-
miR-216a-5p、S1P、NLR在腹膜透析合并腹膜炎患者中的评估价值
编辑人员丨1天前
目的:探讨miR-216a-5p、1-磷酸鞘氨醇(S1P)、中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)在腹膜透析(PD)合并腹膜炎(PDAP)患者中的评估价值。方法:回顾性分析2020年1月至2022年2月在本院就诊的96例PD患者的临床资料,将其中22例经腹透液细菌培养确诊为PDAP的患者设为PDAP组,74例未发生PDAP的患者设为非PDAP组;对比两组患者的基本资料、腹透液中的白细胞计数(WBC)、血常规[钙、镁、磷、钾含量、血红蛋白(Hb)、血清白蛋白(ALB)]、总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG),比较两组血清中的miR-216a-5p、S1P、NLR水平,采用多因素logistic回归分析影响PDAP患者发病的危险因素,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析miR-216a-5p、S1P、NLR表达水平对PDAP的诊断价值。结果:两组性别、年龄、糖尿病、血清Hb、ALB、钙、钾、磷、TC、TG比较,差异均无统计学意义(均 P>0.05),而PDAP组血清中的镁低于非PDAP组( P<0.05),腹透液中的WBC高于非PDAP组( P<0.05)。PDAP组血清中的miR-216a-5p、NLR水平均高于非PDAP组,S1P低于非PDAP组( P<0.05)。多因素logistic回归分析结果显示:高miR-216a-5p、高NLR均是发生PDAP的独立危险因素(均 P<0.05),高S1P是PDAP发生的保护因素( P<0.05);ROC曲线分析结果显示:三者联合检测PDAP的曲线下面积(AUC)为0.991,高于miR-216a-5p、S1P、NLR单独检测(AUC分别为0.879、0.837、0.900),且其特异度均优于单独检测。 结论:高miR-216a-5p、高NLR是发生PDAP的独立危险因素,高S1P是PDAP发生的保护因素,miR-216a-5p、S1P、NLR对PDAP的诊断有一定的价值,联合检测可提高诊断效能。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
基于16S rDNA序列分析天疱疮患者皮肤菌群的变化
编辑人员丨1天前
目的:采用16S rDNA测序技术研究寻常型天疱疮(PV)患者皮肤菌群多样性。方法:收集杭州市第三人民医院皮肤科10例PV患者及10例健康对照,取皮损旁(PV组)及对侧无皮损处皮肤菌群样本(PVn组),正常对照组取相应部位菌群样本。采用16S rDNA扩增子测序技术,对所有样本的菌群基因进行测序与分类,通过Usearch软件对数据聚类分析,得到可操作分类单元(OTU),获得门、纲、目、科、属水平的物种丰度。以Observed species指数、Shannon指数和Simpson指数等反映α多样性,使用主坐标分析法(PCoA)分析β多样性。采用线性判别分析效应量(LEfSe)分析比较各组的差异物种。利用PICRUSt软件进行基因功能预测。2组非参数检验采用Wilcoxon秩和检验,3组间非参数检验采用Kruskal Waills检验。结果:注释到门、纲、目、科、属的OTU分别有2 002、1 869、1 751、1 611、1 120个,3组均以厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门和变形菌门为主,在属水平上,PV组及PVn组葡萄球菌属丰度最高,正常对照组为棒状杆菌属。α多样性分析显示,3组间Observed species指数、Shannon指数、Simpson指数差异均有统计学意义(均 P< 0.05),PV组Shannon指数(3.24±1.30)和Simpson指数(0.70±0.19)均低于正常对照组( P< 0.05)。PCoA分析显示,3组间β多样性差异无统计学意义( P=0.054)。秩和检验显示,3组间丰度差异有统计学意义的物种共32个,其中相对丰度较高的有富集于PV组的芽孢杆菌纲及富集于正常对照组的微球菌属、短波单胞菌属等。按病程< 3个月、≥ 3个月分组,PV长病程组中富集的物种有梭状芽孢杆菌目、颤杆菌属及鞘氨醇单胞菌属等;短病程组γ变形菌纲富集。功能预测显示,与感染性疾病相关的基因功能富集于天疱疮组。 结论:16S rDNA测序技术应用于天疱疮微生物组学研究,证实PV皮肤菌群多样性及组成结构与正常人存在一定差异。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
弱酸性次氯酸消毒口腔综合治疗台水路的效果
编辑人员丨1天前
目的 观察弱酸性次氯酸对口腔综合治疗台水路(DUWLs)消毒及生物膜清除效果.方法 采集口腔科36台口腔综合治疗台的牙科手机、三用喷枪和漱口水共108份水样,分析微生物污染状况并鉴定.用不同浓度次氯酸对供水管路和口腔综合治疗台水路进行冲洗消毒,随机选取13台牙椅,采集消毒后牙科手机、三用喷枪和漱口水出水端水样,进行微生物培养.结果 消毒前牙科手机、三用喷枪、漱口水水样菌落总数中位数分别为340、240、217 CFU/ml;检出致病菌以铜绿假单胞菌、嗜温鞘氨醇杆菌、产吲哚金黄杆菌等为主;50 ppm次氯酸定时消毒,第1天DUWLs末端水样菌落总数下降,然后迅速升高,第3~5天达到顶峰,各类出水端水样菌落总数中位数均为消毒前的10余倍,并有黄褐色絮状物流出.消毒后第7天菌落总数下降.100 ppm定时消毒第1天断崖式下降,第3天各类出水端水样菌落总数均<50 CFU/ml;低浓度(5 ppm)持续性消毒过程中,菌落总数<20 CFU/ml.结论 口腔综合治疗台水路中存在微生物污染,高浓度弱酸性次氯酸对清除DUWLs生物膜有显著效果,低浓度弱酸性次氯酸能够抑制管道内微生物的生长.
