为了探明柞蚕(Antheraea pernyi)卵与赤眼蜂(Trichogramma)之间内共生菌的相互联系,通过 16S rRNA高通量测序技术对赤眼蜂和柞蚕卵的内共生菌多样性及相对丰度进行了测定,并通过KEGG和COG分析了内共生菌生物群落代谢途径差异,预测了生物群落蛋白功能.结果表明,柞蚕卵内共生菌物种丰度在各级分类单元上均高于赤眼蜂,二者共有内共生菌为肠杆菌属(Enterobacter)、假单胞菌(Pseudomonas)、泛菌属(Pantoea)、埃希氏杆菌-志贺氏菌属(Escherichia-Shigella)、芽胞杆菌属(Bacillus)和鞘氨醇单胞菌属(Sphin-gomonas),除芽胞杆菌属隶属于厚壁菌门(Firmicute)外,其他均隶属于变形菌门γ-变形菌纲(γ-proteobacte-ria).就相对丰度而言,赤眼蜂体内葡萄球菌属(Staphylococcus)分布量最高,而柞蚕卵内不动杆菌属(Acineto-bacter)分布量最高.KEGG代谢途径差异分析表明,微生物群落功能主要为氨基酸和碳水化合物代谢,但不同代谢功能的强弱有差异.COG生物群落蛋白功能预测表明,赤眼蜂内共生菌群落蛋白质的氨基酸转运代谢功能显著强于柞蚕卵,但是柞蚕卵内共生菌群落蛋白的脂质转运代谢功能和信号传导功能显著强于赤眼蜂.尽管赤眼蜂和柞蚕卵内共生菌的丰度和多样性有差异,但二者存在多种共有共生菌,这些共有共生菌为次生共生菌,参与了赤眼蜂和柞蚕卵的氨基酸代谢功能、碳水化合物代谢功能以及胞膜转运功能等,因此可能在柞蚕卵和赤眼蜂之间进行平行传递.

目的 鉴定速效救心丸干预稳定型心绞痛气滞血瘀证患者的差异代谢物、代谢通路,探讨速效救心丸相关治疗作用机制.方法 选择 2019 年 9 月—2021 年 9 月在东直门医院等接受义诊的患者和健康人,试验组纳入30 例稳定型心绞痛气滞血瘀证患者,对照组纳入30 名健康人.利用液相色谱-质谱技术对两组受试者进行血清代谢组学分析,采用多变量偏最小二乘回归分析模型的前2 个主成分的VIP值,结合单变量分析差异倍数和P值筛选差异代谢物,基于京都基因与基因组百科全书数据库对差异代谢物进行代谢通路富集分析.结果 共鉴定出试验组与对照组的差异代谢物18 种,其中,4-羟基肉桂酰亚胺、胆绿素-Ⅸ-β、2-亚甲基谷氨酸等代谢物含量低于健康人,左旋肉碱、维生素BT、胍丁胺、柠康酸、鸟嘌呤、薄荷脑等代谢物含量高于健康人.对比试验组患者服用速效救心丸治疗前后的21 种差异代谢物,治疗后细菌叶绿素a、植物鞘氨醇、4-氧视黄醇、神经酰胺、1-甲基鸟嘌呤等代谢物含量较治疗前下降,6-酮前列腺素E1、树脂毒素、前列腺素G2 含量较治疗前升高.差异代谢物质的异常变化提示稳定型心绞痛患者体内可能存在氨基酸、脂质、视黄醇、嘌呤、卟啉和叶绿素、瞬时受体电位通道的炎症介质调节、血清素能突触等多种代谢途径的紊乱.结论 稳定型心绞痛气滞血瘀证患者与健康人体内代谢物存在明显差异,速效救心丸具有双向调节体内血清代谢物的作用,从而发挥调节肠道菌群、维持肠道屏障、改善血脂水平、增加血管内皮功能的稳定、减轻组织细胞炎症反应、抗氧化等作用.

鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas)不仅细胞膜含有比脂多糖更疏水的鞘糖脂,而且具有高效的代谢调控机制和基因调控能力,使其在威兰胶合成、环境修复和促进植物生长等方面具有巨大的应用潜力.目前国内在鞘氨醇单胞菌代谢机制方面的研究尚无新突破.本文主要综述了鞘氨醇单胞菌的系统分类、基因组学、基因调控机制及其应用等方面的研究,从基因层面分析鞘氨醇单胞菌产威兰胶的合成机制,为后续鞘氨醇单胞菌高密度发酵、工业化生产等研究提供理论基础,以便进一步发掘其在生物技术上的应用潜力.

