目的:研究电离辐射对小鼠骨髓细胞中环状RNA(circular RNA，circRNA)的N 6-甲基腺嘌呤(N 6-methyladenine，m 6A)修饰谱的影响，为揭示RNA表观遗传修饰与放射性造血系统损伤之间的关系提供科学依据。 方法:将24只C57BL/6 J小鼠按随机数表法分为健康对照组和照射组，每组12只。照射组用4 Gy 137Cs γ射线对小鼠进行全身照射。照后将两组小鼠脱颈处死，收集股骨中的骨髓细胞。提取总RNA，通过m 6A RNA免疫沉淀-高通量测序(MeRIP-Seq)技术和生物信息学分析方法，探究小鼠受照后骨髓细胞中circRNA m 6A修饰谱的变化。运用MeRIP-qPCR实验对变化显著的m 6A修饰位点进行验证。 结果:健康对照组和照射组中各鉴定出325和455个(其中两组共有178个，健康对照组特有147个，照射组特有277个)circRNA的m 6A修饰位点。健康对照组和照射组中各鉴定出1 275和1 017个(其中两组共有767个，健康对照组特有508个，照射组特有250个)发生m 6A修饰circRNA的来源基因。与健康对照组相比，照射组中有414个m 6A位点的富集倍数显著上调，178个m 6A位点的富集倍数显著下调，差异具有统计学意义( P < 10 -10；倍数筛选阈值> 5)。基因本体论(GO)分析显示，电离辐射后小鼠骨髓细胞中m 6A修饰水平显著改变的circRNA来源基因涉及染色质相关调控、纤毛转换纤维和多聚(A)特异性核糖核酸酶活性等多种功能。京都基因与基因组百科数据库(KEGG)分析显示，电离辐射后小鼠骨髓细胞中m 6A修饰水平显著改变的circRNA来源基因涉及血小板激活、Fc γ R-介导的吞噬作用和B细胞受体信号通路等多种通路。 结论:电离辐射可引起小鼠骨髓细胞中circRNA的m 6A修饰谱的迅速改变，差异甲基化的circRNA的来源基因涉及多种造血系统放射生物学相关的功能通路。该研究为从表观遗传水平揭示造血系统辐射损伤的分子机制奠定基础。

目的:分析慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）的分子特征，揭示其病理生理机制，并构建能有效预测术后复发的预后模型。方法:整合3个数据集GSE198950、GSE179265及GSE136825，其中对照组39例，慢性鼻窦炎不伴鼻息肉组16例，CRSwNP组89例，提取校正 P值<0.05且Log2FC>1的差异基因，随后进行KEGG和GO富集分析及蛋白互作评分。采用随机森林和最小绝对值收敛和选择算法（least absolute shrinkage and selection operator，LASSO）进行变量筛选，交集分析后得到关键节点。回顾性分析二代RNA测序数据（对照4例，CRSwNP 8例），利用Mann-Whitney U检验对前述关键节点进行比较，将 P<0.05的变量纳入模型。利用既往测序数据（原发CRSwNP 16例，复发CRSwNP 15例）通过Logistic回归构建CRSwNP的预后模型，绘制列线图，利用校准曲线和受试者工作特征曲线（ROC），并计算曲线下面积（AUC）以验证模型可信性。 结果:对CRSwNP组中上调和下调的差异基因进行分析，其中神经活性配体-受体相互作用、白细胞介素17信号通路被激活，而钙信号通路及间隙连接被抑制。利用随机森林和LASSO鉴定出关键节点，其中G蛋白γ亚基4（ U=3.00， P=0.028）、胆囊收缩素（ U=0.50， P=0.006）、表皮生长因子（ U=1.00， P=0.008）和神经突触细胞黏附分子1（ U=0.00， P=0.004）在Whitney U检验中具有统计学意义，将其纳入回归模型。将预后模型制成列线图，验证模型校准曲线和ROC表明其高度可信（C-index=0.875，AUC=0.866），而测试集中的ROC曲线显示其可有效预测CRSwNP的术后复发（AUC=0.859）。 结论:本研究利用CRSwNP相关数据集，全面描述了该疾病的分子特征。通过随机森林和LASSO回归筛选出的关键节点构建的预后模型在验证中表现出高准确性，为推进CRSwNP的个体化诊疗提供了有力支持。

