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MassARRAY技术在希特林蛋白缺乏症二阶段分子筛查中的应用分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨MassARRAY技术在希特林蛋白缺乏症二阶段分子筛查中的应用价值,了解两种筛查方法下新生儿希特林蛋白缺乏症的检出率、临床特征、基因突变特点及随访结果。方法:单独通过串联质技术对181 459例新生儿进行瓜氨酸(citrulline,Cit)浓度检测;通过串联质技术对33 156例新生儿检测瓜氨酸浓度,把瓜氨酸浓度截断值大于90百分位(Cit>20 μmol/L),且小于99.5百分位(Cit<43 μmol/L)2 506例进一步应用MassARRAY技术进行二阶段SLC25A13基因筛查,并对阳性患儿进行系统治疗随访。结果:确诊的4例患儿均来自同一地区,单独串联质谱方法确诊2例,串联质谱方法结合MassARRAY技术确诊2例。4例患者中3例检出SLC25A13基因复合杂合突变,1例只检测出一个SLC25A13基因突变;2 506例检出36例携带者,携带率1/70。单独通过串联质技术筛查检出率1/90 729,二阶段分子筛查检出率1/1 253。结论:淄博市希特林蛋白缺乏症总体发病率较高,MassARRAY技术可以提高串联质谱技术筛查产生假阴性聚集性地区的检出率,早诊断、早治疗,预后好。
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编辑人员丨6天前
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GII.P16型诺如病毒聚合酶蛋白的原核表达、活性测定和结晶
编辑人员丨6天前
目的:原核表达GII.P16型诺如病毒RNA依赖RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)蛋白,并对其进行生物活性测定和晶体制备。方法:首先通过RT-PCR方法获得GII.P16 RdRp完整基因并将其克隆至携带His-Tag PET28a载体,构建重组表达质粒,然后转化至大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,并用IPTG诱导RdRp的表达,最后利用SDS-PAGE和Western blot的方法鉴定蛋白的表达情况;采用His-Tag亲和层析和分子筛的方法纯化目的蛋白;分别使用体外酶催化实验和Hampton结晶试剂盒进行蛋白活性测定和晶体筛选。结果:构建了原核表达重组体PET28a-RdRp,并大量表达了相对分子质量约60 kDa的可溶性蛋白;经两次纯化后,获得了高纯度的目的蛋白,纯度达到90%以上;体外酶催化实验显示RdRp重组蛋白具有良好的生物活性;通过多种生长条件的筛选,获得了优质的RdRp晶体。结论:本研究成功获得的GII.P16 RdRp蛋白及其晶体,为理解其生物学功能和解析其晶体结构奠定了基础。
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编辑人员丨6天前
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尿中1-甲氧基-2-丙醇测定的顶空固相微萃取-气相色谱法
编辑人员丨6天前
目的:建立尿中1-甲氧基-2-丙醇(1-methoxy-2-propanol,1M2P)的顶空固相微萃取-气相色谱测定方法。方法:采用碳分子筛/聚二甲基硅氧烷(CAR/PDMS)涂层固相微萃取头对尿样进行顶空萃取;单因素轮换法对萃取温度、盐析量、萃取时间进行优化;以DB-5(30 m×0.32 mm×0.25 μm)毛细管柱为分离柱,氢火焰离子化检测器(FID)检测,外标法定量。结果:尿中1M2P浓度在0.50~10.0 mg/L线性关系良好,相关系数为0.999 3,方法检出限为0.14 mg/L,定量下限为0.45 mg/L,回收率为85.8%~104.7%,日内精密度为3.25%~6.65%,日间精密度为0.81%~3.96%。结论:该方法灵敏度高,操作简便,适用于职业暴露1M2P人群尿中1M2P的测定。
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编辑人员丨6天前
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基于幽门螺杆菌hp0169基因三维结构的生物信息学分析
编辑人员丨2024/7/27
目的:克隆幽门螺杆菌(Hp)hp0169基因并进行晶体学研究,分析其二级结构和三维结构.方法:由UniProt数据库中检索Hp NCTC26695菌株hp0169基因及其编码蛋白序列,采用生物信息学方法分析Hp重组胶原蛋白酶(HpPrtC)蛋白理化性质,SOPMA和DNAStrar软件预测HpPrtC蛋白二级结构特征,SWISS-MOPEL软件构建HpPrtC蛋白三维结构,IEDB和ABCpred软件预测HpPrtC蛋白B淋巴细胞抗原表位,SYFPEITHI网站预测T淋巴细胞抗原表位,专家库(EP)算法和随机森林(RF)算法预测HpPrtC蛋白可结晶性.原核表达HpPrtC重组蛋白,经Ni2+亲和层析和分子筛技术纯化蛋白,结晶试剂盒筛选HpPrtC的结晶条件.结果:hp0169基因共包含1 269个碱基配对,编码蛋白全长422个氨基酸,理论等电点为7.64,相对分子质量为47 300.HpPrtC蛋白为亲水性、可溶性蛋白.HpPrtC蛋白α螺旋的氨基酸数量占全部氨基酸数量百分率为35.78%,β片层为18.72%,β转角为 6.87%,无规则卷曲为 38.63%.抗原表位分析,HpPrtC蛋白含有B淋巴细胞的 5个优势线性表位和 3个构象表位及多个T淋巴细胞潜在优势抗原表位.同源建模,HpPrtC蛋白呈二聚体,单体由β折叠围成桶状结构,周围被α螺旋和无规则卷曲围绕.HpPrtC蛋白为中等难度结晶,且无信号肽和跨膜螺旋,在 0.2 mol·L-1 氯化镁、0.1 mol·L-1 三羟甲基氨基甲烷(Tris)、3.4 mol·L-1 己二醇和pH 8.5条件下出现细小成簇的针状晶体.结论:HpPrtC是一种亲水型蛋白,呈二聚体构造,在适宜条件下呈细小成簇针状晶体,其具有T淋巴细胞和B淋巴细胞优势抗原表位,可作为Hp疫苗设计的抗原,用于构建多价融合疫苗或多表位疫苗,本研究结果为Hp的防治提供了实验基础.
