鼠疫是由鼠疫耶尔森菌（以下简称鼠疫菌）引起的一种烈性传染病，发病急、传播快且病死率极高。历史上发生过3次鼠疫大流行，导致上亿人口死亡。近20年来全球鼠疫疫情呈上升趋势，2000 - 2018年，世界卫生组织（WHO）共收到来自美洲、非洲和亚洲21个国家报告的2万多起鼠疫病例 [1]。我国动物间鼠疫一直较为活跃，且除个别年份外，几乎每年都有人间鼠疫发生。2019年11月，北京市首先出现2例内蒙古自治区输入性肺鼠疫病例，随后内蒙古自治区又报道2例腺鼠疫病例，提示这一甲类传染病仍对人们的生命安全具有极大的潜在威胁 [2,3,4]。链霉素是WHO鼠疫手册 [5]和我国《鼠疫诊疗方案（试行）》（卫办应急发[2011]第18号） [6]中治疗鼠疫的首选药物。但值得注意的是，2021年Dai等 [7]发现国内1株鼠疫菌因编码核糖体蛋白S12的rpsL基因第128 bp位点的碱基发生了突变，从而产生了对链霉素的高度耐药性。为此，本研究应用基于TaqMan-MGB荧光探针的实时荧光PCR法（简称MGB荧光探针法），选取鼠疫流行较为严重的玉树藏族自治州（以下简称玉树州）鼠疫自然疫源地内分离的鼠疫菌，检测链霉素耐药位点rpsL基因第128 bp位点碱基的突变情况，判断当地菌株的耐药情况，为鼠疫疫情的防控提供参考。

目的:采用RNA干扰技术下调DJ-1基因在肺鳞癌细胞HTB-182中的表达，采用串联亲和纯化质谱(TAP-MS)技术寻找DJ-1在HTB-182细胞系中的相互作用蛋白。方法:构建靶向DJ-1基因siRNA慢病毒载体，感染HTB-182细胞(DJ-1 siRNA组)，并设立慢病毒载体对照组(Control siRNA组)及空白对照组，采用Western blot法检测DJ-1蛋白表达水平，建立内源性的DJ-1蛋白表达沉默的si-DJ-1-HTB-182细胞。设计DJ-1的特异性引物，构建带有链霉素结合肽标签(SBP)、钙调蛋白结合肽标签(CBP)的DJ-1表达质粒pNTAP-DJ-1，用脂质体稳定转染细胞系DJ-1 siRNA HTB-182，G418筛选阳性克隆，Western blot进行验证，TAP-MS技术寻找DJ-1的相互作用蛋白。结果:DJ-1 siRNA干扰组中DJ-1的蛋白质表达明显低于空质粒(NC)组和空白对照(BC)组( P<0.05)；成功构建了稳定表达pNTAP-DJ-1质粒的HTB-182细胞系；TAP-MS筛选到DJ-1相互作用的三个蛋白质：细胞角蛋白1(Keratin 1)、细胞角蛋白10(Keratin 10)和NADPH氧化酶活化蛋白P47(P47 Px)。 结论:Keratin 1、Keratin 10和P47 Px可能是DJ-1蛋白的相互作用蛋白。

目的:探讨基于药敏试验比例法的耐多药肺结核(multidrug-resistant pulmonary tuberculosis，MDR-PTB)患者精准治疗的效果，为制订MDR-PTB治疗方案提供科学依据。方法:选取2016年1月5日至2018年4月30日在深圳市慢性病防治中心行结核病治疗的180例MDR-PTB确诊患者，初始治疗方案为6个月阿米卡星、吡嗪酰胺、左氧氟沙星、乙胺丁醇、丙硫异烟胺/18个月吡嗪酰胺、左氧氟沙星、乙胺丁醇、丙硫异烟胺。根据是否完善10种常用药物的药敏试验比例法分为精准治疗组和经验治疗组，精准治疗组根据药物敏感试验结果调整治疗方案。回顾性分析两组患者治疗方案及病情转归等资料。统计学分析采用 χ2检验。 结果:180例患者中，精准治疗组113例，经验治疗组67例。精准治疗组药物的耐药率从低到高依次为：卷曲霉素(0，0/113)、阿米卡星(2.65%，3/113)和卡那霉素(2.65%，3/113)、对氨基水杨酸(7.96%, 9/113)、丙硫异烟胺(11.50%，13/113)、氧氟沙星(38.05%, 43/113)、乙胺丁醇(39.82%, 45/113)、链霉素(76.99%, 87/113)。精准治疗组患者在治疗过程中根据药敏试验比例法进行药物调整104人次，从低到高依次为：阿米卡星(3人次)、丙硫异烟胺(13人次)、左氧氟沙星(43人次)、乙胺丁醇(45人次)。精准治疗组治疗成功率为78.8%(89/113)，高于经验治疗组的52.2%(35/67)，差异有统计学意义( χ2＝13.805， P＝0.000 2)。精准治疗组和经验治疗组患者治疗过程中，丙氨酸转氨酶升高[32.3%(31/96)比34.0%(18/53)]、血肌酐升高[4.2%(4/96)比5.7%(3/53)]、白细胞计数减少[24.0%(23/96)比22.6%(12/53)]患者比例差异均无统计学意义(均 P>0.05)。 结论:基于药敏试验比例法的传统MDR-PTB治疗方案具有较高的治疗成功率，仍是值得选择的治疗方式。

