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结肠癌中LINC00673表达与肿瘤上皮-间充质转化的关系及其作用机制
编辑人员丨5天前
目的:探讨结肠癌组织中长非编码RNA 00673(LINC00673)表达与患者临床病理特征的关系及其作用机制。方法:实时定量聚合酶链反应(Real-time PCR)法检测河北医科大学第二医院在2017年4月至2019年6月手术切除的70例结肠癌组织及癌旁正常肠黏膜组织的LINC00673的表达。患者男45例,女25例。年龄(56.4±11.8)岁,中位年龄56岁。实验分为转染组、阴性对照组及空白对照组。分析LINC00673表达与患者临床病理特征的关系。RNA干扰技术抑制LINC00673在结肠癌细胞中的表达,检测抑制LINC00673表达后细胞上皮-间充质转化(EMT)的影响并探讨分子机制。应用SPSS 22.0统计软件分析,采用 t检验、方差分析处理数据。 结果:与癌旁正常肠粘膜组织(0.703±0.223)比较,结肠癌组织中LINC00673表达(1.393±0.345)明显增高( t=14.053, P<0.01)。LINC00673表达与肿瘤分化程度(高中分化1.004±0.273,低未分化1.491±0.245)、临床分期(Ⅰ~Ⅱ期1.009±0.274,Ⅲ~Ⅳ期1.608±0.226)、淋巴结转移(阳性1.523±0.265,阴性0.988±0.290)明显相关( t=-6.084, P<0.01; t=-9.730, P<0.01; t=6.060, P<0.01)。结肠癌细胞株LINC00673水平明显高于正常肠粘膜细胞株HIEC( F=21.364, P<0.01);抑制LOVO中LINC00673表达后细胞迁移及侵袭能力明显降低(迁移: F=1211.220, P<0.01;侵袭: F=72.672, P<0.01);细胞中EMT相关基因E-Cadherin表达增高,N-Cadherin、Vimentin、MMP-9表达明显降低( F=196.401、147.029、47.231、137.190、551.551、35.646、24.948、17.593, P<0.01),差异有统计学意义。 结论:LINC00673在结肠癌组织中表达增高,抑制LINC00673表达可通过调节EMT分子而抑制结肠癌细胞的EMT。
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编辑人员丨5天前
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结肠癌转移相关基因1在胃癌组织和血清中的表达及相关性研究
编辑人员丨5天前
目的:检测胃癌患者血清和胃癌组织中结肠癌转移相关基因1(MACC1)的表达水平,分析血清及胃癌组织中MACC1表达的相关性,并对MACC1作为胃癌发病标记物诊断的有效性进行探讨。方法:收集51例胃癌患者的血清标本、胃癌组织、癌旁组织、正常胃黏膜标本,同时收集30例正常人血清标本。分别通过和免疫组织化学法和酶联免疫吸附法(ELISA)测定MACC1在胃癌组织、癌旁组织、正常胃黏膜及血清中的表达水平。分析MACC1在血清与胃癌组织中表达的关系,并绘制受试者操作特征(ROC)曲线。分析MACC1的表达与临床病理参数(性别、年龄、发生部位、肿瘤大小、病理分型、胃壁浸润深度、局部淋巴结转移、远处转移、TNM分期)的关系。结果:与健康者相比,胃癌患者血清MACC1表达显著升高( P<0.05)。与胃黏膜组织、癌旁组织相比,胃癌组织中MACC1的表达显著升高(均 P<0.05),癌旁组织和正常组织中MACC1的表达差异无统计学意义( P>0.05)。胃癌组织和胃癌患者血清中的MACC1水平呈正相关( P<0.01)。胃癌患者血清及胃癌组织中MACC1水平与患者临床病理参数间均无统计学意义(均 P>0.05)。 结论:MACC1在胃癌患者血清及胃癌组织中均高表达,且表达水平呈正相关。MACC1有望成为诊断胃癌的临床生物指标。
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编辑人员丨5天前
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结肠癌转移相关基因1调控β-连环蛋白通路在肺腺癌侵袭转移中的作用
编辑人员丨5天前
