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西瓜果实网条突变体的转录组分析
编辑人员丨2周前
以条纹自交系西瓜(TD)和网条突变体西瓜(WT)为材料,通过分离群体的条纹性状比例探索西瓜的条性状遗传基础;以转录组测序及表达差异分析为基础,探索网条突变体西瓜在不同发育阶段的表达谱变化,筛选出条纹自交系与网条突变体西瓜之间表达差异显著的基因57个,主要富集于光合作用天线蛋白通路、生物碱生物合成通路、氨基酸代谢通路等7种代谢途径;通过加权基因共表达网络对核心基因的进一步分析,初步挖掘出部分网条突变体西瓜中有关生物胁迫抗性的基因变化情况,进一步筛选确定西瓜深绿条纹基因(ClGS,watermelon dark-green stripe)、类半胱氨酸蛋白酶抑制剂5编码基因、UDP-葡萄糖基转移酶编码基因、类长春碱合成酶编码基因、叶绿素a-b结合蛋白编码基因可能是决定西瓜网条果皮性状的核心基因;qRT-PCR验证结果表明,条纹自交系西瓜与网条突变体西瓜在基因表达上存在明显差异.本研究为西瓜不同果皮条纹育种提供了新的种质资源,也为阐明西瓜不同果皮条纹性状形成的分子调控机制提供了一定的理论依据.
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编辑人员丨2周前
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适于多物种的通用尾巴序列设计及通用体系的建立
编辑人员丨2024/7/6
[目的]荧光毛细管电泳由于其检测通量高、分辨率高等优点,被广泛应用于个体鉴定、品种鉴定、物种鉴定等多种应用场景中.尾巴序列为荧光毛细管电泳平台的广泛应用提供了高效的解决方案.为解决已有尾巴序列无法满足多物种使用需求,本研究基于编码转译技术开发高效的通用尾巴序列(universal tailed-sequence,UTS)设计工具.基于此工具设计通用尾巴序列,构建适合多作物的通用型PCR体系和程序,提高荧光电泳通量和灵活性.[方法]基于编码转译技术开发高效的通用尾巴序列设计工具,并对 3 755 个常用汉字进行编码转译,并设置序列GC含量、发卡结构及同源引物二聚体退火温度等筛选条件得到符合条件的UTS.使用BLAST工具对通用尾巴序列设计工具生成的UTS在多种生物基因组上进行同源性评估,并在玉米、番茄、辣椒、西瓜等作物上进行实验评估,构建物种通用型实验体系及程序.[结果]通过设计工具编码转译并筛选共得到 7 436 833 个高质量的候选UTS,占所有字组的 52.74%.挑选 6 个UTS在 20 个作物基因组上的BLAST结果显示其与M13 相比具有更好的特异性.通过对通用引物扩增程序进行优化,使通用引物在多个物种上的扩增成功率达到或超过 95%,并具有较强的稳定性.[结论]利用编码转译技术开发通用尾巴序列,并为其搭配物种通用型扩增体系和程序,提供一种通量高、成本低的荧光电泳通用检测方法.
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编辑人员丨2024/7/6
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川黄连调控MAPK/ERK通路对口腔溃疡大鼠微循环及Th1/Th2细胞因子的作用
编辑人员丨2024/4/13
目的 探究川黄连Coptis chinensis Franch.调控丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)/胞外信号调节激酶(ERK)通路对口腔溃疡大鼠微循环及Th1/Th2细胞水平的作用.方法 将大鼠随机分为对照组、模型组、西瓜霜(200mg·kg-1)组和川黄连20、40、80mgkg-1组,每组10只.除对照组外,采用40%冰醋酸灼烧法制备口腔溃疡模型,各给药组涂抹给药,每2天给药1次,连续给药7d.比较各组大鼠口腔溃疡面积;腹主动脉取血检测微循环指标[微量毛细管法测定红细胞压积(HCT),试剂盒法检测血清纤维蛋白原(FIB)水平,椎板式黏度计测定血浆黏度];ELISA法检测血清中炎症因子白细胞介素-6(IL-6)、IL-8和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平及血清中Th1/Th2细胞相关因子γ-干扰素(IFN-γ)、IL-10水平;HE染色观察溃疡黏膜组织病理学变化;Western blotting检测黏膜组织中ERK1/2、p-ERK1/2、p38 MAPK、p-p38 MAPK蛋白表达.结果 与模型组比较,川黄连20、40、80mg·kg-1组口腔溃疡面积均显著减少(P<0.05),黏膜上皮细胞溶解、炎症反应、组织坏死等病理学改变明显减轻;HCT、FIB、血浆黏度均显著降低(P<0.05);血清中炎症因子IL-6、IL-8、TNF-α水平均显著降低(P<0.05);血清中 IFN-γ和 IFN-γ/IL-10水平显著降低,IL-10水平明显升高(P<0.05);ERK1/2、p-ERK1/2、p38 MAPK、p-p38MAPK蛋白表达均显著降低(P<0.05),且川黄连80mg·kg-1作用最明显.结论 川黄连可改善口腔溃疡大鼠微循环,维持Th1/Th2细胞在体内平衡状态,其作用机制可能与抑制MAPK/ERK通路相关.