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
基于16S rDNA及ITS高通量测序分析甲真菌病病甲微生物群落的变化
编辑人员丨1天前
目的:比较甲真菌病患者病甲与健康甲细菌和真菌微生物菌群差异。方法:收集2020年8月至2021年6月于大连市皮肤病医院门诊就诊的31例甲真菌病患者的病甲及健康甲的甲屑样本,提取甲屑菌群总DNA,以细菌16S rDNA的V3-V4区序列及真菌内转录间隔区(ITS)作为目标序列进行基因扩增及Illumina测序,对所测序列采用USEARCH和mothur软件进行OTU聚类分析,采用Wilcoxon rank sum test方法进行α多样性分析,采用相似性分析(Anosim)进行β多样性分析,采用LEFSe方法进行物种差异分析。结果:入组甲真菌病患者31例,男16例,女15例,按年龄分青年组(18 ~ 35岁)10例,中年组(36 ~ 60岁)11例,老年组(大于60岁)10例。α多样性分析显示,病甲组标本Shannon指数明显低于健康甲组( W = 290, P = 0.007),而Simpson指数明显高于健康甲组( W = 663, P = 0.010),病甲组细菌菌群的多样性及均匀度低于健康甲组,病甲在真菌菌群的多样性与健康甲无明显区别。β多样性分析显示,基于unweighted-unifrac距离矩阵分析结果,病甲组与健康甲组细菌和真菌微生物的组成差异无统计学意义(细菌菌群: R = 0.0052, P = 0.331;真菌菌群: R = 0.0036, P = 0.337);基于weighted-unifrac距离矩阵分析结果,病甲组与健康甲组在细菌菌群及真菌菌群的丰度方面差异均有统计学意义(均 P = 0.001)。在物种组成上,病甲组较健康甲组丰度显著降低的细菌菌群有拟杆菌门及变形菌门、β-变形菌纲、伯克氏菌目、罗尔斯顿菌属、鞘氨醇单胞菌属、链球菌属,而芽孢杆菌纲、芽孢杆菌目、葡萄球菌属明显高于健康甲组。病甲组显著升高的真菌菌群有散囊菌纲、爪甲团囊菌目、未分类锤舌菌目、关节皮肤真菌科、黑团孢属、白粉菌属、铁艾酵母属、毛癣菌属、十字花科白粉菌、红色毛癣菌、合轴马拉色菌,而酵母菌纲-酵母菌目-酵母菌科、隐囊菌科、念珠菌、链格孢菌较健康甲组显著降低。 结论:甲真菌病患者病甲与健康甲细菌菌群的多样性及丰度均有明显的差异,真菌菌群仅丰度存在一定的差异,其中某些真菌和细菌菌属可能具有相关性。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
绝经后与育龄期女性泌尿道微生态的复杂多样化及与尿路感染关系的研究
编辑人员丨1天前
目的:探讨女性泌尿道宿主、环境、微生物菌群间的关系及宿主反应性变化,证明泌尿道存在特征性菌群;探讨菌群变化与尿路感染的关系,对尿路感染诊疗产生观念性改变。方法:临床资料收集于2018年2月至2018年3月期间,应用16SrRNA基因测序对健康绝经后(A组,5例)、健康育龄期(B组,5例)及尿路感染的绝经后女性(C组,14例)尿液进行菌群测定,分析泌尿道菌群结构和组成的多样性及差异性。结果:女性尿液中包含种类繁多的微生物菌群,构成多样化,个体差异明显,一般以一种或两种菌种占优势,健康育龄期、绝经后女性组优势菌种主要为乳酸杆菌属、加德纳菌属及鞘氨醇单胞菌属,而鞘氨醇单胞菌属在尿路感染绝经后女性组丰度则明显下降;同时,尿路感染组优势菌群主要为肠杆菌科及乳酸杆菌属,且肠杆菌科丰度明显高于另外两组;而乳酸杆菌属丰度水平在健康育龄期组则明显高于绝经后两组。结论:女性泌尿道菌群以乳酸杆菌属为优势菌,绝经后尿路感染女性泌尿道菌群表现为乳酸杆菌属、鞘氨醇单胞菌属显著减少及肠杆菌科丰度增加,提示这可能是引起绝经后妇女尿路感染发病率升高的重要原因,为诊断尿路感染及非抗菌素手段治疗尿路感染提供思路。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
