目的:探讨时序传播图和病例活动轨迹表在描述某地区新型冠状病毒肺炎传播模式方面的优势，为政府相关部门进行疫情防控提供依据。方法:将某地区某时段确诊病例按照其发病时间、年龄、性别、密切接触人数及相互关系，绘制时序传播图和发病前14 d的活动轨迹表。结果:截至2020年2月10日，该地区报告的63例新型冠状病毒肺炎病例中，确诊57例（含死亡1例），无症状感染者6例；输入性病例57例（占总报告病例数的90.48 %），聚集性疫情报告病例36例（占总报告病例数的57.14 %），病例间互为亲友关系或同乘乘客，病例代际已传播至第4代。 结论:确诊病例时序传播图和活动轨迹表提示，该地区新型冠状病毒肺炎疫情以输入性病例为主，聚集性传播成为当地疫情发展的主要构成。确诊病例时序传播图和活动轨迹表简单明了，可一图看懂当地传播模式，值得在重大传染病防控工作中推广。

鼠疫是由鼠疫耶尔森菌（以下简称鼠疫菌）引起的一种烈性传染病，发病急、传播快且病死率极高。历史上发生过3次鼠疫大流行，导致上亿人口死亡。近20年来全球鼠疫疫情呈上升趋势，2000 - 2018年，世界卫生组织（WHO）共收到来自美洲、非洲和亚洲21个国家报告的2万多起鼠疫病例 [1]。我国动物间鼠疫一直较为活跃，且除个别年份外，几乎每年都有人间鼠疫发生。2019年11月，北京市首先出现2例内蒙古自治区输入性肺鼠疫病例，随后内蒙古自治区又报道2例腺鼠疫病例，提示这一甲类传染病仍对人们的生命安全具有极大的潜在威胁 [2,3,4]。链霉素是WHO鼠疫手册 [5]和我国《鼠疫诊疗方案（试行）》（卫办应急发[2011]第18号） [6]中治疗鼠疫的首选药物。但值得注意的是，2021年Dai等 [7]发现国内1株鼠疫菌因编码核糖体蛋白S12的rpsL基因第128 bp位点的碱基发生了突变，从而产生了对链霉素的高度耐药性。为此，本研究应用基于TaqMan-MGB荧光探针的实时荧光PCR法（简称MGB荧光探针法），选取鼠疫流行较为严重的玉树藏族自治州（以下简称玉树州）鼠疫自然疫源地内分离的鼠疫菌，检测链霉素耐药位点rpsL基因第128 bp位点碱基的突变情况，判断当地菌株的耐药情况，为鼠疫疫情的防控提供参考。

自2020年4月以来，我国新型冠状病毒肺炎疫情（简称新冠肺炎疫情）进入常态化防控阶段。在经过常态化防控探索阶段后，我国疫情防控进入了全链条精准防控的“动态清零”阶段。“动态清零”策略是在遵循“外防输入、内防反弹”防控策略的前提下，当出现本土新冠肺炎病例时，采取有效的综合性防控措施，“发现一起、扑灭一起”，快速切断疫情传播链，使每一起疫情及时终止，感染者“清零”，实现以最小成本取得最大成效。在大规模核酸检测、大数据追踪等新技术的应用下，“动态清零”策略应运而生，它是新冠疫情防控的中国经验。“动态清零”策略是我国在新冠肺炎疫情常态化防控阶段提出并实施的创新性防控策略，其防控目标、技术手段、工作重点等与传统的传染病“围堵”和“缓疫”策略有所不同。本文就我国新冠肺炎疫情防控的三个阶段、“动态清零”策略及科学内涵、演化过程、理论基础、实施阶段及效果进行了分析与总结，为冬春季疫情防控提供科学依据。

基孔肯雅热是一种蚊媒传染病，因检测手段的局限，常被误诊和漏诊。本文报道了义乌确诊的6例输入性基孔肯雅热病例，并对比国内外文献，比较了临床症状的差异，重点阐述了以往文献，特别是国内文献极少关注的淋巴细胞减少的特征。

目的:了解北京市2022全年新型冠状病毒分支BA.5.2流行特征与基因组学特征，为科学监测和防控新冠病毒感染提供依据。方法:收集北京市2022全年新冠病毒感染病例呼吸道标本，过滤后采用高通量测序法进行全基因组测序，测序数据进行比对、分析并构建系统发育树。结果:截止2022年12月中旬累计获得2 881条新冠病毒全长序列，其中BA.5.2占比12.22%，与Wuhan-Hu-1参考基因组的核苷酸和氨基酸序列一致性中位数分别为99.2%和99.0%。352条BA.5.2新冠序列共发现271个氨基酸突变位点，其中常见突变位点有ORF1ab区域的S135R和S蛋白区的D614G等35个；常见缺失位点有ORF1a基因的3 675~3 677位、ORF9b基因的27~29位和S基因的69~70位等；未发现插入变异。系统发育分析显示，北京市2022全年的BA.5.2的病毒基因组均位于GR进化支，与GISAID上的其他分支以及北京监测的其他分支存在一定的进化距离。结论:北京市2022年BA.5.2变异株的流行规律基本与全球流行趋势相一致。352条新冠病毒序列由于时间跨度长、多波输入和本土局部传播疫情共同构成，进化树存在多个进化分支并且存在高达271个氨基酸突变位点。加强对新冠病毒感染等呼吸道传染病的常规监测和全基因组测序，及时了解北京市新冠流行毒株的变化，为及时调整疾病防控策略提供指引。

