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染色体微阵列分析技术对智力障碍或全面发育迟缓患儿遗传学病因的诊断价值
编辑人员丨2天前
目的:探讨染色体微阵列分析(CMA)技术在表现为发育迟缓、智力障碍、孤独症谱系障碍(ASD)、癫痫和多发性先天性异常(MCA)等患儿中的诊断价值。方法:收集2014至2019年在北京大学第一医院收治的1 320例发育迟缓/智力障碍,孤独症、伴或不伴癫痫和MCA患儿,提取外周血DNA,用比较基因组杂交(array-CGH)和单核苷酸多态性(SNP-array)方法分析基因拷贝数变异(CNV),总结CMA技术在智力障碍或全面发育迟缓患儿遗传学病因检测的结果。结果:1 320例患儿中,染色体非整倍体异常10例,单亲二体6例,嵌合体1例。致病性拷贝数变异320例,可能致病性拷贝数变异23例,两者相加检出率为26%(343/1 320)。临床意义不明确CNV 107例,占比8.1%(107/1 320)。可能良性CNV 25例,占比2%(25/1 320)。良性CNV 20例,占比1.5%(20/1 320)。发育迟缓/智力障碍合并MCA的患儿检出率为39.8% (130/327)。结论:CMA具有分辨率高、覆盖全基因组的优势。可以检出显微镜下可见的染色体异常以及染色体微小缺失和重复,从而对智力障碍或全面发育迟缓患儿进行遗传病因学诊断。
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编辑人员丨2天前
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染色体多态性:PGT-A新指征?
编辑人员丨2天前
目的:探讨染色体多态性变异是否可以作为胚胎植入前非整倍体检测(preimplantation genetic testing for aneuploidies,PGT-A)的指征。方法:回顾性队列研究分析于郑州大学第一附属医院生殖医学中心2012年1月1日至2021年12月31日期间接受PGT-A解冻移植和体外受精-胚胎移植( in vitro fertilization and embryo transfer,IVF-ET)新鲜移植助孕患者的临床资料。根据夫妇染色体核型,PGT-A周期分为女方染色体多态性变异(女方多态组)、男方染色体多态性变异(男方多态组)及双方染色体多态性变异(双方多态组),同期染色体正常夫妇为对照(染色体正常组);IVF周期分为女方染色体多态性变异(女方多态组)、男方染色体多态性变异(男方多态组),同期染色体正常夫妇为对照(染色体正常组);比较组间实验室结果和妊娠结局。 结果:PGT-A周期中,各组间活检胚胎染色体非整倍体率、解冻移植临床妊娠率、早期流产率、活产率差异均无统计学意义(均 P>0.05)。IVF新鲜胚胎移植中,各组间临床妊娠率、早期流产率、活产率差异均无统计学意义(均 P>0.05)。IVF助孕后早期流产患者中,女方多态组、男方多态组和染色体正常组流产组织拷贝数变异(copy number variation,CNV)检测异常率分别为26.67%(4/15)、57.89%(11/19)、64.59%(363/562),差异有统计学意义( P=0.010)。 结论:夫妇染色体多态性变异不影响胚胎非整倍体,同时不影响PGT-A周期和IVF新鲜移植周期妊娠结局,且不增加流产组织染色体异常率。目前无明确证据支持染色体多态性变异可作为PGT-A新指征。
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编辑人员丨2天前
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基于波塞冬标准的卵巢低反应人群胚胎非整倍体率分析
编辑人员丨2天前
目的:基于波塞冬标准分析卵巢低反应(poor ovarian response,POR)人群的胚胎非整倍体率,探究卵巢储备评估指标对卵子质量的预测价值。方法:基于2017年1月至2020年12月期间于山东大学附属生殖医院生殖遗传科行胚胎移植前非整倍体筛查(preimplantation genetic testing for aneuploidies,PGT-A)助孕的患者临床资料,进行回顾性病例对照研究。根据年龄和卵巢储备水平参照波塞冬标准分为POR 1组,即非高龄非预期POR组[年龄<35岁,抗苗勒管激素(anti-Müllerian hormone,AMH)≥1.2 μg/L,获卵数≤9枚,258个周期];POR 2组,即高龄非预期POR组(年龄≥35岁,AMH≥1.2 μg/L,获卵数≤9枚,397个周期);POR 3组,即非高龄低储备组(年龄<35岁,AMH<1.2 μg/L,获卵数≤9 枚,99个周期);POR 4组,即高龄低储备组(年龄≥35岁,AMH<1.2 μg/L,获卵数≤9 枚,377个周期)。以年龄为匹配因素,选取卵巢储备及卵巢反应均正常女性设立非POR组作为对照(非POR 1组、非POR 2组、非POR 3组和非POR 4组,AMH≥1.2 μg/L,获卵数>9枚)。根据各组样本量差异,对非高龄组进行1∶2倾向性评分匹配(propensity score matching,PSM;POR 1组比非POR 1组;POR 3组比非POR 3组),高龄组进行1∶1 PSM(POR 2组比非POR 2组;POR 4组比非POR 4组)。胚胎整倍体率和非整倍体率作为主要观察指标,获卵数、MⅡ(成熟卵子)数、双原核(two pronuclei,2PN)数、检测囊胚数、胚胎整倍体数、非整倍体数、嵌合体胚胎数/率作为次要观察指标。结果:POR 1~4组的获卵数[7.0(6.0,9.0)枚、7.0(5.0,8.0)枚、6.0(4.0,9.0)枚和5.0(3.0,7.0)枚]和检测囊胚数[3.0(2.0,4.0)枚、2.0(1.0,3.0)枚、3.0(2.0,4.0)枚和2.0(1.0,3.0)枚]均显著少于同龄非POR 1~4组[获卵数:16.0(13.0,20.0)枚、14.0(11.0,17.0)枚、16.0(13.0,20.0)枚、13.0(11.0,17.0)枚,均 P<0.001;检测囊胚数:4.0(3.0,6.0)枚、3.0(2.0,5.0)枚、4.0(3.0,6.0)枚、3.0(2.0,5.0)枚,均 P<0.001]。非POR 4组在校正重复取卵周期、PGT-A指征、促排卵方案和促性腺激素用量后,POR 4组胚胎非整倍体率显著高于非POR 4组( OR=1.252,95% CI:1.053~1.488, P=0.011),POR 1组、2组、3组患者与相应的非POR 1、2、3组相比,胚胎非整倍体率差异均无统计学意义(均 P>0.05)。 结论:高龄(≥35岁)女性卵巢储备异常降低不仅减少了获卵数,而且因影响卵子质量进而导致胚胎整倍体率下降、非整倍体率上升;而非高龄(<35岁)女性卵巢储备降低主要影响获卵数。
