)收集全血标本中分离的1438株金黄色葡萄球菌和409株表皮葡萄球菌,采用微量肉汤稀释法对分离的菌株进行最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)的测定.万古霉素4种给药方案分别为500mg q6 h、1000mgq12h、1500 mg q12 h和2000mgql2h.通过蒙特卡洛模拟10000例次后,获得4种给药方案的fAUC/MIC达标概率(probability of target attainment,PTA)和累计反应分数(cumulative fraction of response,CFR).CFR≥90%时的给药方案是经验性用药的最佳选择.结果 当对葡萄球菌MIC≤0.5 mg/L时,万古霉素4种给药方案fAUC/MIC均可达到满意的抗菌活性(PTA=100%),当MIC=1 mg/L时,1500 mg q12 h和2000 mg q12 h两种给药方案可达到目标PTA.万古霉素给药剂量500 mg q6 h、1000 mg q12 h、1500mgq12h、2000 mg q12 h对金黄色葡萄球菌的fAUC/MIC CFR分别为83%、83%、87%和98%;对应表皮葡萄球菌的CFR分别为53%、53%、59%和92%.结论 万古霉素用于因金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌引起的血流感染时,应根据MIC值的不同而选择不同的给药剂量进行治疗,经验性选择万古霉素进行抗感染治疗时,给药剂量需达到2000 mg q12 h方能达到较好的抗菌效果.
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编辑人员丨2023/12/30
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蒙特卡洛模拟评价替加环素治疗革兰阴性菌感染给药方案
编辑人员丨2023/10/28
目的:应用蒙特卡洛模拟方法评价替加环素治疗临床常见革兰阴性杆菌引起的医院获得性肺炎(HAP)、复杂腹腔感染(cIAI)以及复杂皮肤软组织感染(cSSSI)的给药方案.方法:收集2018年中国CHINET耐药性监测网相关替加环素对鲍曼不动杆菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌以及阴沟肠杆菌的最低抑菌浓度(MIC)数据,结合药动学/药效学(PK/PD)理论利用蒙特卡洛模拟,计算不同给药方案的达标概率(PTA)和累计反应分数(CFR).结果:治疗革兰阴性菌引起的医院获得性肺炎,当MIC≤0.5 μg/mL时,替加环素50 mg q12h给药剂量的PTA>90%,当MIC≥1 μg/mL,100 mg q12h剂量的PTA和CFR均大于 90%,当MIC≥2 μg/mL,50 mg q12h、75 mg q12h和100 mg q12h给药剂量的PTA小于90%.当替加环素治疗复杂腹腔感染,MIC≤0.5 μg/mL时,50 mg q12h的PTA达到目标值,当MIC=1 μg/mL时,仅 100 mg q12h给药剂量的PTA大于90%.对复杂皮肤软组织感染,当MIC≤0.25 μg/mL时,75 mg q12h和100 mg q12h的剂量可使PTA大于90%,当MIC≥0.5 μg/mL,所有给药方案的PTA和CFR均小于90%.结论:替加环素50 mg q12h的剂量更适合用于治疗HAP.当敏感菌MIC>0.5 μg/mL时,替加环素治疗cIAI可能需要100 mg q12h的剂量获得最佳临床疗效.替加环素治疗cSSSI,只有当MIC≤0.25 μg/mL,可以选用75 mg q12h、100 mg q12h的给药方案.对大肠埃希菌引起的三种感染,替加环素50 mg q12h的给药剂量可能获得较好的临床疗效.
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编辑人员丨2023/10/28
