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NFIX基因功能及相关疾病研究进展
编辑人员丨5天前
核因子I (nuclear factor I,NFI)家族是机体重要的转录因子,包含NFIA、NFIB、NFIC和NFIX四个成员,NFI家族成员的N端DNA结合和二聚化结构域高度保守。NFIX基因在大脑、前列腺、骨骼肌、皮肤、脂肪、卵巢等部位广泛表达。NFIX基因在神经系统发育、肿瘤发生、肌肉和骨骼发育、造血细胞增殖及精子发生等多种生物过程中发挥至关重要的作用。目前国内对NFIX基因的功能研究及临床病例报道均较少,其具体作用机制仍未完全明确,有待进一步研究。为引起临床医师对NFIX基因的重视,提高对该基因相关疾病的认识,该文总结近年国内外相关文献,对NFIX基因的功能及临床研究进展进行综述。
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编辑人员丨5天前
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NFIX基因变异导致一对同卵双胞胎Marshall-Smith综合征并文献复习
编辑人员丨1个月前
该文报道了一对NFIX基因变异导致Marshall-Smith综合征(Marshall-Smith syndrome,MRSHSS)的同卵双胞胎临床及遗传学特点并对相关文献进行复习.2例患儿均表现为全面发育落后、高额头、浅眼眶、漏斗胸.基因检测提示2例患儿均存在NFIX杂合剪接位点变异c.697+1G>A,父母该位点为野生型,根据美国医学遗传学与基因组学学会指南判定为可能致病性变异,该位点突变既往未见文献报道.复习文献共发现32例MRSHSS患者,突变类型为剪切/移码突变.骨骼成熟加速、中至重度全面发育迟缓/智力障碍是MRSHSS患者最主要的临床表现.基因检测结果是该病重要的诊断依据.
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编辑人员丨1个月前
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原发性智力障碍/发育迟缓患儿临床及遗传学分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 对30例原发性智力障碍/发育迟缓(ID/DD)患儿进行临床及遗传学分析,明确病因诊断.方法 收集病例,按照规范化ID/DD病因学诊断流程,对30例患儿依次行生化、代谢、神经影像学检查、染色体核型分析、多重连接依赖的探针扩增技术(MLPA)、目标基因靶向捕获-高通量测序、染色体基因芯片分析(CMA)等检查,对检出的变异进行致病性分析.结果 30例(100%)患儿均表现智力、运动、发育落后,12例(40.0%,12/30例)伴先天畸形,8例(26.7%,8/30例)伴精神行为异常;29例(96.7%,29/30例)存在遗传变异,8例(26.7%,8/30例)变异为致病性突变,其中4种基因的5种变异为未报道的新突变:NFIXc.613C>T(p.Q205X),DHCR7 c.1376G> A(p.W459X)与c.901C> A(p.H301 N),UPF3B c.1034G> A(p.R345H),DLG3c.128G >T(p.G43V),确诊22q13.3微缺失综合征、Angelman综合征、Sotos综合征2型、Smith-Lemli-Opitz综合征、1 1q24.1q24.2微重复综合征、15q21.3q22.2微缺失综合征各1例及X连锁ID 2例.染色体核型、MLPA、目标基因靶向捕获-高通量测序、CMA的诊断阳性率分别为4.5%(1/22例)、6.7%(2/30例)、13.3%(4/30例)、28.6%(2/7例).结论 明确了8例ID/DD患儿的病因诊断,扩大了NFIX、DHCR7、UPF3B、DLG3基因突变谱.在国内首次报道1例NFIX突变导致Sotos综合征2型.