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编辑人员丨2天前
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Non-invasive chromosome screening for embryo preimplantation using cell-free DNA
编辑人员丨2天前
Preimplantation genetic testing (PGT) is a widely adopted screening method that can be performed to identify and select embryos with normal ploidy; however, PGT relies on embryo biopsy, that is, polar body, embryo cells, or trophectoderm biopsy, to obtain embryonic DNA, increase its technical limitations. Studies have indicated that biopsy may have an influence on the quality and development of embryos, and increase the chance of abnormal epigenetic modifications. Therefore, non-invasive PGT (niPGT) detection of cell-free DNA (cfDNA) has gradually become a hot research topic in the field of assisted reproduction. Studies showed cfDNA could be detected in blastocyst fluid and spent culture medium (SCM) in vitro cultured embryos. The cfDNA collection requires less skill and makes lower risk to embryos. Some studies have been conducted to evaluate the feasibility of SCM-based niPGT approaches. When comparing the ploidy consistency of cfDNA in SCM, its consistency to the conventional PGT for aneuploidies results fluctuated widely, it is critical to recognize the factors influencing accuracy. These contradictory results may be related to factors such as the difference in SCM sampling methods and sampling time, and the definition of consistency. In this review, we aimed to comprehensively summarize how researchers use embryonic cfDNA to conduct niPGT detection. It also systematically reviews the factors affecting the accuracy of the test and its underlying issues, as well as prospective applications. We hope to provide a basis for future niPGT research and a useful reference for the standardized operation of niPGT that can be widely applied in clinical practice.
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编辑人员丨2天前
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定量荧光聚合酶链式反应在流产组织染色体畸变分析中的诊断价值
编辑人员丨2天前
目的 评估在以拷贝数变异测序(CNV-seq)为主要遗传学检测手段对流产组织进行染色体畸变分析中辅以定量荧光聚合酶链式反应(QF-PCR)检测的诊断价值.方法 采用QF-PCR及CNV-seq技术同时检测2021年9月至2022年11月海口市妇幼保健院收集的110例流产组织样本.此外,QF-PCR技术将额外检测50例健康人群外周血样本进行数据补充.QF-PCR体系为自建体系,在13、18、21、性染色体共选择17个位点并将其分为两组.Panel A组由D13S796、D13S256、D18S386、D18S535、D21S11、D21S1446、DXS6809、HPRT构成;Panel B组由D13S371、D13S634、D18S51、D18S535、D18S819、D21S1409、D21S1412、DYS218、DXS981、AMEL构成.分析QF-PCR在判别13、18、21、性染色体非整倍体时与CNV-seq结论一致性、QF-PCR为CNV-seq进行母源污染鉴定能力,以及QF-PCR进行13、18、21、性染色体非整倍体的分型能力.结果 对110例流产组织进行检测,两种方法结论一致例数占比为93.6%.其中QF-PCR避免了5例CNV-seq自身局限性造成的不准确结论,2例为QF-PCR的检测失败.在母源细胞污染鉴定能力上,15个短串联重复序列的观察杂合度、期望杂合度与个体识别能力值范围分别为0.737~0.950、0.593~0.941、0.817~0.975;D13、D18、D21与DX的累积He依次为0.9999、0.9998、0.9998与0.9985,累积个体识别能力大于0.999999999999999999999999999999;自建的QF-PCR方法在分型能力上表现良好,其干扰因素影响较小.结论 QF-PCR联合CNV-seq检测可能成为未来孕早期流产组织遗传学分析的主要方法.它不仅能够降低CNV-seq的误诊率、鉴别母体细胞污染.采用自建QF-PCR体系还能够显著降低联合检测成本.
