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新型冠状病毒奥密克戎变异株BA.5、BA.2亚型感染成人和儿童临床特征的分析
编辑人员丨4天前
目的:了解和比较上海市儿童和成人感染新型冠状病毒奥密克戎变异株BA.5、BA.2亚型的临床特征。方法:收集2022年12月1日至2023年1月20日奥密克戎变异株BA.5亚型主导流行期复旦大学附属儿科医院收治的524例新型冠状病毒感染住院儿童的临床资料,包括年龄、性别、临床症状、实验室检查结果等,并对同期家庭内密切接触者临床资料进行收集,与2022年4月4日至4月30日奥密克戎变异株BA.2亚型主导流行期复旦大学附属儿科医院收治的新型冠状病毒感染住院儿童和家庭内感染者临床特征进行比较;对BA.5亚型感染的儿童与成人、危重型与非危重型病例的临床资料进行比较。统计学分析采用独立样本 t检验、曼-惠特尼 U检验、 χ2检验或Fisher确切概率法。 结果:524例患儿的年龄范围为5 d至16岁,其中男301例(57.4%),女223例(42.6%),危重型29例(5.5%),非危重型495例(94.5%)。危重型患儿的发热热峰、气促发生率、肺炎发生率、基础疾病发生率均高于非危重型患儿,差异均有统计学意义( t=12.06, χ2=34.90、10.04、31.10,均 P<0.05);实验室检查方面,危重型患儿淋巴细胞计数减少发生率,C反应蛋白,降钙素原,白细胞介素-6,肝功能、肾功能、肌酸激酶同工酶异常比例均高于非危重型患儿,差异均有统计学意义( χ2=8.18, Z=-4.61, Z=-4.28, Z=-5.13, χ2=195.90, Fisher确切概率法, χ2=136.13,均 P<0.05)。非危重型BA.5亚型感染者中,儿童组症状感染比例高于成人组,儿童组发热、胃肠道症状(恶心、呕吐、腹泻)发生率高于成人组,而成人组咳嗽发生率高于儿童组,差异均有统计学意义( χ2=11.16、11.83、8.50、28.14,均 P<0.05)。2022年12月1日至2023年1月20日和2022年4月4日至4月30日分别收集到588例和355例儿童病例、791例和755例成人病例。儿童组中,BA.5亚型感染患儿咳嗽、惊厥、危重病例发生率较BA.2亚型感染患儿高,差异均有统计学意义( χ2=37.95、40.78、15.54,均 P<0.001)。成人组中,BA.5亚型感染者发热热峰、热程、发热发生率、咳嗽发生率、胃肠道症状发生率均高于BA.2亚型感染者,差异均有统计学意义( t=-4.40, Z=-9.64, χ2=47.29、124.09、29.90,均 P<0.001)。 结论:上海地区奥密克戎变异株BA.5亚型流行高峰时期,危重型患儿全身症状重,合并基础疾病发生率高于非危重型患儿。非危重型BA.5亚型感染者中,儿童症状感染比例高于成人,发热及胃肠道症状较成人多见,而成人咳嗽症状发生率高于儿童。BA.5亚型感染患儿惊厥、危重病例发生率较BA.2亚型高,BA.5亚型感染成人患者的全身症状较BA.2亚型重。
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编辑人员丨4天前
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基于一体化系统的呼吸道合胞病毒分型即时检验检测技术的建立及应用
编辑人员丨4天前
目的:研发一款一体化呼吸道合胞病毒(RSV)分型即时检验(point-of-care testing,POCT)检测试剂并评估其性能。方法:以RSV A和B亚型及ON1和BA9基因型的基因组保守序列设计特异性的引物和探针,优化PCR反应体系和条件,整合试剂玻璃化技术和多重检测平台,开发RSV分型POCT检测试剂,并对该产品的敏感度、特异度、重复性和临床性能进行评估。结果:一体化RSV分型POCT检测试剂敏感度可达500拷贝/ml,特异度好,与临床上表现相似的病原体无交叉反应,试剂批间和批内重复性Ct值的变异系数均<5%,具有较好的重复性,检测试剂应用于53例临床样本测试,检测结果与对比试剂具有较高的一致性和符合率,阳性符合率高达98.11%。结论:本研究开发的一体化RSV分型POCT检测试剂集成了"核酸提取-纯化-检测",实现了"样本进,结果出",操作简单,检测结果准确、可靠、稳定,可用于RSV A和B亚型的分型即时检验,为RSV的防控和诊疗提供助力。
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编辑人员丨4天前
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血液肿瘤患者三例ABO基因亚型鉴定及基因表达分析
