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普氏野马分布区域亚洲璃眼蜱的宏基因组分析与病原体评估
编辑人员丨1天前
目的 评估亚洲璃眼蜱在普氏野马分布区域传播疾病的潜在风险,研究雌、雄蜱在宏基因组水平的特征并进行病原体分析.方法 2022年4月,在新疆卡拉麦里山有蹄类自然保护区使用"守株待蜱"法采集硬蜱,利用体视镜进行形态学鉴定,提取48只蜱(雌、雄各24只)DNA,PCR扩增线粒体细胞色素C氧化酶第1亚基(COⅠ)序列进行分子生物学鉴定.将雌、雄亚洲璃眼蜱分组进行宏基因组测序,非冗余基因集与非冗余蛋白(NR)数据库进行比对,分析蜱携带的微生物群落组成;与京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库和抗生素抗性基因数据库(ARDB)进行比对,获取蜱及蜱传病原体的基因功能注释结果以及抗生素抗性功能注释结果.数据的比较采用t检验分析.结果 共采集硬蜱124只,经形态学鉴定亚洲璃眼蜱成虫119只.硬蜱DNA扩增出约700 bp的阳性条带,经测序与亚洲璃眼蜱(GenBank:MH459386.1)的序列一致性为99%~100%.宏基因组测序经质控过滤共获得469 327 812条序列读长,开放阅读框预测得到836 843~1 094 994条序列.NR数据库比对结果显示,亚洲璃眼蜱携带的细菌菌落丰度占注释到的总群落丰度的99.13%,共注释到细菌32门2 040种,变形菌门和放线菌门为优势菌门,分别占细菌群落丰度的51.52%和44.35%;嗜吞噬细胞无形体为优势菌种,占细菌群落丰度的16.35%.病毒菌落丰度占注释到的总群落丰度的0.004%,共注释到病毒5 门 21种.雌蜱和雄蜱携带的细菌群落和病毒群落的丰富度及多样性差异均无统计学意义(t=-1.180、-1.729,均P>0.05).KEGG基因功能注释到亚洲璃眼蜱新陈代谢基因占比最高(54.38%),主要的功能条目为氨基酸代谢、碳水化合物代谢、膜转运等;共识别出11 352种蛋白通路,其中154种蛋白通路在雌蜱和雄蜱间的差异有统计学意义(t=-2.348,P<0.05).ARDB注释到亚洲璃眼蜱携带154种抗生素抗性基因,包括49种抗性基因类型,主要抗性基因类型为Baca(占62.53%),抗生素类型为肝菌肽.大部分注释到的抗性基因与多重耐药相关,如Mexf、Mexb、Emrd、Mexw等.雌蜱和雄蜱在抗生素抗性基因类型的差异性对比结果显示,仅雌蜱的Emrd基因抗性高于雄蜱(t=-7.558,P<0.05).结论 本研究在宏基因组水平上揭示了亚洲璃眼蜱携带的主要细菌、病毒群落及多重耐药相关的抗生素抗性基因,雌蜱及其携带的病原体具有较高的物种丰度和基因丰度.
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编辑人员丨1天前
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基于超高效液相色谱-质谱技术分析蜱传脑炎患者脂质代谢分布
编辑人员丨1天前
目的:分析蜱传脑炎患者的代谢情况,研究蜱传脑炎对脂质代谢的影响,并阐明可能的发病机制。方法:基于液相色谱-质谱(liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS)联用技术对呼伦贝尔地区的50名蜱传脑炎患者及39名健康组样本进行脂质组学研究。利用主成分分析和正交偏最小二乘-判别分析等多元统计分析方法,对患者的血清样本进行分析。结果:在样本中共检测出465个质谱峰,鉴定出磷脂及甘油酯等代谢物。对显著变化( P<0.01,VIP>1,FC>2)的差异物进行鉴定,共筛选出26种差异代谢物,与机体的抗炎等代谢通路存在一定相关性,其中磷脂酰胆碱、磷脂酰乙醇胺等磷脂类整体趋于上调[log 2(Fold change)>0],甘油二酯、甘油三酯等甘油酯类呈现下降趋势[log 2(Fold change)<0]。且所得潜在标志物的AUC值为0.999,可用于疾病组与健康组的诊断。 结论:经病毒侵染后,人体内磷脂代谢及甘油酯代谢通路会发生一定变化,且所得差异代谢物可作为潜在标志物可用于蜱传脑炎疾病诊断,为疾病进一步研究提供理论依据。
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编辑人员丨1天前
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舟山海岛地区蜱媒病原体多样性及其基因同源性分析
编辑人员丨1天前
