N7-甲基鸟嘌呤(N7-methylguanosine,m7G)修饰是转录后调控中常见的碱基修饰形式之一,也是近年来表观遗传修饰研究的热点.m7G修饰广泛存在于真核生物中,参与调控多种生物学功能.越来越多的证据表明,m7G修饰与多种恶性肿瘤的进展密切相关,本文主要概述了 RNA m7G修饰及其调控分子在消化系统肿瘤中的作用.

目的:建立并验证一种基于N7甲基鸟苷(m7G)RNA甲基化修饰相关基因的乳腺癌预后预测模型.方法:检测31种m7G RNA甲基化相关的关键调控因子在乳腺癌组织中的表达模式.下载癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)中的乳腺癌患者的mRNA基因表达和临床预后数据.通过单变量Cox回归分析评估每个m7G相关基因对生存的预后价值.应用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归方法,构建基于m7G甲基化调节基因的乳腺癌预后风险模型.通过基因集富集分析(GSEA)阐述BC高危人群的主要作用机制.基于m7G建立预后列线图,分别在TCGA和GEO队列中进行验证.结果:构建基于7个m7G甲基化调节基因的预后风险模型.高危组总生存率(OS)明显低于低危组(P＜0.001).GSEA分析表明,在高危人群中"细胞周期"是最重要的致癌通路.利用训练集TCGA队列的风险评分及临床特征,构建了预后列线图,校准曲线和决策曲线分析(DCA)表明其一致性和预测效能很好,并于GEO队列中进行了验证.结论:基于m7G相关基因的预后模型对乳腺癌的预后具有预测作用,可用于指导乳腺癌患者的个体化治疗.

N7-甲基鸟苷(m7G)是表观遗传学调控过程中最常见的RNA修饰之一,在mRNA、核糖体RNA(rRNA)、转运RNA(tRNA)、miRNA等多种RNA分子的加工和代谢中起着重要作用,进而参与细胞增殖、分化、凋亡和迁移等多种功能.越来越多的证据表明,m7G甲基化修饰参与肿瘤的发生发展.异常的m7G甲基化修饰通过调控癌基因和抑制基因的表达促进或抑制多种肿瘤的进展,m7G甲基化修饰及其调控因子可能是肿瘤诊断和治疗的潜在靶点.本文就m7G甲基化修饰的最新研究进展、检测方法及其在肿瘤发生发展中作用的分子机制进行评述.

肺动脉高压(PAH)是一类多病因引起的以肺血管重构为主要特征,并最终引起右心衰竭和过早死亡的临床综合征.尽管PAH临床诊治取得明显进展,但疗效仍不能令人满意,患者5年生存率较低,且其发病机制复杂,目前仍未完全阐明.RNA甲基化修饰作为表观遗传学修饰中的第三大研究领域,其主要通过甲基转移酶(Writers)、去甲基化酶(Erasers)和甲基识别蛋白(Readers)三类蛋白可逆地写入、移除和读取甲基,在不改变基因序列的情况下对细胞增殖、凋亡、代谢等细胞生物学行为发挥重要作用.RNA甲基化修饰在肿瘤、心血管疾病、免疫与代谢性疾病等的发生发展中起着关键的调节作用,此外,其也参与了PAH的发生发展,并给PAH的治疗带来了新的希望.本研究综述了RNA甲基化修饰的种类及作用,N6-甲基腺嘌呤(m6A)、5-甲基胞嘧啶(m5C)和7-甲基鸟苷(m7G)修饰在PAH中的作用机制,以期为研究者提供新思路.

目的 明确N7-甲基鸟苷(7-methylguanosine,m7G)相关基因对腹主动脉瘤(abdominal aortic aneurysm,AAA)的作用.方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中获取人类AAA和正常组织中m7G相关基因的表达数据,并进行差异分析.通过LASSO回归筛选与发病相关的基因并进行免疫浸润分析,根据其表达模式对AAA患者进行共识聚类分型,对两种亚型的差异基因进行基因本体论(gene ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析.最后通过数据库预测筛选出的m7G相关基因的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、微小RNA(microRNA,miRNA).结果 筛选出6个具有显著差异的m7G相关基因,其中IFIT5、NUDT10和NUDT4与AAA发病密切相关.这三者其可能影响CD4幼稚T细胞,自然杀伤(natural killer,NK)细胞,Tregs细胞的免疫浸润程度,根据其表达模式聚类的亚型与AAA的异质性密切相关,并构建了相关竞争性內源RNA(competing endogenouse RNA,ceRNA)网络.结论 m7G相关基因IFIT5、NUDT10和NUDT4可能是治疗人类AAA的潜在靶点.

