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重症新冠肺炎与重症社区获得性肺炎临床特征对比
编辑人员丨1周前
目的:对符合美国感染病学会/美国胸科学会(IDSA/ATS)成人社区获得性肺炎(CAP)处理指南推荐标准的重症新型冠状病毒肺炎(sCOVID-19)和重症社区获得性肺炎(sCAP)患者的临床特点进行对比分析。方法:回顾性对比分析2020年1月1日至3月31日上海援鄂医疗队在武汉三院重症医学科收治的116例sCOVID-19患者和2010年1月1日至2017年12月31日上海市第一人民医院急诊危重病科收治的135例sCAP患者的临床病历资料。收集患者的基本资料、诊断及合并症、实验室检查、病原学及影像学结果、治疗方案、预后及结局。比较sCOVID-19与sCAP患者临床资料的差异,并分析二者的死亡危险因素。结果:sCOVID-19与sCAP患者的28 d病死率分别为50.9%(59/116)和37.0%(50/135);sCOVID-19患者氧合指数(PaO 2/FiO 2)≤250 mmHg(1 mmHg≈0.133 kPa)的比例显著高于sCAP患者〔62.1%(72/116)比34.8%(47/135), P<0.01〕,可能的原因是sCOVID-19患者双肺多发肺叶浸润的比例明显高于sCAP患者〔94.0%(109/116)比40.0%(54/135), P<0.01〕,但sCOVID-19患者进行机械通气的比例却低于sCAP患者〔45.7%(53/116)比60.0%(81/135), P<0.05〕。进一步分析与患者死亡相关的临床指标发现,对于sCOVID-19患者,PaO 2/FiO 2、白细胞计数(WBC)、中性粒细胞计数(NEU)、中性粒细胞比例(NEU%)、中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)、总胆红素(TBil)、血尿素氮(BUN)、白蛋白(ALB)、Ca 2+、凝血酶原时间(PT)、D-二聚体、C-反应蛋白(CRP)等指标在死亡组与存活组间差异均有统计学意义,死亡组接受机械通气、丙种球蛋白、糖皮质激素及液体复苏的比例也较存活组更高;Logistic回归分析显示,需要机械通气、NLR>10、TBil>10 μmol/L、乳酸脱氢酶(LDH)>250 U/L是sCOVID-19患者28 d死亡的危险因素。对于sCAP患者,年龄、BUN、ALB、血糖(GLU)、Ca 2+及D-二聚体等指标在死亡组与存活组间差异有统计学意义,但在治疗方面未见明显差异;Logistic回归分析显示,BUN>7.14 mmol/L,ALB<30 g/L是sCAP患者28 d死亡的危险因素。 结论:sCOVID-19患者的氧合功能较sCAP患者更差,可能是由于病变累及双肺的比例高导致。sCOVID-19和sCAP患者死亡组与存活组间存在差别的指标相类似,提示两种疾病对肾功能、营养状态以及凝血功能等影响具有相似性;但两者的死亡危险因素仍存在差异,考虑sCOVID-19对肺的氧合功能、炎症瀑布反应、肝功能影响更大,而sCAP对肾功能、营养状态影响更大。
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编辑人员丨1周前
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妊娠期糖尿病患者产后5~6年糖代谢转归及胰岛β细胞功能变化的研究
编辑人员丨1周前
目的:了解妊娠期糖尿病(GDM)患者产后5~6年糖代谢转归,并探讨从产后短期(6~12周)到长期(5~6年)胰岛素抵抗及胰岛β细胞功能变化及与糖代谢状态的关系。方法:纳入2007年2月至2008年12月在北京大学第一医院生产且进行了产后短期及长期随访、资料完整的GDM患者72例,根据产后5~6年的糖代谢状况,分为糖代谢正常(NGT)组及糖代谢异常(AGT)组。收集两组患者孕前、孕期、围产期、产后短期及长期相关临床资料,包括人口测量学指标、糖脂代谢指标[口服葡萄糖耐量试验(OGTT)空腹血糖(FPG)、1 h血糖(1hPG)、2 h血糖(2hPG)、3 h血糖(3hPG)、总胆固醇、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇]、使用胰岛素比例、空腹胰岛素(FINS)、OGTT 2 h胰岛素(2hINS),并计算胰岛素敏感性指数(ISI)、稳态模型评估胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)及稳态模型评估胰岛β细胞功能指数(HOMA-β)。