目的:了解舟山海岛地区蜱类所携带的病原体多样性及其基因同源性。方法:2020年4—11月,采用布旗法收集舟山海岛地区发热伴血小板减少征病例居住地周围环境中的游离蜱,采用畜体检查法采集家畜身上的寄生蜱。蜱样本提取RNA或DNA进行荧光RT-PCR检测,以嗜吞噬细胞无形体、立克次体、查菲埃里克体、新型布尼亚病毒、汉坦病毒、汉城病毒、沃尔巴克体、山羊无形体为引物进行PCR扩增初筛。扩增序列测序后进行同源性分析,以邻接法构建系统进化树。结果:共采集蜱样本99只,其中游离蜱样本39只,寄生蜱样本60只。在蜱样本中检出嗜吞噬细胞无形体、立克次体、沃尔巴克体和山羊无形体核酸阳性。此次检出的沃尔巴克体与日本报道的沃尔巴克体(AB025965)同源性为98.70%;立克次体与中国云南立克次体03(KY433580)、日本立克次体LA16同源性为99.83%;嗜吞噬细胞无形体有2个进化分支:一个进化分支与安徽桐城(MK045683)及韩国济州岛(GU064903)的嗜吞噬细胞无形体同源性为100.00%,另一个进化分支与安徽金寨的嗜吞噬细胞无形体(MK045694)同源性为99.70%。结论:舟山海岛地区是嗜吞噬细胞无形体、山羊无形体和日本立克次体的自然疫源地,暴露居民存在感染风险。
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编辑人员丨1天前
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我国新发蜱传病毒性疾病的临床特征及实验检测研究进展
编辑人员丨1天前
蜱作为第二大传染病媒介,可携带并传播多种病原造成人类感染,导致严重的公共卫生危害。近年来,我国面临着蜱传播的发热伴血小板减少综合征病毒不断流行,也有荆门蜱病毒、阿龙山病毒等新发病毒发生感染人的病例报道,为提高对这类新发蜱传病毒性疾病的认识以及掌握熟悉其实验室检测方法,该文对我国新发蜱传病毒性疾病的临床疾病特征,病毒分离、免疫学和分子生物学等实验室检测方法进行综述。
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编辑人员丨1天前
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宁波市2013—2021年发热伴血小板减少综合征流行病学特征
编辑人员丨1天前
目的:了解宁波市2013—2021年发热伴血小板减少综合征(severe fever with thrombocytopenia syndrome, SFTS)的流行特征。方法:系统收集并分析近10年来宁波市SFTS报告病例的个案资料、病原学检测数据及病原基因组测序数据。结果:2013—2021年,宁波市共报告SFTS 65例,死亡8例,病死率12.31%。患者平均年龄为53.65岁,60~70岁年龄组患者最多。宁波市下辖10个区(县)中6个区(县)有SFTS病例报告,以宁海县(33例,50.77%)和象山县(20例,30.77%)报告病例最多。发病时间呈季节性分布,7月为发病高峰,4~8月病例占全年病例数的81.54%(53/65)。76.92%(50/65)病例为农民。92.31%(60/65)病例居住在山区或丘陵地区。65例SFTS病例中,8例患者有明确蜱虫叮咬史,20例患者接触家养动物(宠物)或居住地有鼠类出没。基因测序结果显示,宁波市发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV)流行株为J2基因型和C4基因型。结论:宁波市SFTS患者多为老年农民,宁海县和象山县为高发地区,7月为发病高峰月,J2型和C4型为主要流行株。
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编辑人员丨1天前
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高压氧辅助治疗蜱传斑点热群立克次体重症脑炎1例
编辑人员丨1天前
斑点热群立克次体属于立克次体科立克次体属,是一类原核生物型、短小棒状或球形状微生物,主要经蜱虫或螨虫叮咬传播 [1]。人感染斑点热群立克次体后可出现发热、皮疹、头痛等症状,严重者可出现脑炎、呼吸衰竭等致命并发症。目前关于蜱传斑点热群立克次体引起重症脑炎的报道较少。吉林大学第一医院重症医学科收治了1例蜱传斑点热群立克次体导致重症脑炎患者,在综合治疗的基础上加用高压氧治疗,患者最终病情好转,康复出院。现报道如下。
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编辑人员丨1天前
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新疆主要蜱媒传染病流行病学及临床特征研究进展
编辑人员丨1天前
