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PNPLA3基因高表达对非酒精性脂肪性肝病模型细胞增殖和甘油三酯的影响
编辑人员丨3天前
目的 探讨patatin样磷脂酶域3(PNPLA3)高表达对非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)细胞模型细胞增殖和甘油三酯(TG)的影响.方法 将人肝癌细胞(SMMC-7721细胞)分为对照组、模型组、PNPLA3过表达组、PNPLA3过表达空载组.模型组:经游离脂肪酸诱导建立NAFLD细胞模型,PNPLA3过表达组、PNPLA3过表达空载组:在造模后经慢病毒原液感染、嘌呤霉素筛选获得.用定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)、MTT比色法和TG测试技术检测细胞中PNPLA3表达情况、细胞存活率和胞内TG含量.结果 qRT-PCR结果显示,模型组PNPLA3基因的表达量高于对照组(P<0.01),PNPLA3过表达组PNPLA3基因表达量高于模型组(P<0.01).MTT结果显示,模型组细胞相对存活率高于对照组(P<0.05),PNPLA3过表达组细胞相对存活率高于模型组(P<0.01).TG检测结果显示:模型组TG含量高于对照组(P<0.01),PNPLA3过表达组中胞内TG含量高于模型组(P<0.05).结论 成功构建PNPLA3过表达NAFLD稳转株,PNPLA3的过量表达有助于细胞脂质堆积并增强细胞相对存活率.
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编辑人员丨3天前
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代谢相关性脂肪性肝病相关肝细胞癌的研究进展
编辑人员丨3天前
代谢相关性脂肪性肝病(MAFLD)是非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的新称,包括单纯性脂肪肝和非酒精性脂肪性肝炎(NASH)在内的一系列临床表现。随着MAFLD患病率的快速上升,MAFLD相关性肝细胞癌(MAFLD-HCC)发病率也在全球范围内持续增加。目前,MAFLD已成为许多国家HCC的主要病因之一。与其他病因比较,MAFLD-HCC患者往往更年长,诊断时肿瘤分期较晚,预后较差。此外,MAFLD-HCC还可发生于非肝硬化患者。预计未来10年,中国、法国和美国等国的MAFLD-HCC年发病例数将增加80%~120%。同时,糖尿病和肥胖是MAFLD患者发生HCC的主要危险因素。除年龄、性别等人口学因素外,PNPLA3基因多态性与MAFLD-HCC风险增加相关。最新证据表明,肠道菌群失调、慢性炎症和免疫监视功能受损在MAFLD-HCC的发生发展中起重要作用。对于晚期纤维化或肝硬化的MAFLD患者,建议常规HCC筛查。生活方式干预、降糖药、他汀类药物和阿司匹林可能有助于降低MAFLD-HCC风险,但仍需更多大规模临床试验证实。本文综述了MAFLD-HCC的流行病学、发病机制、危险因素、诊断和预防等方面的最新研究进展,旨在为这一疾病的预防和治疗提供新思路。
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编辑人员丨3天前
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patatin样磷脂酶结构域蛋白3基因rs738409多态性在代谢相关脂肪性肝病诊疗中的应用研究进展
编辑人员丨3天前
代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)是一种以肝脏脂肪蓄积为特征的疾病,是终末期肝病、原发性肝癌、肝移植的重要原因。MAFLD影响了全球约1/4的人口,给公共卫生带来了巨大的负担。遗传因素与环境因素在MAFLD发生发展中共同发挥作用,其中patatin样磷脂酶结构域蛋白3( PNPLA3)基因rs738409多态性是MAFLD发生发展的决定性遗传因素之一。该文就 PNPLA3基因rs738409多态性在MAFLD发生发展中的作用机制,以及其在MAFLD的预测、诊断及治疗中的应用研究进展进行阐述。
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编辑人员丨3天前
