-
伴 NCOR1:: GLYR1融合基因MDS/MPN伴中性粒细胞增多1例患者的研究
编辑人员丨6天前
目的:探讨1例伴 NCOR1:: GLYR1融合基因骨髓增生异常/骨髓增殖性肿瘤(MDS/MPN)伴中性粒细胞增多患者的临床资料与遗传学特征。 方法:以2021年5月就诊于南京医科大学第一附属医院的1例伴 NCOR1:: GLYR1融合基因MDS/MPN伴中性粒细胞增多患者作为研究对象。收集患者的临床资料,分析其骨髓病理资料,并对其进行染色体核型分析、二代测序、转录组测序,分析基因融合序列,验证候选融合基因,并在确诊后给予患者相应的治疗。 结果:患者为67岁男性,因血小板进行性下降就诊,根据骨髓及外周血细胞形态学分析诊断为MDS/MPN伴中性粒细胞增多,给予去甲基化药物、Bcl-2抑制剂等药物治疗。患者在17个月后进展为急性髓系白血病(AML)。外周血转录组测序检测到 NCOR1:: GLYR1融合基因转录本,并经实时荧光定量PCR及Sanger测序验证。患者经地西他滨、阿柔吡星、阿糖胞苷、粒细胞集落刺激因子(DCAG)联合西达本胺方案化疗后达到形态学完全缓解。实时荧光定量PCR检测 NCOR1:: GLYR1融合基因转录本显著下降。 结论:NCOR1:: GLYR1融合基因考虑为该MDS/MPN伴中性粒细胞增多患者的致病原因。
...不再出现此类内容
编辑人员丨6天前
-
基于长链非编码RNA调控ceRNA网络的缺血性脑卒中相关分子机制
编辑人员丨2024/3/16
目的:利用生物信息学分析筛选缺血性脑卒中(IS)的差异表达基因,构建竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,探讨IS的相关分子机制.方法:从GEO数据库下载IS相关的miRNA、mRNA和lncRNA测序数据,借助R软件获取差异基因,通过starBase、miRDB和miRwalk数据库进行lncRNA-miRNA和miRNA-mRNA关系预测,并构建ceRNA网络.预测与差异分析的结果取交集后筛选出差异靶基因(DETmRNAs),利用DAVID数据库进行KEGG和GO富集分析,String数据库构建蛋白互作网络(PPI),采用Cytoscape软件识别核心靶基因.结果:共筛选出存在明显差异表达的miRNAs 20个,mRNAs 1512个,lncRNAs 278个,并成功构建了51ncRNAs-6miRNAs-102mRNAs互作的ceRNA网络.筛选出的285个DETmRNAs所富集的功能主要包括染色质的组织、磷蛋白磷酸酶活性的负向调节和细胞周期等生物学过程,涉及白细胞经内皮迁移、血小板激活等信号通路,最终识别出排名前 10 的核心靶基因为 CREB1、MAPK1、GSK3B、SP1、PIK3R1、NR3C1、NCOR1、NFATC1、SETD2、NSD1.结论:构建ceRNA网络有助于进一步认识IS的分子机制和筛选潜在的生物标志物,为后续康复治疗靶点的确定和制定康复策略提供一些线索.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/3/16
-
MenSCs对PCOS大鼠卵巢损伤修复、生殖系统及HSP90表达的影响
编辑人员丨2024/1/20
目的 研究经血间充质干细胞(MenSCs)移植对多囊卵巢综合征(PCOS)大鼠卵巢损伤修复、生殖系统及热休克蛋白 90(HSP90)表达的影响.方法 选取健康 SPF级 SD雌性大鼠 40 只,随机分为健康组、模型组、治疗组、对照组,每组 10 只.除健康组外,剩余 30 只大鼠均建立PCOS模型,其中 10 只为模型组;10 只 PCOS模型大鼠于尾部静脉注射 200 μL(5×107 个/mL)MenSCs悬液,共饲养 2 周为治疗组;10 只PCOS模型大鼠给予二甲双胍 20 mg·kg-1·d-1 灌胃,共饲养 2 周为对照组.ELISA检测性激素水平.阴道涂片观察动情周期.RT-PCR 检测生殖功能相关指标PPARG1、NCOR1、HDAC3 mRNA表达水平.HE染色观察卵巢病理形态.