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Linc00152/微小RNA-150/β-连环蛋白轴对非小细胞肺癌增殖、迁移和上皮-间充质转化的影响
编辑人员丨2天前
目的:探讨Linc00152/微小RNA(miR)-150/β-连环蛋白(β-catenin)轴对非小细胞肺癌增殖、迁移和上皮-间充质转化的影响。方法:人非小细胞肺癌细胞A549随机分为Linc00152 KD组和长链非编码RNA(lncRNA)对照组,分别采用Linc00152短发卡RNA(shRNA)和lncRNA对照慢病毒感染,建立Linc00152敲降细胞系。采用噻唑蓝(MTT)、克隆形成实验、划痕实验和蛋白质印迹法(Western blot)分析Linc00152对细胞增殖、迁移和上皮-间充质转化的影响。采用生物信息学和双荧光素酶报告基因分析Linc00152和miR-150关系及其靶基因。采用Western blot分析靶基因蛋白表达水平。计量数据比较采用 t检验。 结果:lncRNA对照组细胞Linc00152表达水平(1.24±0.22)明显高于Linc00152 KD组Linc00152表达水平(0.42±0.12),差异有统计学意义( t=4,819, P<0.05)。lncRNA对照组细胞吸光值(2.11±0.18)明显高于Linc00152 KD组(1.75±0.12),差异有统计学意义( t=4,819, P<0.05)。lncRNA对照组细胞迁移数量[(152.65±10.43)个]明显高于Linc00152 KD组[(97.47±9.43)个],差异有统计学意义( t=5.081, P<0.05)。lncRNA对照组细胞上皮标志蛋白N-钙黏蛋白(N-cadherin)表达水平(1.23±0.11)明显低于Linc00152 KD组细胞(2.54±0.33),差异有统计学意义( t=4.909, P<0.05)。lncRNA对照组细胞间质标志蛋白波形蛋白(Vimentin)和E-钙黏蛋白(E-cadherin)蛋白表达水平(1.02±0.09、1.03±0.11)明显高于Linc00152 KD组细胞(0.26±0.07、0.34±0.09),差异有统计学意义( t=4.127、3.298, P<0.05)。生物信息学和双荧光素酶报告基因显示Linc00152的靶miRNA是miR-150,而miR-150的靶基因是β-catenin。lncRNA对照组细胞miR-150表达水平(1.08±0.15)明显低于Linc00152 KD组miR-150表达水平(2.87±0.18),差异有统计学意义( t=3.179, P<0.05)。lncRNA对照组细胞β-catenin蛋白表达水平(1.24±0.22)明显高于Linc00152 KD组β-catenin蛋白表达水平(0.42±0.12),差异有统计学意义( t=4.819, P<0.05)。 结论:Linc00152在非小细胞肺癌中表达上调,下调Linc00152可显著抑制非小细胞肺癌的增殖、迁移和上皮-间充质转化,其作用机制可能是Linc00152通过吸附miR-150促进β-catenin表达。
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编辑人员丨2天前
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Comprehensive analysis of long non-coding RNA and mRNA expression profile in rectal cancer
编辑人员丨2天前
Background::Rectal cancer (RC) is a malignant tumor that seriously threatens human health. Long non-coding RNAs (lncRNAs) play a vital role in tumor regulation. Nevertheless, their exact expression features and functions remain obscure, and therefore was the aim of the current study.Methods::We utilized the Affymetrix human GeneChip to screen differentially expressed profiles of lncRNAs and mRNAs from the cancer tissues and matched paracancer tissues of 6 RC patients. Gene Ontology (GO) and pathway enrichment analyses identified crucial functions and pathways of the aberrantly expressed mRNAs. We used quantitative real-time polymerase chain reaction to verify the significant expression differences of 11 candidate lncRNAs between the cancer and paracancer tissues. LncRNA-mRNA coexpression networks were built by calculating the Pearson correlation value to identify significant correlation pairs. Online bioinformatics tools GEPIA2, ONCOMINE, and PROGgeneV2 were used to mine the expression and prognosis of three crucial mRNAs and six verified lncRNAs. Competing endogenous RNA networks were constructed by predicting microRNA response elements and calculating free energy.Results::We found 1658 differentially expressed lncRNAs (778 up-regulated and 880 down-regulated) and 1783 aberrantly expressed mRNAs (909 up-regulated and 874 down-regulated). GO and pathway enrichment analyses revealed the vital functions of the differentially expressed mRNAs, including cell proliferation, cell migration, angiogenesis, and cellular response to zinc ion. The canonical signaling pathways mainly included the interleukin-17, cell cycle, Wnt, and mineral absorption signaling pathways. Six lncRNAs including AC017002.2 ( P= 0.039), cancer susceptibility 19 (CASC19) ( P= 0.021), LINC00152 ( P= 0.013), NONHSAT058834 ( P= 0.007), NONHSAT007692 ( P= 0.045), and ENST00000415991.1 ( P= 0.045) showed significant differences in expression levels between the cancer tissue and paracancer tissue groups. AC017002.2, NONHSAT058834, NONHSAT007692, and ENST00000415991.1 have not yet been reported in RC. The crucial mRNAs myelocytomatosis viral oncogene (MYC), transforming growth factor beta induced (TGFBI), and solute carrier family 7 member 5 (SLC7A5) were selected. AC017002.2 and LINC00152 were positively correlated with MYC, TGFBI, and cytochrome P450 family 2 sub-family B member 6 (All r > 0.900, P < 0.050). NONHSAT058834 was positively associated with MYC ( r = 0.930, P < 0.001), and CASC19 was positively correlated with SLC7A5 ( r= 0.922, P < 0.001). Conclusion::This study offers convincing evidence of differentially expressed lncRNAs and mRNAs as potential biomarkers in RC.