编辑人员丨4天前
目的:探讨基因分型、基因测序和基因表达分析在血液肿瘤患者ABO血型鉴定疑难情况中的应用和发现。方法:选择2019年6月至2020年5月河北燕达陆道培医院检验科与输血科在血型鉴定时发现血清法正反定型结果不符或凝集不典型的患者3例。分别使用序列特异性引物PCR和Sanger测序法鉴定ABO基因型,用转录组测序分析ABO和FUT1基因表达水平。结果:1例12岁女性急性淋巴细胞白血病患者为O.01.02和BA.04基因亚型,对应B(A)血清亚型;ABO基因表达量正常(354.80)。1例41岁女性急性髓系白血病患者为A1.02和B.01基因型,对应A 1B血清型;ABO基因表达显著减低(45.70)。1例42岁男性骨髓增生异常综合征伴骨髓纤维化患者为A1.02和A2.05亚型,分别对应A 1和A 2血清型;ABO基因表达量为0。3例患者FUT1基因表达量均在正常范围。临床根据基因型和对应的血清型制定血制品输注策略,无输血相关不良反应发生。 结论:血液肿瘤患者可因血型基因亚型或基因表达异常导致血清学血型鉴定困难。ABO基因分型和血型基因表达分析可帮助准确判定原因,为血制品输注提供更好的安全保障。
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编辑人员丨4天前
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脑后循环缺血患者功能性后交通动脉的相位对比MR血管成像研究
编辑人员丨4天前
目的:应用相位对比磁共振血管成像(PC MRA)定量研究脑后循环缺血(PCI)患者的功能性后交通动脉(F-PCoA)的血流动力学特征及临床意义。方法:回顾性搜集2015年4月至2017年3月南方医科大学顺德医院的PC MRA资料,临床诊断PCI且存在F-PCoA者26例(PCI组),临床排除PCI者25例(非PCI组),其中包括10例存在F-PCoA(非PCI组1)和15例不存在F-PCoA(非PCI组2)。记录基底动脉(BA)的截面积和平均流量、平均流速、最小流量、最大流量、最小流速、最大流速,并计算流量峰高(最大流量-最小流量)、流速峰高(最大流速-最小流速),记录F-PCoA的亚型、截面积、平均流量、平均流速,根据流速的正负号判断血流方向,计算F-PCoA前向后绝对流量(左侧F-PCoA前向后绝对流量+右侧F-PCoA前向后绝对流量),并进行统计分析。结果:将PCI组和非PCI组1中存在F-PCoA的36例分为3型:(1) A型:F-PCoA与解剖性后交通动脉(A-PCoA)一致30例;(2) B型:F-PCoA与A-PCoA不一致5例;(3) C型:混合型,一侧F-PCoA与A-PCoA一致但另一侧不一致1例。PCI组与非PCI组1的F-PCoA亚型构成比差异无统计学意义(χ 2=0.609, P=0.737)、前向后绝对分流量差异无统计学意义( t=-0.576, P=0.568),一个心动周期内同一支F-PCoA的血流可为单向或双向,同一病例双侧F-PCoA的血流方向可相同也可不同,但PCI组的F-PCoA前向后绝对分流量曲线有更明显的主波峰。非PCI组中,非PCI组1和非PCI组2的比较,仅BA横截面积差异有统计学意义( t=-2.856, P=0.009),而性别构成、年龄分布、BA平均流量、平均流速、最小流量、最大流量、流量峰高、最小流速、最大流速及流速峰高差异均无统计学意义。 结论:应用PC MRA可定量分析F-PCoA的血流方向、流速及流量等血流动力学信息,F-PCoA的前向后绝对分流量结合血流曲线的形态改变,可能为PCI诊疗提供新的辅助参考信息。
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编辑人员丨4天前
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2018—2019年泉州人呼吸道合胞病毒基因型及基因特征分析
编辑人员丨4天前
目的:分析泉州2018—2019年人呼吸道合胞病毒(HRSV)流行情况和基因特征。方法:样本来自2018年11月至2019年5月福建省泉州市儿童医院送检的下呼吸道感染患儿咽拭子样本,共141份。采用RT-PCR法进行HRSVG基因3′末端靶基因扩增,使用sequencher 5.0以及MEGA5.05软件进行序列编辑、进化树构建和基因特征分析。结果:HRSV阳性样本25份,17份样本成功获得靶基因序列,其中HRSVA 13份,HRSVB 4份;共鉴定出两个基因型:ON1基因型(13份,HRSVA)和BA9基因型(4份,HRSVB)。