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加权基因共表达网络分析黏附基因在腹主动脉瘤中相关机制
编辑人员丨4天前
目的:通过加权基因共表达网络分析揭示腹主动脉瘤(AAA)发生的潜在机制。方法:对数据库编号GSE47472和数据库编号GSE57691两个AAA转录组测序数据合并,进行基因差异表达分析得到差异基因,加权基因共表达网络分析(WGCNA)得到中心基因,两者取交集得到差异中心基因,并对其进行功能富集分析。建立小鼠AAA模型进行定量聚合酶链反应(qPCR)验证差异中心基因表达。使用GraphPad Prism 8进行统计分析。Kolmogorov-Smirnov检验数据正态性,采用独立样本 t检验分析基因差异表达。 结果:共筛选出745个差异表达基因,建立16个基因共表达模块,其中中心模块包含119个基因,取交集后共得到60差异中心基因。对差异中心基因进行功能富集分析结果示AAA中平滑肌增殖分化功能和细胞黏附功能相关基因低表达。低表达的细胞黏附相关基因为钙黏着蛋白-2(CDH2),(钙黏着蛋白-13)CDH13,整合素相互作用蛋白-2(FERMT2),Rho关联含卷曲螺旋结合蛋白激酶1(ROCK1),层黏蛋白α5(LAMA5),进行qPCR验证其表达差异显著性。相对表达倍数分别为FERMT2=0.31 ( t=2.454, P<0.05),ROCK1=0.22( t=3.686, P<0.05),LAMA5=0.45( t=3.168, P<0.05),CDH13=1.36( t=0.103, P>0.05),CDH2=1.71( t=0.702, P>0.05)。 结论:FERMT2、ROCK1、LAMA5低表达可能通过介导血管平滑肌细胞与细胞外基质间黏附作用异常参与AAA形成。
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编辑人员丨4天前
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FERM、ARH/RhoGEF和pleckstrin结构域蛋白1在胸主动脉夹层中的表达及作用
编辑人员丨4天前
目的:探讨FERM、ARH/RhoGEF和pleckstrin结构域蛋白1(Farp1)在胸主动脉夹层中的表达及作用。方法:胸主动脉夹层(TAD)组织来源于2022年12月至2023年3月在武汉大学中南医院因Stanford A型主动脉夹层行外科手术的患者,收集心脏移植供体残余的胸主动脉作为对照(CRTL)组。通过蛋白质印迹法(Western blot)和免疫组织化学检测TAD与CRTL组胸主动脉组织中Farp1的表达水平;3周龄雄性C57BL/6J小鼠喂养0.25%的β-氨基丙腈酯(BAPN)4周构建胸主动脉夹层模型,检测指标及方法同人胸主动脉组织;血管紧张素Ⅱ(AngⅡ,1×10 -7 mol/L)刺激原代大鼠胸主动脉平滑肌细胞(RAVSMCs)24 h模拟胸主动脉夹层,构建Ad-sh-Farp1敲低腺病毒干扰RAVSMCs中Farp1的表达,通过Western blot检测RAVSMCs中收缩表型蛋白标志物。采用非配对 t检验进行统计学分析。 结果:Western blot(1.723±0.084, t=5.667, P<0.05)及免疫组织化学染色(3.507±0.232, t=4.393, P<0.05)结果显示人TAD组织中Farp1的蛋白水平高于对照组;小鼠主动脉夹层组织Western blot(1.304±0.042, t=2.996, P<0.05)和免疫组织化学染色(0.458±0.030, t=4.060, P<0.05)显示了相同结果,且免疫组织化学染色进一步提示Farp1蛋白水平改变主要发生于主动脉中层(平滑肌);细胞实验显示AngⅡ促进RAVSMCs中Farp1蛋白表达上调(1.469±0.115, t=3.912, P<0.05),敲低Farp1抑制了RAVSMCs表型转换[α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA):1.762±0.202, t=3.123, P<0.05;CNN1:1.615±0.101, t=5.288, P<0.05;SM22α:1.618±0.135, t=2.964, P<0.05]。 结论:Farp1与主动脉平滑肌细胞表型转换明显相关,Farp1蛋白水平增高可能促进胸主动脉夹层的发生发展。
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编辑人员丨4天前
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DFNB3型耳聋患儿MYO15A基因变异分析
编辑人员丨4天前