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编辑人员丨2天前
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TCF3调控linc00152在伯基特淋巴瘤中发挥致癌作用的功能和机制研究
编辑人员丨2024/2/3
目的 探讨TCF3通过linc00152调控Daudi和Raji细胞增殖和凋亡中的功能和机制.方法 采用实时定量聚合酶链反应(qPCR)检测linc00152的干扰效率;利用CCK8、Western blotting和流式细胞术检测linc00152对Daudi和Raji细胞增殖和凋亡的影响;ChIP-PCR检测TCF3与linc00152的启动子区结合;qPCR和Western blot-ting 检测TCF3的干扰效率;qPCR检测TCF3对linc00152表达水平的影响.结果 在Daudi和Raji细胞中siRNA能成功干扰linc00152的表达;CCK8结果显示,干扰linc00152能抑制Daudi和Raji细胞增殖,Western blotting和流式结果显示干扰 linc00152 能促进细胞凋亡(Daudi:35.30±2.84 vs.6.95±0.82;Raji:33.17±2.18 vs.6.47± 0.38);ChIP-PCR结果显示,TCF3能与linc00152的启动子结合;qPCR和Western blotting结果显示,TCF3的mRNA和蛋白水平均能被siRNA成功干扰;在Daudi和Raji细胞中,si-TCF3能降低linc00152的表达量(Daudi:0.509±0.048 vs.0.906±0.146;Raji:0.502±0.052 vs.0.966±0.103).结论 linc00152 能促进 Daudi 和 Raji 细胞增殖,抑制细胞凋亡,可能与TCF3对linc00152的调控有关.
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编辑人员丨2024/2/3
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LINC00152通过PI3K/Akt/NF-κB信号通路调控LPS诱导小胶质细胞炎性反应的机制研究
编辑人员丨2023/10/28
目的 探讨lncRNA LINC00152 对脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)诱导的HMC3 小胶质细胞炎性反应的作用机制.方法 将体外培养的 HMC3 随机分成 4 组,即空白组(以完全培养基培养)、LPS 组(在空白组基础上加入 1μg/ml LPS 干预)、阴性对照组[即 LPS +反义寡聚核苷酸(ASO)-NC组,在 LSP干预基础上转染 ASO]和 LPS + ASO-LINC00152 组(在 LSP 干预基础上转染 ASO-LINC00152).流式检测 CD86 +(M1 型)、CD206 +(M2 型)细胞比例,酶联免疫吸附试验(enzyme linked immu-nosorbent assay,ELISA)检测细胞培养上清液中 TNF-α、IL-1β、IL-6 水平,以及细胞中 iNOS活性,实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)检测 PI3K、Akt、p65 基因表达水平,Western blot 法检测PI3K、Akt、p-Akt、p65、p-p65 蛋白表达.结果 与空白组比较,LPS组、LPS + ASO-NC 组和 LPS + ASO-LINC00152 组 CD86 +比例、TNF-α、IL-1β、IL-6、iNOS表达升高(P<0.05),p-Akt、p-p65 表达增加(P<0.05),而 LPS 组和 LPS + ASO-NC 组CD206 +比例下降(P<0.05).与 LPS 组比较,LPS + ASO-NC 组 CD86 +比例升高(P<0.05),iNOS 活性增强(P<0.05),而LPS + ASO-LINC00152 组 CD86 +比例下降(P<0.05),CD206 +比例升高(P<0.05),IL-6 水平下降(P<0.05),iNOS活性减弱(P<0.05),p-Akt、p-p65 表达减少(P<0.05).与 LPS + ASO-NC 组比较,LPS + ASO-LINC00152 组 CD86 +比例下降(P<0.05),CD206 +比例升高(P<0.05),iNOS活性减弱(P<0.05),p-Akt、p-p65 表达减少(P<0.05);各组间 PI3K、Akt、p65 基因及蛋白水平比较差异均无统计学意义(P>0.05).结论 ASO-lncRNA LINC00152 可通过调控 PI3K/Akt/NF-κB 信号通路,使LPS诱导的小胶质细胞表型发生改变,减少炎性细胞因子释放,从而发挥抑制炎性反应的作用.
