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三带双锯鱼(Amphiprion ocellaris)烟碱型乙酰胆碱受体基因的克隆及生物信息学分析
编辑人员丨1周前
鱼类的许多生理过程都受到烟碱型乙酰胆碱受体(nicotinic acetylcholine receptors)的调节,如神经肌肉信号传递.在海洋环境中,三带双锯鱼(Amphiprion ocellaris)被芋螺(Conus)捕食的过程与烟碱型乙酰胆碱受体密切相关.本研究以三带双锯鱼肌肉、脑、肠道组织的cDNA作为模板,克隆三带双锯鱼烟碱型乙酰胆碱受体不同亚基的基因,在此基础上进行生物信息学分析,同时构建系统进化树.研究结果表明,从三带双锯鱼肌肉组织中克隆得到了烟碱型胆碱能受体α1亚基(cho-linergic receptor nicotinic alpha 1 subunit,chrna1)和烟碱型胆碱能受体 e 亚基(cholinergic receptor nicotinic epsilon subunit,chrne)基因序列;从脑组织中克隆获得烟碱型胆碱能受体α10亚基(cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit,chrna10)基因序列.将得到的基因序列利用Colabfold软件对其编码蛋白的3D结构进行预测,所得结果与已经解析的烟碱型乙酰胆碱受体的结构高度相似.采用荧光定量PCR技术对chrna1、chrne、chrna10基因在三带双锯鱼肌肉、脑、肠组织中的表达水平进行检测,结果显示,chrna1、chrne基因在肌肉组织中的表达量非常高,在脑组织中的表达量非常低,肠道组织中没有检测到表达.chrna10基因在脑组织中的表达量较低,在肌肉、肠道组织中没有检测到表达.系统进化树结果表明不同物种间乙酰胆碱受体的蛋白序列高度保守,三带双锯鱼与模式生物斑马鱼(Danio rerio)几乎同源.
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编辑人员丨1周前
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基于网络药理学及分子对接探讨散风通窍滴丸治疗鼻咽癌的分子机制
编辑人员丨1周前
目的:采用网络药理学和分子对接方法探讨散风通窍滴丸治疗鼻咽癌的潜在作用机制。方法:在BATMAN-TCM数据库中寻找散风通窍滴丸的潜在作用通路,并从TCMSP及UniProt数据库筛选出散风通窍滴丸各活性成分可能存在的靶点,GeneCards数据库挖掘鼻咽癌相关靶点基因,通过STRING数据库、Cytoscape软件、EVENN网站、BATMAN-TCM数据库进行网络可视化,最后采用PubChem化合物、RCSB蛋白质数据库、AutoDockTools、Autodock Vina以及PyMoL软件进行分子对接进一步探究其相互作用的可能性。结果:散风通窍滴丸可以对癌症起作用,经筛选在鼻咽癌中发现13个治疗的潜在靶点:NCOA1、NCOA2、HSP90AA1、BAX、PTGS2、JUN、PIK3CG、DPP4、BCL2、PGR、CASP3、CHRNA7和NOS2;对应的靶蛋白为CREBBP、ITGB1、RAC1、HDAC1、STAT1和JAK2,作用通路主要涉及雌激素信号通路,白细胞介素17信号通路和一些凋亡信号通路;多维网络分析结果提示散风通窍滴丸治疗鼻咽癌的3个靶基因为PTGS2、NCOA1、PIK3CG,有6条代谢途径参与该过程,代谢途径主要与凋亡和抗炎症反应相关。分子对接结果提示治疗靶点PTGS2和NCOA2与药物潜在活性成分紧密结合。结论:散风通窍滴丸可能通过参与调节激素分泌、促进肿瘤细胞凋亡、抑制肿瘤细胞增殖、抗炎症反应等治疗鼻咽癌。
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编辑人员丨1周前
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烟碱型胆碱受体α5在前列腺腺癌中的表达及对前列腺腺癌细胞转移活性的影响
编辑人员丨1周前