免疫印迹检测 HSP90.结果 与健康组相比,模型组大鼠动情周期无规律并缩短(P<0.05);与模型组相比,治疗组与对照组大鼠动情周期均有所改善(P<0.05).模型组大鼠有较多闭锁坏死卵泡及炎性细胞;与模型组相比,治疗组与对照组大鼠不同时期卵泡数均有所改善.与健康组相比,模型组FSH、PPARG1 降低,LH、T、NCOR1、HDAC3 升高(P<0.05);与模型组相比,治疗组FSH、PPARG1 升高,LH、T、NCOR1、HDAC3 降低(P<0.05);治疗组与对照组各指标水平比较差异无统计学意义(P>0.05).与健康组相比,模型组HSP90 蛋白表达降低(P<0.005);与模型组相比,治疗组HSP90 蛋白表达升高(P<0.005);治疗组与对照组 HSP90 蛋白表达水平比较差异无统计学意义(P>0.05).结论 移植MenSCs细胞后可改善PCOS大鼠的生殖功能及卵巢功能,可能通过上调HSP90 表达影响性激素水平从而改善卵巢损伤.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/1/20
-
肿瘤基因高通量捕获测序技术检测肝癌细胞株体细胞突变
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨肿瘤基因高通量捕获测序技术在检测肝癌细胞株体细胞突变及突变模式中的应用价值.方法 基于第二代测序技术的目标基因靶向测序技术,采用包含325个肿瘤相关基因panel的罗氏Nimble Gen定制序列捕获系统,对7种肝癌细胞株样本(HuH-7、Hep3B、SK-HEP-1、MHCC97H、MHCC97L、HepG2、HepG2.2.15)进行目标区域捕获和双端测序,并分析其DNA中的肿瘤相关突变基因及突变负荷率,比对出差异基因及突变趋势.结果 测序结果显示目标区域平均覆盖率达99.7%,平均测序深度约1 000×,共检出100个基因突变频率≥5%,包括344个非同义突变,其中有38个与癌症密切相关的突变基因富集于5条致癌信号通路:染色质重塑、Notch、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、p53和Wnt/β-连环蛋白(β-catenin)通路;与肝细胞肝癌(HCC)患者体细胞突变的前期报道比较,肝癌细胞株中染色质重塑和Notch信号通路中基因突变负荷更高;3个未在HCC患者中报道的突变基因被鉴定出来,包括2个肿瘤抑制基因[MSH6、性别决定区Y框蛋白9(SOX9)]和1个癌基因[间变性淋巴瘤受体酪氨酸激酶(ALK)];MHCC97来源细胞株(MHCC97H和MHCC97L)鉴定出44个突变基因,其中30个(68%)为共有突变,并富集在氧化应激通路[Kelch样环氧氯丙烷相关蛋白-1(KEAP1)],染色质重塑[核受体共抑制因子(NCOR1)、组蛋白调控基因(KMT2D)、ARID1A],Wnt/β-catenin(AXIN1、SOX9)和MAPK通路[促分裂原活化蛋白激酶的激酶的激酶(MAP3 K1)、MAP2K3].ALK和白血病病毒癌基因同源物2(ERBB2)只在MHCC97L中检出突变,APOB只在MHCC97H中检出突变,Notch通路(Notch1、Notch2)在MHCC97L中突变频率较高,TERT在MHCC97H突变频率较高;HepG2和HepG2.2.15鉴定出37个突变基因,其中19个(51%)为共有突变,2个Notch通路基因(Notch1、Notch2)和染色质重塑通路[KMT2D、人锌指同源框蛋白4(ZFHX4)]在两者中具有相同突变位点和相近突变频率.肿瘤蛋白p53(Tp53)只在HepG2中检出突变,而腺瘤性息肉病基因(APC)和毛细血管扩张性共济失调突变基因(ATM)只在HepG2.2.15中检出突变.4种来自不同HCC患者建系的肝癌细胞株(HuH-7、Hep3B、SK-HEP-1、HepG2)有不同突变模式,同一克隆来源的肝癌细胞株突变呈现较大相似性.结论 肿瘤基因高通量捕获测序灵敏度高,在肝癌细胞突变检测中具有较高应用价值.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/6