目的:研究FcγRIIb基因修饰树突状细胞对大鼠原位肝移植术后肝功能及病理排斥反应的影响。方法:利用基因克隆技术构建含Lewis大鼠FcγRIIb基因的重组慢病毒表达载体TRE-FcγRIIb。分别包装TRE-FcγRIIb表达病毒与TET-on可诱导病毒，用其共感染DA大鼠骨髓来源未成熟树突状细胞并检测FcγRIIb的表达。将供体DA大鼠与受体Lewis大鼠按照体重进行配对后随机分为三组，三组均行DA-Lewis的大鼠原位肝移植术。对照组(A组)不给予任何预处理。环孢素A组(B组)术后第2天开始给予环孢素A处理。FcγRIIb基因修饰未成熟树突状细胞组(C组)术前1 d供体大鼠静脉注射FcγRIIb修饰的DA大鼠骨髓来源的未成熟树突状细胞(1×10 6细胞)。术后第7天分别取血和肝脏检测肝功能和肝脏病理变化。 结果:C组术后第7天肝功能异常明显低于对照组( P<0.05); C组术后第7天肝脏病理排斥反应明显低于对照组( P<0.05)。对照组中的大鼠平均存活天数为12.8 d；B组的大鼠平均存活天数为65.3 d；C组的大鼠平均存活天数为58.5 d。 结论:FcγRIIb基因修饰未成熟树突状细胞可以降低大鼠原位肝移植术后肝功能异常，减轻术后大鼠肝脏急性排斥反应。

目的:研究免疫球蛋白γFc段受体1b（Fc fragment of IgG receptor 1b， FCGR1B）基因转录水平检测对活动性结核病的诊断价值。 方法:2018年2—9月，收集解放军总医院第八医学中心活动性结核病患者、结核潜伏感染者（LTBI）、治愈结核病患者、健康人和肺炎患者的外周血，分离外周血单个核细胞（PBMC），提取总RNA并反转录为cDNA，实时荧光定量聚合酶链式反应（QPCR）检测PBMC中 FCGR1B基因mRNA的相对表达量，非参数检验比较活动性结核病和对照组 FCGR1B基因mRNA的表达差异、相关性分析 FCGR1B基因mRNA的表达与结核病病情和感染指标的关系，受试者工作特征曲线（ROC）评估 FCGR1B基因转录水平检测在活动性结核病诊断中的价值。 结果:与非结核组（包括LTBI、健康人、治愈结核和肺炎患者）相比，活动性结核病患者PBMC中 FCGR1B基因mRNA的表达较高（ u=2081， P<0.001）；结核患者的载菌量越多， FCGR1B基因mRNA的表达越高（ H=12.35， P=0.015），与C反应蛋白（CRP）的表达显著相关（ r=0.30， P=0.008）； FCGR1B基因mRNA鉴别活动性结核病的曲线下面积（AUC）为0.849，诊断的敏感度和特异度分别为71.43%和84.17%， FCGR1B基因mRNA鉴别肺外结核的AUC为0.906，诊断的敏感度和特异度分别为84.62%和91.89%。 结论:FCGR1B基因mRNA是潜在的活动性结核病分子诊断标志物。