目的:观察烟碱型胆碱受体α5(CHRNA5)在前列腺癌中的表达及对前列腺癌DU145细胞恶性转移的影响。方法:前列腺癌组织及癌旁正常前列腺组织取自2022年1月至2023年10月于天津医科大学总医院接受手术治疗的15例前列腺腺癌患者。免疫组织化学实验检测前列腺癌癌组织以及癌旁正常前列腺组织CHRNA5的表达水平;将前列腺癌细胞系DU145细胞分为3个实验组:si CHRNA5组、si NC组以及Yes相关蛋白1/PDZ结合域的转录共刺激因子(YAP1/TAZ)抑制剂组。通过四甲基偶氮唑蓝(MTT)法检测DU145细胞的增殖能力;通过Transwell实验分析DU145细胞的侵袭能力;通过细胞划痕实验分析DU145细胞的迁移能力;通过流式细胞术分析DU145细胞的凋亡率;通过蛋白免疫印迹检测YAP1/TAZ信号通路以及CHRNA5蛋白的表达水平。两组间比较采用独立样本 t检验。 结果:前列腺癌组织CHRNA5的表达水平高于癌旁正常前列腺组织(0.28±0.07比0.89±0.08, t=12.178, P<0.05)。si CHRNA5以及YAP1/TAZ抑制剂组的DU145细胞增殖能力低于si NC组(1.72±0.06比0.83±0.01比0.81±0.05, F=11.369, P<0.05);si CHRNA5以及YAP1/TAZ抑制剂组的DU145细胞侵袭数低于si NC组(139.19±10.76比83.89±9.36比79.93±8.25, F=21.328, P<0.05);si CHRNA5以及YAP1/TAZ抑制剂组的DU145细胞迁移率低于si NC组[(88.65±6.06)%比(55.86±5.33)%比(56.23±3.88)%, F=20.162, P<0.05];si CHRNA5以及YAP1/TAZ抑制剂组的DU145细胞凋亡率高于si NC组[(3.16±0.36)%比(12.62±0.25)%比(13.26±0.17)%, F=13.179, P<0.05];si CHRNA5以及YAP1/TAZ抑制剂组的DU145细胞YAP1、TAZ蛋白水平低于si NC组(0.81±0.12比0.32±0.15比0.28±0.09, F=15.782, P<0.05;0.79±0.12比0.18±0.09比0.22±0.06, F=17.336, P<0.05);pcDNA3.1 CHRNA5组DU145细胞的YAP1、TAZ蛋白表达水平高于pcDNA3.1 NC组(0.32±0.06比0.78±0.03, t=11.569, P<0.05;0.26±0.07比0.72±0.03, t=16.238, P<0.05)。 结论:CHRNA5在前列腺癌组织中高表达,CHRNA5能够通过激活YAP1/TAZ通路促进前列腺癌DU145细胞的增殖、迁移以及侵袭。
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编辑人员丨1周前
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发作性运动诱发性肌张力障碍的遗传学和功能影像学研究进展
编辑人员丨1周前
发作性运动诱发性运动障碍(PKD)是一种罕见的发作性运动障碍,人群发病率约为1/150 000。PKD与遗传高度相关,除 PRRT2基因外, SCN8A、 KCNA1、 CHRNA4、 DEPDC5、 PNKD、 SLC2A1、 KCNMA1、 ADCY5等基因突变也可以导致PKD表型。功能影像学研究发现PKD患者存在皮质、基底节、丘脑的细微结构或功能异常。本文现围绕PKD的遗传学和功能影像学研究新进展进行综述,以期有助于进一步了解PKD的潜在病理生理学机制。
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编辑人员丨1周前
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单核苷酸多态性对阿尔茨海默病药物疗效影响的研究进展
编辑人员丨1周前
阿尔茨海默病(AD)是一种渐进性神经退行性疾病,需服用药物改善患者症状,但疗效存在个体差异。以“阿尔茨海默病”“药物疗效”“单核苷酸多态性”以及“Alzheimer′s disease”“Drug efficacy”“Single nucleotide polymorphism”作为关键词,在中国知网、维普数据库、万方数据库、Pubmed、Springer Link和Cochrane Library 数据库检索2000年1月至2020年7月发表的相关文献,对AD药物疗效差异与基因单核苷酸多态性相关性进行综述,包括ABCA1、ApoE、ChAT、CHRNA7、IL-6、A2M、CYP2D6、BChE、5HT2a、PON-1和ESR1基因,为临床医生治疗AD时选择药物提供参考依据。