-
NCoR和SRC-1在子宫内膜重度不典型增生中的表达及意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨核受体辅阻遏子(NCoR)与类固醇受体辅活化子-1(SRC-1)在子宫内膜重度不典型增生中的表达及意义.方法 选择2014年1月至2017年2月收治的60例子宫内膜重度不典型增生患者作为观察组,选择同期行内膜活检的30例子宫内膜无病变对象作为对照组,均留取子宫内膜标本,采用免疫组化法观察子宫内膜组织NCoR、SRC-1、雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)表达情况,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法测定子宫内膜组织NCoR、SRC-1 mRNA表达.结果 (1)观察组SRC-1阳性率高于对照组(68.33%vs.6.67%)(P<0.05),其NCoR(20.00%vs.50.00%)、ER(13.33%vs.76.67%)、PR表达阳性率(18.33%vs.80.00%)低于对照组,对比差异有统计学意义(P<0.05);(2)观察组子宫内膜组织SRC-1 mRNA水平明显高于对照组,其NCoR mRNA水平低于对照组,对比差异有统计学意义(P<0.05);(3)子宫内膜重度不典型增生患者内膜组织SRC-1与ER表达呈负相关(r=-0.465,P<0.05),而NCoR与PR表达水平呈正相关(r=0.478,P<0.05).结论 子宫内膜重度不典型增生患者内膜组织NCoR表达水平较低,且与PR表达呈正相关,SCR-1表达水平较高,与ER负相关,推测NCoR、SRC-1两者均可通过介导雌激素调节,影响内膜组织增生,参与子宫内膜癌变过程.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/6
-
17β-HSD1、NCoR和HER-2在子宫内膜息肉组织中的表达及临床意义
编辑人员丨2023/8/5
目的 探究17β-羟类固醇脱氢酶1(17β-HSD1)、核受体辅阻遏子(NCoR)和表皮生长因子受体2(HER-2)在子宫内膜息肉(EP)组织中的表达及临床意义.方法 选择2017年6月至2019年6月在该院行EP切除术治疗患者的息肉组织标本40例作为观察组,远离息肉的正常子宫内膜组织标本40例作为对照组,另选取同期行宫腔镜检查者的正常子宫内膜组织标本40例作为空白组.采用免疫组织化学(SP法)检测3组17β-HSD1、NCoR、HER-2的表达情况.比较3组17β-HSD1、NCoR、HER-2的表达水平及阳性率;采用Spearman相关分析观察组17β-HSD1、NCoR、HER-2表达水平间的相关性;分析17β-HSD1、NCoR、HER-2的表达情况与观察组临床特征及治疗效果间的关系.结果 观察组17β-HSD1、HER-2表达水平及阳性率均高于对照组和空白组,NCoR表达水平及阳性率均低于对照组和空白组,差异均有统计学意义(P<0.05);对照组17β-HSD1、HER-2表达水平及阳性率均高于空白组,NCoR表达水平及阳性率均低于空白组,差异均有统计学意义(P<0.05).观察组17β-HSD1表达水平与HER-2表达水平呈正相关(r=0.634,P<0.05),与NCoR表达水平呈负相关(r=-0.447,P<0.05);HER-2表达水平与NCoR表达水平呈负相关(r=-0.522,P<0.05).观察组17β-HSD1、NCoR、HER-2的表达与临床表现、月经情况均有关(P<0.05).治疗6个月后,观察组17β-HSD1、HER-2、NCoR的表达与复发情况及阴道流血情况均有关(P<0.05).结论 EP患者息肉组织中存在17β-HSD1、NCoR、HER-2的异常表达,且不同临床表现、月经情况及预后情况患者息肉组织中17β-HSD1、NCoR、HER-2的表达水平存在差异.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/5