5条ON1基因型靶基因序列与2012—2015年北京、长春和浙江流行的ON1基因型序列汇聚为一簇(Cluster1);1条(FJ19-02)与2012—2015年我国多个地区流行的ON1基因型序列汇聚为一簇(Cluster2);其余7条为独立的一簇(Cluster-FJ)。HRSVB亚型中FJ18-02、FJ19-14、FJ19-15与2015年在吉林长春流行的BA9基因型序列汇聚在一起;FJ19-13则与2013年在广州和浙江两地流行的BA9基因型序列具有较近的亲缘性。ON1基因型和BA9基因型均在重复插入的72和60个碱基片段区出现了核苷酸和氨基酸变异。Cluster-FJ分支靶基因序列出现了特征性氨基酸突变(H266L);FJ19-13出现了H261Q和Q265L的独立突变。结论:2018—2019年福建泉州流行的HRSV基因型为BA9和ON1,Cluster-FJ为新发现的独立传播链,有可能在泉州建立了本土循环流行。
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编辑人员丨4天前
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新型冠状病毒奥密克戎变异株及其亚系的流行病学及病原学特征
编辑人员丨4天前
新型冠状病毒奥密克戎变异株首次由南非报告,随后迅速在全世界传播,成为全球新型冠状病毒主要优势株,给疫情防控工作带来沉重压力。奥密克戎变异株包括BA.1,BA.2、BA.3、BA.4和BA.5等多种亚系,各亚系之间既有多个共同突变,也有各自独特的突变,这些突变具有不同的传播力。本文对奥密克戎变异株各亚型的流行情况和主要病原学特征做简要综述,为更好地防控疫情提供参考。
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编辑人员丨4天前
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新型冠状病毒奥密克戎变异株BA.2和BA.5亚型感染者的临床特征分析
编辑人员丨4天前
目的:分析西安市新型冠状病毒奥密克戎(Omicron)变异株不同亚型BA.2和BA.5本土感染者的临床症状。方法:纳入2022年新冠肺炎定点医院西安市胸科医院收治的168例2019-nCoV Omicron变异株感染者,收集数据包括流行病学、临床特征、实验室检查指标、病毒载量等,并比较BA.2和BA.5两种不同亚型间的差异。结果:共纳入患者168例,其中包括BA.2亚型感染患者122例和BA.5亚型感染患者46例。BA.2亚型感染者咳嗽比例高于BA.5亚型(43.44%∶23.91%; P=0.021)。相比于Omicron变异株BA.2亚型,BA.5亚型的无症状和轻型感染者比例更高(89.13%∶68.85%; P<0.001),感染者疫苗接种率更高(95.66%∶68.03%; P<0.001),转阴天数较短(8.62; P=0.047),病毒载量更高( P=0.005, P=0.017)。 结论:Omicron变异株具有极强的传染性,发病聚集性强,但临床症状较轻。新冠疫苗对Omicron变异株感染具有高水平的保护作用,建议完成新冠疫苗全程接种。
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编辑人员丨4天前
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呼吸道合胞病毒黏附糖蛋白基因新变异形式的发现及其感染患儿临床特征分析
编辑人员丨4天前
目的:分析北京地区呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus, RSV)流行特征,监测黏附糖蛋白(G)基因序列变异及感染患儿临床特征。方法:收集2023年1月1日—2023年12月31日首都儿科研究所附属儿童医院急性呼吸道感染患儿呼吸道标本,对经呼吸道病原体多重核酸检测确定为RSV阳性的样本,进一步通过PCR方法扩增得到RSV G蛋白基因全长,测序后建立系统发育进化树确定RSV分型及G蛋白序列变异,通过电子病历系统获得临床资料,分析北京地区RSV感染患儿临床特征。结果:共收集5 489份急性呼吸道感染患儿呼吸道标本,其中男3 046例,女2 443例,平均年龄4.36岁。核酸检测确定为RSV阳性的589例(10.7%,589/5 489),其中男349例,女240例,平均年龄(2.51±2.78)岁,中位年龄0.48岁。2023年3月开始RSV呈现持续流行趋势,存在两个流行高峰,分别为5月(24.6%,122/496)和12月(18.2%,126/693)。2023年7月前以A亚型为优势亚型,8—10月为两个亚型博弈阶段,11月转变为B亚型。通过序列分析发现一种长度为954 bp的RSV B亚型新序列(RSV-B-BA9-954bp),在进化树中独立成一簇。存在新变异的RSV B亚型感染患儿收入重症监护病房(ICU)的比例(44.1%,15/34)高于未变异的RSV B亚型感染患儿(25.2%,31/123)(χ 2=4.600, P=0.032),但白细胞计数和C-反应蛋白低于未变异的RSV B亚型感染患儿( P<0.05)。 结论:2023年北京地区儿童中RSV自3月份开始持续流行,出现两个流行高峰,优势流行亚型由A转换为B,监测到一种新的RSV B亚型G蛋白基因变异(RSV-B-BA9-954bp)。