目的:探讨结肠癌转移相关基因1(MACC1)在侵袭转移中的作用及其机制。方法:收集2016年7月至2017年9月于江南大学附属医院手术切除肺癌组织及其对应的癌旁组织180例,构建组织微阵列免疫组织化学检测组织中MACC1与β-连环蛋白(β-catenin)的表达情况。采用慢病毒介导的小干扰RNA(siRNA)下调MACC1在A549细胞中的表达,分为对照组、慢病毒空载体组和敲低组。构建短发卡RNA(shRNA)质粒实现MACC1-shRNA干扰质粒后慢病毒感染H1299细胞(购自美国ATCC公司)使MACC1基因的沉默,分为质粒转染组与慢病毒空载体组,采用5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷(EdU)法、Transwell小室实验、划痕试验分别检测细胞增殖能力、侵袭性和迁移性。组间比较采用两独立样本 t检验。 结果:组织芯片免疫组织化学显示肺腺癌组织中MACC1与β-catenin的表达水平呈正相关(相关系数0.397, P<0.05);慢病毒介导A549细胞MACC1下调后引起β-catenin表达下降[对照组(0.83±0.04)比空载体组(0.91±0.09, t=-0.241, P>0.05;空载体组(0.91±0.09)比敲低组(0.24±0.02, t=1.940, P<0.05);对照组(0.83±0.04)比敲低组(0.24±0.02, t=1.699, P<0.05];沉默MACC1后行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测H1299的β-catenin表达显著下降(0.79±0.07比0.38±0.08, t=3.267, P<0.05),且质粒转染组H1299细胞平均穿膜细胞数[(18.3±2.36)个]少于慢病毒空载体组[(36.2±2.1)个, t=-13.460, P<0.05];划痕实验显示24 h后质粒转染组[(266±27) μm]距离明显小于慢病毒空载体组[(931±36) μm, t=2.631, P<0.01]。 结论:MACC1在肺腺癌中高表达,促进癌基因β-catenin的表达,从而促进肺腺癌的侵袭转移。
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编辑人员丨5天前
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微小RNA-27b-3p靶向干扰素调节因子4调控结肠癌细胞B细胞淋巴瘤-6表达的研究
编辑人员丨5天前
目的:观察微小RNA(microRNA,miR)-27b-3p与干扰素调节因子4(IRF4)的靶向关系,分析其对结肠癌细胞B细胞淋巴瘤分子-6(bcl-6)表达的影响。方法:2015年12月至2017年1月在南昌大学第二附属医院确诊为结肠癌患者共53例,以肿瘤组织作为研究组,以正常结肠黏膜组织作为对照组。应用实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)检测miR-27b-3p的表达。应用免疫组织化学法检测结肠癌中干扰素调节因子4(IRF4)和B细胞淋巴瘤-6(bcl-6)的表达。选择人结肠癌细胞系116,构建阴性对照组、miR-27b-3p转染组、miR-27b-3p和IRF4共转染组,应用免疫印迹实验检测各组中IRF4和bcl-6的表达。应用双荧光素酶报告基因实验观察miR-27b-3p与IRF4的结合情况。组间比较采用 t检验、配对 t检验及方差分析。 结果:结肠癌中miR-27b-3p的表达(2.67±0.40)明显低于对照组(3.68±0.45, t=6.180, P<0.01),miR-27b-3p的表达在不同肿瘤最大径(≥5 cm为2.49±0.39,<5 cm为2.87±0.36)、浸润深度(浆膜及以外为2.44±0.34,未及浆膜为2.88±0.36)、脉管癌栓(有癌栓为2.28±0.42,无癌栓为2.77±0.31)、片状坏死(有坏死为2.36±0.42,无坏死为2.79±0.39)和淋巴结转移(有转移为2.37±0.41,无转移为2.81±0.22)分组的表达中差异有统计学意义( t=4.250、5.180、5.690、5.110、5.190, P值均<0.05)。miR-27b-3p与生存时间有关( χ2=5.080, P<0.05),差异有统计学意义。miR-27b-3p与IRF4( r=-0.600, P<0.05)、miR-27b-3p与bcl-6( r=-0.690, P<0.05)均呈负相关性。双荧光素酶报告基因实验显示miR-27b-3p与IRF4具有靶向关系。miR-27b-3p转染组中IRF4和bcl-6的表达低于阴性对照组( t=3.240、4.330, P<0.05),差异有统计学意义,共转染组能逆转上述改变。 结论:miR-27b-3p靶向负调控IRF4调节结肠癌细胞bcl-6的表达,miR-27b-3p低表达是肿瘤形成和进展的重要事件,检测miR-27b-3p的表达可能与生存时间有关。