两组间比较采用独立样本 t检验、秩和检验、 χ2检验或Fisher精确概率检验。采用多因素logistic回归分析法分析糖代谢异常的影响因素。 结果:72例GDM患者中,NGT组38例(52.78%),AGT组34例(47.22%)。从孕期到产后长期,与NGT组比较,AGT组相关代谢指标差异均具有统计学意义。孕期:AGT组75 g OGTT 3hPG更高,使用胰岛素比例更高(均 P<0.05);产后6~12周:AGT组OGTT 2hPG即显著升高,血糖异常的发生率、高TG血症的比例也更高(均 P<0.05),但两组间HOMA-IR及HOMA-β的差异未见有统计学意义( P>0.05);产后5~6年:AGT组的FPG、OGTT 2hPG及FINS均更高,胰岛素抵抗程度更重,ISI更低(均 P<0.05)。与产后短期(6~12周)比较,无论产后5~6年血糖是否正常,FPG、FINS、HOMA-IR、HOMA-β均显著升高,AGT组OGTT 2hPG和2hINS升高更显著( P<0.05)。多因素logistic回归分析结果显示,孕期OGTT 2hPG、使用胰岛素降糖为产后5~6年发生糖代谢异常的危险因素,OR值(95%CI)分别为1.646(1.015~2.671)和3.570(1.009~12.624)。 结论:GDM患者产后5~6年糖代谢异常发生率高;随着时间的延长,无论血糖是否正常,胰岛素抵抗均逐渐加重,糖代谢异常者尤甚;孕期OGTT 2hPG及孕期应用胰岛素对产后5~6年糖代谢转归有预测作用,提示GDM与T2DM存在发病时间上的延续性及发病机制上的相似性。
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编辑人员丨1周前
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原发性干燥综合征患者肠道菌群特征与外周血淋巴细胞的关系
编辑人员丨1周前
目的:通过检测pSS患者粪便中菌群种类及分布情况,探究肠道菌群变化及其代谢特征与患者淋巴细胞亚群的关系及其在pSS发生、发展中的潜在作用。方法:收集2019年1月至2020年1月在山西医科大学第二医院风湿免疫科住院治疗的101例pSS患者以及以及在山西省人民医院同期健康体检中心体检的101名年龄、性别匹配的健康对照(HC)的粪便样本,进行16s rDNA扩增子分析。采用R软件4.0.3进行统计学分析。Wilcoxon检验及相似性分析(ANOSIM)比较2组间Alpha多样性及Beta多样性。采用 t检验进行差异菌群分析。同时通过流式微球分析技术检测pSS患者外周血淋巴细胞亚群水平,并利用Pearson相关分析淋巴细胞亚群、ESR、CRP、唾液基础流率和刺激后流率等临床指标与特征菌群的关系。 结果:与HC相比,pSS患者的肠道菌群丰富度(Chao1指数、ACE指数)和多样性(Shannon指数、Simpson指数)受损,整体肠道微生物群组成差异有统计学意义(ANOSIM, r=0.09, P=0.001)。在门水平上,pSS患者厚壁菌门水平相对丰度减少,变形菌门的相对丰度增加。在属水平上,pSS中大肠杆菌-志贺菌属( P<0.001)、乳酸杆菌( P<0.001)、双歧杆菌( P<0.001)、罕见小球菌( P<0.001)、另枝菌属( P<0.001)、产粪甾醇真杆菌( P=0.002)比例增高;粪杆菌属( P<0.001)、普氏菌属( P<0.001)、罗氏菌属( P<0.001)、巨单胞菌属( P<0.001)、无杆菌属( P<0.001)、毛螺菌属( P<0.001)、毛螺菌属NK4A136( P=0.006)、挑剔真杆菌( P<0.001)比例明显降低。PICRUST分析显示pSS患者中氨基酸代谢如牛磺酸和亚牛磺酸代谢( P<0.001)、脂肪酸代谢如丙酸代谢( P<0.001)、谷胱甘肽代谢( P=0.002)、硫辛酸代谢( P=0.002)、脂多糖合成( P=0.003)、非核糖体肽合成酶介导的铁载体生物合成( P=0.005)、氨基苯甲酸酯降解( P=0.002)等途径被富集。Pearson相关结果显示,HC和pSS 2组间具有不同丰度的关键菌群,这些关键菌与基础唾液流率、Th17细胞及Treg细胞的绝对数量密切相关。 结论:肠道微生物菌群的失调和代谢的改变会导致宿主免疫细胞的稳态发生变化,这可能与pSS的发生发展密切相关。