目的:探讨常染色体隐性非综合征耳聋3型致病基因MYO15A基因的变异特点及临床特征。方法:回顾性分析自2016年11月至2019年2月在郑州大学第一附属医院遗传与产前诊断中心进行耳聋基因高通量测序的108个非综合征型耳聋家庭的听力及测序数据,总结MYO15A基因的变异情况。结果:共有来自8个家庭的9例耳聋患儿检测到MYO15A基因复合杂合变异,占所有耳聋家庭的7.4%(8/108),变异位点分别为c.5910+1G>A/c.9417_9418insTA、c.4234T>G/c.8324G>T、c.3926A>T/c.5002delC、c.9690+1G>A/c.10257_10259delCTT、c.8324G>T/c.10419_10423delCAGCT、c.4519C>T/c.6454G>C、c.6177+1G>T/c.10257_10259delCTT、c.5692C>T/c.7396-1G>A,所有患儿均为重度至极重度耳聋表型。14个变异位点中,12个变异位于蛋白的重要结构域中,包括motor结构域5个,FERM结构域3个、MyTH4结构域3个,IQ基序1个,其中c.3926A>T、c.4234T>G、c.4519C>T、c.5002delC、c.6454G>C、c.8324G>T、c.9417_9418insTA、c.10419_10423delCAGCT这8个变异经人类基因组突变数据库专业版(截至2020年2月)查询尚无文献报道,根据美国医学遗传学与基因组学学会制定的变异分类标准与指南,6个已有文献报道的变异以及本研究新发现的c.4519C>T、c.5002delC、c.9417_9418insTA、c.10419_10423delCAGCT评定为致病变异,c.8324G>T 评定为可能致病变异,c.3926A>T、c.4234T>G、c.6454G>C评定为临床意义不明变异。结论:MYO15A基因在中国耳聋人群主要以复合杂合变异形式致病,临床表型多为重度至极重度耳聋,变异位点主要集中于motor、FERM、 MyTH4结构域中。
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编辑人员丨4天前
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先天性特发性眼球震颤的致病基因和基因位点
编辑人员丨5天前
先天性特发性眼球震颤(CIN)是指出生后早期出现的、无明显诱因的双眼非自主性、有节律的往返运动。CIN发病率为0.015%~0.14%。CIN患者可表现为不同程度的视力下降以及代偿头位等临床特征。CIN的病因和发病机制不明,但存在家族遗传倾向,可表现为常染色体显性、常染色体隐性以及X连锁遗传。目前报道的与常染色体显性遗传模式相关的致病基因位点有4个,与X连锁遗传模式相关的致病基因位点有3个,而只有位于X染色体上的酵母功能域包含蛋白7( FRMD7)基因被确定与CIN发病相关。笔者现就CIN的遗传特征、临床表型以及相关的致病基因位点、致病基因的发现进行综述,并阐述 FRMD7基因突变引起的眼球震颤的发病机制。
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编辑人员丨5天前
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一家族性多发CCM家系中 CCM1基因新发突变研究
编辑人员丨5天前
目的:报道一家族性多发脑海绵状血管瘤(CCM)家系中 CCM1基因新发突变情况。 方法:长期跟踪观察于哈尔滨医科大学附属第一医院神经外科确诊的一家族性多发CCM家系,并对家系中部分患者、健康成员的血液和(或)病理组织基因组DNA进行全外显子测序及生物信息学分析以筛选出该家系可能的致病基因,然后对致病基因进行Sanger测序验证及其蛋白产物三维结构预测。结果:全外显子测序显示,患者均存在一种 CCM1基因缺失-移码突变(c.1635delA),该突变导致参考碱基"T"的缺失且该突变目前尚未被报道,而健康成员未存在上述突变。Sanger测序验证显示, CCM1基因第15号外显子1635处碱基"A"缺失,引起 CCM1基因阅读框架改变,导致1652~1654位的核苷酸提前出现终止密码子TAG。蛋白产物三维结构预测显示该新发突变可能导致KRIT1蛋白功能区(C-末端)的Ferm-3结构域部分缺失。 结论:一种 CCM1基因新发缺失-移码突变(c.1635delA)致使该家系中家族性多发CCM的发生。
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编辑人员丨5天前
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微RNA-454-3p、FERM结构域蛋白6在乳腺癌组织中的表达水平及临床意义
编辑人员丨2024/6/22
目的 探讨微RNA(miR)-454-3p、FERM结构域蛋白6(FRMD6)在乳腺癌组织中的表达水平以及临床意义.方法 选取唐山市人民医院2016年12月至2018年12月住院手术的150例乳腺癌病人术中切除的乳腺癌组织标本及癌旁组织标本;采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测miR-454-3p、FRMD6在组织中的水平;采用Kaplan-Meier法分析miR-454-3p、FRMD6水平与乳腺癌病人预后的关系,并用log-rank法进行检验;Cox回归分析影响乳腺癌病人预后的因素.结果 乳腺癌组织miR-454-3p水平(1.25±0.24)高于癌旁组织(0.99±0.22),FRMD6水平(0.79±0.19)低于癌旁组织(1.01±0.24),差异有统计学意义(P<0.05);癌组织中miR-454-3p、FRMD6水平与淋巴结转移、组织分化以及TNM分期有关(P<0.05);miR-454-3p高表达组和FRMD6低表达组病人3年累积生存率分别低于miR-454-3p低表达组和FRMD6高表达组病人(均P<0.05);miR-454-3p高表达、FRMD6低表达、TNM分期为Ⅲ/Ⅳ期、淋巴结转移是影响乳腺癌病人预后的危险因素(P<0.05).结论 miR-454-3p在乳腺癌组织中表达上调,FRMD6在乳腺癌组织中表达降低,二者与乳腺癌病人预后密切相关,有望成为临床上预测乳腺癌病人预后的生物性标志物.