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编辑人员丨1周前
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α5-nAChR与MHC-Ⅰ在肺腺癌中的表达及相关性
编辑人员丨2024/7/13
目的 探讨α5-烟碱型乙醜胆碱受体(alpha5-nicotinic acetylcholine receptor,α5-nAChR)与主要组织相容性复合体Ⅰ类分子(major histocompatibility complex class Ⅰ molecule,MHC-Ⅰ)在肺腺癌中的表达及相关性.方法 TC-GA数据库分析CHRNA5(编码α5-nAChR基因)与HLA-B(编码MHC-Ⅰ基因)在肺腺癌中的表达、相关性及其临床意义.运用免疫组织化学技术检测人肺腺癌临床样本、裸鼠肺腺癌异种移植瘤组织中α5-nAChR与MHC-Ⅰ的表达及相关性.在人A549细胞、小鼠LLC细胞中,Western blotting检测在α5-nAChR不同表达水平下的FHIT与MHC-Ⅰ表达及相关性.结果 数据库分析表明,CHRNA5高表达或HLA-B低表达肺腺癌患者的生存率降低,CHRNA5与HLA-B的表达呈负相关(P<0.05).α5-nAChR与MHC-Ⅰ在人肺腺癌、裸鼠肺腺癌异种移植物中的表达呈负相关(P<0.05).在肺腺癌细胞中,α5-nAChR的表达分别与FHIT、MHC-Ⅰ的表达呈负相关(P<0.05),FHIT和MHC-Ⅰ在肺腺癌细胞中的表达呈正相关(P<0.05).结论 α5-nAChR与MHC-Ⅰ的表达呈负相关,并参与肺腺癌的发生.
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编辑人员丨2024/7/13
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青少年肌阵挛癫痫相关非离子通道基因研究进展
编辑人员丨2024/3/23
青少年肌阵挛癫痫(juvenile myoclonic epilepsy,JME)是特发性全面性癫痫(idiopathic generalized epi-lepsy,IGE)中常见的一种亚型.遗传因素在JME中起重要作用,已发现多个基因和染色体位点与JME的发病有关.根据基因突变引起JME中涉及的不同机制,可以将JME相关基因分为离子通道基因和非离子通道基因,离子通道基因的作用机制已经被逐渐明确且只占少数病例,对JME相关的非离子通道基因的研究尚未明确,本文从神经递质相关基因(CHRNA4、GRM4、SLC6A4)、神经系统发育相关基因(TOP3B、CILK1、BRD2、EFHC1)、其他相关基因(TAP-1、CX36)三个方面对JME相关非离子通道基因的研究进展进行综述.
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编辑人员丨2024/3/23
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白脉软膏调控神经活动配体-受体及HIF-1信号通路改善背根神经节慢性压迫大鼠慢性疼痛的作用及机制研究
编辑人员丨2024/1/20
具"舒筋活络"核心功效的白脉软膏临床干预疼痛、痉挛、僵硬等症状的白脉病疗效显著,但其药效学特点及机制尚不明确.该研究建立模拟临床的腰椎间盘髓核突出压迫神经的大鼠L4背根神经节慢性压迫(chronic compression of dorsal root ganglion,CCD)模型,采用行为学、副作用评估、网络分析、拮抗剂及分子生物学验证等方法初步探讨白脉软膏治疗CCD的药效及机制.药效学研究表明,白脉软膏能明显改善CCD模型大鼠的痛敏阈值(机械痛敏、热痛敏、冷痛敏),改善步态行为,且无耐受性及明显的毒副作用;靶组织初筛结果显示白脉软膏能抑制小鼠福尔马林实验第二时相伤害性反应,升高正常小鼠的热板阈值,并降低脊髓炎症因子表达;网络分析发现白脉软膏治疗CCD具有协同性且与下行抑制/易化系统及神经炎症相关.实验进一步采用行为学、免疫印迹、免疫荧光等技术发现白脉软膏发挥CCD镇痛作用可能与其调节CHRNA7、ADRA2A、ADRB2等神经活动配体-受体(神经配基)以及降低脊髓小胶质细胞HIF-1信号通路核心调控元件NOS2/p-ERK/PI3K的表达相关.相关研究初步揭示了白脉软膏治疗白脉病的"舒筋活络"机制,并为其临床合理用药及深入研究提供了参考.