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编辑人员丨2天前
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产前细菌人工染色体标记-磁珠鉴别/分离技术在染色体非整倍体及微缺失/微重复综合征诊断中的应用
编辑人员丨2天前
目的:探讨细菌人工染色体标记-磁珠鉴别/分离技术在产前诊断中的适应证及应用价值。方法:采集2016年4月至2020年12月在济宁市妇幼保健计划生育服务中心进行产前诊断的3 579例单胎:高龄产妇(年龄≥35岁)、血清学产前筛查高风险/临界风险、无创基因检测(NIPT)高风险、超声指标异常、不良妊娠史的羊水样本进行细菌人工染色体标记-磁珠鉴别/分离技术(BoBs)检测,同步进行G显带染色体核型分析检测。核型分析或BoBs检测出的非整倍体异常/微缺失/微重复样本根据需要进行荧光原位杂交(FISH)/单核苷酸多态性(SNP)微阵列验证。结果:(1)高龄、NIPT高风险、血清学筛查高风险指征样本占比89.44%(3 201/3 579),非整倍体异常检出率96.19%(202/210),微缺失/微重复异常检出率87.5%(28/32),合计异常检出率95.04%(230/242);超声指标异常、不良妊娠史、中孕期血清学筛查临界风险指征样本占比10.66%,检出非整倍体及微重复/微缺失的异常占4.96%。(2)BoBs检出198份常见染色体非整倍体(13/18/21/X/Y)异常,12例≥20%的嵌合体,与核型结果一致;2份21-三体、3份X/Y、7份探针检测范围外的2、7、8、9、10、20、mar染色体核型嵌合、8份臂间倒位和5份易位由染色体核型分析检出。BoBs检测对5种非整倍体的敏感度为94.6%(210/222),特异度为100%,假阴性率5.4%(12/222)。BoBs检出32份微缺失/微重复,染色体核型分析检出9份。G显带染色体核型分析与BoBs检测联合应用相较于单一的染色体核型分析,额外检出9.4%(23/244)阳性样本。结论:单纯高龄、NIPT高风险、血清学筛查高风险指征的样本更适合作为BoBs在产前诊断应用的适应证。
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编辑人员丨2天前
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11~13 +6周胎儿大动脉转位的超声诊断及预后分析
编辑人员丨2天前
目的:探讨孕11~13 +6周超声诊断胎儿大动脉转位(TGA)的价值。 方法:选择2015年1月至2022年3月于广西壮族自治区妇幼保健院行妊娠早期超声结构筛查的孕11~13 +6周胎儿进行前瞻性研究,采用三切面筛查法对胎儿心脏结构进行筛查,疑似TGA胎儿随访其后续超声检查、染色体、基因检查结果及妊娠结局,总结11~13 +6周TGA超声特征及预后。 结果:超声检出TGA 21例,其中完全型TGA 20例,矫正型TGA 1例,漏诊2例。超声检出的21例均在灰阶流出道切面显示两大动脉平行征。6例合并非整倍体超声软指标异常;2例合并心外畸形;13例行染色体及微阵列检查,4例染色体异常,均合并软指标异常,1例合并心外畸形。20例引产,1例流产,2例足月分娩,其中1例新生儿期术前死亡,1例存活。结论:11~13 +6周规范化的超声扫描对诊断TGA具有较高的准确性,合并软指标异常或心外畸形其染色体异常发生率高。
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编辑人员丨2天前
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非嵌合型克氏综合征患者通过显微取精获得精子后助孕策略的选择
编辑人员丨2天前
目的:观察非嵌合型克氏综合征(Klinefelter syndrome,KS)夫妇接受冷冻复苏的睾丸显微取精(micro-dissection testicular sperm extraction,micro-TESE)获得的精子进行基于二代测序(next-generation sequencing,NGS)胚胎植入前遗传学检测(preimplantation genetic testing,PGT)的临床效果,探讨非嵌合型KS夫妇最合适的辅助生育助孕方式。方法:回顾性病例系列研究了2018年1月至2020年12月期间在上海交通大学医学院附属仁济医院生殖医学中心就诊的22对非嵌合型KS夫妇所完成的26个PGT周期的临床资料。在女方进行卵巢刺激前,所有非嵌合型KS患者都进行micro-TESE获得精子并冷冻保存。采用NGS进行胚胎检测。结果:总共对55枚胚胎进行了胚胎活检和PGT,其中33枚(60.0%)被检测为整倍体,10枚(18.2%)非整倍体和12枚(21.8%)嵌合体胚。同时,非整倍体和嵌合体胚胎均未涉及性染色体异常。最终14对夫妇获得整倍体胚胎并完成了冻融胚胎移植。目前已有11对夫妇获得临床妊娠,其中6对夫妇已经活产了7个健康的新生儿。结论:当非嵌合型KS男性通过micro-TESE获得精子后可以生育健康的后代。对获得的精子进行冷冻保存的策略有助于女方进行最合适的卵巢刺激。此外,非嵌合型KS男性后代性染色体异常的遗传风险极低。除了采用卵胞质内单精子显微注射(intracytoplasmic sperm injection,ICSI)联合PGT助孕之外,ICSI同样有效且更经济。ICSI应该作为一种助孕选择提供给该类夫妇,受孕后可以通过产前诊断明确胎儿核型。
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编辑人员丨2天前
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卵裂期优质胚胎的染色体嵌合体研究
编辑人员丨2天前