补土雅解方治疗抗生素相关性腹泻的作用机制
编辑人员丨2024/2/3
目的 为了探究补土雅解方对抗生素相关性腹泻大鼠的肠道屏障调节作用.方法 60只SD雄性大鼠,随机分为空白组、模型组、阳性药组(1 g·kg-1),补土雅解方高、中、低剂量组(40.5、20.25、10.125 g·kg-1).采用盐酸林可霉素(5 g·kg-1)灌胃法复制模型,连续7天.造模成功后,进行药物干预7天后取材.HE染色观察肠道病理形态;ELISA试剂盒检测DAO、MPO、LPS;取各脏器组织检测细菌移位;收集粪便进行16S rRNA基因高通量测序分析.结果 与正常组相比,模型组大鼠血清中DAO、MPO、LPS含量显著提高(P<0.001、P<0.01),肠道黏膜上sIgA含量明显下降(P<0.001),促进肠道细菌移位(P<0.001、P<0.01).肠道菌群多样性明显降低,肠道微生物门、属水平均发生明显变化.补土雅解方可降低DAO、MPO、LPS含量(P<0.001、P<0.01、P<0.05),显著提高sIgA含量(P<0.01、P<0.05),有效抑制肠道细菌移位(P<0.001、P<0.01、P<0.05).同时其通过升高厚壁菌门,抑制拟杆菌门和变形菌门比例,以及调控乳酸菌属、鞘氨醇单胞菌属、绿脓杆菌属、肠杆菌属来纠正肠道微生态结构.结论 补土雅解方能够降低肠道黏膜通透性、减少肠道菌群移位、保护肠道免疫屏障、调节肠道菌群结构的多样性、改善肠道微生态紊乱,可有效治疗抗生素相关性腹泻.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/2/3
-
不同附生基质金钗石斛根际微生物的比较研究
编辑人员丨2024/1/20
对同一栽培环境下不同附生基质金钗石斛根际微生物的多样性和差异性进行了研究,以明确基质对其根际微生物的影响.运用高通量测序技术对石质和木质两类5种附生基质的金钗石斛根际微生物进行16S和ITS测序,结合OTU分析、Alpha多样性分析和主成分分析对金钗石斛根际微生物的多样性和差异性进行比较研究.共鉴定了细菌56个门,112个纲,275个目,377个科,621个属;真菌13个门,47个纲,123个目,273个科,503个属.石质基质金钗石斛真菌优势菌属为unidentified_Cantharellales_sp菌属,细菌优势菌属为鞘氨醇单胞菌属、粪杆菌属、unidenti-fied_Chloroplast菌属;木质基质金钗石斛真菌优势菌属为unidentified_Cantharellales_sp菌属、粉褶菌属,细菌优势菌属为粪杆菌属.石质基质较木质基质真菌物种相对丰度差异较大,优势菌属种类不同.功能预测分析表明,附生基质与金钗石斛根际微生物群落功能密切相关.本研究为金钗石斛"基质-根际微生物-菌根真菌"的相关性及其生长发育、次生代谢产物积累规律提供了实验依据,为石斛"生石上者胜"、金钗石斛栽培基质的合理选择提供依据.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/1/20
-
赤眼蜂与柞蚕卵共生细菌群落分析及功能预测
编辑人员丨2023/12/30
为了探明柞蚕(Antheraea pernyi)卵与赤眼蜂(Trichogramma)之间内共生菌的相互联系,通过 16S rRNA高通量测序技术对赤眼蜂和柞蚕卵的内共生菌多样性及相对丰度进行了测定,并通过KEGG和COG分析了内共生菌生物群落代谢途径差异,预测了生物群落蛋白功能.结果表明,柞蚕卵内共生菌物种丰度在各级分类单元上均高于赤眼蜂,二者共有内共生菌为肠杆菌属(Enterobacter)、假单胞菌(Pseudomonas)、泛菌属(Pantoea)、埃希氏杆菌-志贺氏菌属(Escherichia-Shigella)、芽胞杆菌属(Bacillus)和鞘氨醇单胞菌属(Sphin-gomonas),除芽胞杆菌属隶属于厚壁菌门(Firmicute)外,其他均隶属于变形菌门γ-变形菌纲(γ-proteobacte-ria).