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编辑人员丨2023/10/28
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长链非编码RNA 00152对结直肠癌细胞增殖和凋亡的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 检测长链非编码RNA 00152(Linc00152)在结直肠癌组织及细胞株中表达量,观察Linc00152对结直肠癌细胞增殖及凋亡的影响.方法 通过实时定量聚合酶链反应(Real-time PCR)检测Linc00152在31例结直肠癌组织及4株结直肠癌细胞株(CCL244、SW480、HT29、LoVo)中的表达水平,通过小干扰RNA(siRNA)下调CCL244及HT29细胞中Linc00152的表达,以噻唑蓝(M TT)法及克隆形成实验、流式细胞术检测结直肠癌细胞增殖及凋亡的变化.结果 结直肠癌组织中Linc00152表达水平(4.18±3.43)是癌旁组织中Linc00152表达水平(8.94±3.07)的27.07倍(P=0.045),且在结直肠癌细胞株中高表达.siRNA可以下调结肠癌细胞株Linc00152的表达水平,进而抑制细胞增殖,克隆形成能力受到抑制[CCL244实验组(26.67±0.47)%,对照组(44.67±1.89)%,P =0.006];MTT实验发现,转染siRNA后CCL244及HT29细胞活力受到抑制[72 h:抑制率:CCL244 (23.48±3.49)%,HT29 (12.53±2.86)%,P=0.001];干扰Linc00152表达后细胞凋亡率增加[CCL244实验组(9.08±0.22)%,对照组(4.15±0.29)%(P=0.003),HT29实验组(16.36±0.70)%,对照组(7.11±0.88)%,P =0.007].结论 Linc00152在结直肠癌中高表达,干扰Linc00152后可抑制结直肠癌细胞的增殖,并促进细胞凋亡.
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编辑人员丨2023/8/6
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长链非编码RNA Linc00152在泛癌中表达、预后及功能研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 分析Linc00152在泛癌不同组织中表达差异及其表达情况与肿瘤的恶性程度及患者预后的关系,并探究Linc00152在不同类型癌细胞中相关功能.方法 选取33例乳腺标本进行RNA-Seq,用qPCR方法检测50对乳腺癌组织和正常组织Linc00152的表达,结合GEO和TCGA数据库,分析Linc00152表达与乳腺癌恶性程度及患者预后的相关性;分析Linc00152在不同类型癌症、不同分期和分级中的表达情况.采用MDA-MB-231乳腺癌细胞系、SGC-7901胃癌细胞系、786-O肾癌细胞系进行细胞增殖能力、细胞凋亡和细胞迁移侵袭能力检测.结果 Linc00152在乳腺癌组织高表达(P<0.001),在HER2阳性和三阴性乳腺癌中Linc00152表达更高(P<0.0001);Linc00152高表达的乳腺癌患者无事件生存期和无转移生存期较差(P<0.001;P<0.01);敲降 Linc00152后细胞增殖、迁移、侵袭能力降低,细胞凋亡增加(P <0.05).结论 Linc00152在恶性肿瘤中具有促癌作用,可能是潜在的治疗靶点.