目的:研究Fcγ受体ⅢB基因多态性在黄河三角洲汉族人群中的分布，探讨其多个位点的基因多态性与SLE易感性及临床表型的相关性。方法:选择2017年1月至12月于山东省滨州医学院附属医院就诊的144例SLE患者作为试验组，同期健康志愿者150名作为对照组，收集全血标本和临床资料、试验室检查资料，采用单碱基延伸法PCR技术提取基因组脱氧核糖核酸（DNA），采用质谱法进行单核苷酸多态性（SNP）分型检测，应用SPSS 25.0软件进行 χ2检验，分析Fcγ受体ⅢB基因各位点基因多态性与SLE易感性及临床表型的关系。 结果:①在试验组和对照组中，rs115878669 CT、TT基因型频率分别为50.7%、64.0%，23.6%、10.0%，差异有统计学意义（ χ2=5.3， P=0.021； χ2=9.8， P=0.002）；rs147574249 TT基因型频率分别为17.4%、8.0%，差异有统计学意义（ χ2=5.9， P=0.016）；rs199705513 GG、GA基因型频率分别为20.8%、10.0%，59.0%、70.0%，差异有统计学意义（ χ2=6.7， P=0.010； χ2=3.9， P=0.049）；rs77717968 CA基因型频率分别为30.6%、46.0%，差异有统计学意义（ χ2=7.4， P=0.007）。②在试验组中，rs115878669位点杂合子CT基因型频率在血液系统受累和不受累组分别为37.2%、56.4%，差异有统计学意义（ χ2=4.5， P=0.035）；在血小板减少组与血小板正常组中，rs114531649位点AG基因型频率分别为79.2%、50.0%，差异有统计学意义（ χ2=6.8， P=0.009），GG基因型频率分别为4.2%、25.8%，差异有统计学意义（ χ2=4.3， P=0.039），rs147574249位点CC基因型频率分别为4.2%、25.8%，差异有统计学意义（ χ2=5.4， P=0.020），CT基因型频率分别为79.2%、56.7%，差异有统计学意义（ χ2=4.2， P=0.040），rs115878669位点CT基因型频率分别为70.8%、46.7%，差异有统计学意义（ χ2=4.7， P=0.031），rs199705513位点AA基因型频率分别为4.2%、23.3%，差异有统计学意义（ χ2=4.6， P=0.033），rs77717968位点AA基因型频率分别为4.2%、26.7%，差异有统计学意义（ χ2=4.5， P=0.033），TT基因型频率分别为25.0%、9.2%，差异有统计学意义（ χ2=4.8， P=0.028），其他比较无统计学意义（ P>0.05）。在关节受累组与关节未受累组中，rs114531649位点纯合子GG基因型频率分别为31.2%、15.7%，差异有统计学意义（ χ2=4.9， P=0.027），rs147574249位点纯合子CC基因型频率分别为31.2%、15.7%，差异有统计学意义（ χ2=4.9， P=0.027），rs199705513位点纯合子AA基因型频率分别为29.5%、13.2%，差异有统计学意义（ χ2=5.8， P=0.016），rs61803007位点纯合子CC基因型频率分别为32.8%、16.9%，差异有统计学意义（ χ2=4.9， P=0.026），杂合子TC基因型频率分别为67.2%、83.1%，差异有统计学意义（ χ2=4.9， P=0.026），rs77717968位点纯合子AA基因型频率分别为31.2%、16.9%，差异有统计学意义（ χ2=4.1， P=0.044），其他比较差异无统计学意义（ P>0.05）。rs146653557位点杂合子TC基因型基因型频率在有浆膜炎组和无浆膜炎组分别为39.4%、75.0%，差异有统计学意义（ χ2=4.3， P=0.037），其他比较差异无统计学意义（ P>0.05）。在RF升高组与RF未升高组中，rs428194位点CG基因型频率分别为53.8%、22.9%，差异有统计学意义（ χ2=12.7， P=0.000 4），GG基因型频率分别为46.2%、77.1%，差异有统计学意义（ χ2=12.7， P=0.000 4），rs61803004位点GG基因型频率分别为46.2%、78.1%，差异有统计学意义（ χ2=13.7， P=0.000 2），GT基因型频率分别为46.2%、21.0%，差异有统计学意义（ χ2=9.0， P=0.002 7），TT基因型频率分别为7.7%、1.0%，差异有统计学意义（ χ2=4.8， P=0.029），rs61803008位点CT基因型频率分别为46.2%、23.8%，差异有统计学意义（ χ2=6.8， P=0.009 2），TT基因型频率分别为46.2%、74.3%，差异有统计学意义（ χ2=10.1， P=0.001 5）。 结论:Fcγ受体Ⅲ B基因相关位点可能与SLE的疾病易感性及临床表型有关。