目的:了解我国是否存在耐药及耐消毒剂鼠疫菌株，为鼠疫临床治疗提供准确信息。方法:收集我国1943 - 2016年分离自10处鼠疫自然疫源地的2 753株鼠疫菌，根据美国国立生物信息中心（NCBI）公布的耐氨基糖苷类链霉素基因strA、strB，耐β-内酰胺类抗菌药物基因TEM、SHV、CTX-M，耐磺胺类药物基因sul1、sul2、sul3，耐消毒剂基因qacE△1-sul1的序列信息，分别针对每个基因设计1对引物。提取2 753株鼠疫菌基因组DNA，采用PCR法对所有DNA样本进行上述9个目的基因扩增。结果:PCR检测阴性对照和阳性对照成立，2 753株鼠疫菌DNA样本均未见耐氨基糖苷类链霉素基因strA、strB，耐β-内酰胺类抗菌药物基因TEM、SHV、CTX-M，耐磺胺类药物基因sul1、sul2、sul3及耐消毒剂基因qacE△1-sul1对应的目的条带。结论:我国鼠疫菌尚未检测到上述耐药及耐消毒剂基因，但鼠疫菌耐药性的监测工作仍需持续开展。

本研究旨在构建基于核酸滚环扩增（RCA）的简便快速、超灵敏的光学生物传感技术，并将其运用于结核杆菌耐药相关基因的多重检测。本研究在2020年2月至2021年5月期间，于陆军军医大学第一附属医院检验科，针对异烟肼、利福平和链霉素耐药的高频基因突变位点katG315（AGC?ACC）、rpoB531（CAC?TAC）和rpsL43（AAG?AGG），分别设计锁式探针（padlock probe，PLP）、引物和捕获探针，构建了基于磁珠的固相RCA恒温扩增反应体系，并进行了实验参数的优化。通过多色荧光探针（Cy3/Cy5/ROX）对RCA产物精准捕获与信号放大，实现了对3种突变基因的单管多重检测。进一步对该方法的灵敏度、特异性与线性范围等分析性能进行验证，结果显示同一反应体系中katG315的响应范围为1.0 pmol/L至0.1 nmol/L，rpoB531和rpsL43的响应范围为1.0 pmol/L至50.0 pmol/L和1.0 pmol/L至20.0 pmol/L，且该方法具有较好的特异度与灵敏度，在混合靶标中可精确识别单碱基突变，最低检出限低至1.0 pmol/L；在模拟血清样本的回收实验中，回收率可达95.0%~105.2%。综上，本研究构建的恒温扩增型多重检测方法可快速实现3种耐药突变位点的单管多重检测，该技术成本低廉、简便快速、不依赖大型设备，为病原体耐药基因检测提供了一种新的分析方法。