目的 通过分析自身免疫性肝病(AILD)患者肝组织中是否存在特异性细菌,拟为AILD发病机制的研究提供线索.方法 纳入2017年8月至2018年8月在天津医科大学总医院消化科就诊的12例AILD患者[其中4例自身免疫性肝炎(AIH),4例原发性胆汁性胆管炎(PBC),4例PBC-AIH重叠综合征(OS)]和4例肝囊肿患者(对照),均行肝活组织穿刺检查.对所获无菌肝组织进行16SrRNA基因测序,基于线性判别分析效应量找出差异菌,以Spearman相关性分析探讨肝脏菌群与疾病的相关性,并对测得的16S rRNA基因序列进行代谢功能的预测.结果 16例纳入患者肝组织中均检测到细菌.在种水平,AIH组莱比托游动球菌丰度为0.100％,高于其余3组的0,差异有统计学意义[线性判别分析(LDA) =3.31,P=0.034];PBC组嗜热厌氧芽孢杆菌相对丰度为0.200％,高于其余3组的0.100％,差异有统计学意义(LDA=3.34,P=0.014).铜绿假单胞菌PAO1、坚强芽孢杆菌、土壤短芽孢杆菌、鲍曼不动杆菌、玉米鞘氨醇单胞菌、肠沙门菌的相对丰度与血清GGT水平均呈负相关(r=-0.68、-0.68、-0.67、-0.68、-0.68、-0.66,P均＜0.01).与肝囊肿组患者相比,AILD患者脂质代谢途径减弱.血清低密度脂蛋白和总胆固醇的水平与不饱和脂肪酸的生物合成均呈负相关(r=-0.55、-0.65,P均＜0.05).结论 AIH组和PBC组患者肝组织中存在特异性细菌.与AILD发病机制密切相关的肝脏微生物群,可能是一种潜在的诊断和治疗靶点.

目的 为了解医院环境中革兰阴性非发酵菌的分布状况及耐药情况.方法 2017年10月集中采集黑龙江省内11所三级甲等医疗机构不同重点科室环境物体表面及医护人员手样品198份,其中物体表面176份,医护人员手消毒后采样22份.使用法国梅里埃Vitek微生物鉴定仪对分离菌株进行鉴定及药敏试验.使用K-B法药敏纸片法对检出菌株进行同步耐药性检测.结果 22份医护人员手样品中未检出革兰阴性非发酵菌,物体表面检出15株,检出率为8.52％(15/176);以鞘氨醇单胞菌,鲍曼不动杆菌,栖稻假单胞菌为主,且均呈现多重耐药性;硝基呋喃类、叶酸代谢途径抑制剂类抗生素耐药率最高,达到80％.结论 环境中革兰阴性非发酵菌耐药明显,应在临床治疗及选择抗生素时予以关注.

目的:研究黄芪注射液对白细胞减少症模型小鼠的干预作用.方法:将昆明种小鼠随机分为正常组、模型组和药物组,每组8只.模型组和药物组小鼠均腹腔注射环磷酰胺以复制白细胞减少症模型,正常组小鼠腹腔注射等体积无菌注射用水.造模成功后,正常组和模型组小鼠均腹腔注射等体积无菌注射用水,药物组小鼠腹腔注射黄芪注射液0.04 mL/10 g,每日1次,连续7 d.在检测各组小鼠血常规指标(白细胞、淋巴细胞、中性粒细胞、单核细胞计数)的基础上,采用液质联用技术(LC-MS)分析血清中的代谢产物,并通过主成分分析(PCA)、偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)、正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)等多元统计分析以及HMDB、METLIN、KEGG等数据库和相关文献指认、鉴定差异代谢物;借助MetPA在线工具对差异代谢物的代谢通路进行分析,并基于皮尔逊相关系数分析血常规指标与差异代谢物的相关性.结果:与正常组比较,模型组小鼠血常规指标计数均显著减少(P<0.01);与模型组比较,黄芪注射液组小鼠上述血常规指标均显著增加(P<0.01).正常组和模型组小鼠血清样品的LC-MS图谱明显不同,且黄芪注射液组血清样品LC-MS代谢组学数据与正常组接近.多元统计分析和相关数据库分析显示,与正常组比较,模型组小鼠血清中L-异亮氨酸、二十碳五烯酸等17个代谢物含量显著升高,亚精胺等4个代谢物含量显著降低(P<0.05或P<0.01);与模型组比较,黄芪注射液可回调小鼠血清中柠檬酸、L-脯氨酸、乙酰肉碱、L-异亮氨酸、L-苯丙氨酸、1-磷酸鞘氨醇、溶血磷脂酰肌醇、二十碳五烯酸和亚油酸等9个代谢物的含量(P<0.05或P<0.01),且主要与亚油酸代谢,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成,苯丙氨酸代谢等通路有关(代谢通路影响值均大于0.1).相关性分析显示,血常规指数与模型组中含量升高的D-鞘氨醇、亚油酸、柠檬酸等含量之间的相关性较明显(r的绝对值普遍大于0.5).结论:黄芪注射液可增加白细胞减少症模型小鼠的白细胞、淋巴细胞、中性粒细胞、单核细胞计数;其升高白细胞的作用可能与亚油酸代谢,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成及苯丙氨酸代谢等途径有关.