目的 基于网络药理学、分子对接和体外实验验证探索知母皂苷AⅢ(TIA)治疗胶质母细胞瘤(GBM)的潜在靶点及其信号通路.方法 利用Pharmmapper数据库预测TIA的作用靶点,通过GeneCards数据库获得GBM相关的疾病靶点;通过STRING数据库得到交集靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图,并使用Cytoscape 3.6.0软件进行筛选和分析;交集靶点通过DAVID数据库进行基因本体(GO)功能注释分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,采用分子对接技术考察TIA与关键靶点的结合能力.最后,采用GBM细胞U-87MG、U251进行体外细胞实验,运用细胞计数试剂盒(CCK-8)实验检测细胞存活率、Transwell迁移测定实验检测细胞迁移能力,采用Western blot实验、实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(RT-qPCR)实验及药物亲和反应的靶点稳定性(DARTS)实验等验证网络药理学分析结果.结果 网络药理学预测结果显示,TIA作用靶点与GBM疾病靶点存在65个潜在共用靶点;GO分析结果主要集中在炎症应答、细胞增殖的正向调节等过程;KEGG富集分析显示,TIA通过免疫球蛋白G Fcγ受体(FcγR)介导的吞噬作用、谷胱甘肽代谢等信号通路发挥作用;分子对接分析结果显示,TIA与基质金属蛋白酶-2(MMP-2)的结合潜能最强.体外细胞实验结果显示,TIA呈选择性和剂量依赖性抑制人GBM细胞U-87MG和U251的体外增殖和迁移,并通过靶向亲和MMP-2,抑制其表达而发挥作用.结论 TIA可能通过靶向结合MMP-2并抑制其表达而抑制GBM细胞的体外增殖和迁移.

背景:股骨头内硬化带是激素性股骨头坏死疾病发展过程中重要的影像学特征并与预后相关.过氧化物酶体增殖物活化受体γ协同刺激因子1α(peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1α,PGC-1α)被证明具有成骨、促血管形成、抗线粒体凋亡等生物活性,与激素性股骨头坏死的骨修复可能存在紧密关联.目的:筛选激素性股骨头坏死硬化带区与正常区的差异蛋白,筛选出硬化带的关键蛋白,并验证关键蛋白在激素性股骨头坏死股骨头标本中的差异表达;探索激素性股骨头坏死硬化带修复模式.方法:取激素性股骨头坏死行人工全髋关节置换术取出的股骨头标本,通过串联质谱标签技术筛选硬化带区与正常区的差异表达基因,并进行GO与KEGG信号通路分析,构建关键靶点的蛋白互作网络、筛选关键基因.观察关键蛋白在激素性股骨头坏死硬化带中的表达,通过Western blotting、免疫组化验证关键蛋白在硬化带中的表达.结果与结论:①通过串联质谱标签定量蛋白质谱检测发现:相比于正常区骨组织,股骨头硬化带骨组织中具有显著差异表达(Log2FC＞1.20、Log2FC＜0.84和 P＜0.05)的蛋白质有609个,其中发生上调的蛋白质290个,发生下调的蛋白质319个;②通过GO与KEGG通路富集分析,发现在前10位的富集通路中,Wnt信号通路与生命周期调控通路与骨修复关系密切;在生命周期调控通道中,PGC-1α是重要的蛋白之一;③与激素性股骨头坏死标本正常区相比,Western blotting验证了PGC-1α、NRF-1在硬化带中低表达,Cleaved Caspase-3在硬化带中高表达;④光镜下免疫组化结果显示,股骨头组织标本中硬化区及正常区的PGC-1α、NRF1及Cleaved Caspase-3阳性染色分布,可以发现骨小梁、成骨细胞和骨髓均有表达存在;硬化带区Cleaved Caspase-3表达更为明显;⑤结论:激素性股骨头坏死硬化带中存在包含Wnt等成骨相关通路活跃、以PGC-1α低表达为特征的氧化凋亡活跃等生物学行为;PGC-1α在激素性股骨头坏死硬化带中低表达可能与氧化凋亡活跃相关.

目的 探讨Fcγ受体ⅡA(FcγRⅡA)、亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性与急性髓系白血病(AML)患儿化疗后血流感染的关联.方法 回顾性分析武汉儿童医院血液肿瘤科2010年2月-2021年11月130例初诊初治AML患儿接受首次诱导化疗的临床资料;首次诱导化疗后发生血流感染患儿62例纳入感染组,未发生血流感染患儿68例为对照组.采用聚合酶链式反应(PCR)技术-限制性片段长度多态性法(RFLP)对两组患儿外周血FcγRⅡA、MTHFR进行基因分型.结果 血流感染患儿血培养标本共培养分离病原菌78株,其中革兰阴性菌44株占56.41％,以大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌为主;革兰阳性菌21株(26.92％),以表皮葡萄球菌为主;真菌13株,以白假丝酵母为主;多元Logistic回归分析显示,血小板计数及中性粒细胞是AML患儿化疗后血流感染的危险因素(P＜0.05);感染组FcγRⅡA基因R131位点携带G/G基因型及G等位基因频率均高于未感染组(P＜0.05),感染组MTHFR基因C677T位点携带T/T基因型及T等位基因频率均高于未感染组(P＜0.05);校正Logistic回归分析显示,FcγRⅡA基因R131位点携带G等位基因的AML患儿化疗后发生血流感染风险是携带A等位基因的1.697倍(校正OR=1.697,95％CI:1.181～2.439);MTHFR基因C677T位点上携带T等位基因的AML患儿化疗后血流感染风险是携带C等位基因的1.659倍(校正OR=1.659,95％CI:1.239～2.221).结论 AML患儿化疗后血流感染病原菌以大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌等革兰阴性菌为主,FcγRⅡA基因R131位点携带G等位基因、MTHFR基因C677T位点上携带T等位基因的AML患儿化疗后血流感染发生风险明显增加.