蜱属于节肢动物,是第二大病原媒介生物。蜱虫可以传播多种病原体并导致疾病,对人类及畜牧生产造成较大的损害。在我国,几乎所有省市都有蜱媒传染病的发生,但主要分布在新疆、内蒙古和黑龙江等边疆地区。新疆地区蜱媒传染病呈逐年上升趋势,病情重,且在病原分布及特征上有一定的特殊性。本文对新疆地区的主要蜱媒传染病的病原学、流行状况及临床表现进行综述。
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编辑人员丨1天前
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嗜吞噬细胞无形体致病机制的研究现状
编辑人员丨1天前
嗜吞噬细胞无形体以蜱虫为传播媒介,专性寄生于啮齿动物、反刍动物、鹿、马以及人类。当感染嗜吞噬细胞无形体的蜱虫吸食人类血液时,会将嗜吞噬细胞无形体传播至人体内,导致无形体病。随着人类户外活动的增加,蜱虫和人类的接触机会增多,患无形体病的概率也相应增大。无形体病确诊患者经强力霉素治疗大多可以痊愈,但是免疫力低下的患者有并发癫痫、肾衰竭甚至死亡的风险。全面了解嗜吞噬细胞无形体的致病机制,可以为重症患者的治疗提供新的治疗策略。因此,本综述简介了嗜吞噬细胞无形体致病相关蛋白质,然后从干扰细胞骨架重塑、抑制宿主细胞凋亡、固有免疫应答失调三个方面总结了该病原体致病机制的研究现状,并提出需要解决的关键问题。
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编辑人员丨1天前
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寄生于蝙蝠的节肢动物的病毒组:不同的媒介中高度分化的病毒
编辑人员丨1天前
蝙蝠是尼帕病毒和严重急性呼吸综合征冠状病毒等人畜共患病毒的重要宿主。然而,蝙蝠体表的吸血节肢动物是否也携带这些病毒,以及吸血节肢动物携带的病毒与蝙蝠携带的病毒之间的关系尚未报道。本研究于2012—2015年在中国云南省收集了蝙蝠体表686只吸血节肢动物,其中包括蝠蝇、蛛蝇、蜱、螨和跳蚤。采用宏转录组学方法对这些节肢动物携带的病毒进行分析,发现了144种高度多样性的单股正链RNA、单股负链RNA和双链RNA病毒,其中138种是潜在的新病毒。这些病毒分属14个不同的病毒科或目,包括布尼亚病毒目、单分子负链RNA病毒目、呼肠孤病毒科和小核糖核酸病毒目。进一步分析发现,布尼亚病毒目是蜱中最丰富的病毒群(占总病毒RNA的84%),而裸露核糖核酸病毒在蛛蝇和蝠蝇的文库中最丰富(52%~92%),其次是solemoviruses(南方菜豆花叶病毒)(1%~29%)和呼肠孤病毒(0%~43%)。这些病毒基于节肢动物类型高度聚类。值得注意的是,在蝙蝠携带的节肢动物的病毒组中没有发现蝙蝠传播的人畜共患病毒,这似乎并不支持蝙蝠体表的节肢动物是蝙蝠携带的人畜共患病毒的传播媒介。
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编辑人员丨1天前
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2016—2023年福州市登革热疫情流行特征分析
编辑人员丨1天前
通过分析2016—2023年福州市登革热流行特征发现,2016—2023年福州市累计报告登革热病例1 697例(本地病例1 512例,输入病例185例),共报告15起登革热相关突发公共卫生事件,疫情平均持续天数为71.6 d。本地登革热病例:发病高峰期集中在8—10月份,占比96.69%(1 462/1 512);分布在10个县区,年均发病率最高的3个县区为闽侯县(9.95/10万)、仓山区(6.03/10万)、台江区(5.58/10万);2019年(Moran′s I=0.18, P<0.05)和2023年(Moran′s I=0.5, P<0.05)福州市本地登革热病例空间分布呈聚集模式,鼓楼、台江、仓山、晋安区为高-高聚类区域,疫情基本聚集在市区;年龄中位数为47岁,40~70岁占比50.93%(1 770/1 512)。登革热本地病例中待业人员81.15%(1 227/1 512),学生6.81%(103/1 512)占比最高。2016—2019年发病诊断间隔时间中位数分别为3.38 d、6.67 d、3.50 d、3.75 d,2023年为3.46 d,各年份发病-诊断间隔时间中位数的差异无统计学意义( χ2=8.556 4, P>0.05)。输入性病例:主要来自东南亚国家,柬埔寨、巴布亚新几内亚、印度尼西亚占比最高,达62.70%(116/185);5—9月份为白纹伊蚊活跃期,白纹伊蚊抗药性检测结果显示蚊幼对残杀威均表现为敏感,白纹伊蚊成蚊对2种有机磷类杀虫剂(毒死蜱、马拉硫磷)表现为敏感,对1种氨基甲酸菊酯类杀虫剂(残杀威)敏感。
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编辑人员丨1天前