目的:研究黄芪注射液中次生成分作用于白细胞减少症模型小鼠的代谢组学.方法:将小鼠分为正常组、模型组、黄芪注射液组(0.004 mL/g)及其次生成分低、中、高剂量组(0.004、0.008、0.016 mL/g),每组7只.除正常组外,其余各组小鼠均腹腔注射环磷酰胺(80 mg/kg)以复制白细胞减少症模型.造模成功后,各给药组小鼠腹腔注射相应药物,正常组和模型组小鼠腹腔注射等体积无菌注射用水,每天1次,连续7d.实验期间,每隔2d测定小鼠的体质量变化.末次给药后,采用动物血液分析仪检测小鼠的血常规指标[白细胞(WBC)、中性粒细胞(NE)、淋巴细胞(LY)、单核细胞(MO)计数],采用超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱法,结合多元统计分析方法,对小鼠血清进行代谢组学分析.结果:与模型组比较,次生成分低剂量组小鼠体质量在给药第4、8天时均显著增加(P<0.05),次生成分各剂量组小鼠血清中WBC、NE、LY、MO计数均显著升高(P<0.05或P<0.01).经代谢组学分析显示,黄芪注射液中次生成分可显著回调白细胞减少症模型小鼠血清中亚精胺、尿酸、柠檬酸、烟酰胺、二十碳五烯酸、亚油酸、芥酰胺、1-磷酸鞘氨醇等8个差异代谢物的含量,其作用涉及亚油酸代谢途径、烟酸和烟酰胺代谢途径、三羧酸循环途径.结论:黄芪注射液中次生成分具有升高白细胞减少症模型小鼠白细胞的作用,其作用机制可能与干预亚油酸代谢途径、烟酸和烟酰胺代谢途径、三羧酸循环途径有关.

目的 观察高脂高糖饮食致五指山小型猪动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)模型肠道菌群的变化.方法 雄性五指山小型猪12只,按体重分为两组,即正常对照(NC)组和模型(AS)组,每组6只.NC组饲喂正常饲料,AS组饲喂高脂高糖饲料,连续饮食24周后,前腔静脉采血测定糖脂代谢等生化指标,同时进行葡萄糖耐量试验.实验结束后行安死术,观察体内脂肪沉积,并取主动脉血管行苏丹IV染色和腹主动脉血管行HE染色分别观察脂质沉积和组织病理学变化.取盲肠内容物进行16S rDNA测序分析肠道菌群的变化.结果 与NC组比较,AS模型组血清总胆固醇(TC)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、血糖(GLU)、果糖胺(FMN)菌明显升高(P<0.05,P<0.01),体重和体内脂肪沉积亦显著增加(P<0.01),同时AS模型组主动脉血管明显脂质沉积和AS病变.肠道菌群测序分析显示,与NC组相比,AS模型组肠道菌群α-多样性显著降低(P<0.05,P<0.01).在门水平上,AS模型组拟杆菌门和放线菌门明显下降(P<0.05,P<0.01),变形菌门和厚壁菌门/拟杆菌门比值均显著升高(P<0.05).在属水平上,AS模型组黑斯伯利亚菌属(Hespellia)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、毛螺菌属(Lachnospiracea_incertae_sedis)、假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)、巴恩斯氏菌属(Barnesiella)等17个菌属的相对丰度显著下降(P<0.05,P<0.01),沙壤土杆菌属(Ramlibacter)、鞘氨醇杆菌属(Sphingorhabdus)、污水管杆菌属(Cloacibacillus)、草酸杆菌属(Oxalobacter)、鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)、新鞘脂菌属(Novosphingobium)等11个菌属的相对丰度显著上升(P<0.05).功能预测分析显示,脂多糖生物合成、脂多糖生物合成蛋白途径、初级胆汁酸的生物合成、花生四烯酸代谢等多条途径可能参与AS的形成.相关分析显示,TC、内中膜厚度、脂质沉积、果糖胺与草酸杆菌属、鞘氨醇单胞菌属、污水管杆菌属、梭菌属、瘤胃球菌属等14个菌属存在关联.结论 高脂高糖饮食诱导的五指山小型猪AS模型具有肥胖、糖脂代谢紊乱和明显的AS病变的特点,其发生可能与肠道菌群失调有关.