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PNPLA3 rs738409及 UGT1A1 rs10929303基因多态性对儿童非酒精性脂肪性肝病的联合作用
编辑人员丨3天前
目的:探究patatin样磷脂酶域3(PNPLA3)rs738409(C > G)和尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶1A1(UGT1A1)rs10929303(C > T)对儿童青少年非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的联合作用,为NAFLD的遗传学研究提供科学依据。方法:选取1 027名7~18岁儿童青少年作为研究对象,由专职人员调查一般情况和既往病史,测量身高、体质量等,进行肝脏B超检查,并采集清晨空腹静脉血,测量血生化指标;提取DNA,对 PNPLA3 rs738409和 UGT1A1 rs10929303进行基因分型。用logistic回归分析2个基因多态性与NAFLD关联及其联合作用。据资料不同采用 t检验、Mann-Whitney U检验或 χ2检验进行统计学分析。 结果:PNPLA3 rs738409的GG基因型和 UGT1A1 rs10929303的CC基因型与儿童NAFLD发生风险增加相关,分别增加89%( OR = 1.89, 95% CI: 1.11~3.23, P = 0.019)和96%( OR = 1.96, 95% CI: 1.21~3.17, P = 0.006),且同时携带上述2种基因型者患NAFLD的风险较同时不携带者增加306%( OR = 4.06, 95% CI: 1.90~8.66, P < 0.001)。 结论:PNPLA3和 UGT1A1二个基因多态性的联合作用可显著增加儿童NAFLD的发生风险,为阐明NAFLD的遗传易感性提供了新的证据。
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编辑人员丨3天前
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中国东北地区汉族人群PNPLA3 rs738409及TM6SF2 rs58542926基因多态性与原发性肝癌的相关性
编辑人员丨3天前
目的:探讨中国东北地区汉族人群patatin样磷脂酶域3(PNPLA3)rs738409及跨膜蛋白6超家族2(TM6SF2)rs58542926基因多态性与原发性肝癌发病的相关性。方法:采用病例-对照研究,纳入521例原发性肝癌患者作为病例组,164名健康人作为对照组。病例组根据病因学分为有及无肝硬化组。采用聚合酶链反应(PCR)方法分别检测PNPLA3 rs738409及TM6SF2 rs58542926两个位点的基因多态性。对计量资料用 t检验、方差分析或 U检验,对计数资料用χ 2检验或Fisher确切概率法。 结果:病例组与对照组相比,PNPLA3 rs738409 G等位基因频率分布存在明显差异( OR = 1.583, P = 0.001);进一步分组后显示,除在丙型病毒性肝炎相关性肝癌组中与对照组差异无统计学意义外( P = 0.161),在其他分组中均存在明显差异( P值均< 0.05)。与对照组相比,病例组TM6SF2 rs58542926 T等位基因频率明显高于对照组( OR = 1.759, P = 0.048)。分组后仅合并肝硬化肝癌组CT/TT基因型频率及酒精性相关性肝癌组T等位基因频率与对照组的差异有统计学意义( P值分别为0.045,0.032)。将病例组按照是否携带PNPLA3 rs738409 G等位基因分成CG/GG与CC组;按照是否携带TM6SF2 rs58542926 T等位基因分成CT/TT与CC组,结果显示,CG/GG与CC组及CT/TT与CC组肝脏酶学指标、白蛋白(Alb)、总胆红素(TBil)、甲胎蛋白(AFP)及空腹血糖水平的差异均无统计学意义。将病例组伴有肝硬化的患者根据Child-Pugh评分分为≥7分组与< 7分组,结果显示,PNPLA3 rs738409 CG/GG型与CC型患者的Child-Pugh评分差异及TM6SF2 rs58542926 CT/TT型与CC型患者的Child-Pugh评分差异均无统计学意义( P值均> 0.05)。 结论:PNPLA3 rs738409及TM6SF2 rs58542926基因多态性在中国东北地区汉族人群中与原发性肝癌的发生存在相关性。PNPLA3 rs738409及TM6SF2 rs58542926基因多态性在原发性肝癌中对肝脏酶学、Alb、TBil、AFP及空腹血糖等指标没有影响。