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编辑人员丨2023/8/6
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长链非编码RNA linc00152在急性肾衰大鼠肾组织中表达及影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨急性肾衰大鼠肾组织中长链非编码RNA linc00152的表达情况及其对急性肾衰的影响.方法 选取雄性SD大鼠72只,采用随机数字表法分为对照组(n=6)与模型组(n=66).模型组建立庆大霉素诱导的急性肾衰大鼠模型,对照组注射同体积生理盐水.采用实时定量聚合酶链式反应(PCR)法检测对照组及分别于第1、3、7、14、21天自模型组选取的6只大鼠肾组织中血清尿素氮、肌酐、尿N-乙酰-β-D-葡萄糖苷酶含量以及linc00152的表达、分布情况.将剩余36只模型组大鼠分为生理盐水组(n=12)、1 mg/kg siRNA组(n=12)及2 mg/kg siRNA组(n=12).1 mg/kg siRNA组与2 mg/kg siR-NA组分别尾静脉注射1 mg/kg、2 mg/kg linc00152-siRNA以达到活体水平阻断linc00152表达的目的,生理盐水组注射等体积生理盐水,分别于阻断后24、72 h检测linc00152表达水平、血清生化指标及尿液成分.结果 模型组第1天血清尿素氮、肌酐、尿N-乙酰-β-D-葡萄糖苷酶含量显著上升,第3天继续上升,第7天达到峰值,第21天基本恢复至正常水平.正常大鼠肾组织中linc00152主要表达于皮质;模型组linc00152表达在皮质和髓质中均为第1天显著上升,第3天继续上升,第7天达到峰值,第21天基本恢复至正常水平,其中,皮质中linc00152水平变化幅度更明显.1 mg/kg、2 mg/kg linc00152-siRNA干预后24 h,急性肾衰大鼠肾皮质中linc00152表达水平分别下降约40%、70%;1 mg/kg、2 mg/kg linc00152-siRNA干预后72 h,急性肾衰大鼠肾皮质中linc00152表达水平分别下降约50%、80%.1 mg/kg、2 mg/kg linc00152-siRNA干预后24、72 h,急性肾衰大鼠血清总蛋白、白蛋白、尿素氮、肌酐、K+、尿蛋白及尿酮体水平均较生理盐水组显著降低,Na+水平均较生理盐水组显著升高,组间比较,差异均有统计学意义(P<0.05);2 mg/kg linc00152-siRNA干预后24、72 h,急性肾衰大鼠血清总蛋白、白蛋白、尿素氮、肌酐、K+、尿蛋白及尿酮体水平较1 mg/kg siRNA组显著降低,Na+水平较1 mg/kg siRNA组显著升高,组间比较,差异均有统计学意义(P<0.05).结论 linc00152在庆大霉素诱导的急性肾衰大鼠的肾组织中表达显著增加,活体水平阻断linc00152的表达对急性肾损伤有防治作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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小干扰RNA下调Linc00152表达抑制胃癌细胞增殖迁移
编辑人员丨2023/8/6
Linc00152是以长度约为15 kb的长链非编码RNA,其基因位于2号染色p11.2[1],其在肿瘤组织中的表达水平高于正常组织.因而提示其可能与胃癌等恶性肿瘤的发生发展有关.我们采用人胃癌细胞MGC-803为研究材料,通过噻唑蓝(MTT)和划痕实验探讨Linc00152在胃癌细胞增殖和迁移中的作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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长链非编码RNA Linc00152与恶性肿瘤发生、发展关系的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
Linc00152属于长链非编码RNA的一种,是一类长度为828个核苷酸、无编码功能的RNA分子.Linc00152在人类多种肿瘤组织尤其是消化系统恶性肿瘤组织中异常表达,其通过影响肿瘤细胞增殖、凋亡、侵袭及转移等参与肿瘤的发生、发展.近年随着研究的不断深入发现,Linc00152可用于肿瘤诊断、靶向治疗及预后评估等,有望成为新型肿瘤分子生物学标志物.
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编辑人员丨2023/8/6
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Linc00152在脑胶质瘤中的表达及其与患者临床预后的关系
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究Linc00152在脑胶质瘤中的表达及其与患者临床预后的关系.方法 分别检测linc00152在胶质瘤细胞系与肿瘤组织中的表达,分析其与临床病理特征及预后的关系,初步探讨linc00152在脑胶质瘤中的功能.结果 与癌旁脑组织(n=73)相比,在胶质瘤组织(n=73)中Linc00152的表达显著上调(P<0.001);Linc00152高表达与肿瘤的高级别临床分级显著相关(P< 0.05);Kaplan-Meier分析显示Linc00152低表达患者总生存期显著高于高表达者(p<0.001);Cox回归分析显示,Linc00152表达与临床病理分级是胶质瘤患者预后的独立危险因素(P<0.05).结论 Linc00152在脑胶质瘤组织和细胞系中表达显著上调,Linc00152的高表达提示脑胶质瘤患者预后较差,是候选脑胶质瘤预后检测分子标志物及治疗的潜在分子靶点.
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编辑人员丨2023/8/6