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编辑人员丨2024/4/13
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口腔菌群参与槟榔提取物诱发大鼠口腔溃疡的作用研究
编辑人员丨2024/3/23
目的 通过槟榔提取物构建大鼠口腔溃疡模型,观察口腔内菌群结构变化及多样性特征,探索口腔菌群和局部炎性因子参与槟榔提取物诱发大鼠口腔溃疡的发病作用机制研究,为临床防治口腔溃疡提供理论支持.方法 将30只SD大鼠随机分为正常组、模型组、药物治疗组(桂林西瓜霜,8mg/d,连续7d),10只/组.大鼠口腔黏膜经皮下注射10 g/mL的槟榔提取物,复制大鼠口腔溃疡模型.通过观察溃疡面积、溃疡评分、局部组织口腔肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、白介素-2(interleukin-2,IL-2)、IL-8 水平,并取口腔黏膜组织进行HE染色,观察其组织形态学的变化,采用高通量测序方法分析口腔微生物菌群结构分布及微生物群落多样性.结果 与正常组比较,模型组大鼠溃疡面积显著增大,溃疡评分显著上升(P<0.01),口腔黏膜组织TNF-α、IL-2、IL-8水平均显著升高(P<0.01),大鼠口腔唾液的链球菌属(Streptococcus,P<0.05)、韦荣球菌属(Veillonella,P<0.001)均显著减少,模型组大鼠口腔黏膜上皮细胞增生或局灶性坏死,黏膜固有层水肿、出血,并伴有大量的中性粒细胞和单核细胞浸润;与模型组比较,药物治疗组大鼠溃疡面积显著减少(P<0.05,P<0.01),溃疡评分显著减少(P<0.05),口腔黏膜组织TNF-α(P<0.01)、IL-2(P<0.05)、IL-8(P<0.05)水平均显著降低,大鼠口腔唾液的链球菌属(Streptococcus,P<0.001)、韦荣球菌属(Veillonella,P<0.01)显著增加,葡萄球菌属(Staphylococcus,P<0.01)显著减少,口腔黏膜组织病变程度有明显改善.结论 槟榔提取物可成功复制大鼠口腔溃疡模型,其发病机制可能与口腔正常菌群水平降低,潜在致病菌水平升高,破坏其口腔菌群微生物平衡,进而破坏机体免疫系统,引起局部促炎因子升高有关.
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编辑人员丨2024/3/23
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西瓜ClPP2C3克隆及表达分析
编辑人员丨2024/3/16
[目的]蛋白磷酸酶 2C(protein phosphatase 2C,PP2C)是动植物中均存在的一类蛋白磷酸酶,拟探究其在西瓜果实成熟过程中发挥的重要作用.[方法]通过逆转录PCR(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)从栽培类型西瓜'97103'中克隆ClPP2C3,并对其进行生物信息学、表达模式和亚细胞定位分析.[结果]西瓜ClPP2C3 的cDNA序列长度为 1 317 bp,编码 438 个氨基酸,其分子量大小为 47.81 kD,蛋白质等电点为 5.12.ClPP2C3 包含 1 个PP2C保守结构域,与负调控果实成熟的番茄SlPP2C3、草莓FaABI1 具有较高的同源性.西瓜ClPP2C3在细胞核表达.ClPP2C3在含糖量高的栽培品种中表达量显著高于含糖量低的野生品种.栽培品种ClPP2C3的 2 kb片段长度启动子活性显著高于野生品种,而 1 kb片段长度启动子活性之间无显著差异.[结论]由 1-2 kb区间SNP导致的启动子活性差异对不同含糖量品种ClPP2C3表达量存在影响.