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编辑人员丨3天前
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骨肉瘤差异表达基因的生物信息学分析及关键基因筛选
编辑人员丨3天前
目的:筛选成骨型骨肉瘤与正常成骨细胞的差异表达基因,寻找成骨型骨肉瘤发生、发展的关键基因。方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库获得正常成骨细胞和骨肉瘤组织的基因表达数据集GSE33382,采用R语言的limma包筛选正常成骨细胞和成骨型骨肉瘤的差异表达基因,对差异表达基因进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用String数据库构建蛋白交互网络,应用Cytoscape软件的分子复合物检测(MCODE)插件筛选互作网络中的网络模块,应用Cytoscape软件中的BiNGO模块对MCODE筛选得到的前3个主要模块所包含的差异表达基因进行基因本体(GO)富集分析。采用MCC算法筛选蛋白互作网络中前10个关键基因。从GEO数据库获得骨肉瘤的基因表达和生存数据集GSE39055,采用Kaplan-Meier法进行生存分析。选取2005年1月至2015年12月福建医科大学附属第一医院收治的48例成骨型骨肉瘤患者的资料进行验证,采用免疫组化法测定骨肉瘤组织中STC2蛋白的表达,结合患者的临床资料进行生存分析。结果:从GSE33382数据集中共鉴定出差异表达基因874个,其中下调基因402个,上调基因472个。KEGG富集分析显示,差异表达基因主要与p53信号通路、谷胱甘肽代谢、细胞外基质受体相互作用、细胞黏附分子、抗叶酸盐耐受、细胞衰老等通路有关。互作网络中最重要的前10个关键基因为GAS6、IL6、RCN1、MXRA8、STC2、EVA1A、PNPLA2、CYR61、SPARCL1和FSTL3,其中只有STC2的表达与骨肉瘤患者的生存率有关( P<0.05)。验证结果显示,48例成骨型骨肉瘤组织中STC2蛋白表达与肿瘤大小、Enneking分期有关(均 P<0.05)。25例STC2高表达,中位生存时间为21.4个月;23例STC2低表达,中位生存时间为65.4个月,STC2高表达组患者的生存率低于低表达组( P<0.05)。 结论:生物信息学分析方法可有效筛查成骨型骨肉瘤和正常成骨细胞的差异表达基因,STC2是骨肉瘤预后判断的重要预测因子之一。
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编辑人员丨3天前
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先天性鱼鳞病样红皮病3家系PNPLA1基因突变分析
编辑人员丨3天前
目的:检测3个先天性鱼鳞病样红皮病家系基因突变情况。方法:对临床诊断为先天性鱼鳞病样红皮病的3例先证者外周血DNA进行遗传性皮肤病靶基因外显子测序明确突变位点,根据突变位点设计引物进行PCR扩增,Sanger测序验证先证者和家庭成员突变情况,明确致病原因。结果:先证者1和2表现为全身皮肤干燥,下肢伸侧多角形暗褐色鳞屑;先证者3主要表现为躯干、四肢境界清楚红斑、丘疹、鳞屑。均否认家族史。基因检测显示,先证者1存在PNPLA1基因c.100G>A(来自于母亲)和c.377G>A(来自于父亲)复合杂合突变;先证者2存在PNPLA1基因c.320T>A(来自于母亲)和c.434T>C(来自于父亲)复合杂合突变;先证者3存在PNPLA1基因上c.1300delG纯合突变。两个复合杂合突变家系表型和基因突变符合共分离原则。在检出的5个突变中,两个错义突变(c.377G>A和c.320T>A)为首次报道的突变。结论:PNPLA1基因的双等位基因突变是3个先证者的致病突变,新报道的突变丰富了该病基因突变谱。
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编辑人员丨3天前
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中性脂肪沉积症伴肌病患儿1例的临床特征及遗传学分析