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编辑人员丨5天前
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p53基因突变和Numb蛋白表达与结直肠癌临床病理学特征及预后的关系
编辑人员丨5天前
目的:研究p53基因突变和Numb蛋白表达与结直肠癌患者临床病理因素及预后的关系。方法:采用PCR及DNA测序分析60例结直肠癌组织中p53基因突变状况,Western blot检测Numb蛋白的表达,分析p53基因突变状态与Numb蛋白表达水平的相关性;在体外对结肠癌细胞系HCT116(+)和HCT116(-)分别采用基因过表达及RNA干扰,用流式细胞术检测p53基因突变与Numb蛋白表达对结肠癌细胞周期的影响。结果:60例结直肠癌组织中31例存在p53基因突变,突变率为52%,外显子(E)5、6、7、8的突变次数分别为5、6、12、11例次。Numb蛋白在p53基因突变组表达水平显著低于非突变组( P=0.009)。Numb蛋白低表达患者的预后比高表达患者的差( P=0.015),其表达水平与结直肠癌的分化程度、淋巴结转移、TNM分期密切相关(均 P<0.05)。在两种细胞中转入Numb后其细胞周期均出现G 2-M期阻滞,增殖受到抑制,DAPT则具有G 1-S期阻滞,二者无明显协同作用。 结论:结肠癌中p53基因突变状态与Numb蛋白表达密切相关,并影响细胞增殖周期及预后。
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编辑人员丨5天前
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结肠癌转移相关基因1和Polo样激酶1在结直肠癌组织的表达及其临床意义
编辑人员丨5天前
目的:探讨结直肠癌组织中结肠癌转移相关基因1(MACC1)和Polo样激酶1(PLK1)表达的临床意义。方法:收集2016年4月至2021年3月大庆油田总医院资料完整的结104例结直肠癌组织标本及癌旁正常组织标本,采用免疫组织化学法检测各组织中MACC1蛋白和PLK1蛋白表达,采用 χ2检验分析评估MACC1和PLK1的表达水平与结直肠癌临床病理因素之间的关系。 结果:MACC1蛋白在结直肠癌组织中表达率为73.08%(76/104),明显高于癌旁组织中表达率15.39%(16/104),两者差异有统计学意义( χ2=70.165, P<0.01);PLK1蛋白在结直肠癌组织中表达率为57.70%(60/104),明显高于癌旁组织中表达率24.04%(25/104),两者差异有统计学意义( χ2=24.371, P<0.01)。MACC1表达水平与结直肠癌淋巴结转移、浸润深度、TNM分期明显相关( χ2=4.697、6.307、6.899, P<0.05),PLK1表达水平与结直肠癌淋巴结转移、组织学分化程度、TNM分期明显相关( χ2=5.446、5.5076、6.307, P<0.05)。 结论:MACC1蛋白和PLK1蛋白表达与结直肠癌侵袭和转移密切相关,检测上述两种指标,并与临床指标结合,将能更准确判断结直肠癌生物学行为及预后、并指导临床治疗。
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编辑人员丨5天前
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N-乙酰转移酶10参与结直肠癌铁死亡抵抗
编辑人员丨5天前