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编辑人员丨2024/3/16
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野西瓜多糖上调LINC00476对胰腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响
编辑人员丨2024/3/2
目的 探讨野西瓜多糖通过调控LINC00476对胰腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响.方法 将胰腺癌SUIT-2细胞分为空白组和低、中、高剂量实验组,分别用0、200、400、600 μg·mL-1的野西瓜多糖处理SUIT-2细胞.用克隆形成实验检测细胞的增殖能力,用Transwell实验检测细胞的迁移、侵袭能力,用实时荧光定量聚合酶链反应法检测LINC00476和人抗原R(HuR)mRNA的表达水平,用蛋白质印迹法检测HuR蛋白的表达水平.结果 空白组和低、中、高剂量实验组的克隆形成数分别为(137.31±9.43)、(109.57±4.72)、(77.28±5.76)和(50.74±6.76)个,迁移细胞数分别为(229.21±27.67)、(188.69±9.29)、(150.98±20.25)和(109.37±8.04)个,侵袭细胞数分别为(125.96±9.20)、(100.52±7.60)、(81.65±8.62)和(66.01±5.79)个,LINC00476 mRNA 表达水平分别为 0.96±0.07、1.38±0.16、1.68±0.18 和2.18±0.30,HuR mRNA 表达水平分别为 1.05±0.07、0.81±0.06、0.58±0.10 和 0.32±0.04,HuR 蛋白相对表达水平分别为 1.00±0.09、0.74±0.05、0.55±0.03 和 0.32±0.02.与空白组比较,低、中、高剂量实验组的增殖、迁移和侵袭能力均显著降低,HuR表达水平均显著降低,LINC00476 mRNA表达水平均显著升高(均P<0.05).结论 野西瓜多糖可能通过上调LINC00476抑制胰腺癌细胞的增殖、迁移、侵袭.
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编辑人员丨2024/3/2
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基于口腔菌群平衡研究鱼胶多糖治疗口腔溃疡的作用机制
编辑人员丨2024/2/3
目的 研究鱼胶多糖对大鼠口腔溃疡的治疗效果以及鱼胶多糖治疗后大鼠口腔菌群的变化,旨在研究鱼胶多糖治疗口腔溃疡的效果及其原理.方法 用90%石碳酸溶液诱导大鼠口腔溃疡,将模型大鼠随机分为空白组(不做溃疡处理),阳性对照组(西瓜霜涂抹),鱼胶组(鱼胶涂抹),自愈组(不用药).阳性对照组和鱼胶组大鼠用药均为每天1次.于实验第4天,每组大鼠随机取7只进行口腔菌群样品分离并送测序公司进行16SrRNA基因测序,观察大鼠试验期间口腔溃疡创面的大小,体质量变化,耗粮量变化以及口腔菌群变化.结果 阳性对照组大鼠口腔溃疡痊愈时间为(6.70±0.68)d,鱼胶组口腔溃疡痊愈时间为(6.70±0.57)d,自愈组口腔溃疡痊愈时间为(12.00±0.89)d,鱼胶组与自愈组相比差异有统计学意义(P<0.001).16S rRNA基因测序结果显示,鱼胶组与自愈组之间差异菌群为黄单胞菌目(Xanthomonadales)、β 变形菌目(Betaproteobacteriales)、厚壁菌门(Firmicutes)、乳杆菌目(Lactobacillales)、鞘脂杆菌目(Sphin-gobacteriales)、微球菌目(Micrococcales)、肠杆菌目(Enterobacteriales)、假单胞菌目(Pseudomonadales)、放线菌目(Actinomycetales).结论 鱼胶多糖可通过调节口腔菌群从而起到治疗口腔溃疡的作用.
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编辑人员丨2024/2/3
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药西瓜化学成分的研究
编辑人员丨2023/12/9
目的 研究药西瓜 Citrullus colocynthis(L.)Schrad.的化学成分.方法 药西瓜 95%乙醇提取物采用硅胶、ODS-C18柱、半制备HPLC进行分离纯化,根据理化性质及波谱数据鉴定所得化合物的结构.结果 从中分离得到 12个化合物,分别鉴定为 endecaphyllacin A(1)、endecaphyllacin B(2)、khekadaengenin Ⅳ(3)、khekadaengenin Ⅴ(4)、neocucurbitacin C(5)、neocucurbitacin D(6)、23,24-dihydroisocucurbitacin B(7)、dihydro-epi-isocucurbitacin D(8)、(9β,10α)-25-(acetyloxy)-2,20-dihydroxy-9-methyl-19-norlanosta-1,5-diene-3,11,16,22-tetrone(9)、dihydrocucurbitain Q(10)、cucurbitacin E(11)、dihydrocucurbitacin E(12).结论 化合物 9 为新天然产物,化合物1~10 为首次从西瓜属植物中分离得到.