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编辑人员丨1周前
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基于稀疏重建锥形束CT和深度学习技术合成双能物质分解图
编辑人员丨1周前
目的:利用治疗当日低剂量单能锥形束CT(CBCT),合成与治疗当日解剖结构一致的双能物质分解图像(MDI),为在线自适应放疗(ART)和剂量重建等临床应用场景提供定量图像基础。方法:通过改变4D Extended Cardiac-Torso(XCAT)解剖结构输入参数,构建70组男性和女性仿真人体数据,并按照5∶1∶1比例划分为训练集、验证集和独立测试集。其中每组数据包括治疗前的双能CT(DECT)以及发生生理形变后的CBCT,后者反映放疗过程中的患者变化。使用迭代分解算法对双能CT进行物质分解,分别得到骨分解图(MDIB)和软组织分解图(MDIST)。构建基于断层图像的2D CycleGAN网络实现从CBCT到MDI的模态转化,并保留CBCT所代表的放疗当天真实解剖结构。网络以CBCT、MDIB和MDIST为输入,输出为治疗当日的MDIB与MDIST。为测试集患者构建与CBCT解剖结构相同的DECT并获得MDIB与MDIST作为真值,定量评估模型合成双能物质分解图的性能表现。结果:在仅使用传统方案约13.8%的投影数量和辐射剂量情况下,测试集中的10套单能稀疏重建CBCT被模型成功转换成了与放疗当日解剖结构一致的MDIB与MDIST。合成的MDIB和MDIST与真值相比,结构相似性指数(SSIM)分别为0.983±0.006和0.988±0.005;均方根误差(RMSE)分别为0.017±0.005和0.019±0.004;峰值信噪比(PSNR)分别为35.515±2.081和34.409±1.510。模型训练耗时约18 h 51 min,合成每张MDI图像耗时约0.65 s。结论:基于低剂量稀疏重建CBCT,本研究构建的2D CycleGAN网络可以实现跨模态、高保真的双能物质分解图像转化,有望在现有临床平台上为在线自适应放疗、离子放疗计划设计、剂量重建与监控等应用场景提供新型智能成像方法。
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编辑人员丨1周前
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西沙群岛七连屿珊瑚礁鱼类的物种组成与演替
编辑人员丨2024/8/10
七连屿是西沙群岛东北面的一个珊瑚礁群岛,生物多样性极高,近年来由于受到了人类扰动影响,鱼类资源出现明显衰退.为探究这一衰退演变特征并更好地保护和管理七连屿珊瑚礁鱼类资源,我们于2018-2023年采用潜水捕捞、渔捞日志记录、水下视频拍摄以及环境DNA分析等方法,并结合近年这一海域的研究资料,对其鱼类种类组成的现状进行分析.结果如下:2017年至今,七连屿共发现珊瑚礁鱼类412种,隶属于2纲16目60科168属,其中鲈形目鱼类最多,为320种,科水平隆头鱼科种类最多,有47种.七连屿以小型鱼类为多;食性方面以肉食性鱼类为多.2021-2023年大中型鱼类比例及肉食性鱼类比例较2017-2020年出现下降,同时小型鱼类和植食性鱼类比例却出现显著上升.两时间段肉食性鱼类相似性较低,为不相似;植食性鱼类相似性较高,为中等相似;小型鱼类相似性较低,为不相似,大型鱼类也为不相似.优势种中大型鱼类和小型鱼类的种类数显著低于稀有鱼类,肉食性鱼类的种类数也显著低于稀有鱼类,而植食性鱼类的种类数则显著高于稀有鱼类.两时间段的鱼类平均分类差异指数(Delta+)和变异分类差异指数(Lambda+)呈下降趋势.以上表明七连屿珊瑚礁鱼类受到了过度捕捞和生境退化的双重影响,鱼类物种发生了显著的更替.研究为今后预测七连屿珊瑚礁鱼类物种演替趋势提供了基础数据,为西沙珊瑚礁生态系统保护和修复提供了参考.