目的:探究N-乙酰转移酶10(NAT10)对Erastin诱导结直肠癌(CRC)细胞铁死亡敏感性的影响及其机制。方法:使用公共数据库明确NAT10在CRC中的表达及其与Erastin利用度的关系;应用荧光实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)探索Erastin对NAT10 mRNA表达的影响;细胞计数试剂盒(CCK-8)检测NAT10抑制剂Remodelin联合Erastin对CRC细胞SW620活力的影响。构建NAT10稳转敲低细胞株,蛋白质印迹法(Western blot)验证敲减效率成功后,进行RNA-Seq和ac4C-RNA-Seq的测序,分析与对照组比较,NAT10敲低组出现ac4C修饰水平降低和mRNA表达水平下降的基因,再和铁死亡抑制因子集取交集,最后筛选出NAT10调控铁死亡的潜在下游靶基因。RT-qPCR或Western blot检测对照组和NAT10敲低组或Remodelin处理细胞中的转录调节因子核蛋白1(NUPR1)表达水平,验证NAT10对NUPR1的调控作用。两组间比较采取 t检验。 结果:NAT10表达越高,Erastin的药物利用度越低( R=-0.16, P<0.05),SW620细胞Erastin作用组响应性升高(1.440±0.035比1.000±0.096, t=-7.423, P<0.05),Remodelin+Erastin组细胞活力明显低于Erastin组(0.293±0.017比0.906±0.048, t=60.680, P<0.05)。通过铁死亡抑制剂Fer-1干预实验,Fer-1+Erastin+Remodelin细胞组比Erastin+Remodelin组比较,细胞活力出现下降(0.489±0.011比0.412±0.036, t=3.599, P<0.05)。成功构建NAT10稳转敲减细胞系(1.105±0.065比0.309±0.104, t=11.220, P<0.05),测序结果联合铁死亡数据库抑制基因集筛选出NUPR1是NAT10调控铁死亡的下游潜在靶基因。公共数据库证实NAT10与NUPR1呈明显正相关( R=0.40, P<0.05)。RT-qPCR证实NUPR1的mRNA表达在NAT10敲低组中低于对照组(0.087±0.007比0.198±0.005, t=20.758, P<0.05)。Western blot结果表明用Remodelin抑制NAT10表达后,NUPR1在SW480和SW620实验组中蛋白表达水平低于对照组(SW480:0.611±0.175比1.245±0.350, t=6.267, P<0.05;SW620:0.745±0.230比1.201±0.343, t=6.826, P<0.05)。 结论:结肠癌SW620细胞系中NAT10在Erastin作用下响应性升高,NUPR1可能作为其潜在靶基因介导铁死亡抵抗。
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编辑人员丨5天前
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加权基因共表达网络分析和差异基因表达分析鉴定氯离子通道附件1基因对结肠癌预后保护作用
编辑人员丨5天前
目的:结合应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和差异基因表达分析2种方法筛选结肠癌mRNA表达谱中的差异共表达基因,并分析差异共表达基因与预后的关系。方法:基于生物信息学方法从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库分别下载TCGA结肠腺癌数据集的转录组学数据和GSE68468数据集的芯片表达谱数据,筛选出两者在正常组织与结肠癌组织之间的差异表达基因(DEG)和最显著相关的加权基因模块,通过差异基因和加权基因取交集筛选出结肠癌相关差异共表达基因。构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI )网络,利用最大派系中心度(MCC)计算方法筛选出MCC评分排名前10位的核心差异共表达基因,使用TCGA结肠腺癌数据集验证核心基因在正常组织和结肠癌组织中的表达,采用Kaplan-Meier生存分析探索核心基因与患者总生存期和无病生存期之间的关系。使用人类蛋白质图谱(HPA)数据库,对生存相关的差异共表达基因进行免疫组织化学染色验证。结果:TCGA结肠腺癌数据集中DEG共3 481个,GSE68468数据集中DEG共7 275个,共获得237个差异共表达基因。使用PPI网络的MCC计算方法得到10个核心的差异共表达基因,分别为氯离子通道附件1( CLCA1)、 MAPK3、胰高血糖素( GCG)、溶质载体家族26成员3( SLC26 A3)、核受体亚家族1组H成员4( NR1 H4)、脂肪酸结合蛋白1( FABP1)、鸟苷酸环化酶激活因子2A( GUCA2 A)、二磷酸尿苷葡糖醛酸糖基转移酶家族2成员A3( UGT2 A3)、肉碱棕榈酰转移酶2( CPT2)和跨膜4域A12( MS4 A12)。与正常组织相比,TCGA结肠腺癌数据集结肠癌组织的 CLCA1、 GCG、 SLC26 A3、 NR1 H4、 FABP1、 GUCA2 A、 UGT2 A3、 CPT2和 MS4 A12 9个核心基因均下调( P均<0.05),其中 CLCA1高表达结肠癌患者的总生存期和无病生存期均长于低表达组( P均<0.05),免疫组织化学染色结果在蛋白质水平也验证了结果的准确性。 结论:CLCA1可能在结肠癌的发展中起关键作用,可作为进一步诊断和治疗的潜在生物标志物。
