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白血病异基因造血干细胞移植后HLA区域杂合性缺失的研究进展
编辑人员丨5天前
异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)是治疗多种血液系统恶性肿瘤,尤其是白血病的重要手段。经allo-HSCT治疗后,白血病细胞的清除可通过供者淋巴细胞输注(DLI)完成,这是一种过继免疫疗法,可将正常供者来源的外周血淋巴细胞输注到患者体内以诱导移植物抗肿瘤(GVT)效应,继而促进移植后免疫系统的快速重建,清除患者体内残留的癌细胞 [ 1] 。随着预处理方案、移植物抗宿主病(GVHD)预防和支持治疗的改进,白血病移植相关死亡率得到有效降低,但肿瘤复发依然是allo-HSCT后死亡的首要原因。在恶性肿瘤中,染色体杂合性缺失(LOH)是一种常见的染色体畸变方式,表现为同源染色体上一个等位基因的部分或全部遗传物质发生丢失。研究表明,白血病复发的因素多样,人类白细胞抗原(HLA)杂合性缺失(简称为HLA loss)是其中一个重要的诱因。本文就HLA loss的发生发展、检测及其潜在的临床治疗策略的研究进展进行综述。
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编辑人员丨5天前
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HLA新等位基因A*24:191序列及其MHC编码蛋白分子三维结构模拟预测分析
编辑人员丨5天前
目的:鉴定分析人类白细胞抗原(human leukocyte antigens,HLA)新等位基因A*24:191序列,并对其MHC蛋白分子三维结构及其氨基酸残基改变在空间结构中的可能影响进行模拟预测分析。方法:应用Luminex及PCR-SBT进行序列鉴定。应用Phyre2及RCSB PDB分析软件,对其MHC蛋白分子三维结构进行模拟预测分析。Histocheck对比分析与A*24常见等位基因间差异。结果:相较A*24:02序列,新等位基因A*24:191在256、265、270位发生G>C、G>C、A>T改变。MHC分子三维结构预测分析显示,相较HLA-A*24:02,A*24:191第62位氨基酸残基由A*24:02的酸性谷氨酸(Glu)改变为中性谷氨酰胺(Gln),(Risler’s score, R=2),其残基侧链伸展方向都为自α螺旋向外指向groove凹槽;65位由向α螺旋内伸展小分子中性甘氨酸(Gly)改变为向螺旋上外伸展的长链碱性精氨酸(Arg)( R=52); 66位由长链碱性赖氨酸(Lys)改变为中性天冬酰胺(Asn)( R=31),伸展方向都为自α螺旋指向groove凹槽。以上残基均位于构成抗原肽结合凹槽侧壁α螺旋上。其总相异性值DSS Score=3.85。从蛋白分子表面结构模拟图像上,可以清楚看到氨基酸残基改变致α螺旋表面结构形状发生明显改变。 结论:分析预测以上氨基酸残基性质、大小及构型的改变,将可能改变其多肽结合功能,并影响其与TCR及抗体的结合特性。
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编辑人员丨5天前
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肾移植供者抗人类白细胞抗原抗体特异性判别中两个常见问题的探讨
编辑人员丨5天前
抗体介导排斥反应(AMR)是影响移植肾长期存活的关键因素,供者特异性抗体(DSA)是AMR的病因,其准确判定至关重要。目前临床广泛应用的单抗原微珠法(SAB)判别DSA时容易出现漏检以及平均荧光强度(MFI)值低估两个问题。本文通过与中国人群常见人类白细胞抗原(HLA)等位基因进行比对,计算了常用的两种SAB试剂的漏检概率,探讨了体外实验体系中抗体交叉反应对DSA的MFI值的影响。笔者提出应重视上述两个问题的临床意义,尝试用功能性表位(eplet)分析的方法予以校正并列举了临床实例,最后分析了这种校正方法的局限性。
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编辑人员丨5天前
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拉莫三嗪所致药疹的研究进展
编辑人员丨5天前
拉莫三嗪(LTG)是一种新型治疗癫痫、双相情感障碍及神经痛的药物,常见的不良反应是药疹,如固定性药疹、急性泛发性发疹性脓疱病、中毒性表皮松解坏死型药疹、药物超敏反应综合征等。LTG引起药疹包括免疫和非免疫机制。HLA等位基因与LTG引起的药疹相关,有种族差异,且与药疹类型有关。本文总结LTG引起的药疹病因、发病机制、临床特点等,以期指导临床用药。
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编辑人员丨5天前
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人白细胞抗原B27基因亚型与强直性脊柱炎临床相关性进展
编辑人员丨2024/7/6