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编辑人员丨2024/8/10
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聚类分析视角下的中国省域碳排放时空格局及驱动因素分析
编辑人员丨2024/7/13
中国碳排放的时空格局对全球气候治理极为重要,其驱动机制是"减排"的关键所在.对中国省域碳排放时空特征和驱动模式进行聚类研究,揭示不同省域的模式相似性与差异性,对于各省域的"双碳"目标达成和路径安排具有重要影响和现实支撑.研究采用 1997-2019 年碳排放量及社会经济数据,从聚类分析角度探讨了中国省域碳排放的趋势及驱动模式,基于偏最小二乘法(PLS)模型的归因结果,识别不同省域碳排放的驱动因素的贡献度和敏感性,进一步探寻省域减排方案.研究表明:①研究期内中国碳排放以 499.25mt/a的速率上升,呈低位平缓波动-大幅上升-高位缓慢波动的趋势变化,省域碳排放呈北高南低、东高西低格局.②省域碳排放模式具有差异性,北京、天津等为低起点低速发展类,趋势呈扁平"S"型;吉林、新疆等为低起点高速发展类,呈上升"S"型;河南、广东等为中起点高速发展类,呈扩张"S"型.山东、山西为高起点超高速发展类,呈指数"S"型.③中国省域碳排放驱动因子的贡献度和敏感性存在空间差异.经济发展、产业结构、城市化水平与能源消耗等对碳排放的贡献度较高,其中地区GDP、人均GDP、第二产业占比GDP、年底非农人口比例、地区能源消耗总量等是碳排放的主要贡献因子.碳排放对产业结构、科技发展、环境规制的敏感性较强.④中国省域碳排放驱动模式的分异性较为明显,同类驱动模式省域多在地理空间范围内形成"集聚"现象.因此,不同省域政府减排策略的落实应考虑其碳排放的发展规模及驱动机制的差异,实现地区发展和减排"两手抓"的同时利用地区优势,资源互通、交流合作,加强省域间碳排放的"共治",进一步促进高质量发展.
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编辑人员丨2024/7/13
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基于氢氧稳定同位素示踪的侧柏与白榆水源对比
编辑人员丨2024/4/27
明晰常绿与落叶乔木的水分来源及竞争关系,可为区域生态恢复过程中树种的选择和种植方式提供理论依据.本研究以兰州市南山绿化工程区大洼山常绿乔木侧柏(Platycladuss orientalis)和落叶乔木白榆(Ulmus pumila)为对象,测定其木质部及土壤和降水的氢氧稳定同位素比值,利用贝叶斯混合模型和相似性比例指数分析了侧柏和白榆对不同深度土层土壤水的利用特征.结果表明:除7月和10月外,深层(70~100 cm)土壤水是侧柏和白榆的主要水分来源,其贡献率分别为55.82%和58.90%;7月侧柏和白榆转为吸收浅层(0~20 cm)土壤水,贡献率均达90%以上;10月侧柏转为吸收中层(20~70 cm)土壤水,而白榆同时利用深层(70~100cm)和中层(20~70cm)土壤水.侧柏和白榆在整个生长季内除7月外,对水分的竞争不强烈,可在同一生境下同时种植.
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编辑人员丨2024/4/27
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上海2~6岁肥胖/超重儿童肠道菌群多样性和物种组成的病例-对照研究
编辑人员丨2024/4/27
[背景]多项研究表明肠道微生物菌群组成上的变化与肥胖关系密切,但儿童研究较少,且研究结果受到种族、地理位置等因素的影响.[目的]在上海市 2~6岁儿童人群中进行肠道微生物菌群多样性分析,观察肥胖/超重与正常体重儿童之间肠道微生物菌群分布特点及物种差异,探讨肥胖/超重与肠道菌群多样性的关联.[方法]采集上海市 74例 2~6岁儿童粪便样本,其中肥胖/超重 18人,男性 6人,女性 12人(男女比例为 1∶2);正常体重 56人,男性 18人,女性 38人(男女比例约为 1∶2).提取粪便样品中细菌的 16S rDNA,进行PCR扩增、文库构建和高通量测序.采用Naive Bayes算法对扩增子序列变异(ASV)的代表序列及丰度信息进行物种分类学分析(门、纲、目、科、属、种)、群落多样性(Sobs指数、Shannon指数、Shannoneven指数、Coverage指数、PD指数、主坐标分析)分析等.运用Wilcoxon秩和检验、P值多重检验校正、相似性分析检验等对两组进行差异分析,获得儿童肠道菌群组成分布特点及物种差异信息.[结果]共计完成74个粪便样本的测序并对测序结果进行质控和过滤,获得优化序列4905306条,得到 1860个ASVs.对ASVs进行多样性数据分析,得到 8个分类学水平的物种注释结果889个.α多样性分析表明肥胖/超重儿童群落丰富度(Sobs指数)、多样性(Shannon指数)、均匀度(Shannoneven指数)、谱系多样性(PD指数)均比正常体重儿童有所上升,但是两组无统计学差异(P>0.05).β多样性分析显示两组微生物物种组成组间差异不大,未见明显聚类.从门、目、科、属四种分类学水平上对 74例样本进行物种组成分析,结果显示两组肠道菌群都存在一致的核心菌群结构,但是菌群组成有差异.两组间菌群组成差异表现在目、科、属这三个分类学水平上,其中厚壁菌门下的丹毒丝菌目丹毒荚膜菌科的丹毒丝菌属UCG003、链型杆菌属在OB_OW组中显著富集,且对肥胖/超重这一表型差异贡献较大[线性判别分析值(LDA)=3.72,P<0.01;LDA=3.29,P<0.05].变形菌门下的肠杆菌目肠杆菌科未分类肠杆菌属在体重正常组中显著富集,且对体重正常这一表型差异贡献较大(LDA=3.93,P<0.05).[结论]上海 2~6岁肥胖/超重儿童肠道菌群的丰富度和多样性增高,但与正常体重儿童相比无差异.肥胖/超重组和正常体重组存在肠道菌群组成差异.