目的:研究结直肠癌荷瘤小鼠中广谱抗生素的使用及其诱导的抗生素耐药菌对氟尿嘧啶(5-fluorouracil，5-FU)化疗疗效的影响及其中的抗肿瘤免疫相关机制。方法:结直肠癌细胞CT26皮下荷瘤小鼠随机分成4组：荷瘤对照组，氨苄青霉素、链霉素和多黏菌素处理的抗生素组，5-FU化疗组和抗生素+5-FU组。监测记录小鼠肿瘤体积、体重。末次化疗后第7天，流式细胞术检测脾脏中免疫细胞亚群比例和与CT26共培养后增殖的CD8 +T细胞比例；16S rRNA测序分析肠道菌群组成，并分离培养各组小鼠肠系膜淋巴结中的细菌。用分离的细菌刺激骨髓来源的巨噬细胞，定量PCR法检测M1型和M2型巨噬细胞标志分子的表达，流式细胞术检测与细菌处理的巨噬细胞进行共培养的CD8 +T细胞的增殖。将分离自抗生素+5-FU组的细菌和等体积PBS分别灌胃至进行5-FU化疗的CT26荷瘤小鼠，检测小鼠肿瘤大小、肠道菌群组成和与CT26共培养后增殖的CD8 +T细胞比例。 结果:抗生素+5-FU组小鼠的肿瘤体积大于5-FU组，小鼠体重显著低于5-FU组。抗生素的使用对脾脏CD4 +T细胞、CD8 +T细胞、中性粒细胞的比例影响不显著，但促进单核细胞比例升高；抗生素+5-FU组体外增殖的肿瘤特异性CD8 +T细胞比例下降，低于5-FU组。与对照组和5-FU组比较，抗生素的使用导致肠道菌群组成发生变化，菌群α多样性指数明显降低；从抗生素组、5-FU组和抗生素+5-FU组小鼠的淋巴结中分别培养出大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和奇异变形杆菌。奇异变形杆菌处理的骨髓来源的巨噬细胞显著表达M2型巨噬细胞标志分子精氨酸酶，且与该组巨噬细胞共培养后增殖的CD8 +T细胞比例下降。奇异变形杆菌灌胃后小鼠肠道菌群中有变形杆菌属细菌富集，对肿瘤生长没有明显影响，但体外增殖的肿瘤特异性CD8 +T细胞比例下降。 结论:广谱抗生素抑制化疗疗效及肿瘤特异性CD8 +T细胞的增殖，抗生素耐药菌可能在其中发挥作用。

目的:开展耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌（CRKP）全基因组测序，揭示CRKP院内耐药基因流行状态，指导医院感染防控的开展。方法:收集蚌埠市第三人民医院2018年11月至2019年3月临床分离的CRKP，用VITEK-2 Compact分析仪进行菌种鉴定和药敏实验，筛选出的CRKP用Illumina Hiseq 2500平台全基因组测序，SPAdes-2.0序列拼接，采用cgMLST分型法，分析提取核心基因与耐药基因型、SCOTTI软件构建菌株关联图与传播图。结果:19株CRKP菌株中CT3176基因型13株、CT1313型与CT1689型各2株，其他型2株，CT3176型主要分布在重症医学科，呈流行状态；菌株主要携带β-内酰胺酶（耐碳青霉烯类）中的blaKPC-2（19/19）、blaCTX-M-65（19/19）、blaSHV-11（16/19）、blaTEM-1B（14/19），耐氨基糖苷类中的aadA2（14/19）、rmtB（14/19）、AAC（3）-Ⅱd（12/19）、armA（11/19），耐链霉素中的mph（E）（11/19）、msr（E）（11/19）、mph（A）（10/19），耐磷霉素中的fosA6（19/19）等耐药基因；软件分析出编号7与29菌株之间有42%、编号12与17菌株有37%的传播概率，其他菌株间传播概率较低。结论:利用微生物全基因组测序可获得菌株分型与耐药基因携带等基本信息，判定菌株的同源性，编制菌株关联图与传播图，可有效指导医院感染防控工作的开展。

目的:利用全基因组测序数据分析中国耐多药结核分枝杆菌的耐药相关基因突变谱及主要突变类型与菌株基因型的相关性。方法:查询并下载NCBI数据库中截至2019年8月公开发表的中国结核分枝杆菌全基因组测序数据，利用全基因组数据预测菌株分子药敏结果，统计不同药物耐药相关基因的突变类型，并分析耐药突变类型与菌株基因型的相关性。结果:根据分子药敏结果从2 019株菌株中鉴定出1 024株耐多药菌株，对常用抗结核药物的耐药相关基因主要突变类型分别为 katG S315T（73.2%，异烟肼）、 rpoB S450L（63.1%，利福平）、 rpsL K43R（70.0%，链霉素）、 embB M306V（37.4%，乙胺丁醇）、 pncA启动子区T（-11）C（7.9%，吡嗪酰胺）、 gyrA A90V （32.3%，氟喹诺酮类）、 rrs A1401G（67.7%，二线注射类）、 fabG1启动子区C（-15）T（87.0%，乙硫异烟胺）、 folC I43T（30.4%，对氨基水杨酸）。其中， katG S315T、 rpsL K43R、 embB M306V、 gyrA D94G在L2系菌株中的频率显著高于L4系菌株， folC I43T仅在L2系菌株中发现； katG S315T在古典北京型菌株中比例较高，而 rpsL K43R在现代北京基因型菌株中的比例更高，其差异均有统计学意义（均 P<0.05）。 结论:本研究提供了基于全基因组测序的我国耐多药结核分枝杆菌对多种常用抗结核药的耐药相关基因主要突变类型，为研发敏感、特异的快速分子检测方法提供了依据；同时也发现多种耐药相关基因主要突变类型与菌株基因型有关。