-
转导蛋白β样1X连接受体1在实体瘤中的研究进展
编辑人员丨2023/8/5
转导蛋白(β)样1X连接受体1(TBL1XR1/TBLR1)是核受体辅阻遏物(NCoR)和视黄酸和甲状腺激素受体的沉默介体(SMRT)阻遏复合物的整体亚基.它是一种进化上保守的蛋白质,在所有物种中具有高度相似性.已有研究表明,其在多种肿瘤中过表达,且参与多种肿瘤相关信号通路的激活和上皮-间质转化(EMT),并与肿瘤的侵袭、迁移、预后和化疗耐药等密切相关.本文就TBL1XR1的特点及其与肿瘤的关系展开阐述.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/5
-
核受体辅抑制因子1对缺血再灌注损伤小鼠的心肌保护作用
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨心肌细胞来源的核受体辅抑制因子1(nuclear receptor corepressor 1,NCoR1)对心肌缺血再灌注损伤(myocardial ischemia/reperfusion injury,MI/RI)小鼠心肌的保护作用及可能机制.方法 心肌细胞NCoR1基因特异性敲除小鼠44只,随机分为假手术基因敲除组和MI/RI基因敲除组各22只;具有心脏特异性aMHC-Cre标签的野生型小鼠44只,随机分为假手术野生型组和MI/RI野生型组各22只.MI/RI基因敲除组、MI/RI野生型组结扎左冠状动脉30 min后恢复灌注血流制备MI/RI模型;假手术基因敲除组、假手术野生型组仅穿线不结扎左冠状动脉.造模成功后24 h,各组分别取12只小鼠测定左室射血分数(left ventricular ejection fraction,LVEF)和左心室短轴缩短分数(left ventricular fractional shortening,LVFS),然后处死小鼠取心脏,采用TTC染色法评估心肌梗死面积百分比;各组分别取1只小鼠行MRI检查,评估小鼠心肌收缩情况和水肿程度.造模成功后3h,各组分别取4只小鼠处死后取心脏组织,行DHE染色观察活性氧(reactive oxygen species,ROS)含量,行免疫组织化学染色观察还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(nacotinamide adenine dinucleotide phosphate,NADPH)、3-硝基酪氨酸(3-nitrotyrosine,3-NT)阳性细胞;各组分别再取5只小鼠,采用ELISA法检测心肌组织中NADPH、3-NT水平.结果 造模后24 h,LVEF、LVFS在MI/RI基因敲除组[(34.16±1.61)%、(16.08±0.87)%]、MI/RI野生型组[(40.61±1.07)%、(19.61±0.60)%]均低于假手术基因敲除组[(58.47±2.12)%、(29.59±1.64)%]、假手术野生型组[(58.23±2.13)%、(30.35±1.47)%](P<0.05),心肌梗死面积百分比在MI/RI基因敲除组[(38.71±2.63)%]大于MI/RI野生型组[(18.34±2.16)%](P<0.05),MI/RI基因敲除组LVEF、LVFS均低于MI/RI野生型组(P<0.05);MI/RI基因敲除组心肌收缩、水肿程度均较MI/RI野生型组严重.ROS含量及NADPH、3-NT水平在MI/RI基因敲除组[(1.61±0.08)%、(3.26±0.19) μg/L、(15.50±1.07)μg/L]、MI/RI野生型组[(0.58±0.03)%、(2.39±0.17)μg/L、(9.96±0.70)μg/L]均高于假手术野生型组[0、(1.12±0.09)μg/L、(3.12±0.14)μg/L]、假手术基因敲除组[0、(0.95±0.04) μg/L、(3.25±0.28) μg/L](P<0.05),MI/RI基因敲除组高于MI/RI野生型组(P<0.05),假手术野生型组与假手术基因敲除组比较差异无统计学意义(P>0.05).结论 心肌细胞来源NCoR1对MI/RI小鼠的心肌具有保护作用,其机制可能缓解MI/RI损伤诱发的氧化应激损伤.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/5