目的 探讨N7-甲基鸟苷(m7G)修饰相关长链非编码RNA(lncRNA)与胃癌的预后及免疫特征间的关系.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取胃癌和癌旁组织的转录组数据和临床数据.采用皮尔森相关分析识别m7G相关的lncRNA.通过单因素Cox回归、最小绝对收缩和运算符选择(LASSO)回归算法和多因素Cox回归构建m7G相关lncRNA的风险预测模型,并通过Kaplan-Meier生存曲线和受试者操作特征(ROC)曲线验证.构建列线图用于预测胃癌患者的预后.通过基因本体(GO)、京都基因和基因组数据库(KEGG)和免疫功能分析m7G高、低风险组生物功能的差异.通过肿瘤免疫逃逸(TIE)、免疫治疗药物敏感性和肿瘤突变负荷(TMB)评估免疫治疗反应.结果 由6个m7G相关lncRNA(AC090425.3,AC004817.3,AC023590.1,C3orf36,AC012055.1,LINC01854)构建的预后模型被证明具有良好的预测能力.GO和KEGG富集分析表明,肌肉相关生物学功能与m7G相关lncRNA显著相关.m7G低评分患者TMB高,肿瘤免疫功能障碍和排除评分低,化疗药物敏感性高.结论 m7G相关lncRNA可能与肌肉减少症和免疫反应有关,是m7G高风险患者预后较差的原因之一.

生物体内大分子物质的特定化学修饰是调节分子结构与功能的高效性方法,DNA和蛋白质的修饰会影响下游信号通路的激活,RNA化学修饰则在基因选择性表达中发挥关键性调节作用.大自然中存在170多种不同类型的RN A化学修饰,它们分别参与编码和非编码RNA的修饰过程.RNA修饰的失调会影响多种疾病的发生发展.在这篇综述中,我们着重介绍了N6-甲基腺苷、5-甲基胞嘧啶、N1-甲基腺苷、7-甲基鸟嘌呤和Pseudouridine在内的多种RNA化学修饰,并对其在消化道肿瘤中的作用进行了归纳和总结.

早在60多年前科学家已经发现RNA化学修饰的存在,但直到近年来关于RNA修饰功能的研究才得到广泛关注及蓬勃发展,其中病毒RNA修饰的功能成为了病毒学研究领域新的热点.目前已有150多种RNA修饰被发现,这些修饰在调控RNA结构、剪接、核运输、翻译、稳定性等多种生物过程中发挥重要作用.目前病毒RNA修饰中最受关注的7种化学修饰包括N6-甲基腺苷(m6A)、5-甲基胞苷(m5C)、N1-甲基腺苷(m1A)、N7-甲基鸟苷(m7G)、N4-乙酰胞苷(ac4C)、假尿苷(Ψ)和核糖甲基化(Nm).本文介绍了细胞中的修饰系统,讨论了当前各种修饰的检测方法并对这些修饰在病毒复制中的功能进行了归纳总结.此外,我们提出了病毒RNA修饰未来可能的一些研究方向.

RNA修饰是表观遗传修饰的一种,可通过降低mRNA的稳定性或表达,编码抑癌基因以降低其抑癌作用,并增强促癌转录体的稳定性和表达,在调节生物过程和肿瘤病理方面发挥重要作用.目前研究较多的RNA修饰包括N6-甲基腺苷(m6A)修饰、N1-甲基腺苷(m1A)修饰、5-甲基胞嘧啶(m5C)修饰、7-甲基鸟苷(m7G)修饰、假尿苷(psi)修饰、腺苷-肌苷转换(A-I)修饰和2′-O-甲基化(2′-O-Me)修饰等.RNA修饰可以通过METTL3、METTL14、METTL16等甲基转移酶,FTO、ALKBH5等去甲基化酶,YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3等甲基结合蛋白,分别进行催化、擦除和识别,精确调控甲基化过程,在肿瘤细胞增殖、转移、侵袭、凋亡、自噬以及肿瘤耐药中发挥重要作用,参与肺癌的发生发展.

N7-甲基鸟苷(m7G)是转录后调控中最常见的碱基修饰之一,广泛分布于tRNA、rRNA以及真核生物mRNA的5′帽子区.m7G修饰通过影响RNA分子的代谢,积极参与人体中多种生理和病理功能.越来越多的证据表明m7G修饰相关因子在肿瘤中异常表达,且与多种原癌基因和抑癌基因的表达以及肿瘤的发生和进展密切相关.因此,m7G修饰水平可以成为一些肿瘤的生物标志物或潜在的干预靶点,为肿瘤的早期诊断和治疗提供更多可能性.本文综述了目前关于m7G修饰在多种肿瘤发生和进展中的功能和分子机制,探讨m7G研究的未来方向及临床应用前景.