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编辑人员丨2024/4/27
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三种侧耳属真菌基因组密码子偏好性比较分析
编辑人员丨2024/4/6
为了解 3 种侧耳属真菌基因组密码子的使用偏性及影响因素,本研究以糙皮侧耳、刺芹侧耳和白灵侧耳基因组CDS序列为研究对象,通过生物信息学方法对3种侧耳密码子使用偏性进行了分析.结果表明,3 种侧耳基因组总碱基组成差异小,GC 含量高.RSCU、RFSC 分析表明糙皮侧耳 G/C结尾的偏好密码子的比例最高(82.14%),并且有 3 个特有偏好密码子.3 种侧耳共有偏好密码子 25 个,以G/C结尾的占 80%;共有高频密码子 3 个,均以G/C结尾.密码子相似性分析表明3 种侧耳密码子使用模式比较相似(相似性指数均小于 0.001),其中刺芹侧耳与白灵侧耳的相似性最高(相似性指数为 0.000 259 014);且 3 种侧耳密码子的使用频率与灰盖鬼伞和金针菇较为接近.PR2-plot、ENc-GC3 和中性绘图分析表明 3 种侧耳密码子偏好性使用主要受自然选择影响,在一定程度上也受碱基突变压力和其他因素影响.上述结论为分析侧耳真菌的进化规律及选择最佳异源表达受体系统提供了依据.
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编辑人员丨2024/4/6
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IgA肾病与膜性肾病患者肠道微生物菌群结构分析
编辑人员丨2023/12/9
[背景]越来越多的证据表明肠道失衡与免疫介导的疾病相关,但肠道菌群和免疫介导的肾脏疾病之间的关系仍不清楚.[目的]通过Illumina高通量测序方法对IgA肾病(immunoglobulin A nephropathy,IgAN)、膜性肾病(membranous nephropathy,MN)患者和健康人群的肠道菌群进行比较.[方法]回顾性选择 2020 年 9 月-2021 年 12 月期间,在甘肃省人民医院肾内科行肾穿刺活检并诊断为IgAN及MN患者的新鲜粪便标本,分别编号为IgAN组和MN组,收集体检中心健康人群粪便标本作为健康对照组,每组样本为 10 例.采用高通量测序技术对粪便样本中所有细菌的 16S rRNA基因V3-V4 区进行DNA测序,然后进行分类操作单元(operational taxonomic units,OTU)、物种分类、α多样性、β多样性等分析,比较 3 组之间的肠道菌群差异.[结果]与健康对照组相比,门水平上IgAN组的变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)比例明显增高,分别为 18%vs.4%和 18.3%vs.5%;属水平上IgAN组大肠杆菌-志贺氏菌和双歧杆菌属丰度显著增加(14.1%vs.2.1%和 17.5%vs.4.7%),而粪杆菌属(11%vs.20.5%)、拟杆菌属(8.0%vs.21%)、巨单胞菌属(1.8%vs.8.0%)丰度降低.与健康对照组相比,门水平上MN组的变形菌门丰度增加(20%vs.4%);属水平上MN组的埃舍里奇-志贺氏菌(13.8%vs.2.1%)丰度增加,而双歧杆菌属(3.2%vs.4.7%)、粪杆菌属(18%vs.20.5%)、拟杆菌属(14.3%vs.21%)、巨单胞菌属(1%vs.8%)丰度降低.α多样性分析结果显示,肾病组丰富度指数低于健康对照组,多样性指数高于健康对照组.通过相似性分析(analysis of similarities,ANOISM)发现 IgAN 组与健康对照组之间肠道菌群构成的差异具有统计学意义(R=0.19,P=0.013),MN患者和健康对照组肠道菌群构成存在差异,但结果不具有统计学意义(R=0.08,P=0.08).线性判别分析(linear discriminant analysis,LDA)差异贡献分析发现,3 组之间共有 14 个物种存在显著差异.[结论]IgAN和MN患者的肠道微生物特征与健康对照组不同.
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编辑人员丨2023/12/9