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编辑人员丨2024/1/20
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CHRNA1和ORM1基因多态性对维库溴铵肌松效应的影响
编辑人员丨2023/8/6
[目的]探讨CHRNA1和ORM1基因多态性对维库溴铵肌松效应的影响.[方法]选取ASA Ⅰ~Ⅱ级、年龄18~65岁,择期全麻下拟行乳腺包块切除的女性患者114例,术前采集外周静脉血5 mL,采用3730XL DNA测序仪(Applied Biosystems,USA)直接测序.麻醉诱导期间给予2ED95(0.1 mg/kg)维库溴铵,用TOF-Watch加速度仪进行肌肉松弛监测,采用4个成串刺激(train of four,TOF)方式监测拇内收肌的收缩反应.观察起效时间、时效、体内作用时间、恢复指数、TOF比率恢复到25%的时间.按照肌松监测指标的90%置信区间纳入标准,选取107例患者其中的12例,对CHRNA1全外显子、rs16862847和ORM1(A113G)进行测序.[结果]12例患者CHRNA1基因的全外显子、rs16862847SNP位点和ORM1 A113G测序结果显示CHRNA1基因的全外显子、rs16862847均未发现突变.ORM1发现7例A113G杂合子突变(ORM1* F/* S),5例未发现突变(ORM1* F/* F).[结论]ORM1 A113G基因多态性可能在一定程度上影响维库溴铵的肌松效应,其可能机制需进一步研究.
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编辑人员丨2023/8/6
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良性家族性新生儿-婴儿癫痫致病基因谱研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 分析良性家族性新生儿-婴儿癫痫(BFNIE)家系的致病基因谱.方法 收集2012年12月至2016年4月在北京大学第一医院儿科就诊的BFNIE家系的临床资料和外周血DNA,首先采用Sanger测序方法筛查PRRT2基因突变,对于未发现PRRT2基因突变的家系再采用靶向捕获二代测序癫痫基因检测包对BFNIE的候选致病基因进行突变筛查.结果 共收集7个BFNIE家系,共有30例受累者,其中男15例、女15例,起病年龄为2日龄~6月龄.7个家系均发现基因突变,PRRT2基因Sanger测序发现一个家系携带PRRT2基因热点突变c.649dupC;二代测序发现3个家系携带SCN2A基因错义突变(c.2674G>A/p.V892I、c.2872A>G/p.M958V和c.2627A>G/p.N876S),其中c.2872A>G/p.M958V和c.2627A>G/p.N876S为未报道的新突变;二代测序发现3个家系携带KCNQ2基因突变,其中错义突变见于2个家系(c.958G>A/p.V320I和c.998G>A/p.R333Q),c.958G>A/p.V320I为未报道的新突变,KCNQ2基因杂合片段缺失见于1个家系,该片段缺失还累及了邻近的CHRNA4基因,缺失范围包括KCNQ2基因和CHRNA4基因的全部外显子.结论 BFNIE的致病基因谱包括KCNQ2、SCN2A和PRRT2基因,基因突变检出率高,KCNQ2和SCN2A基因突变在BFNIE中常见.SCN2A基因突变c.2872A>G/p.M958V和c.2627A>G/p.N876S及KCNQ2基因突变c.958G>A/p.V320I为新发现的突变.
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编辑人员丨2023/8/6