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编辑人员丨5天前
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KRAS基因突变对结直肠癌肝转移患者长期预后的影响及临床相关因素研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨KRAS基因状态与结直肠癌肝转移(CRLM)患者临床因素和预后的关系。方法:回顾分析2005年1月至2019年12月连续在解放军总医院第一医学中心诊治的1 248例CRLM患者资料,其中男性880例,女性368例,年龄范围21~88岁,中位年龄56岁。比较不同临床特征患者的KRAS基因突变率。单因素和多因素logistic回归分析KRAS基因突变的影响因素。Kaplan-Meier法分析生存情况,生存率比较采用log-rank检验。结果:KRAS基因野生型729例,突变型519例,突变率41.6%(519/1 248)。11例原发病灶位于双侧结肠。女性与男性、糖类抗原19-9≥38 g/L与<38 g/L、糖尿病与非糖尿病、原发病灶位于右半结肠(52.1%,160/307)与左半结肠(38.2%,355/930)的CRLM患者KRAS基因突变率比较,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。单因素回归分析显示,KRAS基因突变与性别、糖类抗原19-9、有无糖尿病、原发肿瘤部位相关。多因素logistic回归分析,原发肿瘤部位( OR=0.557,95% CI:0.423~0.733)是KRAS基因突变的独立影响因素。KRAS基因野生型CRLM患者累积生存率优于突变型,差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:CRLM中,KRAS基因突变型更易出现在右半结肠癌患者中,KRAS基因突变型患者长期预后相对较差。
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编辑人员丨5天前
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结肠癌转移相关基因1和驱动蛋白超家族23在乳腺癌组织中的表达及其临床意义
编辑人员丨5天前
目的:探讨结肠癌转移相关基因1(MACC1)和驱动蛋白超家族23(KIF23)在乳腺癌组织中的表达及其临床意义。方法:收集2015年2月至2020年11月临沂市人民医院和临沂市肿瘤医院病理学确诊的97例乳腺癌组织和对应癌旁组织,使用免疫组织化学方法检测上述组织中MACC1和KIF23表达,进行 χ2检验统计学分析两者的表达与乳腺癌临床病理学参数之间的关系。 结果:MACC1在乳腺癌组织中阳性表达率为71.13%(69/97),明显高于在癌旁组织中阳性表达率[18.56%(18/97)],两者差异有统计学意义( χ2=54.205, P<0.01)。KIF23在乳腺癌组织中阳性表达率为65.98%(64/97),明显高于在癌旁组织中阳性表达率[20.62%(20/97)],两者差异有统计学意义( χ2=40.648, P<0.01)。MACC1在表达水平与乳腺癌肿瘤大小、TNM分期、淋巴结转移明显相关( χ2=5.026、7.570、4.478, P<0.05),差异有统计学意义。KIF23表达水平与乳腺癌肿瘤大小、组织学分化程度、TNM分期、淋巴结转移明显相关( χ2=5.206、8.521、5.165、6.8206, P<0.05),差异有统计学意义。 结论:检测乳腺癌组织中MACC1和KIF23的表达有助于判断乳腺癌生物学行为。
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编辑人员丨5天前