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编辑人员丨2024/6/22
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Ezrin/YAP信号轴促进胃癌细胞增殖的作用研究
编辑人员丨2023/12/9
背景与目的:笔者前期研究发现埃兹蛋白(Ezrin)与YAP蛋白在胃癌组织中表达升高,且与患者不良预后密切相关.因此,本研究在胃癌细胞中进一步分析两者的关系与作用.方法:将胃癌细胞分别用Ezrin特异性siRNA序列(si-Ezrin)转染、YAP激动剂(HY-101299B组)处理、si-Ezrin转染+HY-101299B处理,以转染无关siRNA序列的胃癌细胞为阴性对照.随后分别用CCK-8法及平板克隆实验检测细胞的增殖活力、Transwell实验检测细胞的侵袭能力,并用qPCR和Western blot检测各组细胞中YAP及其下游靶分子的mRNA及蛋白的表达.结果:与阴性对照组比较,转染si-Ezrin的胃癌细胞的增殖能力明显减弱,细胞中YAP及其下游分子(Mst、WW45、Lats1、Lats2、TEAD)的mRNA与蛋白水平表达明显下调,而HY-101299B处理的胃癌细胞上述指标均呈反向变化(均P<0.05);转染si-Ezrin同时加HY-101299B处理,两者的上述作用部分相互抵消.转染si-Ezrin与HY-101299B对胃癌的侵袭能力均无明显影响(均P>0.05).结论:Ezrin在胃癌中起了致癌因子的作用,机制可能与其激活YAP通路促进胃癌细胞的增殖有关.
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编辑人员丨2023/12/9
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Ezrin在炎症性疾病中的研究进展
编辑人员丨2023/9/2
Ezrin属于ezrin-radixin-moesin(ERM)家族成员,是连接质膜(PM)和细胞骨架的连接蛋白,在介导肿瘤的侵袭和转移过程中发挥主要作用.近年研究表明Ezrin参与调节免疫细胞功能,在T细胞中,Ezrin调节免疫突触的形成,通过控制B细胞信号传导和蛋白转运调节体液免疫.此外,Ezrin还可将囊性纤维化跨膜电导调节剂(CFTR)与TLR4信号联系起来,协调巨噬细胞的抗菌免疫反应,与L-选择素结合促使中性粒细胞功能转换和黏附.以上作用表明Ezrin在炎症性疾病中发挥作用.本文主要就Ezrin在炎症及炎症性疾病中的最新研究进展进行总结.
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编辑人员丨2023/9/2
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L-periaxin与Ezrin的N端FERM结构域结合依赖其第3段核定位信号序列
编辑人员丨2023/8/6
L-periaxin是外周神经系统特异表达的骨架蛋白之一,占外周神经系统髓鞘总蛋白质的16%,参与髓鞘形成和维护.埃兹蛋白(Ezrin)属于Ezrin-Radxin-Moesin (ERM)蛋白质家族,与细胞黏附、迁移、生存以及肿瘤的发生、发展相关.作者前期研究证实,L-periaxin与Ezrin通过“头对头,尾对尾”的模式相互结合.本文通过双分子荧光互补、免疫共沉淀、GST pull down、荧光共定位、海肾荧光素酶互补、荧光光谱以及分子对接等方法,揭示L-periaxin的核定位信号区(nuclear location signal,NLS)与蛋白质Ezrin的FERM(Ezrin Radixin Moesin)结构域的“头对头”相互结合,依赖L-periaxin第3段核定位信号序列NLS3与Ezrin的FERM结构域的F3亚结构域.本结果为进一步理解Ezrin在髓鞘化过程中的作用,以及阐明调节L-periaxin蛋白功能的信号通路奠定基础.
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编辑人员丨2023/8/6
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阴沟肠杆菌和大肠杆菌的生物化工发酵能力比较研究
编辑人员丨2023/8/6
本研究通过对Escherichia coli JM109 菌株和E. cloacae gxas 菌株的碳源利用能力、菌株的生长优势以及胞内发酵产物组成进行了研究.实验结果表明:在碳源利用测试中E. coli JM109 结果表现阳性(+)只有8 种,阴性(-)有32 种,而E. cloacae gxas 阳性(+)有38 种,阴性(-)只有18 种,具有广泛的碳源谱.比较2 株菌株的生长曲线发现E. cloacae gxas 比E. coli JM109 生长快,稳定期具有更高的生物量.GC-MS 分析结果显示两个菌株的发酵产物的差异极大,在多尺度面上没有重合点.以大肠杆菌为对照菌株,阴沟肠杆菌的发酵产物中有14 776 个化合物的产量比大肠杆菌高,只有7 725 个化合物的产量比大肠杆菌低.因而,阴沟肠杆菌在生物化工发酵应用中比大肠杆菌更具潜力优势.
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编辑人员丨2023/8/6