目的:测定11种抗菌药物对鼠疫耶尔森菌（简称鼠疫菌）的最低抑菌浓度（minimum inhibitory concentration，MIC），建立鼠疫菌MIC测定方法，掌握常用抗生素对鼠疫菌的抑菌范围，为鼠疫的临床治疗提供基线数据。方法:根据美国临床和实验室标准协会（Clinical Labor Standard Institution，CLSI）药敏试验方法中的琼脂稀释法，分别测定氧氟沙星、环丙沙星、复方新诺明（甲氧苄啶-磺胺甲恶唑）、硫酸卡那霉素、硫酸链霉素、头孢曲松钠、氨苄青霉素钠、氯霉素、盐酸壮观霉素、头孢呋辛钠、盐酸四环素共11种抗菌药物对118株鼠疫菌的MIC，并计算MIC 50、MIC 90（能抑制50%、90%细菌生长的最低药物浓度）。以纸片扩散法的检测结果作为对照观察两者的一致性。118株鼠疫菌分离自青海省鼠疫自然疫源地，由青海省地方病预防控制所保存。 结果:检测的118株鼠疫菌，未发现具有单个或多个抗菌药物抗性的菌株，与纸片扩散法结果一致，并获得11种抗菌药物对118株菌的MIC 50、MIC 90。 结论:成功建立了鼠疫菌MIC测定方法，该方法能高通量测定抗菌药物对鼠疫菌的MIC，评价鼠疫菌对抗生素的敏感性，是一种高效、经济、实用的实验手段。

目的:分析湖南省吡嗪酰胺耐药结核病的流行情况及危险因素，描述相应结核分枝杆菌分离株的基因型分型和成簇特征。方法:收集湖南省胸科医院（湖南省结核病防治所）2016年1月至2018年12月，3 862例完成包括吡嗪酰胺在内的五种一线抗结核药物（吡嗪酰胺、异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇）药敏测试的患者基本信息和药敏结果，计算吡嗪酰胺耐药结核病的流行率，并采用单变量和多变量的logistic回归分析对其进行危险因素分析；选取2017年6月至2018年6月212株吡嗪酰胺耐药结核分枝杆菌分离株，对其进行24位点的MIRU-VNTR分型，用遗传差异值（h值）和Hunter-Gaston指数（HGI）进行位点分辨率的评价，运用BioNumerics 5.0软件对MIRU-VNTR结果进行成簇分析；并进一步对簇内的菌株进行 pncA测序分析。 结果:湖南省结核病患者的吡嗪酰胺耐药率为14.7%（566/3 862），耐多药结核病（MDR-TB）患者的吡嗪酰胺耐药率为60.5%（511/844）。多变量logistic回归分析结果显示，相比抗结核药物全敏感（异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇均为敏感）的结核病患者，单耐异烟肼、MDR-TB患者产生吡嗪酰胺耐药的风险更高，调整OR值（95% CI）分别为：13.08（5.67~30.18）、298.41（164.88~540.08）， P值均<0.01。成簇性分析结果显示：65株菌株形成19个簇，成簇率为30.7%（65/212），8个簇至少存在两株菌株具有相同的 pncA突变类型，其中4号簇的4例患者、6号簇的3例患者和16号簇的2例患者均居住在同一个县。至少有47.6%［101（47例初治患者+54例复治成簇患者）/212］的吡嗪酰胺耐药结核病患者提示是由传播导致的。 结论:湖南省吡嗪酰胺耐药结核病的流行形势较严峻，对任意一线抗结核药物耐药的结核病患者，尤其是MDR-TB患者，需尽快进行吡嗪酰胺药敏测试从而确定治疗方案；近一半结核病患者产生吡嗪酰胺耐药是由于传播导致，吡嗪酰胺耐药结核病的防治策略是重点做好患者的规范化治疗和管理的同时，加强对传染源的发现和控制。