人类白细胞抗原Ⅰ类分子B27(HLA-B27)与强直性脊柱炎(AS)的发病紧密相关,是AS的重要遗传易感因素。目前临床诊断AS常用流式技术检测该指标,但容易出现假阳性或假阴性的结果,导致误诊和漏诊。随着研究深入和技术进步,人们发现HLA-B27存在多种基因亚型,截至目前共计379种。从全球范围来看,其分布呈现出人群和地域的差异,中国人中最常见的是HLA-B27:05和HLA-B27:04;且各种基因亚型与AS的发病相关性不尽相同,AS相关的高危亚型包括HLA-B27:02、04、05,AS相关的保护亚型包括HLA-B27:06、09,而HLA-B27:03、07与AS的相关性尚未达成统一认识。此外,不同基因亚型在发病年龄、临床特征(如发病部位、肌腱附着点炎、葡萄膜炎)、治疗预后等方面也各有特点。因此,阐明HLA-B27的确切致病机制,通过HLA-B27基因亚型检测,可能有助于AS的临床筛查、早期诊断和治疗。本文分析了HLA-B27常规分子检测对AS诊断的不足,总结了HLA-B27基因亚型的研究进展及其在AS中的临床意义,同时对HLA-B27基因亚型的临床应用作了展望。
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编辑人员丨2024/7/6
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基于二代测序的HLA-Ⅱ类等位基因多态性研究及等位基因丢失防范策略
编辑人员丨2024/4/27
目的:研究二代测序技术(NGS)检测深圳地区随机健康无关汉族人群HLA-DRB1、DQB1、DQA1、DRB3、DRB4、DRB5、DPA1、DPB1等位基因多态性的精确性,探讨HLA-DRB1等位基因丢失的原因及室内关键质控体系建立策略.方法:采用MiSeqDxTM NGS平台对1 012例样本完成HLA-Ⅱ类等位基因分型.对质控体系软件提示的疑难样本和HLA-DRB1纯合子样本采用PCR-SSOP法或PCR-SBT法进行确认.结果:检出HLA-DRB1、DRB3、DRB4、DRB5、DQA1、DQB1、DPA1、DPB1等位基因分别有45、7、5、7、17、21、10、27 种.常见等位基因(频率>10%)有 HLA-DRB1*09:01(17.09%)、15:01(10.72%);DRB3*02:02(25.99%)、03:01(10.18%);DRB4*01:03(36.46%);DRB5*01:01(15.42%);DQA1*01:02(20.01%)、03:02(17.19%);DQB1*03:01(19.47%)、03:03(17.98%)、05:02(11.66%)、06:01(10.67%);DPA1*02:02(54.45%)、01:03(31.18%);DPB1*05:01(39.13%)、02:01(16.90%).HLA-DRB1 和DQB1位点基因频率与中国常见及确认的HLA等位基因表(CWD2.4)进行统计学比较,差异无统计学意义(x2=12.68,P>0.05).对NGS检出的94例HLA-DRB1纯合子样本采用PCR-SSOP法进行复检,检出HLA-DRB1位点漏检等位基因1例,通过SBT法确认为漏检DRB1*04:03等位基因,为此建立了本实验室室内质控体系.检出新等位基因2例,获WHO HLA系统因素命名委员会命名.结论:基于NGS-HLA分型方案的HLA分型结果,模棱两可结果比率更低.HLA-Ⅱ类等位基因在深圳地区无关健康供者汉族人群中存在遗传多态性.在临床组织相容性试验中独立使用NGS方法存在局限性,需要内部质量控制策略来防范偶发的等位基因丢失事件.
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编辑人员丨2024/4/27
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KIR3DL3基因cDNA分子克隆测序法鉴定1个常见型新等位基因
编辑人员丨2023/8/6
目的 建立KIR3DL3基因cDNA分子克隆测序方法,鉴定在南方汉族人群中新发现的1个KIR3DL3等位基因.方法 对1例KIR3DL3基因测序分型结果异常的标本,采集EDTA抗凝新鲜外周血样,提取mRNA,反转录成cDNA后,采用1对KIR3DL3基因特异性PCR引物对全部编码区序列做PCR扩增,扩增产物经切胶回收纯化后,做分子克隆和单体型测序.结果 经分子克隆和测序,检出1个正常的KIR3 DL3* 01002等位基因和1个新变异的KIR3DL3等位基因,该新等位基因的序列与KIR3 DL3*048最相近,但存在编码区(CDS)nt 1074 A>G同义突变,位于第8外显子的第337密码子由CAA变成CAG,其序列提交国际GenBank(序列号:KU529269)和IPD-KIR Database(IWS40002178),已被世界卫生组织(WHO) HLA因子命名委员会KIR分委会正式命名为KIR3DL3*04802,该新等位基因在306名南方汉族无关个体中共检出12次,检出频率为3.92%.结论 成功建立KIR3DL3基因cDNA分子克隆测序方法,在等位基因水平的KIR研究中具有良好的应用前景.