目的:对天津市1例输入基孔肯雅热病例开展病毒基因分型，确定基孔肯雅病毒（CHIKV）与全球主要流行株的关系。方法:提取临床症状疑似为CHIKV感染患者血清中RNA，采用荧光定量RT-PCR法检测CHIKV核酸。两步RT-PCR法扩增编码CHIKV包膜糖蛋白E1的基因，扩增产物经测序后开展测序分析。将测序结果与全球其他地区流行毒株一同构建系统发生树。结果:天津市输入型CHIKV基因分型属于能够感染白纹伊蚊并在其体内繁殖的东/中/南非基因型印度洋亚型（ECSA-IOL）。系统发生树分析表明，此次输入的CHIKV与2016-2017年在巴基斯坦、意大利、孟加拉国等国家流行的CHIKV毒株高度同源，序列的同源性高达99.4%，并与这些国家流行的CHIKV毒株共同组成1个基因分型簇。结论:此次输入性基孔肯雅热病例感染的毒株更容易在人群中传播，提示应加强对基孔肯雅热输入性病例的防控工作，以防止该蚊媒传染病在我国发生本地聚集性传播。

目的:了解广州市新型冠状病毒肺炎（COVID-19）境外输入病例流行特征，为疫情防治工作提供科学依据。方法:资料来源于全国传染病报告信息管理系统截至2020年4月1日广州市COVID-19境外输入病例数据，采用Excel 2010和SPSS 19.0软件对数据进行整理与统计学分析。结果:截至2020年4月1日，广州市累计报告COVID-19境外输入病例103例，其中确诊病例92例，无症状感染者11例。境外输入病例确诊数占全国同期11.4 %（92/806）。男女性别比为1.58∶1（63∶40），年龄中位数31（ P 25~ P 75：22~40）岁，年龄范围11~63岁；职业以商业服务（41/103，占39.8 %）及学生（36/103，占35.0 %）为主。入境后目的地为非广东省内占43.7 %（45/103），涉及19个广东以外省份及直辖市。病例感染来源国主要为英国（27/103，占26.2 %），菲律宾（13/103，占12.6 %），美国（13/103，占12.6 %）和尼日利亚（7/103，占6.8 %）。境外输入病例涉及入境航班34条，其中发现病例≥3例的航班10条（10/34，占29.4 %），累计航程时间（11.14±0.53）h。29例（29/103，占28.2 %）在入境前已出现症状，65例（65/103，占63.1 %）在发病前已被管控。发病后被管控病例的自由活动时间为（6.76±0.79）d。境外输入病例的密切接触者人数平均53人，导致境外输入聚集性疫情13起，涉及病例36例（包括境外关联病例1例）。 结论:截至2020年4月1日，广州市COVID-19境外输入病例来源分布广泛，尚未发现病例在飞机上传播。COVID-19境外输入疫情早期扩散风险较高，政府加强境外疫情输入防控措施有效降低了社区传播风险。

本例患者长期居住于美国马萨诸塞州，急性起病，抵达中国后因发热伴贫血、黄疸就诊，血宏基因组学二代测序(mNGS)检测出田鼠巴贝虫，外周血涂片示部分红细胞内见寄生虫，确诊为人田鼠巴贝虫病，予米诺环素联合克林霉素抗感染治疗后病情好转。提示入境患者出现不明原因发热时，需了解当地流行病学特征，可选择mNGS进行病原学检测。此外，米诺环素是否可作为治疗巴贝虫病的备选药物尚需进一步探索。

目的:新型冠状病毒肺炎（新冠肺炎）自暴发以来，世界各国疫情形势、非药物防控措施、疫情下的民众行为模式及疫苗接种等差异巨大。我国疫情也在经历较长时间无本土病例后，由于境外输入等因素引起局部疫情暴发，给疫情防控带来巨大挑战。深入探讨疫情多次暴发的机制和差异性是极为必要的。方法:本研究基于SEIR传染病动力学模型，构建新颖的演化方程来融合干预措施和疫苗接种以及民众行为改变的动态过程。发展方法计算最优的干预强度和疫苗接种速率使得易感人群规模低于其阈值，从而避免疫情的二次暴发。结果:强干预或超强干预措施过早地解除，一个弱的诱因会不同程度地导致新冠肺炎疫情的再次暴发，而且早期控制措施越强，解除后二次暴发的程度越大；民众个体行为变化对疫情的敏感性程度以及防控措施的加强与解除是诱导疫情多次暴发的关键因素；最优的早期干预措施和及时优化接种疫苗不仅能够避免后期疫情的多次暴发，更能有效地降低第一波疫情的峰值并推迟其到来的时间。结论:本研究揭示了干预措施的强弱与解除、民众行为对疫情的响应切换、疫苗接种率和时效性、外界诱因和新冠病毒传播强度等因素诱导新冠肺炎疫情的多次暴发。

疟疾是疟原虫感染所致的地方性传染病，主要在热带和亚热带地区流行。尽管世界卫生组织在2021年6月宣布我国通过了消除疟疾认证，但随着国际交流的日益频繁，我国面临的输入性疟疾威胁将长期存在。为促进临床医师深入了解并合理治疗疟疾，提高疟疾诊治的水平，国内感染病及寄生虫病领域相关专家共同编写了《疟疾诊疗指南》。该指南对疟疾的病原学、流行病学、发病机制、临床表现、实验室检查、诊断及鉴别诊断、治疗、护理、预防等方面进行介绍，并重点强调了应对不同临床状况时的治疗方案，以便临床医师合理应用。