目的:应用基于多次退火环状循环扩增(multiple annealing and looping-based amplification cycles,MALBAC)的单细胞测序技术分析卵裂期优质胚胎的嵌合体率及类型。方法:收集接受卵胞浆内单精子显微注射治疗并生育正常后代的夫妇捐献的卵裂期冷冻优质胚胎,解冻,消化透明带,收集卵裂球,进行单细胞全基因组扩增及二代测序。结果:共解冻胚胎23枚,收集184个卵裂球。175个(95.1%)卵裂球获得了测序结果,其中100个(57.1%)为非整倍体。在23枚胚胎中,3个(13.0%)为正常的二倍体,20个(87.0%)为嵌合体,其中包括5个(21.7%)非整倍体嵌合型、7个(30.4%)为二倍体-非整倍体嵌合型、5个(21.7%)为异常嵌合型、3个(13.0%)为无规律分离型。结论:卵裂期优质胚胎中存在较高的染色体嵌合体率。复杂染色体异常或高比例异常细胞的嵌合体可能是影响胚胎发育潜能的重要因素。
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编辑人员丨2天前
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Precise capture of circulating endometrial cells in endometriosis
编辑人员丨2天前
Background::Endometriosis (EM) is a complex benign gynecological disease, but it has malignant biological behavior and can invade any part of the body. Clinical manifestations include pelvic pain, dysmenorrhea, infertility, pelvic nodules, and masses. Our previous study successfully detected circulating endometrial cells (CECs) in the peripheral blood of patients with EM. The purpose of this study is to overcome the limitation of cell size in the previous microfluidic chip method, to further accurately capture CECs, understand the characteristics of these cells, and explore the relationship between CECs and the clinical course characteristics of patients with EM.Methods::Human peripheral venous blood used to detect CECs and circulating vascular endothelial cells (CVECs) was taken from EM patients ( n = 34) hospitalized in the Peking University People’s Hospital. We used the subtraction enrichment and immunostaining fluorescence in situ hybridization (SE-iFISH) method to exclude the interference of red blood cells, white blood cells, and CVECs, so as to accurately capture the CECs in the peripheral blood of patients with EM. Then we clarified the size and ploidy number of chromosome 8 of CECs, and a second grouping of patients was performed based on clinical characteristics to determine the relationship between CECs and clinical course characteristics. Results::The peripheral blood of 34 EM patients and 12 non-EM patients was evaluated by SE-iFISH. Overall, 34 eligible EM patients were enrolled. The results showed that the detection rates of CECs were 58.8% in EM patients and 16.7% in the control group. However, after classification according to clinical characteristics, more CECs could be detected in the peripheral blood of patients with rapidly progressive EM, with a detection rate of 94.4% (17/18). In total, 63.5% (40/63) of these cells were small cells with diameters below 5 μm, and 44.4% (28/63) were aneuploid cells. No significant association was found between the number of CECs and EM stage.Conclusion::The number and characteristics of CECs are related to the clinical course characteristics of patients with EM, such as pain and changes in lesion size, and may be used as biomarkers for personalized treatment and management of EM in the future.
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编辑人员丨2天前