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编辑人员丨2023/8/6
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河北地区汉族人群HLA-C位点基因多态性分析
编辑人员丨2023/8/6
目的:了解河北汉族人群人类白细胞抗原(HLA)-C位点基因多态性及分布特征.方法:对1 912例河北地区汉族人群献血者采用基于测序的分型技术(SBT)进行HLA-C位点高分辨基因分型,直接计算等位基因频率,并与中国其他地区人群进行比较.结果:1 912例河北汉族献血者中共检出41个HLA-C等位基因,其中频率大于0.050的常见等位基因共7个,分别为C* 07:02(0.13546),C* 06:02 (0.118985),C* 08:01(0.101726),C* 03:03(0.10068),C*01:02(0.09022),C*03:04(0.089174),C* 04:01(0.071391).与我国其他文献中汉族人群数据进行群体比较后发现,河北汉族人群HLA-C位点频率除与最高的常见基因与中国造血干细胞捐献者均为C* 07:02外,与其他地区无论是分布规律还是常见等位基因的频率均存在显著差异,四川、广东、湖南岳阳3省市与中国南方汉族人群基因分布规律却较为相近.结论:获得了河北地区汉族人群HLA-C位点基因分布规律和特征,与南方汉族人群差异显著,本研究为中国人群HLA-C位点基因研究和应用提供了参考数据.
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编辑人员丨2023/8/6
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人类白细胞抗原-DR4-DR53与自身抗体检测对类风湿关节炎的诊断价值
编辑人员丨2023/8/6
类风湿关节炎(RA)是所有炎症性关节炎病变中最为常见的自身免疫病,其病理特征主要表现为关节滑膜慢性炎症[1],随后侵犯下层软骨造成关节破坏,对身体的损伤极为严重.2016年全球人群患病率约为0.6%~1.1%,我国患病率约为0.33%~0.37%[2],且呈现出逐年增高趋势.有相关报道显示RA病因尚未明确,可能与免疫调节、遗传等因素有关,发病机制涉及遗传易感性、B细胞和T细胞的活化、自身抗体的产生和细胞因子的释放,以及补体系统的激活,环境因素等[3],其中遗传易感因素占60% 左右.通过及早诊断并进行治疗可以有效缓解病情并降低病残率.先前实验已证实人类白细胞抗原(HLA)上的相关等位基因如HLA-DR4、HLA-DR53对RA的遗传自身免疫易感性有影响,自身抗体在动物模型中已被明确指出是RA发病机制的重要组成部分[4].本实验通过HLA-DR4、HLA-DR53与自身抗体检测结合,为RA的诊治与预防提供进一步指导.
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编辑人员丨2023/8/6
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HLA基因分型质控体系的建立及其关键的质控点
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨HLA-A、B、C、DRB1和DQB1等位基因分型的关键质控点,探讨组织配型实验中关键质控点的配置方案,以提高HLA分型的准确性.方法 应用PCR-直接测序分型(PCR sequence-based typing,PCR-SBT)法,对10 167例随机健康献血者和组织配型供、受者的全血样本HLA-A、B、C基因的第2~4外显子,DRB1基因的第2外显子,DQB1基因的第2、3外显子进行测序分型.应用PCR序列特异性寡核苷酸探针法对56例正、反向序列不一致的样本进行复核.对不能与IMGT/HLA数据库中已知等位基因匹配的单核苷酸序列进一步作克隆测序分析.针对关键质控点设计控制机制.结果 在10 167例样本中,共检出HLA-A、B、C、DRB1和DQB1新等位基因8个,绘制出在分析常见HLA等位基因时容易误读的单核苷酸多态性位置表,其中HLA-A位点3个、B位点8个、C位点6个、DRB1位点4个、DQB1位点6个.在关键质控点设置措施中,样本编号的唯一性及实验过程中DNA的转管应当被重视.结论 在HLA基因分型工作中,核对两个等位基因间差异的单一核苷酸和关键控制点,可确保HLA分型结果的准确性.
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编辑人员丨2023/8/6