[目的]探讨下肢动脉硬化闭塞症膝下病变的潜在机制和免疫相关性.[方法]从高通量基因表达数据库下载GSE100927数据集,利用R语言软件Limma数据包和加权基因共表达网络分析筛选与下肢动脉硬化闭塞症膝下病变相关的基因并进行信号通路富集分析;构建蛋白-蛋白相互作用网络并筛选下肢动脉硬化闭塞症膝下病变相关的核心基因,分析核心基因在下肢动脉硬化闭塞症膝下病变样本与对照样本间的差异,利用受试者工作特征曲线下面积评价核心基因的诊断效能.采用反卷积算法(CIBERSORT)评估各样本中免疫细胞分布并计算不同免疫细胞在下肢动脉硬化闭塞症膝下病变样本与对照样本间的差异.[结果]筛选获得下肢动脉硬化闭塞症膝下病变差异表达上调基因153个,差异表达下调基因63个,加权基因共表达网络分析结果表明下肢动脉硬化闭塞症膝下病变基因差异表达以上调为主,涉及胆固醇代谢、血小板活化等信号通路;蛋白酪氨酸磷酸酶受体C型(PTPRC)、Spi-1原癌基因(SPI1)、集落刺激因子1受体(CSF1R)和Fcγ受体Ⅲa(FCGR3A)可能是下肢动脉硬化闭塞症膝下病变的核心基因,且诊断效能较好.下肢动脉硬化闭塞症膝下病变与单核细胞的浸润程度呈正相关(r=0.419,P=0.037),与M2型巨噬细胞的浸润程度呈负相关(r=-0.491,P=0.013).[结论]下肢动脉硬化闭塞症膝下病变涉及胆固醇代谢、血小板活化等多种信号通路;与单核细胞、巨噬细胞介导的免疫反应密切相关;PT-PRC、SPI1、CSF1R和FCGR3A可能是下肢动脉硬化闭塞症膝下病变的核心基因.

目的:筛选并鉴定阿尔茨海默病(AD)神经炎症相关关键基因.方法:用R语言limma包分别筛选GEO数据库中的数据集GSE144459(Healthy=16,AD=16)和GSE135999(Healthy=6,AD=7)中的差异基因(DEGs);用在线韦恩图工具对上述获得的差异表达基因(DEG1、DEG2)与NCBI数据库获得(IRGs)取交集,以获得差异表达的IRGs;用R语言clusterProfiler包对其进行功能富集分析;通过STRING数据库(https://string-db.org)和Cytoscape软件对差异表达IRGs进行PPI网络构建,并用cytoHubba插件来筛选PPI中的关键节点作为候选基因.后续用于LASSO回归分析进一步筛选特征基因并构建分类器,用数据集GSE122063(AD=56,Control=44)验证特征基因的表达并绘制箱线图.结果:本研究共获得 106个差异表达的IRGs.富集分析与金黄色葡萄球菌感染、中性粒细胞外陷阱形成、Toll样受体、FcγR介导吞噬作用等功能及信号通路相关.经过PPI网络的构建、LASSO回归分析、分类器构建及受试者工作特征(ROC)曲线绘制以及特征基因的表达验证,最终得出Fcgr2b、Cd14、Fcgr1、Fcgr3、Ly86在AD中具有较强的预测诊断能力.结论:Fcgr2b、Cd14、Fcgr1、Fcgr3、Ly86在AD中起着关键作用,可以作为AD潜在的诊断和治疗靶点.