-
内脏转移性去势抵抗性前列腺癌患者的基因突变特征分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨内脏转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC-VM)患者的基因突变特征.方法 选取2017年1月至2019年12月在温州医科大学附属第一医院泌尿外科确诊为mCRPC-VM的患者33例,均完善前列腺易感基因二代测序.采用生物信息学分析mCRPC-VM患者的基因突变特征,并与SU2C-PCF数据库的444例转移性去势抵抗性前列腺癌患者基因组数据进行比较.结果 33例mCRPC-VM患者突变频率从高到低的基因分别为TP53(45.45%)、AR(42.42%)、NCOR2(15.15%)、PTEN(15.15%)、FOXA1(15.15%)、PIK3CA(15.15%)、RB1(15.15%).3例(9.09%)患者携带胚系突变,均发生于DNA损伤修复通路基因.肝转移患者AR、FOXA1突变频率均高于非肝转移患者(均P<0.05).TP53、NCOR2、PTEN、FOXA1、PIK3CA突变类型占比最高均为错义突变,AR突变类型占比最高为基因扩增,RB1突变类型占比最高为移码突变.基因缺失突变主要发生在肺转移患者(71.43%),扩增突变主要发生在肝转移患者(66.67%).与SU2C-PCF数据库比较,本院患者PTEN突变频率明显较低(P<0.05);而AR、TP53、NCOR2、FOXA1、PIK3CA、RB1等基因突变频率比较,差异均无统计学意义(均P>0.05).结论 mCRPC-VM患者的高频率突变基因为TP53、AR,高频率突变基因的类型以错义突变为主.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/5
-
心肌细胞来源NCoR1对小鼠心肌梗死损伤的保护作用
编辑人员丨2023/8/5
目的 探究心肌细胞来源的核受体辅抑制因子1(NCoR1)对小鼠心肌梗死损伤发挥的作用.方法 构建心肌细胞NCoR1特异性敲除小鼠并根据不同手术处理分为假手术野生型组、假手术基因敲除组、心肌梗死野生型组和心肌梗死基因敲除组,每组各50只小鼠.统计各组小鼠在心肌梗死28 d的生存率和心功能水平;通过病理染色判断梗死面积与纤维化程度;测定小鼠血清心肌酶[磷酸肌酸激酶(CK-MB)、乳酸脱氢酶(LDH)]及炎症指标[肿瘤坏死因子α (TNF-α)、白介素6(IL-6)]水平.结果 与野生型小鼠相比,基因敲除组小鼠存活率更低,左心室射血分数[(30.39±5.13)%vs.(9.46±2.10)%]和左心室缩短分数[(14.62±2.69)% vs.(4.26±0.96)%]均明显下降,而左室容积[(101.50±14.07)μL vs.(197.50±22.41)μL]明显升高(均P<0.05);小动物PET/CT提示心肌梗死后野生型小鼠对18F-FDG的摄取量更高[(2.74±0.06)MBqvs.(1.60±0.03)MBq],梗死程度[(36.22±0.86)% vs.(47.17±1.27)%]和纤维化程度[(32.70±0.85)%vs.(46.38±1.31)%]更低(均P<0.05);血清学指标显示敲除小鼠心肌损伤更重且炎症水平更高(均P<0.05).结论 心肌细胞中NCoR1在小鼠心肌梗死中发挥重要的保护作用.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/5