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编辑人员丨2023/8/6
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基于GEO数据库的多发性骨髓瘤细胞焦亡预后分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 采用生物信息学分析技术筛选多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)细胞焦亡差异表达基因,并进行预后分析.方法 在基因表达谱数据库(GEO)中选取MM细胞焦亡相关基因表达谱芯片数据,采用R软件筛选MM患者肿瘤组织和健康对照组中细胞焦亡差异表达基因.对筛选出的差异表达基因通过Cox回归分析识别预后相关基因,进行预后分析.结果 以GSE6477基因表达谱数据集为分析对象,选取与焦亡相关基因匹配共获得焦亡相关基因.将29个差异基因进行预后分析,14个基因(INAVA、P2RY2、NES、NFIX、SPATA17、NLRP2、INHBC、GZMB、CCDC74A、TNF、SNHG28、MUC1、NANOS1、CD6)纳入风险模型构建,生存分析显示年龄、肿瘤分期、风险评分与MM患者预后显著相关.结论 通过生物信息学方法,构建了14个细胞焦亡相关基因的MM预后模型,可能为MM患者的个体化治疗和评估提供参考.MM细胞焦亡基因通过生物学过程影响预后.
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编辑人员丨2023/8/5
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NSD1基因新发突变致Sotos综合征患儿1例临床分析并国内相关文献复习
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨NSD1基因新发突变致Sotos综合征患儿的临床特征,并对国内相关研究文献进行复习.方法 选择2019年9月18日青岛大学附属医院收治的1例Sotos综合征男性患儿(患儿1)为研究对象.回顾性分析其临床资料,采取全外显子组测序及Sanger测序对其致病突变基因位点进行分析,并进行家系验证.本例患儿检出突变位点,于千人基因组数据库、美国国家心肺和血液研究所外显子组测序数据库(ESP6500SI)、外显子组整合数据库(ExAC)进行检索,确定其是否为已报道突变位点.根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)制定的《序列变异解释的标准和指南》(以下简称为ACMG指南),对检出突变致病性进行评级.以"Sotos综合征""脑性巨人症""儿童"为关键词,在万方数据知识服务平台、中国知网等数据库进行文献检索,并对检索文献进行复习.本研究遵循的程序符合青岛大学附属医院伦理委员会规定,并通过该伦理委员会审查、批准(审批文号:QYFYWZLL25663).结果 患儿1为3岁10个月男童,由于"生长过快3+年"就诊,有过度生长、特殊面容和神经精神发育迟缓等Sotos综合征典型症状;患儿1的男性生殖系统超声结果提示双侧隐睾,骨龄为3.5岁,头颅MRI提示脑实质内未见明显异常信号影,幕上脑白质较少,胼胝体较薄,双侧侧脑室扩张,枕大池增大;患儿1心脏超声、全脊柱正位X射线摄片均未见异常;患儿1 NSD1基因发生c.6007_6009+1delAAAG杂合突变,经Sanger测序验证显示,患儿父母未携带该杂合突变,患儿为新发突变,该突变尚未被千人基因组数据库、ESP6500SI、ExAC等数据库收录.根据ACMG指南,判断该突变为可能致病性突变.文献检索结果:共计检索到20篇国内Sotos综合征患儿相关病例报告,涉及26例Sotos综合征患儿(患儿2~27).对包括患儿1及患儿2~27的27例该病患儿的分析结果如下.这27例患儿中,①男、女性患儿分别为22、5例.②中位确诊年龄为11个月.③22例患儿报道就诊主诉分别为神经精神发育落后(14例,63.6%),生长过快(2例,9.1%),抽搐或其他症状(6例,27.3%),其余5例患儿未报道就诊主诉;查体发现过度生长为16例(59.3%),特殊面容为23例(85.2%),神经精神发育迟缓为27例(100.0%).④骨龄较实际年龄偏大者为8例,心血管系统发育异常为11例,泌尿生殖系统发育异常为5例,颅脑影像学异常为24例.⑤23例患儿进行基因检测发现,5q35微缺失为10例(43.5%),NSD1基因突变为12例(52.2%),NFIX基因突变1例(4.3%),均为散发病例.结论 国内报道的Sotos综合征均为散发病例,以NSD1基因突变和5q35微缺失为主;男性患儿居多;均有神经精神发育落后表现,绝大多数有特殊面容和过度生长表现,患儿基因型与表型有较明显相关性.本研究首次报道的NSD1基因c.6007_6009+1delAAAG新发杂合突变丰富了人类NSD1基因突变类型.
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编辑人员丨2023/8/5