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编辑人员丨2024/7/27
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GPC3蛋白结构的分析及其表达纯化
编辑人员丨2024/6/22
目的 了解GPC3蛋白结构,构建GPC3蛋白的原核表达纯化系统,高效表达和纯化出GPC3蛋白.方法 从GenBank中获取基因序列,通过Protparam、SOPMA、SWISS-MODEL等在线软件对GPC3蛋白(25-554 aa)的结构进行分析.从不同载体和菌株中筛选出相对优势的组合,优化其表达条件,并诱导表达TrxA-GPC3融合蛋白,通过包涵体的溶解和复性、亲和层析、标签切割和分子筛纯化等方法分离纯化出无TrxA标签的GPC3蛋白.结果 GPC3蛋白的相对分子质量为60.26 kDa,等电点为5.76,不稳定系数为41.27,脂肪系数为83.66,平均亲水系数为-0.312,是不稳定的亲水性蛋白,其主要为α-螺旋和无规则卷曲结构,引入标签的TrxA-GPC3融合蛋白比GPC3蛋白更稳定.通过对比筛选出表达效率较高的BL21(DE3)-pET32a-GPC3工程菌,其在0.5%的葡萄糖浓度和0.1 mmol/L的IPTG浓度条件下,结合20℃的诱导温度及16h的诱导时间,可显著提高蛋白表达量,通过亲和层析得到纯度90%以上的TrxA-GPC3融合蛋白,利用凝血酶将TrxA标签切除,最后通过分子筛纯化得到单一的GPC3蛋白.结论 利用生物信息学分析了GPC3蛋白的理化性质和结构,并在原核系统中成功表达和纯化了GPC3蛋白,为高特异性抗体的制备或筛选以及结构-功能研究奠定了基础,同时也为其它蛋白的表达纯化提供科学的指导意义.
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编辑人员丨2024/6/22
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绿脓杆菌RNA降解蛋白PNPase与RNase E表达纯化及相互作用
编辑人员丨2023/8/6
目的 RNA降解复合体是RNA在生物体内更新的主要工具.PNPase通过3'到5'核酸外切酶降解RNA,Rnase E参与其调控.通过对绿脓杆菌RNA降解蛋白PNPase与Rnase E进行克隆表达纯化,并获取复合物蛋白,进而揭示PNPase与Rnase E对绿脓杆菌RNA的降解机制.方法对PNPase与Rnase E基因序列进行PCR扩增,构建重组质粒,分别转入E.coli BL21中表达,应用镍离子亲和层析,离子亲和层析和分子筛纯化目的蛋白PNPase与Rnase E;通过Pull-down方法验证PNPase和Rnase E的相互作用.结果成功克隆、表达、纯化绿脓杆菌PNPase与Rnase E蛋白,并通过Pull-down获得大量PNPase-Rnase E复合物.结论PNPase与Rnase E蛋白能相互作用并形成PNPase-Rnase E复合物.
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编辑人员丨2023/8/6
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四川省30家综合医院无创正压通气治疗过程中供氧浓度和吸入氧浓度的调查研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 了解无创正压通气(NPPV)治疗慢性阻塞性肺疾病急性加重期(AECOPD)伴Ⅱ型呼吸衰竭患者的供氧浓度和吸入氧浓度现状,为提高无创呼吸机治疗效果提供实证依据.方法 采用横断面研究设计对四川省30家综合性医院的呼吸内科病房终端氧浓度、呼吸机出口端氧浓度和接受NPPV治疗的AECOPD伴Ⅱ型呼吸衰竭患者鼻/面罩内实际吸入氧浓度进行测量或统计.结果 30家医院均为医院中心供氧,其供氧方式有3种:分子筛制氧机供氧5个(16.7%);液态氧供氧7个(23.3%);以制氧机和液态氧的混合供氧18个(60.0%).病房终端总体供氧浓度为(85.60±5.65),呼吸机出口端氧浓度低于治疗氧浓度预设值(P <0.05).同时给予40%给氧浓度时,鼻/面罩内实测吸入氧浓度为(33.36±1.29),且吸入氧浓度随着吸气相正压(IPAP)升高有下降趋势.结论 相关部门必须加强对病房终端、呼吸机出口端以及鼻/面罩内实际吸入氧浓度的质量监测,并根据监测结果适度提高NPPV治疗过程中治疗氧浓度预设值,从而保障患者有效的氧疗.