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编辑人员丨2023/12/9
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黑曲霉菌剂不同处理对西瓜根际细菌群落及土壤理化性质的影响
编辑人员丨2023/12/9
[背景]针对我国设施栽培西瓜土传病害发生严重、土壤理化性质劣变等问题,探究微生物菌剂对西瓜根际土壤微生物群落调控及土壤营养改良的作用.[目的]研究黑曲霉菌剂不同处理方式对设施栽培西瓜根际细菌多样性、群落结构及土壤理化性质的影响.[方法]通过高通量测序分析黑曲霉菌剂不同处理对西瓜根际土壤细菌多样性和群落结构的影响;采用分析化学方法测定西瓜根际土壤理化性质并解析驱动西瓜根际细菌群落动态变化的主要理化因素.[结果]黑曲霉菌剂(Y)、氨基寡糖素水剂(A)及黑曲霉菌剂与氨基寡糖素水剂配施(YA)处理,细菌 α 多样性指数如Chao1、ACE和Shannon等较对照均有所增加;不同处理西瓜根际优势细菌在门水平包括变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteriota)、绿弯菌门(Chloroflexi)、酸杆菌门(Acidobacteriota)等,其中 Proteobacteria 相对丰度最高,依次为 A(28.26%)>Y(26.74%)>YA(22.61%);黑曲霉菌剂处理西瓜根际土壤芽单胞菌科(Gemmatimonadaceae)和类诺卡氏菌科(Nocardioidaceae)相对丰度较对照明显提高到 4.06%和 2.43%,氨基寡糖素水剂处理中根际土壤假单胞菌属(Pseudomonas)丰度显著提高(P<0.05),不同处理组微枝形杆菌属(Microvirga)相对丰度较对照均有所提高;黑曲霉菌剂单独或与氨基寡糖素水剂配施处理,西瓜根际土壤全氮、全磷及速效磷含量明显提高;冗余分析(redundancy analysis,RDA)表明,土壤pH、全氮、速效磷、速效钾与西瓜根际细菌群落结构具有显著相关性(P<0.05);Spearman 相关性分析表明,根际假单胞菌科相对丰度与土壤全氮、全磷、速效磷、速效钾呈显著或极显著正相关.[结论]黑曲霉菌剂在设施栽培西瓜种植中单独或与氨基寡糖素水剂配施处理,具有提高西瓜根际土壤细菌多样性、增加有益菌群相对丰度、改良土壤理化性质从而提高土壤肥力的作用,该结果为黑曲霉菌剂产品开发及在设施栽培西瓜种植中合理应用提供了科学依据.
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编辑人员丨2023/12/9
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六神丸对口腔溃疡小鼠IL-6、IL-8水平及MAPK/ERK通路的影响
编辑人员丨2023/11/11
目的 研究六神丸对小鼠口腔溃疡的疗效及可能的作用机制.方法 将 32 只 C57BL/6JGpt 级小鼠随机分成对照组、模型组、六神丸组、桂林西瓜霜组,每组 8 只.于小鼠口腔左侧颊部黏膜上使用氢氧化钠片状晶体灼烧构建口腔溃疡模型.对口腔溃疡造模成功的小鼠分别外敷涂抹给予六神丸和桂林西瓜霜粉末 0.375 g,连续5 d.观察小鼠口腔溃疡的恢复状态,用 ELISA 试剂盒检测血清白细胞介素(IL)-6、IL-8 水平.取口腔溃疡部位组织,将溃疡组织制备匀浆,用二喹啉酸(BCA)法测定总蛋白浓度,并用Western blotting方法检测细胞外调节蛋白激酶(ERK)磷酸化水平.结果 与模型组比较,六神丸组小鼠口腔溃疡部位组织恢复情况较好,IL-6、IL-8 水平显著降低(P<0.05),局部组织中ERK磷酸化水平降低.结论 六神丸对氢氧化钠灼烧的口腔溃疡小鼠模型具有一定治疗作用,且可能的机制是通过降低血液中IL-6 和IL-8 水平,进而导致局部组织中ERK磷酸化水平降低改善病理状态.
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编辑人员丨2023/11/11