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编辑人员丨4天前
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珠海市新型冠状病毒奥密克戎变异株BA.1和BA.2亚型感染者的临床特征分析
编辑人员丨4天前
目的:探索珠海市新型冠状病毒(2019-nCoV)奥密克戎(Omicron)变异株BA.1和BA.2亚型感染者的临床特征。方法:纳入2022年1月13日至3月8日中山大学附属第五医院收治的122例2019-nCoV Omicron变异株感染者,其中成人病例79例(BA.1亚型23例,BA.2亚型56例),儿童病例43例(BA.1亚型19例,BA.2亚型24例)。比较BA.1亚型和BA.2亚型病例不同年龄组的临床表现、实验室检查指标、病毒载量、疫苗接种和感染类型的差异。计量资料采用Mann-Whitney U检验或Kruskal-Wallis H检验,计数资料采用 χ2检验或Fisher确切概率法。 结果:在成人Omicron变异株感染者中,BA.2亚型感染者基线病毒载量比BA.1亚型高[7.64(6.92,8.55) lg拷贝/mL比6.64(6.04,7.34) lg拷贝/mL, Z=-3.022, P=0.003],且无症状感染者和轻型患者比例更高,普通型患者比例更低( χ2=8.052, P=0.012),BA.1亚型感染者肺部出现炎症比例(6/23,26.1%)高于BA.2亚型感染者(2/56,3.6%)( χ2=6.776, P=0.009)。在儿童病例中,BA.2亚型感染者发热比例(16/24,66.7%)高于BA.1亚型感染患儿(5/19,26.3%),淋巴细胞计数降低百分比(17/24,70.8%)亦高于BA.1亚型患儿(1/19,5.3%)( χ2=6.910和18.734, P=0.009和 P<0.001]。与成人病例相比,BA.2亚型感染患儿发热比例更高[(16/24,66.7%)比(19/56,33.9%), χ2=7.317, P=0.007)]。成人和儿童BA.2亚型鼻拭子两周内病毒载量均呈先上升后下降趋势,下降幅度比BA.1亚型更快。 结论:成人2019-nCoV Omicron变异株BA.2亚型感染者入院时基线病毒载量高,早期传染性更强,但病毒载量下降更快,儿童BA.2亚型感染者发热比例和淋巴细胞计数降低百分比更高,提示BA.2亚型防控形势更加严峻。
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编辑人员丨4天前
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北京市首起新冠病毒Omicron变异株BA.5引起新冠肺炎聚集性疫情的调查研究
编辑人员丨4天前
目的:对延庆区新冠肺炎聚集性疫情进行流行病学调查和基因测序,分析病例的感染来源、传播链条、防控措施,为新冠疫情防控提供参考。方法:对病例开展流行病学调查,应用大数据技术对病例的活动轨迹进行核查,对风险点位进行调查管控,判定和管理密切接触者,并对人员和环境开展核酸检测,对溯源重点人群采集血清标本进行抗体检测,对报告的病例进行全基因组测序、比对,分析感染来源和传播链。结果:2022年7月4日至7月10日,延庆区聚集性疫情共涉及16例新冠病毒确诊病例(普通型1例、轻型15例),其中延庆区8例,顺义区5例,通州区、昌平区、丰台区各1例,毒株分型均为新冠病毒Omicron亚型变异毒株BA.5,潜伏期中位数为3 d。指示病例为1例从美国入境人员,6月15日至6月30日在上海隔离点隔离,7月1日隔离期满后返京,7月4日诊断为确诊病例,在工作单位传播给同工作、同餐人员引起的聚集性疫情。结论:OmicronBA.5亚分支正成为全球主要流行毒株,要加强入境人员管理,做好口岸城市疫情防控工作。加强疫苗接种、核酸检测等常态化防控措施落实,早期发现疫情后,采取科学精准的防控措施。
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编辑人员丨4天前