就相对丰度而言,赤眼蜂体内葡萄球菌属(Staphylococcus)分布量最高,而柞蚕卵内不动杆菌属(Acineto-bacter)分布量最高.KEGG代谢途径差异分析表明,微生物群落功能主要为氨基酸和碳水化合物代谢,但不同代谢功能的强弱有差异.COG生物群落蛋白功能预测表明,赤眼蜂内共生菌群落蛋白质的氨基酸转运代谢功能显著强于柞蚕卵,但是柞蚕卵内共生菌群落蛋白的脂质转运代谢功能和信号传导功能显著强于赤眼蜂.尽管赤眼蜂和柞蚕卵内共生菌的丰度和多样性有差异,但二者存在多种共有共生菌,这些共有共生菌为次生共生菌,参与了赤眼蜂和柞蚕卵的氨基酸代谢功能、碳水化合物代谢功能以及胞膜转运功能等,因此可能在柞蚕卵和赤眼蜂之间进行平行传递.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/12/30
-
基于代谢组学探讨速效救心丸治疗稳定型心绞痛气滞血瘀证的作用机制
编辑人员丨2023/12/30
目的 鉴定速效救心丸干预稳定型心绞痛气滞血瘀证患者的差异代谢物、代谢通路,探讨速效救心丸相关治疗作用机制.方法 选择 2019 年 9 月—2021 年 9 月在东直门医院等接受义诊的患者和健康人,试验组纳入30 例稳定型心绞痛气滞血瘀证患者,对照组纳入30 名健康人.利用液相色谱-质谱技术对两组受试者进行血清代谢组学分析,采用多变量偏最小二乘回归分析模型的前2 个主成分的VIP值,结合单变量分析差异倍数和P值筛选差异代谢物,基于京都基因与基因组百科全书数据库对差异代谢物进行代谢通路富集分析.结果 共鉴定出试验组与对照组的差异代谢物18 种,其中,4-羟基肉桂酰亚胺、胆绿素-Ⅸ-β、2-亚甲基谷氨酸等代谢物含量低于健康人,左旋肉碱、维生素BT、胍丁胺、柠康酸、鸟嘌呤、薄荷脑等代谢物含量高于健康人.对比试验组患者服用速效救心丸治疗前后的21 种差异代谢物,治疗后细菌叶绿素a、植物鞘氨醇、4-氧视黄醇、神经酰胺、1-甲基鸟嘌呤等代谢物含量较治疗前下降,6-酮前列腺素E1、树脂毒素、前列腺素G2 含量较治疗前升高.差异代谢物质的异常变化提示稳定型心绞痛患者体内可能存在氨基酸、脂质、视黄醇、嘌呤、卟啉和叶绿素、瞬时受体电位通道的炎症介质调节、血清素能突触等多种代谢途径的紊乱.结论 稳定型心绞痛气滞血瘀证患者与健康人体内代谢物存在明显差异,速效救心丸具有双向调节体内血清代谢物的作用,从而发挥调节肠道菌群、维持肠道屏障、改善血脂水平、增加血管内皮功能的稳定、减轻组织细胞炎症反应、抗氧化等作用.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/12/30
-
玉米/大豆间作对根际土壤磷素生物有效性和微生物群落结构的影响
编辑人员丨2023/12/30
为了探究玉米/大豆间作对根际土壤微生物群落和磷素生物有效性的影响,本研究基于高通量测序技术研究玉米和大豆单作与间作模式中土壤磷组分和微生物群落结构特征.结果表明:与单作相比,玉米/大豆间作能够提高根际土壤有机质、速效磷、微生物生物量磷和地上部生物量,其中速效磷的提高主要与酶浸提磷和盐酸浸提磷含量的提高有关.各处理根际土壤的优势菌门均为变形菌门、放线菌门、酸杆菌门和绿弯菌门,优势菌属均为类诺卡氏属、红杆菌属、鞘氨醇单胞菌属和节杆菌属,其中变形菌门和鞘氨醇单胞菌属的相对丰度最高;间作玉米根际土壤变形菌门和鞘氨醇单胞菌属的相对丰度均显著高于单作,间作大豆根际土壤变形菌门的相对丰度较单作显著增加.土壤理化指标和有效性磷组分与根际土壤微生物组成关系密切.表明玉米/大豆间作能通过改变根际微生物群落结构来影响根际土壤磷的生物有效性.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/12/30