编辑人员丨3天前
目的:探讨1例中性脂肪沉积症伴肌病(NLSDM)患儿的临床表型以及基因变异。方法:选择2021年2月因"发现高肌酸激酶(CK)升高2月余"就诊于郑州大学第一附属医院的1例NLSDM患儿作为研究对象,对其进行临床和实验室检查,并应用全外显子组测序进行基因变异分析,对候选变异进行Sanger测序家系验证。结果:患儿为9岁女性,表现为双下肢乏力、持续CK增高且营养心肌治疗无效。基因检测提示患儿 PNPLA2基因存在母源性c.32C>G(p.S11W)和父源性c.516C>G(p.N172K)复合杂合变异。根据美国美国医学遗传学与基因组学学会相关指南,上述变异均被评级为可能致病性变异(PM1+PM2_Supporting+PP3+PP4)。 结论:PNPLA2基因c.32C>G(p.S11W)和c.516C>G(p.N172K)复合杂合变异考虑为该患儿肌无力和CK增高的遗传学病因。
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编辑人员丨3天前
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腹泻型肠易激综合征关键基因及通路的生物信息学研究
编辑人员丨1个月前
目的 基于生物信息学分析探索腹泻型肠易激综合征(IBS-D)的关键基因及通路,为其诊断与治疗提供潜在的分子靶标.方法 分析基因表达综合数据库中GSE212719数据集,使用GEO2R识别差异表达基因(DEGs);通过DAVID数据库进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析;使用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,Cytoscape 3.10.1软件筛选IBS-D的功能模块和关键基因;使用基于R语言的微生信平台进行基因集富集分析(GSEA)并分析最显著基因集中前10个基因的转录水平,最后建立核心通路.结果 共182个DEGs,包括94个上调基因和88个下调基因;排序前三位的上调基因是MT-ATP6、FSIP2、FABP2,下调基因是LOC112268284、COL13A1、RNA5-8SN1.GO富集分析结果显示,主要集中在黏膜的先天免疫反应、核小体和核糖体组装等.KEGG通路分析结果显示,以核糖体、真核生物中的核糖体生物发生、系统性红斑狼疮为主要通路.PPI网络图由44个节点和336条边共同构建,发现10个核心Hub基因分别是 CDK1、TOP2A、CCNB1、KIF23、NDC80、CENPE、KNL1、ANLN、DEPDC1、HMMR.GSEA 发现,IBS-D 的致病通路可能与酸碱平衡异常、血清乳酸增加、乳酸酸中毒、线粒体异常和线粒体呼吸链活动异常等密切相关;最显著基因集中前 10 个基因是 NDUFA12、SLC26A3、PIGA、UQCRB、NDUFAF4、TRMT10C、ACAT1、GFM2、PNPLA8 和NDUFA4.关键信号通路以TOP2A和MT-ATP6为核心.结论 TOP2A和MT-ATP6基因上调可能与线粒体功能障碍导致血清乳酸增加相关,而COL13A1基因下调可能使肠道肌肉组织的结构受损和炎症增加,这些都可能与IBS-D的发生、发展有关.这一综合分析提供了 IBS-D的关键基因和通路信息,为进一步研究提供了新方向.
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编辑人员丨1个月前
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钠-葡萄糖耦联转运体2抑制剂的药物基因组学研究进展
编辑人员丨2024/8/17
钠-葡萄糖耦联转运体2抑制剂(SGLT2i)是一类新型口服降糖药物,广泛应用于2型糖尿病患者的降糖治疗,但由于患者的遗传背景差异,常导致药物治疗的反应性多样.本文通过综述SGLT2i的药物基因组学研究报道,发现UGT1A9、UGT2B4、SLC5A2、ABCB1、PNPLA3、WFS1基因变异可能影响SGLT2i的药代动力学以及SGLT2i在改善非酒精性脂肪性肝病、减重等方面的降糖外效应,但尚无足够的临床证据支持基因多态性影响SGLT2i的降糖疗效.
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编辑人员丨2024/8/17