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编辑人员丨2023/8/6
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轮状病毒P[6]基因型毒株LL4260株的VP8*核心区蛋白的表达和纯化
编辑人员丨2023/8/6
目的 为研究P[6]基因型轮状病毒受体结合特性,利用原核表达纯化得到P[6]基因型轮状病毒LL4260毒株的VP8*核心区蛋白.方法 将P[6]基因型毒株LL4 260株的质粒利用PCR扩增得到核心区基因片段,克隆到pET30a载体中构建重组质粒pET30a-LL4260VP8+ core,重组质粒转化到BL21(DE3)感受态细胞中进行蛋白表达,经亲和层析和分子筛层析纯化表达后得到目的蛋白.结果 P[6]基因型轮状病毒LL4260毒株核心区pET30 a-LL4260VP8* core蛋白为可溶表达,经纯化及电泳鉴定,得到相对分子质量为22×103的目的蛋白.结论 本研究构建的P[6]基因型轮状病毒LL4260毒株pET30 a-LL4260VP8* core重组质粒,表达纯化了相应核心区目的蛋白,为进一步分析蛋白的性能和结构提供基础.
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编辑人员丨2023/8/6
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不同肾功能进展IgA肾病患者血清IgA1对人肾小球系膜细胞增殖及TGF-β1表达的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的·探讨肾功能快速进展为终末期肾病(end stage renal disease,ESRD)的IgA肾病患者与肾功能长期稳定的IgA肾病患者血清IgA1对体外培养的正常人肾小球系膜细胞(human mesangial cells,HMCs)增殖的刺激作用及对转化生长因子β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)表达水平的影响.方法·9例经肾活检确诊为原发性IgA肾病的患者,根据病情进展情况分为肾功能快速进展组(n=6)和肾功能长期稳定组(n=3).采用亲和层析及分子筛提取血清IgA1;用不同质量浓度(10、50、250、1 000 μg/mL)的IgA1分别干预HMC 12、24 h.CCK8法测定细胞增殖率;real-time PCR测定TGF-β1 mRNA表达;ELISA法测定TGF-β1蛋白表达.结果·肾功能快速进展组及肾功能长期稳定组患者血清IgA1对HMC有明显的促增殖作用,且表现为时间依赖性和浓度依赖性,作用高峰质量浓度分别为250 μg/mL和1 000 μg/mL.2组患者血清IgA1均能显著上调TGF-β1的mRNA和蛋白的表达.在肾功能快速进展组,IgA1质量浓度为10 μg/mL时TGF-β1的mRNA及蛋白水平达到高峰,其后随刺激浓度升高而递减;在肾功能长期稳定组, TGF-β1水平则与血清IgA1呈现平行的浓度依赖性.结论· 肾功能快速进展及长期稳定的患者血清IgA1在一定浓度和时间范围内均具有刺激HMC增殖的作用.在较低质量浓度(10~50 μg/mL)范围内,促增殖作用没有明显差异,但肾功能快速进展的患者血清IgA1上调TGF-β1表达的作用更强,提示血清IgA1具有一定的预后评估作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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HIV-1 CAP2NC蛋白的表达及体外自组装
编辑人员丨2023/8/6
构建并表达HIV-1 CAP2NC蛋白,探索其体外自组装条件.通过PCR技术扩增HIV-1 (NL4-3 毒株)CAP2NC 基因片段,并将其连接到原核表达载体pTO-T7,获得重组质粒pTO-T7-CAP2NC,然后转化至大肠杆菌BL21(DE3)菌株,经疏水层析纯化后获得重组蛋白CAP2NC.SDS-PAGE 结果表明,重组蛋白CAP2NC可在大肠杆菌可溶高效表达,经纯化后纯度约为95%.ELISA 检测表明重组蛋白CAP2NC 可被HIV-1 衣壳蛋白特异性单克隆抗体识别,具有较好反应活性.重组蛋白透析后在非原性SDS-PAGE中呈现为多种聚体形式.分子筛排阻层析分析CAP2NC蛋白透析后可进行组装,负染电镜进一步观察显示CAP2NC蛋白在RNA 存在条件下,可形成空心管状颗粒,其形态结构与HIV-1 病毒衣壳体外自组装形成的类似.上述结果表明HIV-1 CAP2NC 蛋白具有体外自组装的性质,为进一步在体外研究非成熟病毒样颗粒结构奠定基础.
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编辑人员丨2023/8/6
